<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL671561.7	1	AGAATGGCAATCATTAAAAAGTCAGGAAACAACAGGTGCTGGAGAGGATG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	113134	AGAATGGCAATCATTAAAAAGTCAGGAAACAACAGGTGCTGGAGAGGATG	113183

AL671561.7	51	TGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTTGGTGGGACTGTAAACTAGTTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	113184	TGGAGAAACAGGAACACTTTTACACTGTTGGTGGGACTGTAAACTAGTTC	113233

AL671561.7	101	AACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCAATTCCTGAAGGATCTAGAACTAGAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	113234	AACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCAATTCCTGAAGGATCTAGAACTAGAA	113283

AL671561.7	151	ATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATGCCCAAAGGATTA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	113284	ATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATGCCCAAAGGATTA	113333

AL671561.7	201	TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGTGGCAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	113334	TAAATCATGCTACTATAAAGACACATGCACATGTATGTTTATTGTGGCAC	113383

AL671561.7	251	TATTCACAATAGCAAAGAATTGGAACCAACCCAAATGTCCATCAATGATA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	113384	TATTCACAATAGCAAAGAATTGGAACCAACCCAAATGTCCATCAATGATA	113433

AL671561.7	301	GACTAGATTAAGAAAATGCAGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	113434	GACTAGATTAAGAAAATGCAGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGC	113483

AL671561.7	351	CATAAAAAGGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGTGACATGGATGAAGCAGGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	113484	CATAAAAAGGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGTGACATGGATGAAGCAGGA	113533

AL671561.7	401	AACCATCATTCTGAGCAAACTATCACGAAGACAGAAAATCAAACAGTGCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	113534	AACCATCATTCTGAGCAAACTATCACGAAGACAGAAAATCAAACAGTGCA	113583

AL671561.7	451	TGTTCTCACTCATAGGTGAATTGAACAATGAGAACACTTGGACACAGGAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	113584	TGTTCTCACTCATAGGTGAATTGAACAATGAGAACACTTGGACACAGGAT	113633

AL671561.7	501	GGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCGTCGGGTGGCGGGATGGGGGAGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	113634	GGGGAACATCACACACTGGGGCCTGTCGTCGGGTGGCGGGATGGGGGAGG	113683

AL671561.7	551	GATAGCATTAGGAGAAATACCTAATGTAAATGACTAGTTAAAGAGGGCAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	113684	GATAGCATTAGGAGAAATACCTAATGTAAATGACTAGTTAAAGAGGGCAG	113733

AL671561.7	601	CAAACCAACAGGGCACATGCATACATATGTGACAAACCTGCACGTTATGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	113734	CAAACCAACAGGGCACATGCATACATATGTGACAAACCTGCACGTTATGC	113783

AL671561.7	651	ACATGTACCATAGAACTTAAAGTATAATTTTAAAAAAATGTAAGAGAAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	113784	ACATGTACCATAGAACTTAAAGTATAATTTTAAAAAAATGTAAGAGAAAA	113833

AL671561.7	701	GAATACCAAAGTTAATTGCAAGGATCCTTAATAAGAACTACTTACATTGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	113834	GAATACCAAAGTTAATTGCAAGGATCCTTAATAAGAACTACTTACATTGG	113883

AL671561.7	751	AAGCAAACCACAGAGAATTGTAAGGAGTCATGTGACAGAGAGGACCAGGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	113884	AAGCAAACCACAGAGAATTGTAAGGAGTCATGTGACAGAGAGGACCAGGA	113933

AL671561.7	801	TGCCAAGAAAATGGACTTGGCTAAAAATAGGTCATTTAACCCTTGGCTGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	113934	TGCCAAGAAAATGGACTTGGCTAAAAATAGGTCATTTAACCCTTGGCTGA	113983

AL671561.7	851	CTGGCATCTCTCTAGATTTTCAGTTATACAATGTTCAATCTGCTGTGCAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	113984	CTGGCATCTCTCTAGATTTTCAGTTATACAATGTTCAATCTGCTGTGCAA	114033

AL671561.7	901	GGTAATTCCATCTTGCAAAGGATTTGATGTTACATTCTACCACACATACA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	114034	GGTAATTCCATCTTGCAAAGGATTTGATGTTACATTCTACCACACATACA	114083

AL671561.7	951	ACTGAATTAAACTTTTACGGAATTGGAAATGCAAATAATTGATCAAAATA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	114084	ACTGAATTAAACTTTTACGGAATTGGAAATGCAAATAATTGATCAAAATA	114133

AL671561.7	1001	AATCAAACAAGAAAAGAATAGGAAGGAATAACCAGTGATGGAATATCAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	114134	AATCAAACAAGAAAAGAATAGGAAGGAATAACCAGTGATGGAATATCAAA	114183

