<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645748.9	1	GAATTCAAAAGACCATACAAGAGACTTGGAAACCATTGAAGTCTTAGAGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	90104	GAATTCAAAAGACCATACAAGAGACTTGGAAACCATTGAAGTCTTAGAGG	90153

AL645748.9	51	CATATTGATATTTAGGGGCAATTAGTTTTGCTGTTTTCTCTCTCTCTCTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	90154	CATATTGATATTTAGGGGCAATTAGTTTTGCTGTTTTCTCTCTCTCTCTC	90203

AL645748.9	101	TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATCTATCCAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	90204	TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATCTATCCAT	90253

AL645748.9	151	CATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATGTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	90254	CATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATGTT	90303

AL645748.9	201	TATATGTATATCCTTCTATATATAAACATATACACACATGCTCACGTGCG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	90304	TATATGTATATCCTTCTATATATAAACATATACACACATGCTCACGTGCG	90353

AL645748.9	251	TGCGCGCGCACGTGCGTGCGCGCGCACGCGCGCACACACACACACACACA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	90354	TGCGCGCGCACGTGCGTGCGCGCGCACGCGCGCACACACACACACACACA	90403

AL645748.9	301	CATAAACATCCTTAACAAAATTTATTCTCATCAAACTTTAAAAATGTCAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	90404	CATAAACATCCTTAACAAAATTTATTCTCATCAAACTTTAAAAATGTCAC	90453

AL645748.9	351	TTAAAGATTCAGAAATTCAATTAAATATTATCAGTTGGATTATTAATGAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	90454	TTAAAGATTCAGAAATTCAATTAAATATTATCAGTTGGATTATTAATGAA	90503

AL645748.9	401	TTTTGCTTGTTTGGATAAAAGGATGCTTTGATATGAGTTGGTGGACCCTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	90504	TTTTGCTTGTTTGGATAAAAGGATGCTTTGATATGAGTTGGTGGACCCTG	90553

AL645748.9	451	TATGAAAATCCATGAGTGTCACAGGCCTCTTGGTGGGTTGTTTTCTTTCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	90554	TATGAAAATCCATGAGTGTCACAGGCCTCTTGGTGGGTTGTTTTCTTTCT	90603

AL645748.9	501	GTGAAGCTGAAGGTGTTTAGCTACTAAAAGCCTTAATTTTCTCACTTGTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	90604	GTGAAGCTGAAGGTGTTTAGCTACTAAAAGCCTTAATTTTCTCACTTGTG	90653

AL645748.9	551	TCATGGAACCATGGAAATGAGGCTAAAAATATAGAAACGTTTCTTCATAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	90654	TCATGGAACCATGGAAATGAGGCTAAAAATATAGAAACGTTTCTTCATAA	90703

AL645748.9	601	AGAAACGTGTGTATAGAAGCTGGATTGTCATCACTGTTAGTGACACGAGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	90704	AGAAACGTGTGTATAGAAGCTGGATTGTCATCACTGTTAGTGACACGAGT	90753

AL645748.9	651	AGCAATAGCAGTCTGCCACACTTAGTTTATTTTTATTTTCATTGTGTATT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	90754	AGCAATAGCAGTCTGCCACACTTAGTTTATTTTTATTTTCATTGTGTATT	90803

AL645748.9	701	TTTTTGTGGAAAATTCTTTGTCATATATATGTAATACAAAAACATACGAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	90804	TTTTTGTGGAAAATTCTTTGTCATATATATGTAATACAAAAACATACGAA	90853

AL645748.9	751	TCTTTTTAGAAAACACATATAGGTATTTTGCTTTTGTGTATTTCTGTACC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	90854	TCTTTTTAGAAAACACATATAGGTATTTTGCTTTTGTGTATTTCTGTACC	90903

AL645748.9	801	GCATGTACAGACATCTTCTGCATTTCAGGGAATCCAGAAGAGGAATTTGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	90904	GCATGTACAGACATCTTCTGCATTTCAGGGAATCCAGAAGAGGAATTTGG	90953

AL645748.9	851	GTCTTCTTGAGCTAGAGTTACAAATGGTTGTGAGTTGCCATGTGACTGCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	90954	GTCTTCTTGAGCTAGAGTTACAAATGGTTGTGAGTTGCCATGTGACTGCT	91003

AL645748.9	901	GGGATTTGAATCTGAGTCCTCTGAGAATAGCCATTGCTTTAAACTACTAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	91004	GGGATTTGAATCTGAGTCCTCTGAGAATAGCCATTGCTTTAAACTACTAA	91053

AL645748.9	951	GCCATCTTTCCAGCTTGGAATCTCTATTTTTAAACTGTTTTTATACATAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	91054	GCCATCTTTCCAGCTTGGAATCTCTATTTTTAAACTGTTTTTATACATAT	91103

AL645748.9	1001	TTATTTATAACTTGTCTACTAAGAAGAAAACTGAAAGACATCTAGTCATA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	91104	TTATTTATAACTTGTCTACTAAGAAGAAAACTGAAAGACATCTAGTCATA	91153

