<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL683823.11	1	ATCTTTCCGTTGTTCACATCAGAATGTTTGTGGAGGCGTCTCTCTAGTTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	87130	ATCTTTCCGTTGTTCACATCAGAATGTTTGTGGAGGCGTCTCTCTAGTTT	87179

AL683823.11	51	ATCTTAGAACATTAAGACTTGTCTTAACAACAGCCAAAAAATGGTTATGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	87180	ATCTTAGAACATTAAGACTTGTCTTAACAACAGCCAAAAAATGGTTATGC	87229

AL683823.11	101	TCGTACTCTGGTCTGACCGTTCTACAAGGTAGGTTGGTATTGAAATACCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	87230	TCGTACTCTGGTCTGACCGTTCTACAAGGTAGGTTGGTATTGAAATACCA	87279

AL683823.11	151	CACTGTATCTCATACATACTGTTAACCTCAAAGATTTAAGGAGAAAGACC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	87280	CACTGTATCTCATACATACTGTTAACCTCAAAGATTTAAGGAGAAAGACC	87329

AL683823.11	201	ACTGTCCCAAATCACTGAGGCCAAATTAATTAAAACAAACTCTTTTTTTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	87330	ACTGTCCCAAATCACTGAGGCCAAATTAATTAAAACAAACTCTTTTTTTT	87379

AL683823.11	251	AAAAGTTGTGTACATGAGCTGACTCCCCCTGCTAAGGCAGGGTTCAAGAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	87380	AAAAGTTGTGTACATGAGCTGACTCCCCCTGCTAAGGCAGGGTTCAAGAG	87429

AL683823.11	301	ATTGGTATTGGACATGGGCCAGATAAGGGCTTTTTATAGCTCACGGGTAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	87430	ATTGGTATTGGACATGGGCCAGATAAGGGCTTTTTATAGCTCACGGGTAG	87479

AL683823.11	351	GGGGTTTCCAAGTGGGGGATTTGGCACATAGGTGAGGCGGGGTTCCAAGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	87480	GGGGTTTCCAAGTGGGGGATTTGGCACATAGGTGAGGCGGGGTTCCAAGA	87529

AL683823.11	401	GCAAAACATAACAAGGTGGTCATAATAACTTTTTGAAATAAATGTAGAGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	87530	GCAAAACATAACAAGGTGGTCATAATAACTTTTTGAAATAAATGTAGAGT	87579

AL683823.11	451	TGCAAGGTGTTGATAAGAACCTCCTGAAACAAAGGCATTTTGGCCATTCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	87580	TGCAAGGTGTTGATAAGAACCTCCTGAAACAAAGGCATTTTGGCCATTCC	87629

AL683823.11	501	TGCAACAGGCAAGAACAGAACCATTTGTAGTTAAGGTTACAAGTGGGGCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	87630	TGCAACAGGCAAGAACAGAACCATTTGTAGTTAAGGTTACAAGTGGGGCA	87679

AL683823.11	551	CAGCCCCACTTAGAGAAACAGAGATTTAATCGCAAACAGGAATGAACCTA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	87680	CAGCCCCACTTAGAGAAACAGAGATTTAATCGCAAACAGGAATGAACCTA	87729

AL683823.11	601	GCTTGTCTTTATTATAAGTTGGCTTTCAAGCCCAAAATGGAAGCAGCTGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	87730	GCTTGTCTTTATTATAAGTTGGCTTTCAAGCCCAAAATGGAAGCAGCTGG	87779

AL683823.11	651	GTTCATCAATAAATATGTAATTACTATTTGTTATCGAAAATAAATTTGAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	87780	GTTCATCAATAAATATGTAATTACTATTTGTTATCGAAAATAAATTTGAA	87829

AL683823.11	701	AAGTTTGTGCTTGTCAATATAGCCTCTTGGTTTTCATAGATTAAGTAGAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	87830	AAGTTTGTGCTTGTCAATATAGCCTCTTGGTTTTCATAGATTAAGTAGAT	87879

AL683823.11	751	TTGTTTTGTTTTGTTTTTAAACTATTAGGCATGATGGCATTTGCCCATAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	87880	TTGTTTTGTTTTGTTTTTAAACTATTAGGCATGATGGCATTTGCCCATAA	87929

AL683823.11	801	TCTCAGCACTTAGGAGGTAAAGAGAGAGGGAGCAGAAGTTCAAAGCCAAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	87930	TCTCAGCACTTAGGAGGTAAAGAGAGAGGGAGCAGAAGTTCAAAGCCAAG	87979

AL683823.11	851	CTGGACCTGGCAGCATGTATCTTTAACTCCTGTATTCAGGAGGCATTTGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	87980	CTGGACCTGGCAGCATGTATCTTTAACTCCTGTATTCAGGAGGCATTTGC	88029

AL683823.11	901	AATGGATCTCTGTGTGTTTGAGGCCAGCCTGATCTACAGAGTGAGTACCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	88030	AATGGATCTCTGTGTGTTTGAGGCCAGCCTGATCTACAGAGTGAGTACCA	88079

AL683823.11	951	GGCAGCCAGGGCTACAGAGGATGACCCTGTCTCAAAGAACAAACACACAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	88080	GGCAGCCAGGGCTACAGAGGATGACCCTGTCTCAAAGAACAAACACACAA	88129

