<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL627074.11	1	GAATTCTGTGGAGAGCTTGAATTGATTTGGATCCTCTAAACAGAGAACTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	62899	GAATTCTGTGGAGAGCTTGAATTGATTTGGATCCTCTAAACAGAGAACTG	62948

AL627074.11	51	TATAATATATTGGGAAACAAGGACTTGGATAGAAATTTGTACATGATCTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	62949	TATAATATATTGGGAAACAAGGACTTGGATAGAAATTTGTACATGATCTT	62998

AL627074.11	101	CATTAACGGGGAGAGATGGAGGTTTTTAGAGGTTTTGAGGTAGAAGTAAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	62999	CATTAACGGGGAGAGATGGAGGTTTTTAGAGGTTTTGAGGTAGAAGTAAG	63048

AL627074.11	151	CCTCTAGAGCCAAATGGATATGCCAGTTCTTAGTGGAAGTCTTTGGTACC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	63049	CCTCTAGAGCCAAATGGATATGCCAGTTCTTAGTGGAAGTCTTTGGTACC	63098

AL627074.11	201	TAGTAGCTGACTCAGAATCTTTCTTTAGAAAGCATGGAGACCATGGGAAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	63099	TAGTAGCTGACTCAGAATCTTTCTTTAGAAAGCATGGAGACCATGGGAAG	63148

AL627074.11	251	TATAGTTAGTTTTGCTGCTGTTTGTTTTAATAGTGCTGAGGATAGGTCAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	63149	TATAGTTAGTTTTGCTGCTGTTTGTTTTAATAGTGCTGAGGATAGGTCAC	63198

AL627074.11	301	AAGGCCTTGGCCATGTTAGGTAAGTGCGATACCTCTGAGTCAATACCCCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	63199	AAGGCCTTGGCCATGTTAGGTAAGTGCGATACCTCTGAGTCAATACCCCA	63248

AL627074.11	351	GCTACAAGTAAGTTTTGGTTTTTGGTTTTGTGTTGTGGGTTTTTTGTTTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	63249	GCTACAAGTAAGTTTTGGTTTTTGGTTTTGTGTTGTGGGTTTTTTGTTTG	63298

AL627074.11	401	GTTGGTTTTTGTTTTGTTTGTTTTTCAAGGCAGGGTTTCTCTGTGTAGCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	63299	GTTGGTTTTTGTTTTGTTTGTTTTTCAAGGCAGGGTTTCTCTGTGTAGCC	63348

AL627074.11	451	TTGGCTGTTCTGGATTTCACTCTGTTGATCAGGCTGGCCTTGAACTCAAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	63349	TTGGCTGTTCTGGATTTCACTCTGTTGATCAGGCTGGCCTTGAACTCAAA	63398

AL627074.11	501	GATCTGCCTGCCTCTGCCTCCTAAGAGTTGGGATTAAAGGCATAACACCA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	63399	GATCTGCCTGCCTCTGCCTCCTAAGAGTTGGGATTAAAGGCATAACACCA	63448

AL627074.11	551	CCATCCAGCTACAAATATGTTGTTAGTGAACCAAGAGATTTTTTTTTCCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	63449	CCATCCAGCTACAAATATGTTGTTAGTGAACCAAGAGATTTTTTTTTCCT	63498

AL627074.11	601	TCACTTTAAACTTTGTAGGTTATAGTCATACTTTGCCAGTAAACATTCAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	63499	TCACTTTAAACTTTGTAGGTTATAGTCATACTTTGCCAGTAAACATTCAA	63548

AL627074.11	651	AGAGATTTGGCTTCACTTTAGTTTGTTTAAAAAAAAAGTTTCTTCTGGAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	63549	AGAGATTTGGCTTCACTTTAGTTTGTTTAAAAAAAAAGTTTCTTCTGGAT	63598

AL627074.11	701	ATAAGTTCATTGATGAAGTTATGTGAACATAGGATTTTCATTTACTCTTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	63599	ATAAGTTCATTGATGAAGTTATGTGAACATAGGATTTTCATTTACTCTTT	63648

AL627074.11	751	TAAAAATGCTTTCATTTCAGTTATAAAATAGTATAAAATAAATTCTTTCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	63649	TAAAAATGCTTTCATTTCAGTTATAAAATAGTATAAAATAAATTCTTTCT	63698

AL627074.11	801	TTTTTTATAGTAGATGGCAAAGTTCCTAAGACATTCCAGAATTCCCTTGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	63699	TTTTTTATAGTAGATGGCAAAGTTCCTAAGACATTCCAGAATTCCCTTGT	63748

AL627074.11	851	TCATCTTGGACTTAACACTATGAAGTCTGCAAACATATGTATAGGTCGGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	63749	TCATCTTGGACTTAACACTATGAAGTCTGCAAACATATGTATAGGTCGGC	63798

AL627074.11	901	CAGTGCTCCTTACCAGTTTGGATGGAAAGCAGGAGGTAAAAGTCCTTATC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	63799	CAGTGCTCCTTACCAGTTTGGATGGAAAGCAGGAGGTAAAAGTCCTTATC	63848

AL627074.11	951	CTTTTCCTTTGCAAACATTTGAAATCATACTGGTCTGAACTTTTAATACA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	63849	CTTTTCCTTTGCAAACATTTGAAATCATACTGGTCTGAACTTTTAATACA	63898

