<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX322637.7	176564	GAATTCACAGACAGTGTCGCCGAACCTGGCTGGGGATATGGGGAAGTCAA	176613
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	1	GAATTCACAGACAGTGTCGCCGAACCTGGCTGGGGATATGGGGAAGTCAA	50

BX322637.7	176614	GAAAGCGGACTTTGTCGACTTTGCGCATATCAGCCAGGGGTGGCGCTCCT	176663
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	51	GAAAGCGGACTTTGTCGACTTTGCGCATATCAGCCAGGGGTGGCGCTCCT	100

BX322637.7	176664	GGACCACTAATGTGGACATCGTCCTTCCCAACGCACACGCAGCGGACTCA	176713
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	101	GGACCACTAATGTGGACATCGTCCTTCCCAACGCACACGCAGCGGACTCA	150

BX322637.7	176714	GTAGTCCGAAGAGCTAAGTCGGCGGCGGTGCGAAGCTCGTAAGCCTGGGT	176763
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	151	GTAGTCCGAAGAGCTAAGTCGGCGGCGGTGCGAAGCTCGTAAGCCTGGGT	200

BX322637.7	176764	TGGACCCACCCTCGTGCAGCTCGGCCAGCGCCTGCGCTTGGTAGCGCTAG	176813
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	201	TGGACCCACCCTCGTGCAGCTCGGCCAGCGCCTGCGCTTGGTAGCGCTAG	250

BX322637.7	176814	TAGGTGGCTATCGCATGCAAGGCTGAAGCAGCCTGGCCCGCAGCTATGTA	176863
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	251	TAGGTGGCTATCGCATGCAAGGCTGAAGCAGCCTGGCCCGCAGCTATGTA	300

BX322637.7	176864	AGCTCTAGCTCCGAGGGAGGTAGATAACTTACAGGCTTTGGATGGGAGAC	176913
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	301	AGCTCTAGCTCCGAGGGAGGTAGATAACTTACAGGCTTTGGATGGGAGAC	350

BX322637.7	176914	GAGGCGGATCCCGCCAAGAAGAGGCGCCGCGCGGATTTACCGCCATCGCG	176963
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	351	GAGGCGGATCCCGCCAAGAAGAGGCGCCGCGCGGATTTACCGCCATCGCG	400

BX322637.7	176964	CACTCAACCTGAGGAATCGCCACATACCCCCTGGCTGTTTCACCGTCAAG	177013
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	401	CACTCAACCTGAGGAATCGCCACATACCCCCTGGCTGTTTCACCGTCAAG	450

BX322637.7	177014	AGTGGTTAGGGTGGAGGAACACGCAGCACGAGCAGAAAAAAGTGCTTTAC	177063
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	451	AGTGGTTAGGGTGGAGGAACACGCAGCACGAGCAGAAAAAAGTGCTTTAC	500

BX322637.7	177064	AAGACCGCGTGAGCCTACTGTGCACCTCCGGGAAGAAGGGAACGCCCCTC	177113
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	501	AAGACCGCGTGAGCCTACTGTGCACCTCCGGGAAGAAGGGAACGCCCCTC	550

BX322637.7	177114	TAGTCGGTCCGGCCGCGGAGCTGGGGGATAAACCATCTCCAACCCACGGC	177163
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	551	TAGTCGGTCCGGCCGCGGAGCTGGGGGATAAACCATCTCCAACCCACGGC	600

BX322637.7	177164	CGAAGCAGCCCGGGAAAGCACGGCTAACATGTCCGTTTCAGGATCCGTAG	177213
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	601	CGAAGCAGCCCGGGAAAGCACGGCTAACATGTCCGTTTCAGGATCCGTAG	650

BX322637.7	177214	TGACAGCGCTCACCAGCCCGAAGGGGGCGAGCGGGTCTGGATCATCATCG	177263
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	651	TGACAGCGCTCACCAGCCCGAAGGGGGCGAGCGGGTCTGGATCATCATCG	700