AL683823.11	1001	ACACCAAAACAAAAGCCAGCCTCTGAACCTCTGCCACATACACACCGAGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	88130	ACACCAAAACAAAAGCCAGCCTCTGAACCTCTGCCACATACACACCGAGA	88179

AL683823.11	1051	GTACAGCCAGTACCAAACAGCAGCAGCAGCAGCAAAGAATTATCATCTTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	88180	GTACAGCCAGTACCAAACAGCAGCAGCAGCAGCAAAGAATTATCATCTTT	88229

AL683823.11	1101	GGGACGGCCAATAGGATGGGCCTCCTGGTTTCCTTTGTGTGTACCCCACT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	88230	GGGACGGCCAATAGGATGGGCCTCCTGGTTTCCTTTGTGTGTACCCCACT	88279

AL683823.11	1151	ACTCCCCCACACCCTACCCTCAGAAACATCACCTGAGTATTTGTCAGCAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	88280	ACTCCCCCACACCCTACCCTCAGAAACATCACCTGAGTATTTGTCAGCAT	88329

AL683823.11	1201	CACACGGATGGCAGGACGTTTCTCCTTTGTTTGAGTAGTAGTTGGCTGGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	88330	CACACGGATGGCAGGACGTTTCTCCTTTGTTTGAGTAGTAGTTGGCTGGA	88379

AL683823.11	1251	CAAAGCTTGCAGAAAGGGGAGCCCTGCTTGGCAGCGTATGTGCCAGGCTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	88380	CAAAGCTTGCAGAAAGGGGAGCCCTGCTTGGCAGCGTATGTGCCAGGCTT	88429

AL683823.11	1301	GCAGGGGAAACACTCGGAGGTGTAAGCCACCCCTAGGAAGAAAGAATGGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	88430	GCAGGGGAAACACTCGGAGGTGTAAGCCACCCCTAGGAAGAAAGAATGGT	88479

AL683823.11	1351	ATAGACGATCAAAGCTTGAGCCCAGACACCAAGGCCCTGGGGACCAAATG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	88480	ATAGACGATCAAAGCTTGAGCCCAGACACCAAGGCCCTGGGGACCAAATG	88529

AL683823.11	1401	CCCATCCCTCCCTAGAAGCCAGGAGTCCAGGAAGCCAGCAGCAGACCCAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	88530	CCCATCCCTCCCTAGAAGCCAGGAGTCCAGGAAGCCAGCAGCAGACCCAG	88579

AL683823.11	1451	ATCCAAGCTGTTTTCTGTACCTGTTATGGCGATGTTTCTAACAAGCACGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	88580	ATCCAAGCTGTTTTCTGTACCTGTTATGGCGATGTTTCTAACAAGCACGG	88629

AL683823.11	1501	GCTTGGACACTTTGGACCACACCGAGAAAGCTGTGGTTCTCCAATAGAGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	88630	GCTTGGACACTTTGGACCACACCGAGAAAGCTGTGGTTCTCCAATAGAGG	88679

AL683823.11	1551	ACGTTATTGCCTCTATTTAGCTCAACCTTCAAAAAGGCATAAGGTAGGTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	88680	ACGTTATTGCCTCTATTTAGCTCAACCTTCAAAAAGGCATAAGGTAGGTG	88729

AL683823.11	1601	TTAATTCATCACAAAAATGGGCATCACTAACTTGCCTTTTGTAGCTTTGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	88730	TTAATTCATCACAAAAATGGGCATCACTAACTTGCCTTTTGTAGCTTTGT	88779

AL683823.11	1651	GTTTTTAACCCTCTCCCACTCTTCCCTGATCCTCCACATATGATCCGTGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	88780	GTTTTTAACCCTCTCCCACTCTTCCCTGATCCTCCACATATGATCCGTGC	88829

AL683823.11	1701	ATCATATGCACTACAAGCATCTCTAATGGAGCGATCAGAACAGGACCAGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	88830	ATCATATGCACTACAAGCATCTCTAATGGAGCGATCAGAACAGGACCAGA	88879

AL683823.11	1751	GGGGGCTGGCAGTAAGGGAGACTGACGATTGCTCATTCTTCTATGGTTTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	88880	GGGGGCTGGCAGTAAGGGAGACTGACGATTGCTCATTCTTCTATGGTTTT	88929

AL683823.11	1801	CCAGAAAACACAGCCTCAAAGCTGGAACGCTCTGGCTCCTGGGATGAAGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	88930	CCAGAAAACACAGCCTCAAAGCTGGAACGCTCTGGCTCCTGGGATGAAGT	88979

AL683823.11	1851	CATAGGGGCAAACTAGCCACTGTATAGCATCATCTAGCAACCACAAAAAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	88980	CATAGGGGCAAACTAGCCACTGTATAGCATCATCTAGCAACCACAAAAAG	89029

AL683823.11	1901	AGGAATCACTTATGTCTCAGCCTGCCCCCTCCGTTACGGCCCTCGGCCTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	89030	AGGAATCACTTATGTCTCAGCCTGCCCCCTCCGTTACGGCCCTCGGCCTC	89079

AL683823.11	1951	TCCTCTGGGATCCCAAGGACGGCTGGTGTGATGCTCACACTGTGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL672200.10	89080	TCCTCTGGGATCCCAAGGACGGCTGGTGTGATGCTCACACTGTGGAATTC	89129

Overview

Query
AL683823.11 - 180483 bps
Hit
AL672200.10 - 89129 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link