<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL671899.11	1	TTGGAAAATTAGAATCCAAAATTAAGTAGACTGACACCTCAATTCCCCTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	205266	TTGGAAAATTAGAATCCAAAATTAAGTAGACTGACACCTCAATTCCCCTA	205315

AL671899.11	51	CACAGGGCATCAATCCAGCCTTCATAGAACCAAGGGCCTCTCCTCCCATT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	205316	CACAGGGCATCAATCCAGCCTTCATAGAACCAAGGGCCTCTCCTCCCATT	205365

AL671899.11	101	GATGCACAACAATGCCATCCTCTGCTACATATGCAGCTAGAGCCATGTGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	205366	GATGCACAACAATGCCATCCTCTGCTACATATGCAGCTAGAGCCATGTGT	205415

AL671899.11	151	ACTCCTTTGTTGATGGCTTAGTCCCTGGGAGCTCTGGGGGGACTGGTTGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	205416	ACTCCTTTGTTGATGGCTTAGTCCCTGGGAGCTCTGGGGGGACTGGTTGG	205465

AL671899.11	201	TTGATGCTCTTGTTCGCTTACAGTGTTTTTGTGTTATGAAAGCAGATTTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	205466	TTGATGCTCTTGTTCGCTTACAGTGTTTTTGTGTTATGAAAGCAGATTTT	205515

AL671899.11	251	GTACATGATTGGACTGTGGACCTTCTGGTGTGGGCCACTGCCCATCAGAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	205516	GTACATGATTGGACTGTGGACCTTCTGGTGTGGGCCACTGCCCATCAGAT	205565

AL671899.11	301	GACAGCGTTTACCCTTCCATACAAGCAAAATGTCTGCAGGCTTTGTTGAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	205566	GACAGCGTTTACCCTTCCATACAAGCAAAATGTCTGCAGGCTTTGTTGAA	205615

AL671899.11	351	TGTTGGTATTGGGAAAGAGAGTCCCCACTTAAGAGTTGCTTTAGTAGAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	205616	TGTTGGTATTGGGAAAGAGAGTCCCCACTTAAGAGTTGCTTTAGTAGAAA	205665

AL671899.11	401	AAATTAAACGTAGATGTGAATTGTTTCTGTCTTGTTCAGTTGAGGATTCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	205666	AAATTAAACGTAGATGTGAATTGTTTCTGTCTTGTTCAGTTGAGGATTCA	205715

AL671899.11	451	GGATCCTCAGTAAACAATTTCAAGTGGGTAGCTGAGGATGTAGCCCAGTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	205716	GGATCCTCAGTAAACAATTTCAAGTGGGTAGCTGAGGATGTAGCCCAGTA	205765

AL671899.11	501	GTAGAGTGTTTGCCTAGCAGAAGAGAAGCCCTGGGTCCAATCTATGCCCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	205766	GTAGAGTGTTTGCCTAGCAGAAGAGAAGCCCTGGGTCCAATCTATGCCCA	205815

AL671899.11	551	AATTTTAAAAAATATGGCAGTTAGAGAACACGGAAGTTTTAGGTTTAATT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	205816	AATTTTAAAAAATATGGCAGTTAGAGAACACGGAAGTTTTAGGTTTAATT	205865

AL671899.11	601	TTCTGGGCAATAGTTTTAGATTTCCTCTATCTATCTATCTTTCTTTCTTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	205866	TTCTGGGCAATAGTTTTAGATTTCCTCTATCTATCTATCTTTCTTTCTTT	205915

AL671899.11	651	CTTTCTTTCTTTCTTCCTCTCTCATTCTTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	205916	CTTTCTTTCTTTCTTCCTCTCTCATTCTTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTAA	205965

AL671899.11	701	ATTTTTAGGATATTCACATATGTAGTTTTAGAATCAAAGATTAAGATGTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	205966	ATTTTTAGGATATTCACATATGTAGTTTTAGAATCAAAGATTAAGATGTC	206015

AL671899.11	751	TCTATAAATTATGTAATAAAAACAATCCTTTAGGCTATACCATCTAATTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	206016	TCTATAAATTATGTAATAAAAACAATCCTTTAGGCTATACCATCTAATTT	206065

AL671899.11	801	CAACTTCTCTGAGGCAGCACTTAAAGCTTCTTTTTTTTTTAAGATTAATT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	206066	CAACTTCTCTGAGGCAGCACTTAAAGCTTCTTTTTTTTTTAAGATTAATT	206115

AL671899.11	851	TTTATTTTTATGAGTGTGGGTGTTTTTCCTCACCTATATTTACATGTGTA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	206116	TTTATTTTTATGAGTGTGGGTGTTTTTCCTCACCTATATTTACATGTGTA	206165

AL671899.11	901	GTGTGCCTTCAAAGGCAAGAAGAGGACACTGGGACCCTTGGAGTGCTGAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	206166	GTGTGCCTTCAAAGGCAAGAAGAGGACACTGGGACCCTTGGAGTGCTGAT	206215

AL671899.11	951	TATGTATGGTTCTGTTCCACCCAGCATTTGGATGCTGCCAACTGAGCCCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	206216	TATGTATGGTTCTGTTCCACCCAGCATTTGGATGCTGCCAACTGAGCCCA	206265

