<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645970.15	1	GAATTCCAGGGGCAGGAAGCAGGAGTGGGTGGGTTGGGGTGCAGGGCAGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	102207	GAATTCCAGGGGCAGGAAGCAGGAGTGGGTGGGTTGGGGTGCAGGGCAGG	102256

AL645970.15	51	GGGAGGATATAGGGGGCTTTGGGGACAGCATTTGAAATGTAAATGAAGAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	102257	GGGAGGATATAGGGGGCTTTGGGGACAGCATTTGAAATGTAAATGAAGAA	102306

AL645970.15	101	TATATCTAACAAAAAAAGAAAAAGAATAGTCTAGTTTCCCTTGAATACTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	102307	TATATCTAACAAAAAAAGAAAAAGAATAGTCTAGTTTCCCTTGAATACTT	102356

AL645970.15	151	AAAAATGTCTCCACAGATTGTATATATATATATATATATATATATATGTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	102357	AAAAATGTCTCCACAGATTGTATATATATATATATATATATATATATGTG	102406

AL645970.15	201	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATATA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	102407	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATATA	102456

AL645970.15	251	TATATATATATATATATATATATATATATATATATACATTATACATGTCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	102457	TATATATATATATATATATATATATATATATATATACATTATACATGTCT	102506

AL645970.15	301	GAATAACAATATTCTGTTCTTCAAAAGACATTGTTACTGTCACTTGTCTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	102507	GAATAACAATATTCTGTTCTTCAAAAGACATTGTTACTGTCACTTGTCTA	102556

AL645970.15	351	AAGGTCAGCTTTACATTTTAGAACTTCACATTTTCAATAGCTTTAAAAGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	102557	AAGGTCAGCTTTACATTTTAGAACTTCACATTTTCAATAGCTTTAAAAGA	102606

AL645970.15	401	TCAATTTTGCAGGCACACTCTGTGATCTCAGATTTTTAATTCCTATCCAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	102607	TCAATTTTGCAGGCACACTCTGTGATCTCAGATTTTTAATTCCTATCCAA	102656

AL645970.15	451	ACATTTCTGATAATTCTATTACTATAGTTTTTGGCAATAATCTATTGAGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	102657	ACATTTCTGATAATTCTATTACTATAGTTTTTGGCAATAATCTATTGAGA	102706

AL645970.15	501	AATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAGAAACAAATAAATAAAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	102707	AATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAGAAACAAATAAATAAAT	102756

AL645970.15	551	AAAAAGGCTACATACAGAATAGCCTAGGATTAATTCAGGAAGTCTTCAGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	102757	AAAAAGGCTACATACAGAATAGCCTAGGATTAATTCAGGAAGTCTTCAGA	102806

AL645970.15	601	AATCTTTTTTTTTTAAATTTTTTTATTTATTTTTATTTTTATTAGGTATT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	102807	AATCTTTTTTTTTTAAATTTTTTTATTTATTTTTATTTTTATTAGGTATT	102856

AL645970.15	651	TTCCTCATTTACATTTCCAATGCTATCCCAAAAGTCCCCCATACCCTTAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	102857	TTCCTCATTTACATTTCCAATGCTATCCCAAAAGTCCCCCATACCCTTAC	102906

AL645970.15	701	CCCCACTTCCCTACCCACTCATTCCCATTTTTTTGGCCCTGGCATTCCCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	102907	CCCCACTTCCCTACCCACTCATTCCCATTTTTTTGGCCCTGGCATTCCCC	102956

AL645970.15	751	TGTACTGGGGCATATAAAGTTTGGGTGTCCAATGGGCCTCTCTTTCCAGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	102957	TGTACTGGGGCATATAAAGTTTGGGTGTCCAATGGGCCTCTCTTTCCAGT	103006

AL645970.15	801	GATGGCTGACTAGGCCATCTTTTGATACATATGCAGCTAGAGTCAAGAGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	103007	GATGGCTGACTAGGCCATCTTTTGATACATATGCAGCTAGAGTCAAGAGC	103056

AL645970.15	851	TCTGGGGTACTGGTTAGTTCATAATGTTGTTGCACCTACAGGGTTGCAGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	103057	TCTGGGGTACTGGTTAGTTCATAATGTTGTTGCACCTACAGGGTTGCAGA	103106

AL645970.15	901	TCTCTTTAGCTCCTTGGATACTTTTTCTAGCTCCTCTATTGGGGGCGCTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	103107	TCTCTTTAGCTCCTTGGATACTTTTTCTAGCTCCTCTATTGGGGGCGCTG	103156

AL645970.15	951	TGTTCCATCCAATAGCTGACTGTGAGCATTTACTTATGTGTTTTCTAGGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	103157	TGTTCCATCCAATAGCTGACTGTGAGCATTTACTTATGTGTTTTCTAGGC	103206

AL645970.15	1001	GCTGACCTAGTCTCACAAAAGACAGCTATATCAGGGTCCTTTCAGCTAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	103207	GCTGACCTAGTCTCACAAAAGACAGCTATATCAGGGTCCTTTCAGCTAAA	103256

