<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL669914.2	1	GAATTCAAAAGCAGCACAACTCTTAGGTTTGAACACTTTTTTTAATGGTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	82828	GAATTCAAAAGCAGCACAACTCTTAGGTTTGAACACTTTTTTTAATGGTA	82877

AL669914.2	51	TTTCAATAGATCCATCTACAGAGCCTCGCAGGGTGTTACTTGCAGTTGGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	82878	TTTCAATAGATCCATCTACAGAGCCTCGCAGGGTGTTACTTGCAGTTGGC	82927

AL669914.2	101	CTTTAATACCTTAAGTGGGTCTGCTTAAAAACTAATTGTTTTTATGTTAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	82928	CTTTAATACCTTAAGTGGGTCTGCTTAAAAACTAATTGTTTTTATGTTAA	82977

AL669914.2	151	TCAGGTTTTAAAAATACTAAGTGTTCCTAAGAAATATACACACCACTTAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	82978	TCAGGTTTTAAAAATACTAAGTGTTCCTAAGAAATATACACACCACTTAG	83027

AL669914.2	201	ATGTGGATACTTCCTAAAAACAGGCAGTGCATGAGCACTGGTGATGGACA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	83028	ATGTGGATACTTCCTAAAAACAGGCAGTGCATGAGCACTGGTGATGGACA	83077

AL669914.2	251	TTGTGACTGCATCGAGCGCTTGCAACTTTGAGGTGAATGAAGTCTGTACT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	83078	TTGTGACTGCATCGAGCGCTTGCAACTTTGAGGTGAATGAAGTCTGTACT	83127

AL669914.2	301	GACTCCTGGTTGCAACACATAGGAACACAGTGGCTACTTTGTATTGAGGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	83128	GACTCCTGGTTGCAACACATAGGAACACAGTGGCTACTTTGTATTGAGGA	83177

AL669914.2	351	GATGTCCTGGACTCACAGAAACTCAGGGCTATGGAATAAAGGTAAATTTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	83178	GATGTCCTGGACTCACAGAAACTCAGGGCTATGGAATAAAGGTAAATTTA	83227

AL669914.2	401	AAACACCACAAGCGGGAGTCACAGATACCTTGTTTGCAAAAGTGAAACTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	83228	AAACACCACAAGCGGGAGTCACAGATACCTTGTTTGCAAAAGTGAAACTT	83277

AL669914.2	451	AGGAGCTTTGTGAGTCCTGTTGTAATGCTTTTAGACACTTTATATATCAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	83278	AGGAGCTTTGTGAGTCCTGTTGTAATGCTTTTAGACACTTTATATATCAA	83327

AL669914.2	501	GGGGCCAAAGTCACATGTTTTTACCGATTAGATTCCTGATCATTCAGGGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	83328	GGGGCCAAAGTCACATGTTTTTACCGATTAGATTCCTGATCATTCAGGGG	83377

AL669914.2	551	TTACCAAGATTCTGCTACCCACTGTAGTTAATACACAAAAAGCAAACTGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	83378	TTACCAAGATTCTGCTACCCACTGTAGTTAATACACAAAAAGCAAACTGG	83427

AL669914.2	601	TCTCTATACTATCTCATGCACCCAGGCACAACTTTTCCAGATTTAAAGAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	83428	TCTCTATACTATCTCATGCACCCAGGCACAACTTTTCCAGATTTAAAGAA	83477

AL669914.2	651	AAAGAAAAAAGAAATAAAAGAAAAAAACCTCTGTCTCTACACCTCCATTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	83478	AAAGAAAAAAGAAATAAAAGAAAAAAACCTCTGTCTCTACACCTCCATTC	83527

AL669914.2	701	CCAGGGAGAGCTCCCTCTCTGGCACCAAGCTCCCTGGGGTGAGTTTTCTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	83528	CCAGGGAGAGCTCCCTCTCTGGCACCAAGCTCCCTGGGGTGAGTTTTCTT	83577

AL669914.2	751	TTTGAAGAGTCCAGGGGAACAGGTAAGCAGCGGGGAAGCAGGGAGTCCAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	83578	TTTGAAGAGTCCAGGGGAACAGGTAAGCAGCGGGGAAGCAGGGAGTCCAT	83627

AL669914.2	801	TTCAGGGACAGGAATTCCCGGATGAAAAGTGAAAGGAGAGGGACGGGGCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	83628	TTCAGGGACAGGAATTCCCGGATGAAAAGTGAAAGGAGAGGGACGGGGCC	83677

AL669914.2	851	CAAGCTGAGGGTTTCTTCCTGGTTTCTCGGACAGCTCCTGGACCAAGACT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	83678	CAAGCTGAGGGTTTCTTCCTGGTTTCTCGGACAGCTCCTGGACCAAGACT	83727

AL669914.2	901	CAGGGAACATTGAGACAGAGCGTTTGTCACAGGAGGAGCGGGGTCAGGGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	83728	CAGGGAACATTGAGACAGAGCGTTTGTCACAGGAGGAGCGGGGTCAGGGC	83777

AL669914.2	951	GAAGTCCCAGAGCCCCAGGCATGGCTCTCAGGGTCTCAGGCCCCGAAGGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	83778	GAAGTCCCAGAGCCCCAGGCATGGCTCTCAGGGTCTCAGGCCCCGAAGGC	83827