AL627074.11	1001	AGGAGTTGGTGAACAGAACTTTTTAATTGTATTTGTGGATCAGAAGTTGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	63899	AGGAGTTGGTGAACAGAACTTTTTAATTGTATTTGTGGATCAGAAGTTGG	63948

AL627074.11	1051	TTCTTTCTTTTTGTGATGTCCATTTCAAGGGTCAACAGGTTATCAGGATT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	63949	TTCTTTCTTTTTGTGATGTCCATTTCAAGGGTCAACAGGTTATCAGGATT	63998

AL627074.11	1101	GCTGGCAAGTGTCATCATCTGTTGAACCATCTTGCTGACTCAAAAAAAAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	63999	GCTGGCAAGTGTCATCATCTGTTGAACCATCTTGCTGACTCAAAAAAAAA	64048

AL627074.11	1151	AAAACCCCACAAAAAATTGTGTATTATAAAAGACAGTCATACGGGTGCTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	64049	AAAACCCCACAAAAAATTGTGTATTATAAAAGACAGTCATACGGGTGCTA	64098

AL627074.11	1201	GAGCAGTGGCTCAGCAGTTACGAATGTACTGTTTGCTCTTCCAAAGGATC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	64099	GAGCAGTGGCTCAGCAGTTACGAATGTACTGTTTGCTCTTCCAAAGGATC	64148

AL627074.11	1251	TGAGCTCAGTTCCCAGCACCTACGTCAGGTATCACAGTCGCCTATAACTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	64149	TGAGCTCAGTTCCCAGCACCTACGTCAGGTATCACAGTCGCCTATAACTC	64198

AL627074.11	1301	TAGCACATACCCTCTCACCACACATATGCATATATACATAATTAAGGCAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	64199	TAGCACATACCCTCTCACCACACATATGCATATATACATAATTAAGGCAT	64248

AL627074.11	1351	CACGACTGTCACGTTCATAGTAGTCACTCAAATACCAGAGAAAGGGTCTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	64249	CACGACTGTCACGTTCATAGTAGTCACTCAAATACCAGAGAAAGGGTCTT	64298

AL627074.11	1401	TTTTTCCTCAAGGAGTTAGTGATGCATATCCCTCCCCGTTCTGTTTCTCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	64299	TTTTTCCTCAAGGAGTTAGTGATGCATATCCCTCCCCGTTCTGTTTCTCT	64348

AL627074.11	1451	AATCTGCTAAATATATTTCTCTGCAGAAATGGGATTTTTGAGGTAAGAAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	64349	AATCTGCTAAATATATTTCTCTGCAGAAATGGGATTTTTGAGGTAAGAAG	64398

AL627074.11	1501	AGCACCTGCCCTTCATACAAATATTTATTATTCTCCTAGGTTTGGCTATA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	64399	AGCACCTGCCCTTCATACAAATATTTATTATTCTCCTAGGTTTGGCTATA	64448

AL627074.11	1551	CTTCTTTCTCTTGATGTCATATGGAATTTGAAGACTTCCAAGACCAGAAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	64449	CTTCTTTCTCTTGATGTCATATGGAATTTGAAGACTTCCAAGACCAGAAT	64498

AL627074.11	1601	TTTTCCCAGATTTTTAGCTGCTTGGCTCTCTGTCCTGTTACCAACTCCTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	64499	TTTTCCCAGATTTTTAGCTGCTTGGCTCTCTGTCCTGTTACCAACTCCTG	64548

AL627074.11	1651	CCTCTGCCCTAACTTTTTTTTTTTTTTAACTTATTTCATCTGTGGGAGAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	64549	CCTCTGCCCTAACTTTTTTTTTTTTTTAACTTATTTCATCTGTGGGAGAT	64598

AL627074.11	1701	GTTTGTATACATGTCTTCATATACCTATAGATACCTCAGATGTTTCTTAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	64599	GTTTGTATACATGTCTTCATATACCTATAGATACCTCAGATGTTTCTTAG	64648

AL627074.11	1751	GCCCCACTTTCCCTGCTCTTTGAGCTGGGGTCTGTTACTTGGCCTGGAAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	64649	GCCCCACTTTCCCTGCTCTTTGAGCTGGGGTCTGTTACTTGGCCTGGAAC	64698

AL627074.11	1801	TCATAGATACGTCTGTGGTGTTTGGTTTGTATGCTCCAGAAACATACTGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	64699	TCATAGATACGTCTGTGGTGTTTGGTTTGTATGCTCCAGAAACATACTGT	64748

AL627074.11	1851	CTGTCTCCTCAGCACTGAGATTACAAGTGTGAGCCACATGGTTGGCCTTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	64749	CTGTCTCCTCAGCACTGAGATTACAAGTGTGAGCCACATGGTTGGCCTTT	64798

AL627074.11	1901	TTTATTGGTTCTGGAGGTCACACTCAGATCCTCATACTTGCATAGCAAGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	64799	TTTATTGGTTCTGGAGGTCACACTCAGATCCTCATACTTGCATAGCAAGT	64848

AL627074.11	1951	GCTTTACAGACAAAGCCATCTCCAGTTCCAAGATCCAGGCATTAAAGAGA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669927.9	64849	GCTTTACAGACAAAGCCATCTCCAGTTCCAAGATCCAGGCATTAAAGAGA	64898

Overview

Query
AL627074.11 - 177133 bps
Hit
AL669927.9 - 64898 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link