<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662789.11	1	GAATTCACAGATAAAGAAACAGTGATTTAAGAAAAAGGAAATTTTTTTAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	122048	GAATTCACAGATAAAGAAACAGTGATTTAAGAAAAAGGAAATTTTTTTAT	122097

AL662789.11	51	TAAGAGTCATCTCTTTTGCCTGGGCACAGTGTCTCACATCTATAATCCTA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	122098	TAAGAGTCATCTCTTTTGCCTGGGCACAGTGTCTCACATCTATAATCCTA	122147

AL662789.11	101	GCATGTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTGCTTGAGTCCAGCAGTTCAAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	122148	GCATGTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTGCTTGAGTCCAGCAGTTCAAG	122197

AL662789.11	151	ACCAGCCTGGGCAACATGGCAAAATCTCATGTCTACCAAAATTACAAAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	122198	ACCAGCCTGGGCAACATGGCAAAATCTCATGTCTACCAAAATTACAAAAA	122247

AL662789.11	201	TTAGCTGGGCGTGGTTGCCTGCCTGTATTCCCAGCTACTCTGGAGCCTGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	122248	TTAGCTGGGCGTGGTTGCCTGCCTGTATTCCCAGCTACTCTGGAGCCTGA	122297

AL662789.11	251	GGAGGGAGGATCACTTGAGCATAAGTGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCTCGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	122298	GGAGGGAGGATCACTTGAGCATAAGTGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCTCGA	122347

AL662789.11	301	TCACACCACTGAGCTATAGACTGGGTGACAGAGCCAGGCCCTACCTCAAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	122348	TCACACCACTGAGCTATAGACTGGGTGACAGAGCCAGGCCCTACCTCAAA	122397

AL662789.11	351	AAGAGAAAAAAAGTCTCTTTCAATGAATCTCATAGTGCTAAGGTTCTGTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	122398	AAGAGAAAAAAAGTCTCTTTCAATGAATCTCATAGTGCTAAGGTTCTGTG	122447

AL662789.11	401	CAAGCTTTAGAGATTTCTGGAAATGATGACAACATAGCTGGGGAAAAATA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	122448	CAAGCTTTAGAGATTTCTGGAAATGATGACAACATAGCTGGGGAAAAATA	122497

AL662789.11	451	GAAACTGGAGGAAGAGGTAAGCAGACATGGCTAGTTAAGGAAAGCTGAGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	122498	GAAACTGGAGGAAGAGGTAAGCAGACATGGCTAGTTAAGGAAAGCTGAGG	122547

AL662789.11	501	GCATGATGGGTGAACCTAGGAAATTTAGGACAAGACCCCAGTAAGACAAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	122548	GCATGATGGGTGAACCTAGGAAATTTAGGACAAGACCCCAGTAAGACAAT	122597

AL662789.11	551	GAGTTCCCAAGACTTGCCCATTGACTTTCAGCCCTATGAGACGTGAACAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	122598	GAGTTCCCAAGACTTGCCCATTGACTTTCAGCCCTATGAGACGTGAACAA	122647

AL662789.11	601	TGTTCACATCATCTCGGTAACCCCACACAGAGTATATAGTTTGAACATTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	122648	TGTTCACATCATCTCGGTAACCCCACACAGAGTATATAGTTTGAACATTA	122697

AL662789.11	651	TTAAATTTCTGATAGTTGATTATTTTTGACTTAAAAAATAGAATTTCATA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	122698	TTAAATTTCTGATAGTTGATTATTTTTGACTTAAAAAATAGAATTTCATA	122747

AL662789.11	701	TAATTTATACATTAGTTAAATCTCTTCTGTCATGTCTAGTTAGAGCACAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	122748	TAATTTATACATTAGTTAAATCTCTTCTGTCATGTCTAGTTAGAGCACAT	122797

AL662789.11	751	AGGAGATGCAAGAGAAACAAGTACAGAAAGGTTAAAAAAGATTCATAATG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	122798	AGGAGATGCAAGAGAAACAAGTACAGAAAGGTTAAAAAAGATTCATAATG	122847

AL662789.11	801	AACACGAACCTGGGCTAGTTTTTCAGAGGATGCCTTAAGTTCTTTAGGCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	122848	AACACGAACCTGGGCTAGTTTTTCAGAGGATGCCTTAAGTTCTTTAGGCA	122897

AL662789.11	851	CCAAAGAATACCTCATAAATGCTCTGTATCTGTAAGGTGACTCCAAGTAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	122898	CCAAAGAATACCTCATAAATGCTCTGTATCTGTAAGGTGACTCCAAGTAT	122947

AL662789.11	901	TAACAATCTCAGCTTCAGTTCCAGGGACTTTTCCCCACAAGAAAGGAAGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	122948	TAACAATCTCAGCTTCAGTTCCAGGGACTTTTCCCCACAAGAAAGGAAGA	122997

AL662789.11	951	GCACTAAGTATAACTTCTGTCAGAGAACCTACATACACTACAGGGATACA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	122998	GCACTAAGTATAACTTCTGTCAGAGAACCTACATACACTACAGGGATACA	123047

AL662789.11	1001	GGCCTTATAAACATTGGAGTTCAGCAAGAAAAGAAAGGAGATAATGGGGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	123048	GGCCTTATAAACATTGGAGTTCAGCAAGAAAAGAAAGGAGATAATGGGGA	123097