AL669914.2	1001	GGTGCATGGGCTGGGGAGGTGCAGCATTGGGGATTCCCCATCTCCGCAGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	83828	GGTGCATGGGCTGGGGAGGTGCAGCATTGGGGATTCCCCATCTCCGCAGA	83877

AL669914.2	1051	GTTTCTCTTCTCCCTCTCCCAGCCTGCGACGGGTCCTTCTTCCTGGACAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	83878	GTTTCTCTTCTCCCTCTCCCAGCCTGCGACGGGTCCTTCTTCCTGGACAC	83927

AL669914.2	1101	TCACGACGCGGACCCAGTTCTCACTCCCACTGAGTGTCGGGTTTCTAGGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	83928	TCACGACGCGGACCCAGTTCTCACTCCCACTGAGTGTCGGGTTTCTAGGG	83977

AL669914.2	1151	AAGCCAATCAGCGTCGCGCGGCCCCGGTTCTAAAGTCCCCACGCACCCAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	83978	AAGCCAATCAGCGTCGCGCGGCCCCGGTTCTAAAGTCCCCACGCACCCAC	84027

AL669914.2	1201	CGGGACTCGGAGTCTCCCCAGACGCCGACGATGGGGTCATGGCGCCCCGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	84028	CGGGACTCGGAGTCTCCCCAGACGCCGACGATGGGGTCATGGCGCCCCGA	84077

AL669914.2	1251	ACCCTCCTCCTGCTGCTCTCGGGGACCCTGGCCCTGGCCGAGACCTGGGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	84078	ACCCTCCTCCTGCTGCTCTCGGGGACCCTGGCCCTGGCCGAGACCTGGGC	84127

AL669914.2	1301	GGGTGAGTGCGGGGTCAGGAGGGAAACGGCCTCTGCCGTGAGGAGCGAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	84128	GGGTGAGTGCGGGGTCAGGAGGGAAACGGCCTCTGCCGTGAGGAGCGAAA	84177

AL669914.2	1351	GGTCCACCTGGCTGGGGCGCAGGACCCGGGGAGCCGCGCCGGGAGGAGGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	84178	GGTCCACCTGGCTGGGGCGCAGGACCCGGGGAGCCGCGCCGGGAGGAGGG	84227

AL669914.2	1401	TCGGGCGGGTCTCAGCCCCTCCTCGCCCCCAGGCTCCCACTCCATGAGGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	84228	TCGGGCGGGTCTCAGCCCCTCCTCGCCCCCAGGCTCCCACTCCATGAGGT	84277

AL669914.2	1451	ATTTCAGCACCGCCGTTTCCTGGCCGGGCCGCGGGGAGCCCAGCTTCATT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	84278	ATTTCAGCACCGCCGTTTCCTGGCCGGGCCGCGGGGAGCCCAGCTTCATT	84327

AL669914.2	1501	GCCGTGGGCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGGTCGACAGTGACGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	84328	GCCGTGGGCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGGTCGACAGTGACGC	84377

AL669914.2	1551	CGTGAGTCTGAGGATGAAGACGCGGGCGCGGTGGGTGGAGCAGGAGGGGC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	84378	CGTGAGTCTGAGGATGAAGACGCGGGCGCGGTGGGTGGAGCAGGAGGGGC	84427

AL669914.2	1601	CGGAGTATTGGGACCTACAGACACTGGGCGCCAAGGCCCAGGCACAGACT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	84428	CGGAGTATTGGGACCTACAGACACTGGGCGCCAAGGCCCAGGCACAGACT	84477

AL669914.2	1651	GACCGAGTGAACCTGCGGACCCTGCTCCGCTACTACAACCAGAGCGAGGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	84478	GACCGAGTGAACCTGCGGACCCTGCTCCGCTACTACAACCAGAGCGAGGC	84527

AL669914.2	1701	GGGTGAGTGACCCCGGCCCGGGGCGCAGATCACTTACTCCCCGCTCCATG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	84528	GGGTGAGTGACCCCGGCCCGGGGCGCAGATCACTTACTCCCCGCTCCATG	84577

AL669914.2	1751	CCTCACGGACGGCCCTGGTCCCCTGAGTCTCCGGGTCCAAGATCGACCCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	84578	CCTCACGGACGGCCCTGGTCCCCTGAGTCTCCGGGTCCAAGATCGACCCC	84627

AL669914.2	1801	GAGGCTGCGGGACCTGCAGAGATCCTCGACCCGGGAGAGCCCCAGGCGCC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	84628	GAGGCTGCGGGACCTGCAGAGATCCTCGACCCGGGAGAGCCCCAGGCGCC	84677

AL669914.2	1851	TTTACCTGGTTTCATCTTCAGTTGAGGCCAAAATCTCCGCAGGTTGCTAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	84678	TTTACCTGGTTTCATCTTCAGTTGAGGCCAAAATCTCCGCAGGTTGCTAG	84727

AL669914.2	1901	GGGCCGGGCCAGGGCTCGGTGGGCGGGGCTGACCGCGGGAACTGGGCCAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	84728	GGGCCGGGCCAGGGCTCGGTGGGCGGGGCTGACCGCGGGAACTGGGCCAG	84777

AL669914.2	1951	GGTATCACATCCTCCAGGGAATGTTTGGCTGCGACCTGGGGCCCGACGGG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL671277.5	84778	GGTATCACATCCTCCAGGGAATGTTTGGCTGCGACCTGGGGCCCGACGGG	84827

Overview

Query
AL669914.2 - 159178 bps
Hit
AL671277.5 - 84827 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link