BX322637.7	177264	GACAATGAAAGCCCACCCTCCGATGCCGCGGTGGACATCTGGTCTCCGGT	177313
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	701	GACAATGAAAGCCCACCCTCCGATGCCGCGGTGGACATCTGGTCTCCGGT	750

BX322637.7	177314	GTCATCGGGCGTAAGGGCTACCATCTGTTAGACGGATCGCTTCCCCCGCC	177363
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	751	GTCATCGGGCGTAAGGGCTACCATCTGTTAGACGGATCGCTTCCCCCGCC	800

BX322637.7	177364	CGAAGCTTGGATGGAGCGCTTAGAGGAGCGGGAGGTCCGCGGGCCCGTGG	177413
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	801	CGAAGCTTGGATGGAGCGCTTAGAGGAGCGGGAGGTCCGCGGGCCCGTGG	850

BX322637.7	177414	GCGACGGATTATCTCTCGCTGAAACCCTCAGATCTGCCCGAGTGCCCGCT	177463
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	851	GCGACGGATTATCTCTCGCTGAAACCCTCAGATCTGCCCGAGTGCCCGCT	900

BX322637.7	177464	GCAGAGCAGGGGACAACTGGGGTGGTTCACCCTTTTGCAAAGGCTAACCG	177513
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	901	GCAGAGCAGGGGACAACTGGGGTGGTTCACCCTTTTGCAAAGGCTAACCG	950

BX322637.7	177514	CGATCTTGTGCAACAGTCATGGCATCGCAATGACGACATGAACTGCCCGT	177563
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	951	CGATCTTGTGCAACAGTCATGGCATCGCAATGACGACATGAACTGCCCGT	1000

BX322637.7	177564	GAGCAGCGCATTAACATGCTGGACCCCCAGACATGTAACGCAGTGCCCGC	177613
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	1001	GAGCAGCGCATTAACATGCTGGACCCCCAGACATGTAACGCAGTGCCCGC	1050

BX322637.7	177614	GCCCATCATCCGAGGACAGGAAACCACCGCATCCAGAAACGCACAGTCGG	177663
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	1051	GCCCATCATCCGAGGACAGGAAACCACCGCATCCAGAAACGCACAGTCGG	1100

BX322637.7	177664	AGCGCCGTCCTGATAAGGACGTGCTGCACGACTGTGTTGCTCTTTCTGTG	177713
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	1101	AGCGCCGTCCTGATAAGGACGTGCTGCACGACTGTGTTGCTCTTTCTGTG	1150

BX322637.7	177714	AAGTTTGCAACTTTATACGCACCGCTCTGGAGGACCGGACCCAAAGAACG	177763
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	1151	AAGTTTGCAACTTTATACGCACCGCTCTGGAGGACCGGACCCAAAGAACG	1200

BX322637.7	177764	CCAGGCAAGGGAGAAACCCAGCTCGACCGTCTGCCACTGCGTGTACACAC	177813
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	1201	CCAGGCAAGGGAGAAACCCAGCTCGACCGTCTGCCACTGCGTGTACACAC	1250

BX322637.7	177814	TCTGGACCGGGAGAATGCTCTCGTTCGCTCAGAATCGCTGGTCACAGCAG	177863
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	1251	TCTGGACCGGGAGAATGCTCTCGTTCGCTCAGAATCGCTGGTCACAGCAG	1300

BX322637.7	177864	GAGGAACCCTCATCGACTCGATCAGAAAGTCTCTGAAGCGAAAAGGATAG	177913
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	1301	GAGGAACCCTCATCGACTCGATCAGAAAGTCTCTGAAGCGAAAAGGATAG	1350

BX322637.7	177914	CGTCTGCTGGCGCCAGGTGAGCTTATATACTCAGTTGATTGCTTATGCCG	177963
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	1351	CGTCTGCTGGCGCCAGGTGAGCTTATATACTCAGTTGATTGCTTATGCCG	1400

BX322637.7	177964	CTCACCTGCGCAGGCTTGCGCTGCCAATTCATTCTTAATTGGCCCGTTCA	178013
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	1401	CTCACCTGCGCAGGCTTGCGCTGCCAATTCATTCTTAATTGGCCCGTTCA	1450

