<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662848.6	1	GAATTCAGTCTCCACCCTGCTTTCTGCTTCAGTAAGTTGTCCCAAATGGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	69419	GAATTCAGTCTCCACCCTGCTTTCTGCTTCAGTAAGTTGTCCCAAATGGA	69468

AL662848.6	51	CGGTATCAATGAAAGTCACAGTTTTTATTGAGAAAGTCCTCTCGCCGGGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	69469	CGGTATCAATGAAAGTCACAGTTTTTATTGAGAAAGTCCTCTCGCCGGGC	69518

AL662848.6	101	GCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCAGTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	69519	GCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCAGTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTG	69568

AL662848.6	151	GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	69569	GATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAA	69618

AL662848.6	201	AAATACAAAAAAAATTAGCCGGGCGCGGTGGCGGGCGCTTGTAGTCACAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	69619	AAATACAAAAAAAATTAGCCGGGCGCGGTGGCGGGCGCTTGTAGTCACAG	69668

AL662848.6	251	CTGCTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCAGAGC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	69669	CTGCTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCAGAGC	69718

AL662848.6	301	TTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	69719	TTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGC	69768

AL662848.6	351	AAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAAAAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	69769	AAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAAAAAA	69818

AL662848.6	401	AAAGAAAGTCCTCTCTACACGACTGCTCTGTCCTCATCTTTTTGAGCTTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	69819	AAAGAAAGTCCTCTCTACACGACTGCTCTGTCCTCATCTTTTTGAGCTTG	69868

AL662848.6	451	GAGGTGATCACAACAGAGCTGTGGGTACTAAGGCACTGCACTATTCTTTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	69869	GAGGTGATCACAACAGAGCTGTGGGTACTAAGGCACTGCACTATTCTTTC	69918

AL662848.6	501	TGATTTCCCTACACCCTGCCTACTTCTTTGTAATTATCACTTTATTAAAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	69919	TGATTTCCCTACACCCTGCCTACTTCTTTGTAATTATCACTTTATTAAAC	69968

AL662848.6	551	TCTCCCCCAAATTATCCTAATTTCACTGTGCTATTCATTTCCTGCTAGGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	69969	TCTCCCCCAAATTATCCTAATTTCACTGTGCTATTCATTTCCTGCTAGGA	70018

AL662848.6	601	CCATGAATAGAGACACTTACCACACAAAGCAATGTGCTACAAGCTATGGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	70019	CCATGAATAGAGACACTTACCACACAAAGCAATGTGCTACAAGCTATGGG	70068

AL662848.6	651	GTTCATTGGAAGTGTAAGAGGCCAGACTCGGTGGCTCACGCCTGTAATCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	70069	GTTCATTGGAAGTGTAAGAGGCCAGACTCGGTGGCTCACGCCTGTAATCC	70118

AL662848.6	701	CAGCAATTCGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACTTTAGACCAGAAGCTGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	70119	CAGCAATTCGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACTTTAGACCAGAAGCTGG	70168

AL662848.6	751	AGACCAGAATGGCCAACGTGGTGAAACCCCATTTCTACTAAAAAATTTTA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	70169	AGACCAGAATGGCCAACGTGGTGAAACCCCATTTCTACTAAAAAATTTTA	70218

AL662848.6	801	AAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTATGCGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	70219	AAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTATGCGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGA	70268

AL662848.6	851	GGCTGAGGCAGGAGAATCCACTGGGTGATGGAGCAAGATTCTGTCTCAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	70269	GGCTGAGGCAGGAGAATCCACTGGGTGATGGAGCAAGATTCTGTCTCAAA	70318

AL662848.6	901	CAAAAAAATAAATAAATAAAATACAAGGAAGTGTAAGAAAAGATCCCTAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	70319	CAAAAAAATAAATAAATAAAATACAAGGAAGTGTAAGAAAAGATCCCTAA	70368

AL662848.6	951	TCTCTAGATGTTTAACCTGAGGCATTTAAATAGTACCACTCATGAAGAGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	70369	TCTCTAGATGTTTAACCTGAGGCATTTAAATAGTACCACTCATGAAGAGG	70418

AL662848.6	1001	GAGTGTAGCTGAGTGCTACATGGTGCTCTACAGACAGCAGGTATGGTAAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	70419	GAGTGTAGCTGAGTGCTACATGGTGCTCTACAGACAGCAGGTATGGTAAG	70468

AL662848.6	1051	AAATCAAGGTCTCTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACAGCTGTAATCCCAGCA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	70469	AAATCAAGGTCTCTGGCTGGGCGCAGTGGCTCACAGCTGTAATCCCAGCA	70518

AL662848.6	1101	CTTGGGAGGCCGAGGCAGTTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	70519	CTTGGGAGGCCGAGGCAGTTGGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCA	70568

AL662848.6	1151	GCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCGTCTCCACTTAAAAGACAAAAATTAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	70569	GCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCGTCTCCACTTAAAAGACAAAAATTAG	70618

AL662848.6	1201	CCAGGTGTGGTGGCAGGAGCCTGTAATCCCAGCTTCTCGGGAGGCTGAGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	70619	CCAGGTGTGGTGGCAGGAGCCTGTAATCCCAGCTTCTCGGGAGGCTGAGG	70668

AL662848.6	1251	CAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCGATAAGCTGAGATC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	70669	CAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCGATAAGCTGAGATC	70718

AL662848.6	1301	TCGCCACTGGACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCGTCTCAAAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	70719	TCGCCACTGGACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCGTCTCAAAAA	70768

AL662848.6	1351	AAAAAAAAAGGAGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTTATCCCAGCACTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	70769	AAAAAAAAAGGAGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTTATCCCAGCACTA	70818

AL662848.6	1401	TGGGAGGCCTAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGGGTTAGAGACCAGCCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	70819	TGGGAGGCCTAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGGGTTAGAGACCAGCCT	70868

AL662848.6	1451	GACCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	70869	GACCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGG	70918

AL662848.6	1501	GTGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACTACTTGGGAGGCTGAGGCAGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	70919	GTGTGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAACTACTTGGGAGGCTGAGGCAGG	70968

AL662848.6	1551	AGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTAAGCCGAGATCGCGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	70969	AGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTAAGCCGAGATCGCGC	71018

AL662848.6	1601	CACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAACAAGACTCCATCTCAACAACAAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	71019	CACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAACAAGACTCCATCTCAACAACAAC	71068

AL662848.6	1651	AACAAAAAAAAAAGGAGCCGGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	71069	AACAAAAAAAAAAGGAGCCGGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGC	71118

AL662848.6	1701	ACTTTGCGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	71119	ACTTTGCGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGAC	71168

AL662848.6	1751	CAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAATTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	71169	CAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAATTA	71218

AL662848.6	1801	GCTGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAAGCTGAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	71219	GCTGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAAGCTGAG	71268

AL662848.6	1851	GCAGGAGAATCACTTGAACCCGAGAGGCGGAGGCTGCAGTGAGCCGAGAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	71269	GCAGGAGAATCACTTGAACCCGAGAGGCGGAGGCTGCAGTGAGCCGAGAT	71318

AL662848.6	1901	CACGCCATTGAACCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	71319	CACGCCATTGAACCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAA	71368

AL662848.6	1951	AAAAAAAAAAAAAAATGGAAAGAAAGAAATCAGGGCCTCCGGGACATGGA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732442.7	71369	AAAAAAAAAAAAAAATGGAAAGAAAGAAATCAGGGCCTCCGGGACATGGA	71418

Overview

Query
AL662848.6 - 185617 bps
Hit
AL732442.7 - 71418 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link