<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 450 bps

Full alignment

BX004827.19	1	GGATGATTTTACAAAGTACCTTCTTAAGGGCGGGGGAGGATATTACAAAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	216720	GGATGATTTTACAAAGTACCTTCTTAAGGGCGGGGGAGGATATTACAAAG	216769

BX004827.19	51	TACCTTCTCAAGGGTGGGGAGGGTGTGTTGTACAAAATACATTCACAAGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	216770	TACCTTCTCAAGGGTGGGGAGGGTGTGTTGTACAAAATACATTCACAAGG	216819

BX004827.19	101	GTGGGGGACTATCAGAAAGTACATTATCACAAGGGCGGGGAGGGTGTATT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	216820	GTGGGGGACTATCAGAAAGTACATTATCACAAGGGCGGGGAGGGTGTATT	216869

BX004827.19	151	GTCACAAAGTCAATTGATCAGTTAGGGTTGGGCAGGAACAAATCACAATG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	216870	GTCACAAAGTCAATTGATCAGTTAGGGTTGGGCAGGAACAAATCACAATG	216919

BX004827.19	201	GTGGAATGTCATCAGTTAAGACAGGAACTGGCTATTTTCACTTCTTTTGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	216920	GTGGAATGTCATCAGTTAAGACAGGAACTGGCTATTTTCACTTCTTTTGT	216969

BX004827.19	251	GGGTCTTCAATTGCTTCAGGCCACCTGGATGTATACGTGCAGGTCACAGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	216970	GGGTCTTCAATTGCTTCAGGCCACCTGGATGTATACGTGCAGGTCACAGG	217019

BX004827.19	301	GGATATGATGGCTTAGCTTGGGCTCAGAGGCCTGACAGGCACTGCTTACT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	217020	GGATATGATGGCTTAGCTTGGGCTCAGAGGCCTGACAGGCACTGCTTACT	217069

BX004827.19	351	CACTGATGAGTCTCCGTTGGGGATTACTTCCAGGACTCCCTCAGCAGGGG	400
			|||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||
AL732314.18	217070	CACTGATGAGTCTCCGTTGGGACTTACTTCCAGGACTCCATCAGCAGGGG	217119

BX004827.19	401	ATTTTTCTGCTTCAAGGGCTCATGCTGGGCACATGAATGGAAGGGTTGAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	217120	ATTTTTCTGCTTCAAGGGCTCATGCTGGGCACATGAATGGAAGGGTTGAT	217169

BX004827.19	451	TCCTCCTGGAGGCGTCGAGGGAGATGCCTCCAAAAGGAGGAACTGACTCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	217170	TCCTCCTGGAGGCGTCGAGGGAGATGCCTCCAAAAGGAGGAACTGACTCT	217219

BX004827.19	501	CTTTGACCAACGTCACATGATAGCAACCTGCCAGGAACCAGGAACCAGAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	217220	CTTTGACCAACGTCACATGATAGCAACCTGCCAGGAACCAGGAACCAGAG	217269

BX004827.19	551	ACACGTATCCAACCAAAAGGCACCTGCCTCTTCCCCAGCTCCTGCTGGTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	217270	ACACGTATCCAACCAAAAGGCACCTGCCTCTTCCCCAGCTCCTGCTGGTT	217319

BX004827.19	601	TGTGGGGCAACCCTGGGAGTCCTTGTCTTGCAAATGTGTTGTCTAGCTCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	217320	TGTGGGGCAACCCTGGGAGTCCTTGTCTTGCAAATGTGTTGTCTAGCTCT	217369

BX004827.19	651	CCTCCTGAATGAGGCATCACCTGCATTCTCCACCTGCGTTCTTTGGAAGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	217370	CCTCCTGAATGAGGCATCACCTGCATTCTCCACCTGCGTTCTTTGGAAGA	217419

BX004827.19	701	GCTTTGCAGCCTCTCAGGAGAGCTGCTCACCTGTCCCCCCTGCCTGCTCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	217420	GCTTTGCAGCCTCTCAGGAGAGCTGCTCACCTGTCCCCCCTGCCTGCTCA	217469

BX004827.19	751	TTGCCCTGTGCAAACCAGAGTCCTGAGACACTCCCCAAAGGTTGGTCCCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	217470	TTGCCCTGTGCAAACCAGAGTCCTGAGACACTCCCCAAAGGTTGGTCCCT	217519

BX004827.19	801	ACCAACCCAGGTTGCCTCTTATTTCTTGCAACAAGACAGCAAAAGACGCT	850
			|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	217520	ACCAACCCAGGTTGCCTCTTGTTTCTTGCAACAAGACAGCAAAAGACGCT	217569

