<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  AL445665.21	167701	GAATTCATAAGAAAAAAATCTGTATATTTGTGAAAAAATCAGGATCTATC	167652
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	123623	GAATTCATAAGAAAAAAATCTGTATATTTGTGAAAAAATCAGGATCTATC	123672

C  AL445665.21	167651	ATATCCCAAGTTTATTTGGTGGCATTAACATATAATAGTCCATTTGCTTA	167602
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	123673	ATATCCCAAGTTTATTTGGTGGCATTAACATATAATAGTCCATTTGCTTA	123722

C  AL445665.21	167601	CTCCCCATAAATATGTAAAAAGGCAAAGAGAAAGTAAAAAATAAAATTAT	167552
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	123723	CTCCCCATAAATATGTAAAAAGGCAAAGAGAAAGTAAAAAATAAAATTAT	123772

C  AL445665.21	167551	TCTTCCACTCACACAAGTGGCTGAATAGGCCTAATCAATATTCACTTCAT	167502
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	123773	TCTTCCACTCACACAAGTGGCTGAATAGGCCTAATCAATATTCACTTCAT	123822

C  AL445665.21	167501	TGTTCCCCCATAATTCTATATGTTTAGCTTTTAAACATCTATCTTTTAAA	167452
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	123823	TGTTCCCCCATAATTCTATATGTTTAGCTTTTAAACATCTATCTTTTAAA	123872

C  AL445665.21	167451	TATGCTATTTTTATTAATTTGAAGTTAATCAACTAAAATAGGTTCATTCC	167402
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	123873	TATGCTATTTTTATTAATTTGAAGTTAATCAACTAAAATAGGTTCATTCC	123922

C  AL445665.21	167401	TTTCACTTTACCACTATTACAAGTGACTATCTAGGAGCCTGAGTTCTAAT	167352
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	123923	TTTCACTTTACCACTATTACAAGTGACTATCTAGGAGCCTGAGTTCTAAT	123972

C  AL445665.21	167351	GAGGCAGCCATTCCAAACATGTACAGACAAAGCAGTGGTTTCCCTGGCAA	167302
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	123973	GAGGCAGCCATTCCAAACATGTACAGACAAAGCAGTGGTTTCCCTGGCAA	124022

C  AL445665.21	167301	CGAGAACCATGAAAAAGCTCATAGAATAGTTATTCCCACCCTTACACACA	167252
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	124023	CGAGAACCATGAAAAAGCTCATAGAATAGTTATTCCCACCCTTACACACA	124072

C  AL445665.21	167251	ACTCCTTTTCATTTCAGTAAAGCTTCCTGTCAGAACACATTCATCAATGT	167202
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	124073	ACTCCTTTTCATTTCAGTAAAGCTTCCTGTCAGAACACATTCATCAATGT	124122

C  AL445665.21	167201	AATTTGCCAACAAAGTTTAAGAGATTAAATCCCCCTCCCCACAAGAATGT	167152
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	124123	AATTTGCCAACAAAGTTTAAGAGATTAAATCCCCCTCCCCACAAGAATGT	124172

C  AL445665.21	167151	AAAAATAAAAAAACAAAATAAAACCTACAATCAAAAATCAACAGCTATGC	167102
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	124173	AAAAATAAAAAAACAAAATAAAACCTACAATCAAAAATCAACAGCTATGC	124222

C  AL445665.21	167101	TGAAATTGTAGTTAGGTCATCAGGTAATGCTTCAAAGGAAGTAAAGGACA	167052
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	124223	TGAAATTGTAGTTAGGTCATCAGGTAATGCTTCAAAGGAAGTAAAGGACA	124272

C  AL445665.21	167051	TCCTAAGACTCCTGAATACAGTTAACATCACTTTGAACCTGAGATTAATT	167002
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	124273	TCCTAAGACTCCTGAATACAGTTAACATCACTTTGAACCTGAGATTAATT	124322

C  AL445665.21	167001	TTCATTTGATTTTTATCAGAGGATACAGAAGGTAGATGCATCAGGAGGAG	166952
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	124323	TTCATTTGATTTTTATCAGAGGATACAGAAGGTAGATGCATCAGGAGGAG	124372

C  AL445665.21	166951	GGGCAGGTGCCTTTAATCATTACCTCTAGCATTATCACTTACAACCTCAA	166902
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	124373	GGGCAGGTGCCTTTAATCATTACCTCTAGCATTATCACTTACAACCTCAA	124422

C  AL445665.21	166901	AGCAGCTTTTATTTAATTTAGTAAAAGTTTATAAAAATTTAAATTATTGT	166852
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	124423	AGCAGCTTTTATTTAATTTAGTAAAAGTTTATAAAAATTTAAATTATTGT	124472

C  AL445665.21	166851	ATGCATCAAATTAAGATTTAAGATGTCCTTCATAAACATTAACCTTTTGT	166802
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	124473	ATGCATCAAATTAAGATTTAAGATGTCCTTCATAAACATTAACCTTTTGT	124522

C  AL445665.21	166801	TGGTGATGTTTACCAAGAAAGGTAAACTCTGAAAACATGATGTCATCGTT	166752
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	124523	TGGTGATGTTTACCAAGAAAGGTAAACTCTGAAAACATGATGTCATCGTT	124572

C  AL445665.21	166751	TCAATTGGTGGAATTAAGTAAAAGATTTTCAAATGAGGCACTTGAACCTA	166702
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	124573	TCAATTGGTGGAATTAAGTAAAAGATTTTCAAATGAGGCACTTGAACCTA	124622