AL645970.15	1051	TCTTGGTAGTGTATGCAATGGTGTCATCGTTTGGAGGCTAAATATGGGAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	103257	TCTTGGTAGTGTATGCAATGGTGTCATCGTTTGGAGGCTAAATATGGGAT	103306

AL645970.15	1101	GGATCCCTAGATATGGCAGTCTCTAGATGGTCCATCCTTTTGTCTCAGCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	103307	GGATCCCTAGATATGGCAGTCTCTAGATGGTCCATCCTTTTGTCTCAGCT	103356

AL645970.15	1151	CCAAACTTTGTCTCTGTAACTCCTTCCATGGGTCATTGTTTCCAATTCTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	103357	CCAAACTTTGTCTCTGTAACTCCTTCCATGGGTCATTGTTTCCAATTCTA	103406

AL645970.15	1201	AGAAGGGGCAAAGTGTCCACACTTTGGTCTTCGTTCTTCTTCAGTTTCAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	103407	AGAAGGGGCAAAGTGTCCACACTTTGGTCTTCGTTCTTCTTCAGTTTCAT	103456

AL645970.15	1251	GTGTTTTGCAAATTGTATCTTATATCTCGGGTATACTAAGTTTCTGGATA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	103457	GTGTTTTGCAAATTGTATCTTATATCTCGGGTATACTAAGTTTCTGGATA	103506

AL645970.15	1301	CATATGCAGCTAGAGTCAAGAGCTCCGGGGTAGTGGTTATTGTTGTTCTA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	103507	CATATGCAGCTAGAGTCAAGAGCTCCGGGGTAGTGGTTATTGTTGTTCTA	103556

AL645970.15	1351	CCTATAGGGTTGCAGATCCCTTTAGCTCCTTGGGTACTTTCTCCAGCTCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	103557	CCTATAGGGTTGCAGATCCCTTTAGCTCCTTGGGTACTTTCTCCAGCTCC	103606

AL645970.15	1401	TCCATTGGGGGCCCTGTGATCCATCTAATAGCTGACTTCAGAAATCTGAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	103607	TCCATTGGGGGCCCTGTGATCCATCTAATAGCTGACTTCAGAAATCTGAA	103656

AL645970.15	1451	TGTGATTTCTCATTCAGTGGGGGGATTGCAGGTCATAGGGAGGTGTGAAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	103657	TGTGATTTCTCATTCAGTGGGGGGATTGCAGGTCATAGGGAGGTGTGAAC	103706

AL645970.15	1501	TGCATATTTTACATAAATTCAGAGAAATGGCTACATTTCTGATTTACACT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	103707	TGCATATTTTACATAAATTCAGAGAAATGGCTACATTTCTGATTTACACT	103756

AL645970.15	1551	AAAAAACAATATCTACATATTTTGGAATAAATGGAAAAAAGGTAAAGATT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	103757	AAAAAACAATATCTACATATTTTGGAATAAATGGAAAAAAGGTAAAGATT	103806

AL645970.15	1601	TAAATTTTAAATTTTGACTTATTTCTGTGTATAAGACTTTTGTTCACATA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	103807	TAAATTTTAAATTTTGACTTATTTCTGTGTATAAGACTTTTGTTCACATA	103856

AL645970.15	1651	TTTACCTATTCACCACATTGTACCAAGTGTCTGTGCAGGTCACATGAGGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	103857	TTTACCTATTCACCACATTGTACCAAGTGTCTGTGCAGGTCACATGAGGG	103906

AL645970.15	1701	AATTAGATCCCTTGAAACTGGAGTTAGAGATAGATGTGAACTACCACATG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	103907	AATTAGATCCCTTGAAACTGGAGTTAGAGATAGATGTGAACTACCACATG	103956

AL645970.15	1751	AGGGTTGGAAACCACTGAGATATCTCTCTAGCTAGCAGGATTTTCTGTAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	103957	AGGGTTGGAAACCACTGAGATATCTCTCTAGCTAGCAGGATTTTCTGTAA	104006

AL645970.15	1801	TGATCACCAAATGATTTTTTAAAAAATTATTTTCATCAGAAACAAAATAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	104007	TGATCACCAAATGATTTTTTAAAAAATTATTTTCATCAGAAACAAAATAT	104056

AL645970.15	1851	CTATAGTTTTGTTTTGCTTGCCTTTTTAGAAAAAAAATTATTTACTTCAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	104057	CTATAGTTTTGTTTTGCTTGCCTTTTTAGAAAAAAAATTATTTACTTCAA	104106

AL645970.15	1901	ACAGAAAAGCCCACAAAAATTCATTTATTTTTTTCTCAGACCTCAGACAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	104107	ACAGAAAAGCCCACAAAAATTCATTTATTTTTTTCTCAGACCTCAGACAC	104156

AL645970.15	1951	TTGCTAGTGCGATGCCAGAAGTTTATATTAAATTGTTATTAATTCTGAAT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772247.19	104157	TTGCTAGTGCGATGCCAGAAGTTTATATTAAATTGTTATTAATTCTGAAT	104206

Overview

Query
AL645970.15 - 141160 bps
Hit
AL772247.19 - 104206 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link