BX004827.19	851	GCAGAAGGATCGCTTACCTTGTTTGGAAAGAGAGCCCACCCTTTCACCTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	217570	GCAGAAGGATCGCTTACCTTGTTTGGAAAGAGAGCCCACCCTTTCACCTC	217619

BX004827.19	901	GCTGGCAAACATTTTCTTGTGTCCTAATGAGAACCCCAAGGAATACCCCG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	217620	GCTGGCAAACATTTTCTTGTGTCCTAATGAGAACCCCAAGGAATACCCCG	217669

BX004827.19	951	GGATGTGAGGAGAGGGAGCGTCCGCCCGGCGGCCCGCCCCAAGGAGCCTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	217670	GGATGTGAGGAGAGGGAGCGTCCGCCCGGCGGCCCGCCCCAAGGAGCCTG	217719

BX004827.19	1001	AGGCTGTCCTGCACACATCACCACACACACTCTCTGCATTGCAGTCCCAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	217720	AGGCTGTCCTGCACACATCACCACACACACTCTCTGCATTGCAGTCCCAT	217769

BX004827.19	1051	GTTTATAGAGAAGATTACAGGTGAGTTTCCAAAATCCCAGCCCATGCTGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	217770	GTTTATAGAGAAGATTACAGGTGAGTTTCCAAAATCCCAGCCCATGCTGC	217819

BX004827.19	1101	CCCTACCTGACGATGTTTGATTTCCGAATTCCTTTAATTTCAGCAAATGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	217820	CCCTACCTGACGATGTTTGATTTCCGAATTCCTTTAATTTCAGCAAATGG	217869

BX004827.19	1151	ATATTGGCTGTGGGTCAGCATAGATTTTTTCCGGTTATTTAAACAACATT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	217870	ATATTGGCTGTGGGTCAGCATAGATTTTTTCCGGTTATTTAAACAACATT	217919

BX004827.19	1201	TCAGATGCTTTTCCTGGCATCATTAGCTGAATGCTTCTACTGACAGCTGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	217920	TCAGATGCTTTTCCTGGCATCATTAGCTGAATGCTTCTACTGACAGCTGG	217969

BX004827.19	1251	AATCATTCAAACATCTGAGACAAGAGAGTGAACAGGACGTTCACTTGTTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	217970	AATCATTCAAACATCTGAGACAAGAGAGTGAACAGGACGTTCACTTGTTA	218019

BX004827.19	1301	CCGTGTCTCCTCGCTTCTCAACCACCACCCCTGAAATTCGCAGACTGTCA	1350
			|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	218020	CCGTATCTCCTCGCTTCTCAACCACCACCCCTGAAATTCGCAGACTGTCA	218069

BX004827.19	1351	CTCTGGGGAGCCTGTGAACGTGGCTGAACGCAAACGGATTTAAAACTTGA	1400
			  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	218070	--CTGGGGAGCCTGTGAACGTGGCTGAACGCAAACGGATTTAAAACTTGA	218117

BX004827.19	1401	CAGGTGTTTCCAGCATGGAAAGGAACAAGGACTATAACGGCG------AA	1444
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||
AL732314.18	218118	CAGGTGTTTCCAGCATGGAAAGGAACAAGGACTATAACGGCGAATAATAA	218167

BX004827.19	1445	TAATAATAATAATAATAAAAGACAAATTAGGGATCAAGATCCAGTCTGTT	1494
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	218168	TAATAATAATAATAATAAAAGACAAATTAGGGATCAAGATCCAGTCTGTT	218217

BX004827.19	1495	TTTGTCTCATTTATAGTCTTTTCTCCAAGAGGTTGTAGGCTGGTACCATT	1544
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	218218	TTTGTCTCATTTATAGTCTTTTCTCCAAGAGGTTGTAGGCTGGTACCATT	218267

BX004827.19	1545	TCACTAGGTTAAAAGCCTACGGTGTCAAGAGGTGCTAAGCTTTGCTGCTG	1594
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	218268	TCACTAGGTTAAAAGCCTACGGTGTCAAGAGGTGCTAAGCTTTGCTGCTG	218317

BX004827.19	1595	TCTCTTGCTTGGCAAGACAAGCTCCGAGTCTTTCTGGAACTGACAATTGT	1644
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	218318	TCTCTTGCTTGGCAAGACAAGCTCCGAGTCTTTCTGGAACTGACAATTGT	218367

BX004827.19	1645	GTG-GGGCATTTTCTTGTTTCTGGGGTTCTTTGCATGCATAGGGGCTGAT	1693
			||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	218368	GTGTGGGCATTTTCTTGTTTCTGGGGTTCTTTGCATGCATAGGGGCTGAT	218417

BX004827.19	1694	CTTTGATATCCACTCTGGACTCCTCTCTGCAAACCTCTGGACATGCCACA	1743
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	218418	CTTTGATATCCACTCTGGACTCCTCTCTGCAAACCTCTGGACATGCCACA	218467

