<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL672277.21	1	CATCTATCTACCATTCCATCCATGCATTCATCCATGTATCCATCCATGCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	113999	CATCTATCTACCATTCCATCCATGCATTCATCCATGTATCCATCCATGCA	114048

AL672277.21	51	TCCATGCATCCATCCATCCATTCATGCATCCATCTACCATTCCATCCATG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	114049	TCCATGCATCCATCCATCCATTCATGCATCCATCTACCATTCCATCCATG	114098

AL672277.21	101	CATTCATCCATGCATTCATCCATGTATCCATGCATCCATGCATCCATCCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	114099	CATTCATCCATGCATTCATCCATGTATCCATGCATCCATGCATCCATCCA	114148

AL672277.21	151	TCCATCCATCCATCCATCCATCCATCTATCTACCATTCCATCCATGCATC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	114149	TCCATCCATCCATCCATCCATCCATCTATCTACCATTCCATCCATGCATC	114198

AL672277.21	201	CATCCATCCATGAATCCACACATCCATCCATCCATCTATCTACCATTCCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	114199	CATCCATCCATGAATCCACACATCCATCCATCCATCTATCTACCATTCCA	114248

AL672277.21	251	TCCATCCATGGATCCATCCATGCATCCATCCATCCATTCATCCATCCATC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	114249	TCCATCCATGGATCCATCCATGCATCCATCCATCCATTCATCCATCCATC	114298

AL672277.21	301	TACCTACCATTCCGTCCATGTATCCATCCATGCATTCATACATGAATCCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	114299	TACCTACCATTCCGTCCATGTATCCATCCATGCATTCATACATGAATCCA	114348

AL672277.21	351	TGCATCCATCCATGCATCCATCCATCCATTCATCCATCCATCTAACATTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	114349	TGCATCCATCCATGCATCCATCCATCCATTCATCCATCCATCTAACATTC	114398

AL672277.21	401	CATCAATCTATCTACCATTCCATCCATGCATCCATCCATGCATCCATCCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	114399	CATCAATCTATCTACCATTCCATCCATGCATCCATCCATGCATCCATCCA	114448

AL672277.21	451	TTCATTCATCCCTCCATCTACCATTCCATCCATCTATCTACCATTCCATC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	114449	TTCATTCATCCCTCCATCTACCATTCCATCCATCTATCTACCATTCCATC	114498

AL672277.21	501	CATGCATCCATCCATGCATCCATCCATTCATTCATCCCTCCATCTACCAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	114499	CATGCATCCATCCATGCATCCATCCATTCATTCATCCCTCCATCTACCAT	114548

AL672277.21	551	TCCATCCATCTATCTACCATTCCATCCATGCATCCATCCATGCATTCTTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	114549	TCCATCCATCTATCTACCATTCCATCCATGCATCCATCCATGCATTCTTC	114598

AL672277.21	601	CATGCATCCATCCATCCATTCATCCATCCATCTACCTACCATTCCATCCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	114599	CATGCATCCATCCATCCATTCATCCATCCATCTACCTACCATTCCATCCA	114648

AL672277.21	651	TGCCTCCATCCATGCATTCGTCCATGAATCCATGCATCCATCCATGCATC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	114649	TGCCTCCATCCATGCATTCGTCCATGAATCCATGCATCCATCCATGCATC	114698

AL672277.21	701	CATTCATCCATTCATCCATCCACCTAGCATTCCATCCATCTATCTACCAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	114699	CATTCATCCATTCATCCATCCACCTAGCATTCCATCCATCTATCTACCAT	114748

AL672277.21	751	TCCATTCTTGCATCCACCAATGCATCTATCCATCCGTTCATCTGTCCATC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	114749	TCCATTCTTGCATCCACCAATGCATCTATCCATCCGTTCATCTGTCCATC	114798

AL672277.21	801	CATCTACCATTCCATCCATCTATCTACCATTCCATCCATGCATCCATCCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	114799	CATCTACCATTCCATCCATCTATCTACCATTCCATCCATGCATCCATCCA	114848

AL672277.21	851	TGCATCCATCCATGAGTCCATGCATCCATCCATCCATCCATGCATCCATC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	114849	TGCATCCATCCATGAGTCCATGCATCCATCCATCCATCCATGCATCCATC	114898

AL672277.21	901	CATCCATCCATCTTGTCTTTATCCCACCAAGACTCTACAGAGACACCCGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	114899	CATCCATCCATCTTGTCTTTATCCCACCAAGACTCTACAGAGACACCCGT	114948

AL672277.21	951	CTGCAGAGTGGGTAAAGAGAAACTAACTTCTCCCTGGGGCTTTCCCAAGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	114949	CTGCAGAGTGGGTAAAGAGAAACTAACTTCTCCCTGGGGCTTTCCCAAGA	114998

AL672277.21	1001	GGTATGGCCGGAGTGCAGACACGTCAGTTATGCAGTCAATGCTGAGTGAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	114999	GGTATGGCCGGAGTGCAGACACGTCAGTTATGCAGTCAATGCTGAGTGAG	115048