AL645748.9	1051	AAAGCAAAACTTGAAGAATGGTAAAAAATACACATGCAACTCATTTTCCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	91154	AAAGCAAAACTTGAAGAATGGTAAAAAATACACATGCAACTCATTTTCCT	91203

AL645748.9	1101	ATCTGAGCACTTCATCAAGATGACAATAGTGTAGTGCAGGGCTTGTTATT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	91204	ATCTGAGCACTTCATCAAGATGACAATAGTGTAGTGCAGGGCTTGTTATT	91253

AL645748.9	1151	GGCAATTTCCAAAAGAAGGAAGCAGGTGAGATCCATAGGGAGATAGTAGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	91254	GGCAATTTCCAAAAGAAGGAAGCAGGTGAGATCCATAGGGAGATAGTAGG	91303

AL645748.9	1201	ACCTGTAATAACAGTAGCCACCTTAAACACAGGAATACTGTCAGGTGTGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	91304	ACCTGTAATAACAGTAGCCACCTTAAACACAGGAATACTGTCAGGTGTGC	91353

AL645748.9	1251	TGCATATCTATGATTGTGTATCTTCCTAAAGACTTAAAGAAAAAGATGAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	91354	TGCATATCTATGATTGTGTATCTTCCTAAAGACTTAAAGAAAAAGATGAA	91403

AL645748.9	1301	CATAATTAATGCGTGAATTTTTTACAAGAAATCTCAGCAATAAGAGTTAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	91404	CATAATTAATGCGTGAATTTTTTACAAGAAATCTCAGCAATAAGAGTTAT	91453

AL645748.9	1351	ATTCAGAAAGAGAAGTCTAGCCACAAAACATAGAATGTCTAAGAAGAGCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	91454	ATTCAGAAAGAGAAGTCTAGCCACAAAACATAGAATGTCTAAGAAGAGCA	91503

AL645748.9	1401	TTATTATGTTGAAGTACAAAGAACAGATGAAATAAACAGAAGTTATAATC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	91504	TTATTATGTTGAAGTACAAAGAACAGATGAAATAAACAGAAGTTATAATC	91553

AL645748.9	1451	ACAGTGGGCAATAACCTGAATTATTAGTAAATACTCAAAACAAATGGTAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	91554	ACAGTGGGCAATAACCTGAATTATTAGTAAATACTCAAAACAAATGGTAT	91603

AL645748.9	1501	AAGTATTCCAACTGAAAGACAGGCCTGGGAGTGAAGCTCAGAGGCAGAGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	91604	AAGTATTCCAACTGAAAGACAGGCCTGGGAGTGAAGCTCAGAGGCAGAGT	91653

AL645748.9	1551	GCTTGCCTAGCATACACAAGACTCTGGGCTCAGACACTAGTACTATAACA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	91654	GCTTGCCTAGCATACACAAGACTCTGGGCTCAGACACTAGTACTATAACA	91703

AL645748.9	1601	TTGCTTTGCTACCATAAGCACAGTTTCTACTATGGTACTTGCTTATAAAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	91704	TTGCTTTGCTACCATAAGCACAGTTTCTACTATGGTACTTGCTTATAAAC	91753

AL645748.9	1651	AAAAGAACACGATTACACATAACAATAATTTACTTCTGTTGTATGCTATT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	91754	AAAAGAACACGATTACACATAACAATAATTTACTTCTGTTGTATGCTATT	91803

AL645748.9	1701	AATAAAAATAAGGGACTAATTTTGAAAATATTTACTATGCCAATACGAAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	91804	AATAAAAATAAGGGACTAATTTTGAAAATATTTACTATGCCAATACGAAG	91853

AL645748.9	1751	CAGAGGAAGCCAGAATAAACTGCATTAATTCACGTCATGTTGACCTCAGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	91854	CAGAGGAAGCCAGAATAAACTGCATTAATTCACGTCATGTTGACCTCAGA	91903

AL645748.9	1801	ATGAGGAAGATCACCTGGAAAGAAGTGGTTGGAAGCAAAATAATTGAGGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	91904	ATGAGGAAGATCACCTGGAAAGAAGTGGTTGGAAGCAAAATAATTGAGGC	91953

AL645748.9	1851	ATTGATTCTATAAAAATGTACAGGGGTGCTCATGCCTGCATTCCTGACAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	91954	ATTGATTCTATAAAAATGTACAGGGGTGCTCATGCCTGCATTCCTGACAA	92003

AL645748.9	1901	CAGAGTGTCAAGGAGAAGCAGACATACTTGTCACCATAGTAAGTGAGTTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	92004	CAGAGTGTCAAGGAGAAGCAGACATACTTGTCACCATAGTAAGTGAGTTA	92053

AL645748.9	1951	AGCTGTCCTAAAGAAATGGAAGAAGGAACAAGTACAAAATTAGGTAAATG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL670757.5	92054	AGCTGTCCTAAAGAAATGGAAGAAGGAACAAGTACAAAATTAGGTAAATG	92103

Overview

Query
AL645748.9 - 58318 bps
Hit
AL670757.5 - 92103 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link