BX004827.19	1744	GACAGCAGCTGTAACGTAGTGGGGTCAGCCTGCTTACAACCCACGTACCA	1793
			||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||
AL732314.18	218468	GACAGCAGCTGTAACTTACTGAGGTCAACCTGCTTACAACCCACGTACCA	218517

BX004827.19	1794	ACCCCATGGAGGTGATTGTCGTATGACTAACAGCAGGCAGTTAAGGAGAA	1843
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	218518	ACCCCATGGAGGTGATTGTCGTATGACTAACAGCAGGCAGTTAAGGAGAA	218567

BX004827.19	1844	AGTCATGCTTTACAAACGAGTCTGTGACTAGAAATCACAGGACCTGATGA	1893
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	218568	AGTCATGCTTTACAAACGAGTCTGTGACTAGAAATCACAGGACCTGATGA	218617

BX004827.19	1894	ATCCCTCAGAAACCCAAGAGGGATGGACTAACATTAAGGGGGTTGTGGAC	1943
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
AL732314.18	218618	ATCCCTCAGAAACCCAAGAGGGATGGACTAACATTAA-GGGGTTGTGGAC	218666

BX004827.19	1944	TGTCCAGCCGTGCAGGGACGGTCTCCAAGAAGATGCTTTAGACACAACGG	1993
			||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	218667	TGTCCAGCCGTGCAGGGACAGTCTCCAAGAAGATGCTTTAGACACAACGG	218716

BX004827.19	1994	TGAATTC	2000
			|||||||
AL732314.18	218717	TGAATTC	218723

Compact alignment

skip 350 bps 100% identity alignment

BX004827.19	351	CACTGATGAGTCTCCGTTGGGGATTACTTCCAGGACTCCCTCAGCAGGGG	400
			|||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||
AL732314.18	217070	CACTGATGAGTCTCCGTTGGGACTTACTTCCAGGACTCCATCAGCAGGGG	217119

skip 400 bps 100% identity alignment

BX004827.19	801	ACCAACCCAGGTTGCCTCTTATTTCTTGCAACAAGACAGCAAAAGACGCT	850
			|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	217520	ACCAACCCAGGTTGCCTCTTGTTTCTTGCAACAAGACAGCAAAAGACGCT	217569

skip 450 bps 100% identity alignment

BX004827.19	1301	CCGTGTCTCCTCGCTTCTCAACCACCACCCCTGAAATTCGCAGACTGTCA	1350
			|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	218020	CCGTATCTCCTCGCTTCTCAACCACCACCCCTGAAATTCGCAGACTGTCA	218069

BX004827.19	1351	CTCTGGGGAGCCTGTGAACGTGGCTGAACGCAAACGGATTTAAAACTTGA	1400
			  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	218070	--CTGGGGAGCCTGTGAACGTGGCTGAACGCAAACGGATTTAAAACTTGA	218117

BX004827.19	1401	CAGGTGTTTCCAGCATGGAAAGGAACAAGGACTATAACGGCG------AA	1444
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||
AL732314.18	218118	CAGGTGTTTCCAGCATGGAAAGGAACAAGGACTATAACGGCGAATAATAA	218167

skip 200 bps 100% identity alignment

BX004827.19	1645	GTG-GGGCATTTTCTTGTTTCTGGGGTTCTTTGCATGCATAGGGGCTGAT	1693
			||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	218368	GTGTGGGCATTTTCTTGTTTCTGGGGTTCTTTGCATGCATAGGGGCTGAT	218417

skip 50 bps 100% identity alignment

BX004827.19	1744	GACAGCAGCTGTAACGTAGTGGGGTCAGCCTGCTTACAACCCACGTACCA	1793
			||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||
AL732314.18	218468	GACAGCAGCTGTAACTTACTGAGGTCAACCTGCTTACAACCCACGTACCA	218517

skip 100 bps 100% identity alignment

BX004827.19	1894	ATCCCTCAGAAACCCAAGAGGGATGGACTAACATTAAGGGGGTTGTGGAC	1943
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
AL732314.18	218618	ATCCCTCAGAAACCCAAGAGGGATGGACTAACATTAA-GGGGTTGTGGAC	218666

BX004827.19	1944	TGTCCAGCCGTGCAGGGACGGTCTCCAAGAAGATGCTTTAGACACAACGG	1993
			||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
AL732314.18	218667	TGTCCAGCCGTGCAGGGACAGTCTCCAAGAAGATGCTTTAGACACAACGG	218716

skip 7 bps 100% identity alignment

Overview

Query
BX004827.19 - 69861 bps
Hit
AL732314.18 - 218723 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
199.4993020001200012167202187231
Short-link