<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL671921.16	1	TACTAACATGAAAAATTAACTGAAAATACAGCATGATACTATTTTGGTTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	192210	TACTAACATGAAAAATTAACTGAAAATACAGCATGATACTATTTTGGTTC	192259

AL671921.16	51	AAAAGGCCAGGTCTGGTGGTGTATGCCTTTAAATACAGCCTTTGGGAGAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	192260	AAAAGGCCAGGTCTGGTGGTGTATGCCTTTAAATACAGCCTTTGGGAGAC	192309

AL671921.16	101	AGAGGCATCTGTGTGGAGTCTGGTCTACATATTGAGTTGCAGGCCAGCCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	192310	AGAGGCATCTGTGTGGAGTCTGGTCTACATATTGAGTTGCAGGCCAGCCA	192359

AL671921.16	151	GAATTACATGGTGAGACCCTGTCTAAAAATAAATAAATATATGAACAAAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	192360	GAATTACATGGTGAGACCCTGTCTAAAAATAAATAAATATATGAACAAAT	192409

AL671921.16	201	AAATATGTATCATTGATCACTGTGAGGCAGTAGTATGTATATATGTGTGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	192410	AAATATGTATCATTGATCACTGTGAGGCAGTAGTATGTATATATGTGTGC	192459

AL671921.16	251	ATTCATGTATGCATGTATGTAGGTAGGTAGGTATGCATAGGGACCAATGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	192460	ATTCATGTATGCATGTATGTAGGTAGGTAGGTATGCATAGGGACCAATGG	192509

AL671921.16	301	AGGCTAGGTTATATACCAAAATATTAATAATGGTGGTAAGCTCTGCATGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	192510	AGGCTAGGTTATATACCAAAATATTAATAATGGTGGTAAGCTCTGCATGA	192559

AL671921.16	351	TTAATTTATTGAAAATATTTGCTATTTTTGCTTCTCTAAGTTTTCTAACA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	192560	TTAATTTATTGAAAATATTTGCTATTTTTGCTTCTCTAAGTTTTCTAACA	192609

AL671921.16	401	TGAAAACATTTTTACTTTTGCAATATGGCAAAAATTAACTGGAAAGAAGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	192610	TGAAAACATTTTTACTTTTGCAATATGGCAAAAATTAACTGGAAAGAAGT	192659

AL671921.16	451	ACATGATGTCCAGTGAATTAAAATCCTGAAAACAAAGATGTTCTTTGGCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	192660	ACATGATGTCCAGTGAATTAAAATCCTGAAAACAAAGATGTTCTTTGGCA	192709

AL671921.16	501	AAAACAAAAAAGAAATCCTTTTAGCTTGTTTACAGAGTCAGAGATACAAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	192710	AAAACAAAAAAGAAATCCTTTTAGCTTGTTTACAGAGTCAGAGATACAAT	192759

AL671921.16	551	ACACAGATGTGCGCCTCGCTTCCCGGACACTCCCTGAGTTCACATGTGGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	192760	ACACAGATGTGCGCCTCGCTTCCCGGACACTCCCTGAGTTCACATGTGGT	192809

AL671921.16	601	TTTTCCACAAGTTCATGAGAAACTTGGAAACGTATTAGTTACCAACACAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	192810	TTTTCCACAAGTTCATGAGAAACTTGGAAACGTATTAGTTACCAACACAA	192859

AL671921.16	651	ACACCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGGGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	192860	ACACCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGGGA	192909

AL671921.16	701	GGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGAGAGAGAGAGGCAAGGCAAACTGAGAAAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	192910	GGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGAGAGAGAGAGGCAAGGCAAACTGAGAAAT	192959

AL671921.16	751	CACAGATATGTAGGAAGAGTCCCTTCCCATCATTCCTTGCTTAAACAGAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	192960	CACAGATATGTAGGAAGAGTCCCTTCCCATCATTCCTTGCTTAAACAGAC	193009

AL671921.16	801	CAGAATTAAACATGTCCTCATAACTGCAGTAAGCTTTAAAAGTGACTTAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	193010	CAGAATTAAACATGTCCTCATAACTGCAGTAAGCTTTAAAAGTGACTTAC	193059

AL671921.16	851	ATACTTTATTAAGGGGAGTTCTGGAAAGATTCAAATAATACAATGTTCTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	193060	ATACTTTATTAAGGGGAGTTCTGGAAAGATTCAAATAATACAATGTTCTG	193109

AL671921.16	901	TTTTTCTGAAAGGTCTTCAAAAATATTTTATTAGGCAGCCGCTTGGCTTC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	193110	TTTTTCTGAAAGGTCTTCAAAAATATTTTATTAGGCAGCCGCTTGGCTTC	193159

AL671921.16	951	AGTTGAGTAGACCATTGTAACATTGCAATGTATTTTCTAAATGTTTTGTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	193160	AGTTGAGTAGACCATTGTAACATTGCAATGTATTTTCTAAATGTTTTGTT	193209

AL671921.16	1001	AACTGTGGTGAGACCTAACCACTTGCCTTAACCATTTTTTAATGTCACTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	193210	AACTGTGGTGAGACCTAACCACTTGCCTTAACCATTTTTTAATGTCACTT	193259

