<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL672024.9	1	GAATTCTCACCTGAGGAATACCGAATGGCAGAGAAGCACCTGAAAAAATG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	67347	GAATTCTCACCTGAGGAATACCGAATGGCAGAGAAGCACCTGAAAAAATG	67396

AL672024.9	51	TTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	67397	TTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGAT	67446

AL672024.9	101	TCCACCTCACACCAGTCAGAATGTCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	67447	TCCACCTCACACCAGTCAGAATGTCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGC	67496

AL672024.9	151	AGATGCTGGCGAAGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	67497	AGATGCTGGCGAAGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTG	67546

AL672024.9	201	GGATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCCGTCTGGCGGTTCCTCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	67547	GGATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCCGTCTGGCGGTTCCTCA	67596

AL672024.9	251	GAAAATTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	67597	GAAAATTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGC	67646

AL672024.9	301	ATATATCCAGAAGATGCCCCAACAGGTAAGAAGGACACATGCTCCACTAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	67647	ATATATCCAGAAGATGCCCCAACAGGTAAGAAGGACACATGCTCCACTAT	67696

AL672024.9	351	GTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	67697	GTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGAT	67746

AL672024.9	401	GCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACACAATG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	67747	GCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACACAATG	67796

AL672024.9	451	GAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	67797	GAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAA	67846

AL672024.9	501	ATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACATTCACAAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	67847	ATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACATTCACAAA	67896

AL672024.9	551	GGAACTCACACAATATGTACTCACTGATAAGTGGATATTAGCCCCAAACC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	67897	GGAACTCACACAATATGTACTCACTGATAAGTGGATATTAGCCCCAAACC	67946

AL672024.9	601	TAGGATACCCAAGATATAAGATATAATTTGCTAAACACATGAAACTCAAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	67947	TAGGATACCCAAGATATAAGATATAATTTGCTAAACACATGAAACTCAAG	67996

AL672024.9	651	GAGAATGAAGACTGAAGTGTGGACACTATGCCCCTCCTTAGATTTGGGAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	67997	GAGAATGAAGACTGAAGTGTGGACACTATGCCCCTCCTTAGATTTGGGAA	68046

AL672024.9	701	CAAAACACCCATGGAAGGAGTTACAGAGACGGAGTTTGGAGCTGAGATGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	68047	CAAAACACCCATGGAAGGAGTTACAGAGACGGAGTTTGGAGCTGAGATGA	68096

AL672024.9	751	AAGGATGGACCATGTAGAGACTGCCATAGCCAGGGATCCACCCCATAATC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	68097	AAGGATGGACCATGTAGAGACTGCCATAGCCAGGGATCCACCCCATAATC	68146

AL672024.9	801	AGCATCCAAACGCTGACACCATTGCATACACTAGCAAGATTTTATTGAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	68147	AGCATCCAAACGCTGACACCATTGCATACACTAGCAAGATTTTATTGAAA	68196

AL672024.9	851	GGACGCAGATGTAGCTGTCTCTTGTGAGACTATGCCGGGGCCCAGCAAAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	68197	GGACGCAGATGTAGCTGTCTCTTGTGAGACTATGCCGGGGCCCAGCAAAC	68246

AL672024.9	901	ACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTAATGGATGGATCATAGGGCTCCCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	68247	ACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTAATGGATGGATCATAGGGCTCCCA	68296

AL672024.9	951	ATGGAGGAGCTAGAGAAAGTAGCCAAGGAGCTAAAGGGATCTGCAACCCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	68297	ATGGAGGAGCTAGAGAAAGTAGCCAAGGAGCTAAAGGGATCTGCAACCCT	68346

AL672024.9	1001	ATAGGTGGAACAACATTATGAGCTAACCAGTACCCCGGAGCTCTTGACTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	68347	ATAGGTGGAACAACATTATGAGCTAACCAGTACCCCGGAGCTCTTGACTC	68396

AL672024.9	1051	TAGCTGCATATATATCAAAAGATGGCCTAGTCGGCCATCACTGGAAAGAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	68397	TAGCTGCATATATATCAAAAGATGGCCTAGTCGGCCATCACTGGAAAGAG	68446

AL672024.9	1101	AGGCCCATTGGACTTGCAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAATACCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	68447	AGGCCCATTGGACTTGCAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAATACCA	68496