AL671899.11	1001	GGTCCTCTGCAAGAACAGCAGGTTCTCTGGCTTGCTGAGCCATCTCTCCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	206266	GGTCCTCTGCAAGAACAGCAGGTTCTCTGGCTTGCTGAGCCATCTCTCCA	206315

AL671899.11	1051	GCCCCACTCTCAGTTCCTTTATCACCTTCTATTGAGAACATGGGCATCAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	206316	GCCCCACTCTCAGTTCCTTTATCACCTTCTATTGAGAACATGGGCATCAT	206365

AL671899.11	1101	CTGATAGGCATCATCTACACACTTTTCATAATGGAATAAATTTCTGCATA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	206366	CTGATAGGCATCATCTACACACTTTTCATAATGGAATAAATTTCTGCATA	206415

AL671899.11	1151	TCTGTTCTCTGGCCACCCACAGTTGCCTAGAGGATTGGACATAGTCAATG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	206416	TCTGTTCTCTGGCCACCCACAGTTGCCTAGAGGATTGGACATAGTCAATG	206465

AL671899.11	1201	CAACCTCTCAAATAGCTTACACATAGCAATTTTTGTCAAATTTATCAGTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	206466	CAACCTCTCAAATAGCTTACACATAGCAATTTTTGTCAAATTTATCAGTA	206515

AL671899.11	1251	GTTGTGCTAGTAGAACTTTTCATGGTTGGGCCATACTGTGAGCATTTGAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	206516	GTTGTGCTAGTAGAACTTTTCATGGTTGGGCCATACTGTGAGCATTTGAG	206565

AL671899.11	1301	AGTAATATATATGCATGAGACATGATGTACTCGTTAACAGGCCTAGAATC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	206566	AGTAATATATATGCATGAGACATGATGTACTCGTTAACAGGCCTAGAATC	206615

AL671899.11	1351	ACCGAGGAGGAAAGCCTCCAGTTAACTGTGGTGGGGAGGCCTACCCTCAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	206616	ACCGAGGAGGAAAGCCTCCAGTTAACTGTGGTGGGGAGGCCTACCCTCAC	206665

AL671899.11	1401	TGAGGGCCACAGCAGCTGGGCTTTGCTCTTGTGCTTGATAAAAAGAGAAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	206666	TGAGGGCCACAGCAGCTGGGCTTTGCTCTTGTGCTTGATAAAAAGAGAAA	206715

AL671899.11	1451	GCTTGCTGCGCACTAGCACTCGCTGTCTGTCCTTCCTGATGGTGTGCGCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	206716	GCTTGCTGCGCACTAGCACTCGCTGTCTGTCCTTCCTGATGGTGTGCGCA	206765

AL671899.11	1501	GTGTGACTAGCAGCTGCCCTTTCCTGCCACCAGGCCTTCCTCCTTTAAGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	206766	GTGTGACTAGCAGCTGCCCTTTCCTGCCACCAGGCCTTCCTCCTTTAAGG	206815

AL671899.11	1551	TGCTTCATGTCATGTATTTTGACTGGGGCTGGAGAGATGGCTCAGCAGTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	206816	TGCTTCATGTCATGTATTTTGACTGGGGCTGGAGAGATGGCTCAGCAGTT	206865

AL671899.11	1601	AAGAGCAGTGACTGCTCTTCCAGAGGTTCTGAGTTTAATACCCAGCAACC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	206866	AAGAGCAGTGACTGCTCTTCCAGAGGTTCTGAGTTTAATACCCAGCAACC	206915

AL671899.11	1651	ACATGGTGGCTCACAACCATCTGTAATGGGTTCTGATGCCCTCTTCTGAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	206916	ACATGGTGGCTCACAACCATCTGTAATGGGTTCTGATGCCCTCTTCTGAC	206965

AL671899.11	1701	ATGCAGGTGTGCATGCAGATAAGAGTGTTCATATACATGAAATAAATTTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	206966	ATGCAGGTGTGCATGCAGATAAGAGTGTTCATATACATGAAATAAATTTT	207015

AL671899.11	1751	TAAAAAATCAGAACTATTTTGAGCACATTCAGTCTAAACCATGCTTTTTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	207016	TAAAAAATCAGAACTATTTTGAGCACATTCAGTCTAAACCATGCTTTTTG	207065

AL671899.11	1801	TGTGGATTCCTGGATGGGCTGGAGAACTCTTCCAGAGTTGAGTTCCCAGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	207066	TGTGGATTCCTGGATGGGCTGGAGAACTCTTCCAGAGTTGAGTTCCCAGA	207115

AL671899.11	1851	ACTCGGGTTGGGTGGGTCACAACCCTGTAACTCTAGGCCTCAGGATCTGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	207116	ACTCGGGTTGGGTGGGTCACAACCCTGTAACTCTAGGCCTCAGGATCTGA	207165

AL671899.11	1901	CATCTTCTGGCCTCTGCAGGATTTCACATAAGGGAACGTACACACTAAGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	207166	CATCTTCTGGCCTCTGCAGGATTTCACATAAGGGAACGTACACACTAAGT	207215

AL671899.11	1951	AACACATAAATAAAAGTGAATTAAAACGTTTAAAAAGATTTATGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671854.14	207216	AACACATAAATAAAAGTGAATTAAAACGTTTAAAAAGATTTATGGAATTC	207265

Overview

Query
AL671899.11 - 132775 bps
Hit
AL671854.14 - 207265 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link