AL672277.21	1051	TTGACTCAGTCAACGCTGAGTGAGGGGCCATGTAGTCCACACCACGCAGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	115049	TTGACTCAGTCAACGCTGAGTGAGGGGCCATGTAGTCCACACCACGCAGT	115098

AL672277.21	1101	CAGCCCTGAGTGGGGAGTAAGAGGGAGAGCACCTTGAGGACAAAACATTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	115099	CAGCCCTGAGTGGGGAGTAAGAGGGAGAGCACCTTGAGGACAAAACATTA	115148

AL672277.21	1151	AGCATTGTGCACATCTTCACATCTCTCTGAAATATGGCTTCACCCAGGAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	115149	AGCATTGTGCACATCTTCACATCTCTCTGAAATATGGCTTCACCCAGGAT	115198

AL672277.21	1201	GACCTGACACCAGGACATTCTGCTCTCAGGTGCCATGTTGGTGTCATAGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	115199	GACCTGACACCAGGACATTCTGCTCTCAGGTGCCATGTTGGTGTCATAGA	115248

AL672277.21	1251	AAGGGAATCAGTTAAAATCATGAACATTCCAGGCGTCCGCTTTTATTCTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	115249	AAGGGAATCAGTTAAAATCATGAACATTCCAGGCGTCCGCTTTTATTCTA	115298

AL672277.21	1301	AGAATATAGCACTCCATTTGAAAAGAAACAAGGTCCTCCACCTTTCTGTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	115299	AGAATATAGCACTCCATTTGAAAAGAAACAAGGTCCTCCACCTTTCTGTT	115348

AL672277.21	1351	CTGGGAGCCTTTAACTCTGGAGATCTTCCTTTGCACATATACTAGTGGGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	115349	CTGGGAGCCTTTAACTCTGGAGATCTTCCTTTGCACATATACTAGTGGGC	115398

AL672277.21	1401	TTGCTTCTGTCCCTTTCTGGGTATCTCCACACAGTCGCCCTTGGAGAGAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	115399	TTGCTTCTGTCCCTTTCTGGGTATCTCCACACAGTCGCCCTTGGAGAGAC	115448

AL672277.21	1451	CAAACGCCTGGCAGCTGGTGTAGTTTCCTGTTGGGTCACAGAGTCTTCCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	115449	CAAACGCCTGGCAGCTGGTGTAGTTTCCTGTTGGGTCACAGAGTCTTCCT	115498

AL672277.21	1501	CCCCAATAGAGCCGCCGTCACCCCTCTCCTGACAGCTCAGGGCTGCTGAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	115499	CCCCAATAGAGCCGCCGTCACCCCTCTCCTGACAGCTCAGGGCTGCTGAC	115548

AL672277.21	1551	CAGCTCACACGGGTCTCTCCTGAATTCATTGCCCTCCCTTCCAAGCCGTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	115549	CAGCTCACACGGGTCTCTCCTGAATTCATTGCCCTCCCTTCCAAGCCGTG	115598

AL672277.21	1601	CTGTATTTTAATGTACTTTTTCAAGGAGTTTATGATCTCTGCTGCTTTCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	115599	CTGTATTTTAATGTACTTTTTCAAGGAGTTTATGATCTCTGCTGCTTTCA	115648

AL672277.21	1651	TAGCATCTGTCAAGAGTATCAAACTGTGGTCCCCTCTTTGAGTTAATAAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	115649	TAGCATCTGTCAAGAGTATCAAACTGTGGTCCCCTCTTTGAGTTAATAAA	115698

AL672277.21	1701	GCTACAGTACAATAGTGCATGGGTATCAGAGGTCTGTAGACCTTTCTCAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	115699	GCTACAGTACAATAGTGCATGGGTATCAGAGGTCTGTAGACCTTTCTCAC	115748

AL672277.21	1751	GACTTACCAACCTGACATGAAATCATTAATGATTACTCCACCGTCCTTGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	115749	GACTTACCAACCTGACATGAAATCATTAATGATTACTCCACCGTCCTTGA	115798

AL672277.21	1801	GTTTTTAGACGGTTGCTGTATAATGATCCTTCCCTTCCTACCTTTTTCTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	115799	GTTTTTAGACGGTTGCTGTATAATGATCCTTCCCTTCCTACCTTTTTCTG	115848

AL672277.21	1851	GTTTCTTGATGAGATGGTTATCTGGGGCTCTGTCAGGTCCTAATGGAATT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	115849	GTTTCTTGATGAGATGGTTATCTGGGGCTCTGTCAGGTCCTAATGGAATT	115898

AL672277.21	1901	CAACCGGACTGGATTCACGTTTTCCTTCCCGGCGCTGGCTCCGTTGATTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	115899	CAACCGGACTGGATTCACGTTTTCCTTCCCGGCGCTGGCTCCGTTGATTT	115948

AL672277.21	1951	TCTCGTCATGAAATAAAATAATTGCTTTGACAGGATTCAGGTGAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672311.26	115949	TCTCGTCATGAAATAAAATAATTGCTTTGACAGGATTCAGGTGAGAATTC	115998

Overview

Query
AL672277.21 - 131682 bps
Hit
AL672311.26 - 115998 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link