AL672024.9	1151	GGGCCAAAAAGGGGGAGTGGGTGGGCAGGGGAGTGGGGGTGGGTGGATAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	68497	GGGCCAAAAAGGGGGAGTGGGTGGGCAGGGGAGTGGGGGTGGGTGGATAT	68546

AL672024.9	1201	GGGGGACTTTTGGTATAGCATTGGAAATGTAAATGAGTTAAATACCTAAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	68547	GGGGGACTTTTGGTATAGCATTGGAAATGTAAATGAGTTAAATACCTAAT	68596

AL672024.9	1251	AAAAAATGGAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAATGTAGGCCAGACTCTCAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	68597	AAAAAATGGAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAATGTAGGCCAGACTCTCAG	68646

AL672024.9	1301	AATTGGAATCAAAAGAAGTAGAAGGTAAAGCCTCTTGTCCCTTTACAGAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	68647	AATTGGAATCAAAAGAAGTAGAAGGTAAAGCCTCTTGTCCCTTTACAGAA	68696

AL672024.9	1351	TCTATAGCGCTCTTGTGTGTATGACCAGAAGGCATTCTCTCCACTTCCCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	68697	TCTATAGCGCTCTTGTGTGTATGACCAGAAGGCATTCTCTCCACTTCCCT	68746

AL672024.9	1401	TACTTGTCTCACTAAGTTAATGGAGGATATATGTATATATATGCTGGGAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	68747	TACTTGTCTCACTAAGTTAATGGAGGATATATGTATATATATGCTGGGAC	68796

AL672024.9	1451	ACGTGGCACTTTGAACATTGTATACAGGGGGATGACTCTTTGTTGCATGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	68797	ACGTGGCACTTTGAACATTGTATACAGGGGGATGACTCTTTGTTGCATGC	68846

AL672024.9	1501	TATACTCCCGATCTCTTCAGTTGCTTACCCAGAGTCAGTGTGCTTGTTCC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	68847	TATACTCCCGATCTCTTCAGTTGCTTACCCAGAGTCAGTGTGCTTGTTCC	68896

AL672024.9	1551	CCGAGCTGAGCTGTTTATAGCACTTGCATTTACTAGTACACTTATTATGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	68897	CCGAGCTGAGCTGTTTATAGCACTTGCATTTACTAGTACACTTATTATGT	68946

AL672024.9	1601	AATGAGGCATCAGCTAAATCAGTGAATAGAAAGGAAATAGGATCGTAGTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	68947	AATGAGGCATCAGCTAAATCAGTGAATAGAAAGGAAATAGGATCGTAGTT	68996

AL672024.9	1651	TCTACAAAAACCACAACGAATGCTTTGTAGAGAGTGAGTACGAAGAATAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	68997	TCTACAAAAACCACAACGAATGCTTTGTAGAGAGTGAGTACGAAGAATAG	69046

AL672024.9	1701	ACAAAAAGGTTTTATATGCATGTTCTCAGCCACACTCAAACACAGCTAGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	69047	ACAAAAAGGTTTTATATGCATGTTCTCAGCCACACTCAAACACAGCTAGA	69096

AL672024.9	1751	ACTTTGGATTTAGATAAGCTTGGGGTTTCACCAGAGGATTATAAAAGAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	69097	ACTTTGGATTTAGATAAGCTTGGGGTTTCACCAGAGGATTATAAAAGAAA	69146

AL672024.9	1801	CAGAGAAAATAGAGGGAATTAAATGTATGTACATATATACACATGCATAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	69147	CAGAGAAAATAGAGGGAATTAAATGTATGTACATATATACACATGCATAT	69196

AL672024.9	1851	ACACACATTGTACATATATATGCACACATATATACATATATGCATATGTA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	69197	ACACACATTGTACATATATATGCACACATATATACATATATGCATATGTA	69246

AL672024.9	1901	CAAATGCACATATATACACACATAAACATACATACACATATATATTCATA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	69247	CAAATGCACATATATACACACATAAACATACATACACATATATATTCATA	69296

AL672024.9	1951	TGGAAACATACATACATATATACATATATAAACATACATACATATGGTAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671997.10	69297	TGGAAACATACATACATATATACATATATAAACATACATACATATGGTAG	69346

Overview

Query
AL672024.9 - 110173 bps
Hit
AL671997.10 - 69346 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link