BX322637.7	178014	ATACTCTTTCAGACGAGTAGCTTCTGAACCGAACCTCCCAATGCGTGGAT	178063
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	1451	ATACTCTTTCAGACGAGTAGCTTCTGAACCGAACCTCCCAATGCGTGGAT	1500

BX322637.7	178064	TTTACAAATCAAATCCACTTATAGTGCTGAAGTTCCCCCCGAAGGGGAAC	178113
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	1501	TTTACAAATCAAATCCACTTATAGTGCTGAAGTTCCCCCCGAAGGGGAAC	1550

BX322637.7	178114	TCTTGTTATACGTGTCTGACCCTTGTACCTCTATTCCTTTGGTGTTGAAA	178163
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	1551	TCTTGTTATACGTGTCTGACCCTTGTACCTCTATTCCTTTGGTGTTGAAA	1600

BX322637.7	178164	TTGCTAGCAGACTTCGGCCTGATCTCAGGATATAAATTAAATTTGAGTAA	178213
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	1601	TTGCTAGCAGACTTCGGCCTGATCTCAGGATATAAATTAAATTTGAGTAA	1650

BX322637.7	178214	AAGTGAATTAATGCCTATTAATACAGCAGCCTTGGATTACCCATTAGGTT	178263
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	1651	AAGTGAATTAATGCCTATTAATACAGCAGCCTTGGATTACCCATTAGGTT	1700

BX322637.7	178264	CTCTACCTTTCAAATCCTCCTTACAAAGTTTCAAATATTTGGGCATAAAT	178313
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	1701	CTCTACCTTTCAAATCCTCCTTACAAAGTTTCAAATATTTGGGCATAAAT	1750

BX322637.7	178314	ATCACAAAAAGCTTTTCGGACTTATTTGACCTCAACTTTGTCCCATTAGT	178363
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	1751	ATCACAAAAAGCTTTTCGGACTTATTTGACCTCAACTTTGTCCCATTAGT	1800

BX322637.7	178364	GAATAATCTTGCACAGGATTTTAATCGATGGTCTCTCCTCCCCTTATCTT	178413
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	1801	GAATAATCTTGCACAGGATTTTAATCGATGGTCTCTCCTCCCCTTATCTT	1850

BX322637.7	178414	TGATCGGTAGGGTTAACTGTATTAAGATGAATGTACTTCCTAGATTTCTT	178463
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	1851	TGATCGGTAGGGTTAACTGTATTAAGATGAATGTACTTCCTAGATTTCTT	1900

BX322637.7	178464	TACTTATTTCAATGTATTCCTATTTTTATTCCAAAATCTTTTTTTGTTTC	178513
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	1901	TACTTATTTCAATGTATTCCTATTTTTATTCCAAAATCTTTTTTTGTTTC	1950

BX322637.7	178514	ACTTGATTGCTCTATTTCTAGTTTTCTCTGGAACAGAAAAACCCCAAAGA	178563
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL772198.14	1951	ACTTGATTGCTCTATTTCTAGTTTTCTCTGGAACAGAAAAACCCCAAAGA	2000

Overview

Query
BX322637.7 - 178563 bps
Hit
AL772198.14 - 211682 bps
Total alignments
23
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100199820001765641785631120001
283.82234746206462537-1825441
387.3859710156100862022-154515511
498.48188198172107172304-1134115381
586.24166305145269145573-1623265291
688.621852919970299992111534118321
787.2121236614801845-111534118851
885.18173353145266145618-111534118841
985.42194383145266145648-165110655001
1089.171943069969299997165131654531
1189.7524637614801855-165131655011
1285.68185362151218151579-165131655001
1384.1817236814526514563211010931014651
1485.5619036815121715158411010931014661
1589.382413741487186011011001014661
1688.541953119968799997-11011441014661
1782.7715836716462516499111701971705501
1888.0822237314871859-11771441775121
1990.462313369969810003311771541774991
2087.96207349145272145620-11771561775121
2190234351151221151571-11771561775151
2287.33194377175581793411787361791141
2391.418561213766027781412087742100171
Short-link