AL662789.11	1051	GGCCACTGGGTCCATCCTCACATATGAGGACTATGGCCAACACCAAAGGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	123098	GGCCACTGGGTCCATCCTCACATATGAGGACTATGGCCAACACCAAAGGT	123147

AL662789.11	1101	CCTGTGGGGAACCTAACACTGGATCGTCTAGGAGAGACCCTTTGAATTCC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	123148	CCTGTGGGGAACCTAACACTGGATCGTCTAGGAGAGACCCTTTGAATTCC	123197

AL662789.11	1151	CTTGACTCCCACAAAATTTTCAGTAAGAACCTCCTTTTGTCTGACATAAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	123198	CTTGACTCCCACAAAATTTTCAGTAAGAACCTCCTTTTGTCTGACATAAG	123247

AL662789.11	1201	TCAACATAATAAAGGGAAGTGCTGTATGGGGAATTTATTTTAGAATCCTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	123248	TCAACATAATAAAGGGAAGTGCTGTATGGGGAATTTATTTTAGAATCCTT	123297

AL662789.11	1251	ATTTCTAAATCCTCTAAAGACCCTGAGGACATGTGATGCAAAGGTTTTAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	123298	ATTTCTAAATCCTCTAAAGACCCTGAGGACATGTGATGCAAAGGTTTTAT	123347

AL662789.11	1301	TGGTGGAGATTTGAAAAGAAATGATTTGTGCAAAGGCCCCTTACACAAGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	123348	TGGTGGAGATTTGAAAAGAAATGATTTGTGCAAAGGCCCCTTACACAAGT	123397

AL662789.11	1351	CTCATGAAGAGGGCAAGTACCCAAGCTCCTTTTATGGAGGAAATAATTTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	123398	CTCATGAAGAGGGCAAGTACCCAAGCTCCTTTTATGGAGGAAATAATTTG	123447

AL662789.11	1401	GGATCCAATGATAAAGATGGGCAATCTCTGAAGAAAACGTCACAATTTCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	123448	GGATCCAATGATAAAGATGGGCAATCTCTGAAGAAAACGTCACAATTTCT	123497

AL662789.11	1451	TAAGGGACATGGCCTGGGCACAATGTTAACAAAACTCCCTATTTTCCCCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	123498	TAAGGGACATGGCCTGGGCACAATGTTAACAAAACTCCCTATTTTCCCCA	123547

AL662789.11	1501	CCCCATAGTAGCTCAGCACCCGCAATGTGCACTTACGTCGGGTGTCCCCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	123548	CCCCATAGTAGCTCAGCACCCGCAATGTGCACTTACGTCGGGTGTCCCCA	123597

AL662789.11	1551	GACAAAGCCAGTGGGGAGCTCAGCACCATCAGTGTCACTGTCAGCGCTGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	123598	GACAAAGCCAGTGGGGAGCTCAGCACCATCAGTGTCACTGTCAGCGCTGT	123647

AL662789.11	1601	CATGCAGGAGCCTCCAGGGAGCTTCAGACACACCATGCTGGAGAACAGGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	123648	CATGCAGGAGCCTCCAGGGAGCTTCAGACACACCATGCTGGAGAACAGGA	123697

AL662789.11	1651	CAGGACCAGGGGCCAGAGAAGCAGGCAAGTCTCACTCAGGGAGAACTATG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	123698	CAGGACCAGGGGCCAGAGAAGCAGGCAAGTCTCACTCAGGGAGAACTATG	123747

AL662789.11	1701	AACCCCTCCACCCACATTCCAAGTTATAGGGAGGAAGTTACTGATTTCCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	123748	AACCCCTCCACCCACATTCCAAGTTATAGGGAGGAAGTTACTGATTTCCT	123797

AL662789.11	1751	TGCTCCTGGGTTGGGTAATCTCGTGTTGGAGAACCAATCAGCATCTGAGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	123798	TGCTCCTGGGTTGGGTAATCTCGTGTTGGAGAACCAATCAGCATCTGAGT	123847

AL662789.11	1801	TCAATAGCATCATCAGTTGCTGGTCAGAGATGCTGTATGAAGGTCCTCTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	123848	TCAATAGCATCATCAGTTGCTGGTCAGAGATGCTGTATGAAGGTCCTCTT	123897

AL662789.11	1851	CTGAAACAGAATTTCCTTCTTTAAAGGATTGTTTTAATTTAGCACTTGGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	123898	CTGAAACAGAATTTCCTTCTTTAAAGGATTGTTTTAATTTAGCACTTGGA	123947

AL662789.11	1901	AGGTTTGAACCAGTTGCATGTAAAACACCTTAATTGGGGAGCTATTGTAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	123948	AGGTTTGAACCAGTTGCATGTAAAACACCTTAATTGGGGAGCTATTGTAG	123997

AL662789.11	1951	CCAGCTCTGTGCTGGTCAGTGATGTGTTCACAAGTTTGAGCCTTGTAAGA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL713966.7	123998	CCAGCTCTGTGCTGGTCAGTGATGTGTTCACAAGTTTGAGCCTTGTAAGA	124047

Overview

Query
AL662789.11 - 147557 bps
Hit
AL713966.7 - 124047 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link