C  AL445665.21	166701	TTTTCTATCTATGCATGCAGTAGAAAAAAGCACACAAAACAGGCAGCATT	166652
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	124623	TTTTCTATCTATGCATGCAGTAGAAAAAAGCACACAAAACAGGCAGCATT	124672

C  AL445665.21	166651	TTGTGTCATGCGGCATTTCAAACAAGAGGGAAAACACATCTGGAAATAAA	166602
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	124673	TTGTGTCATGCGGCATTTCAAACAAGAGGGAAAACACATCTGGAAATAAA	124722

C  AL445665.21	166601	AGGTGTTTAGCTGAAAGAATTGACCTTAAATAAAACAATTGCAACACTTG	166552
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	124723	AGGTGTTTAGCTGAAAGAATTGACCTTAAATAAAACAATTGCAACACTTG	124772

C  AL445665.21	166551	ATTTGGGCTTCTTACTGGAAATCAAATTCTTTGAGTTTAAAATACACCTA	166502
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	124773	ATTTGGGCTTCTTACTGGAAATCAAATTCTTTGAGTTTAAAATACACCTA	124822

C  AL445665.21	166501	CTAAATGTAATACAAAACCAAAATAACACACTTTCAGCATTTCTCAAAAT	166452
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	124823	CTAAATGTAATACAAAACCAAAATAACACACTTTCAGCATTTCTCAAAAT	124872

C  AL445665.21	166451	GTTAGCACCCAGCAAATGCAGAGTTTACAGTTCTAGTGATTTTCCCTGTT	166402
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	124873	GTTAGCACCCAGCAAATGCAGAGTTTACAGTTCTAGTGATTTTCCCTGTT	124922

C  AL445665.21	166401	CTTTTCATGGAATGCATATCTAACCCGTTTTTCAGCCAGCATGCTACAGC	166352
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	124923	CTTTTCATGGAATGCATATCTAACCCGTTTTTCAGCCAGCATGCTACAGC	124972

C  AL445665.21	166351	AAAGGAAGATTCATGTTGTCCAGGGCTATTTCTTTAAAACAGTATGGAAA	166302
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	124973	AAAGGAAGATTCATGTTGTCCAGGGCTATTTCTTTAAAACAGTATGGAAA	125022

C  AL445665.21	166301	TTACTTTTACCATAAATTAGGTTGTGCTTTAATGCTGAGAAAGGTCTATT	166252
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	125023	TTACTTTTACCATAAATTAGGTTGTGCTTTAATGCTGAGAAAGGTCTATT	125072

C  AL445665.21	166251	TTGCCTTCATTTTGACCCATGACATACTTAGCCTTACAACAGCATAATGA	166202
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	125073	TTGCCTTCATTTTGACCCATGACATACTTAGCCTTACAACAGCATAATGA	125122

C  AL445665.21	166201	GCATAATGAGGTCAAAACTAACACTGCAAAATAAAACACACACCCCCACA	166152
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	125123	GCATAATGAGGTCAAAACTAACACTGCAAAATAAAACACACACCCCCACA	125172

C  AL445665.21	166151	CAAACACACATTATTTCTCAAGGAAGATAAAAAAAAAAAAAGGTCACATT	166102
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	125173	CAAACACACATTATTTCTCAAGGAAGATAAAAAAAAAAAAAGGTCACATT	125222

C  AL445665.21	166101	GATTTTCTTTTTTTTAAAGCGGGACATTCTCACTACTTTTTTCACCTGAA	166052
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	125223	GATTTTCTTTTTTTTAAAGCGGGACATTCTCACTACTTTTTTCACCTGAA	125272

C  AL445665.21	166051	GATTGAAAAGGAAACTCATTTCAGTTTGTAACATTGCACTGACTGTTCCA	166002
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	125273	GATTGAAAAGGAAACTCATTTCAGTTTGTAACATTGCACTGACTGTTCCA	125322

C  AL445665.21	166001	GACACAAAATGAATCAAGTCTCCTGTTGGATTATGTGGTTAGCATTTCTT	165952
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	125323	GACACAAAATGAATCAAGTCTCCTGTTGGATTATGTGGTTAGCATTTCTT	125372

C  AL445665.21	165951	CTCTTCTCTGGTGAGATAATTCGTTACTTAGGACAGCTGTGGTATAAAAA	165902
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	125373	CTCTTCTCTGGTGAGATAATTCGTTACTTAGGACAGCTGTGGTATAAAAA	125422

C  AL445665.21	165901	CTCAAACATTGTCTTTTGCAGAATGGATTTGAAAAGTGGGCCCCCATTCT	165852
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	125423	CTCAAACATTGTCTTTTGCAGAATGGATTTGAAAAGTGGGCCCCCATTCT	125472

C  AL445665.21	165851	ATTTTTGTTAGAAAATAATAAAATCACAAATTTTATCATGTATCAAAAAT	165802
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	125473	ATTTTTGTTAGAAAATAATAAAATCACAAATTTTATCATGTATCAAAAAT	125522

C  AL445665.21	165801	GAAAAGTGAAATATAAATGTGAAAGGTCTGATATTTACTTAATGAATATT	165752
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	125523	GAAAAGTGAAATATAAATGTGAAAGGTCTGATATTTACTTAATGAATATT	125572

C  AL445665.21	165751	TACCAAATACTTAGCATTTGCATATTAAGTACAAGCCTCAGGGAAAAAAA	165702
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AL773524.13	125573	TACCAAATACTTAGCATTTGCATATTAAGTACAAGCCTCAGGGAAAAAAA	125622

Overview

Query
AL445665.21 - 167701 bps
Hit
AL773524.13 - 125622 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
110002000165702167701-11236231256221
Short-link