AL671561.7	1051	TATGAATGGAAAACAGAATAGGACTGCTAAAAAGAAAAAAAATTTCAGAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	114184	TATGAATGGAAAACAGAATAGGACTGCTAAAAAGAAAAAAAATTTCAGAA	114233

AL671561.7	1101	GCACATAATAGCCGTGTTATTTAGAATCATAGTGGTGTGCAAATGACTTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	114234	GCACATAATAGCCGTGTTATTTAGAATCATAGTGGTGTGCAAATGACTTC	114283

AL671561.7	1151	TATCACATCTCATTCAATACCAGAGCAAAAGATGTTAAGTTTATTATGTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	114284	TATCACATCTCATTCAATACCAGAGCAAAAGATGTTAAGTTTATTATGTA	114333

AL671561.7	1201	ATGCCCACCAAATAGCTAGCTTTTGAAAAAAACTTGTTTCTCAATTTGAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	114334	ATGCCCACCAAATAGCTAGCTTTTGAAAAAAACTTGTTTCTCAATTTGAG	114383

AL671561.7	1251	CTAACCATTTCAGGCTACTGCATCAAACCAAAGTTATTGGCATCATGCTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	114384	CTAACCATTTCAGGCTACTGCATCAAACCAAAGTTATTGGCATCATGCTA	114433

AL671561.7	1301	AGCTAGATGTGTTGACTGAAGTATGAGATTCACACTTTTGTAAATGAAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	114434	AGCTAGATGTGTTGACTGAAGTATGAGATTCACACTTTTGTAAATGAAAA	114483

AL671561.7	1351	GCAATTTGATTAGGCAATGTTTTCCTAAGTGAAAGCAAGTTATTAGAGAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	114484	GCAATTTGATTAGGCAATGTTTTCCTAAGTGAAAGCAAGTTATTAGAGAA	114533

AL671561.7	1401	GTAAAGAAACAAAAGAATGGCTACTCCATATAGTGGAGTTTTTGTTTTTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	114534	GTAAAGAAACAAAAGAATGGCTACTCCATATAGTGGAGTTTTTGTTTTTT	114583

AL671561.7	1451	TTTTTTAAGTGTAGGCAAATGTTTAGTGAAGATGATATTTCAATAAGAAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	114584	TTTTTTAAGTGTAGGCAAATGTTTAGTGAAGATGATATTTCAATAAGAAA	114633

AL671561.7	1501	ATTGGTGCTTGGGACGTGCTTCCACTAAATTTGAGATATCTTAGACAAAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	114634	ATTGGTGCTTGGGACGTGCTTCCACTAAATTTGAGATATCTTAGACAAAA	114683

AL671561.7	1551	CAAAGTCTTATTTTCAAGACATTATTTTTATCAGACTGAAGTCTTGGAAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	114684	CAAAGTCTTATTTTCAAGACATTATTTTTATCAGACTGAAGTCTTGGAAC	114733

AL671561.7	1601	TATTTGATCTAGTTACTCTATGTTCTCAACTGTGTTAACTAATTGAAAAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	114734	TATTTGATCTAGTTACTCTATGTTCTCAACTGTGTTAACTAATTGAAAAC	114783

AL671561.7	1651	AACATTGTTATTAAAGGTATTCACAAGAAAAATTCAGAGTTACTGTTGCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	114784	AACATTGTTATTAAAGGTATTCACAAGAAAAATTCAGAGTTACTGTTGCA	114833

AL671561.7	1701	TATCCTTTCTCTGTTTCAAACTGTTTTCTCCTAAGCACCCAAGGCTCTGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	114834	TATCCTTTCTCTGTTTCAAACTGTTTTCTCCTAAGCACCCAAGGCTCTGT	114883

AL671561.7	1751	GATGTCTGAAACAGTTAATCATTAATTTTAAAAGATAAGCTTATCGTGGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	114884	GATGTCTGAAACAGTTAATCATTAATTTTAAAAGATAAGCTTATCGTGGA	114933

AL671561.7	1801	ATTAGAAAAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGATCCAATAAGAGCTCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	114934	ATTAGAAAAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGATCCAATAAGAGCTCA	114983

AL671561.7	1851	TATAGCAAAGAGAATACTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCAGCACAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	114984	TATAGCAAAGAGAATACTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCAGCACAC	115033

AL671561.7	1901	TACCCCACTTAAAAGTATACTGTGAGGCTACAGTAAACAAAACAGCATGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	115034	TACCCCACTTAAAAGTATACTGTGAGGCTACAGTAAACAAAACAGCATGA	115083

AL671561.7	1951	TACTGGTACAAAAACAGGCACATAGACCAATGGAACAGAATAGAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL669813.6	115084	TACTGGTACAAAAACAGGCACATAGACCAATGGAACAGAATAGAGAATTC	115133

Overview

Query
AL671561.7 - 105633 bps
Hit
AL669813.6 - 115133 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link