AL671921.16	1051	CCTCAAAATAAAGAGTTGGATATTTTTTTTTCTAACTTCTTTTTACCGAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	193260	CCTCAAAATAAAGAGTTGGATATTTTTTTTTCTAACTTCTTTTTACCGAT	193309

AL671921.16	1101	TAAACTTTCACAGGAGAATCTAGATCCTTCTAAAATTCATTTTCACTAAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	193310	TAAACTTTCACAGGAGAATCTAGATCCTTCTAAAATTCATTTTCACTAAT	193359

AL671921.16	1151	CATCTATAAACAGGGAAACCAGTATATGGACCTTCTAATGGGAATAAACA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	193360	CATCTATAAACAGGGAAACCAGTATATGGACCTTCTAATGGGAATAAACA	193409

AL671921.16	1201	GGCTTGTATGGCCCCAAGAGGCCAAGAATATAAGAAATACATGCACTGAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	193410	GGCTTGTATGGCCCCAAGAGGCCAAGAATATAAGAAATACATGCACTGAA	193459

AL671921.16	1251	ATAACTGTGCCTTCGATCAATTGTCAGGTCCACTGTCCCCTTAGATGAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	193460	ATAACTGTGCCTTCGATCAATTGTCAGGTCCACTGTCCCCTTAGATGAAA	193509

AL671921.16	1301	TATATTAAGCATACAGCTTAACTCTTCTCTAGAGCAGTGCTTCTCAACCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	193510	TATATTAAGCATACAGCTTAACTCTTCTCTAGAGCAGTGCTTCTCAACCT	193559

AL671921.16	1351	TCCTAATGCTATGACACTTTAATACCGTTCCTCATGGTGTAGTGACACCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	193560	TCCTAATGCTATGACACTTTAATACCGTTCCTCATGGTGTAGTGACACCC	193609

AL671921.16	1401	CCCACCCAACCACAAGATTAATTCATTATGCTGGGTGTGGTGGAGAGCAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	193610	CCCACCCAACCACAAGATTAATTCATTATGCTGGGTGTGGTGGAGAGCAT	193659

AL671921.16	1451	GCCTTCTGCATTGAATCCTAGCACTTGGGAGGCAGAGCCAAGTAGATCTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	193660	GCCTTCTGCATTGAATCCTAGCACTTGGGAGGCAGAGCCAAGTAGATCTC	193709

AL671921.16	1501	TGACTTTGAGTCGAGCCTGGCCTTCAGAGTGACGTTCTGGGACAGCAAGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	193710	TGACTTTGAGTCGAGCCTGGCCTTCAGAGTGACGTTCTGGGACAGCAAGG	193759

AL671921.16	1551	CTACACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAACTAAACCAAAACACAAATATATG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	193760	CTACACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAACTAAACCAAAACACAAATATATG	193809

AL671921.16	1601	TTTGTTGCTACTTCATAACTATAATTTTGCTACTGTTATGAGTCATAATG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	193810	TTTGTTGCTACTTCATAACTATAATTTTGCTACTGTTATGAGTCATAATG	193859

AL671921.16	1651	TAAATATCTGATGTGCAGGATATTGGCCATGACCCACAGGTTGAGAACCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	193860	TAAATATCTGATGTGCAGGATATTGGCCATGACCCACAGGTTGAGAACCT	193909

AL671921.16	1701	TTGCTTTACAGCCACGTCCAATGTTTTCCCCCACCCCAAACAGAACTGAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	193910	TTGCTTTACAGCCACGTCCAATGTTTTCCCCCACCCCAAACAGAACTGAA	193959

AL671921.16	1751	AGGGCATTACCTCAACTTCCTGACTTCTGTCAATGACATAAGGCATTGAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	193960	AGGGCATTACCTCAACTTCCTGACTTCTGTCAATGACATAAGGCATTGAC	194009

AL671921.16	1801	CACTGCATTATCACCTGCCATTTACTGATGCGAAAAAGCCTGCATTCAGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	194010	CACTGCATTATCACCTGCCATTTACTGATGCGAAAAAGCCTGCATTCAGG	194059

AL671921.16	1851	TTCTCACAGCCTCTCATTTGTCTCTCCATCGCTAATCTATCTATTTTTTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	194060	TTCTCACAGCCTCTCATTTGTCTCTCCATCGCTAATCTATCTATTTTTTG	194109

AL671921.16	1901	CCACTTGAATCTAAACAGCAGCAGACTGCCAGCCAGCCAGCTGGCTCAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	194110	CCACTTGAATCTAAACAGCAGCAGACTGCCAGCCAGCCAGCTGGCTCAAA	194159

AL671921.16	1951	TTCCACTTTAATCACGTTACGGTGCAGTTCGAGAATACAATATTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671894.20	194160	TTCCACTTTAATCACGTTACGGTGCAGTTCGAGAATACAATATTGAATTC	194209

Overview

Query
AL671921.16 - 123444 bps
Hit
AL671894.20 - 194209 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link