<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662801.7	1	GAATTCCACAGCGTGACATGGAGACATGATGTCTGCCTGCTGTTGGGAAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	35001	GAATTCCACAGCGTGACATGGAGACATGATGTCTGCCTGCTGTTGGGAAA	35050

AL662801.7	51	ATAGCACCAATAGACCTGTTTGATGTGCTTGACACAGGGTTGCCACAAGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	35051	ATAGCACCAATAGACCTGTTTGATGTGCTTGACACAGGGTTGCCACAAGC	35100

AL662801.7	101	CTCCAATCTCTAAATAAAAAACAGCATCTGCAAAGAGCAATAAAGGGAAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	35101	CTCCAATCTCTAAATAAAAAACAGCATCTGCAAAGAGCAATAAAGGGAAG	35150

AL662801.7	151	CACAATAAAAGGTACATCTGCAAAGGGGAATCAGCACTTAAGCAAGGTCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	35151	CACAATAAAAGGTACATCTGCAAAGGGGAATCAGCACTTAAGCAAGGTCA	35200

AL662801.7	201	GGATGAGCTTTCAAGTCAGGTGGACCTAGACATGAACCCTCCAGGCCCTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	35201	GGATGAGCTTTCAAGTCAGGTGGACCTAGACATGAACCCTCCAGGCCCTA	35250

AL662801.7	251	CCAACAACCAGCTATGGACCTTCGAGCACATCCAGCCTAGAGCTGCCCCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	35251	CCAACAACCAGCTATGGACCTTCGAGCACATCCAGCCTAGAGCTGCCCCC	35300

AL662801.7	301	AACAGACACTTCCCCAGTGAATGCTGAATGAAACCATCTGAGCCAGTTTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	35301	AACAGACACTTCCCCAGTGAATGCTGAATGAAACCATCTGAGCCAGTTTC	35350

AL662801.7	351	CTCAGGTGCAAACCAGTGAGGTAATTCCTACCTTGCAGAGTGAAGTGAGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	35351	CTCAGGTGCAAACCAGTGAGGTAATTCCTACCTTGCAGAGTGAAGTGAGA	35400

AL662801.7	401	AAAGACAGTGTTAAGAAATGCCGGGTGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	35401	AAAGACAGTGTTAAGAAATGCCGGGTGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCC	35450

AL662801.7	451	AGCACTTTGGGAGGCCAAGACGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	35451	AGCACTTTGGGAGGCCAAGACGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGA	35500

AL662801.7	501	CCACCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCCACTAAAAATACAAAAAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	35501	CCACCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCCACTAAAAATACAAAAAA	35550

AL662801.7	551	TTAGCCGGGCGTAGTGGCGAGCACCTGTAGTCCCAGCTCCTCGGGAGGGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	35551	TTAGCCGGGCGTAGTGGCGAGCACCTGTAGTCCCAGCTCCTCGGGAGGGT	35600

AL662801.7	601	GAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	35601	GAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCCA	35650

AL662801.7	651	GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	35651	GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCA	35700

AL662801.7	701	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACACAAGACCTGTGGTAGCCTTTCCTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	35701	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACACAAGACCTGTGGTAGCCTTTCCTT	35750

AL662801.7	751	TCTGTCTGGCAGCAGCCACTGGGTAAACCAAGATGGTGCATACAAGTACA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	35751	TCTGTCTGGCAGCAGCCACTGGGTAAACCAAGATGGTGCATACAAGTACA	35800

AL662801.7	801	TCCAGAAGCTATGGAAGAAGCAGTCTGATGTCATGAGCTTTCTTCTGAGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	35801	TCCAGAAGCTATGGAAGAAGCAGTCTGATGTCATGAGCTTTCTTCTGAGG	35850

AL662801.7	851	GTCCGCTGCTGGCAGTACCACCAGCTCTCTGCTCTCCACAGGGATCCCCG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	35851	GTCCGCTGCTGGCAGTACCACCAGCTCTCTGCTCTCCACAGGGATCCCCG	35900

AL662801.7	901	CCCCACCCAGCCCAATAAAGCACGCTACTGGGCTACAGCCAAGCAAGGTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	35901	CCCCACCCAGCCCAATAAAGCACGCTACTGGGCTACAGCCAAGCAAGGTT	35950

AL662801.7	951	ATGTTACATATAAGCGCCACGGTGGCTGAAAATCTAGTTCCTAAGAAGGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	35951	ATGTTACATATAAGCGCCACGGTGGCTGAAAATCTAGTTCCTAAGAAGGC	36000

AL662801.7	1001	AACTTAACAGCAAGCCTGTCTATCATGGTGTTAACCAGCTAGTTTGCTTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	36001	AACTTAACAGCAAGCCTGTCTATCATGGTGTTAACCAGCTAGTTTGCTTA	36050

AL662801.7	1051	AAGCCTTCAGTCTGTTACAGAAGAGCAAGCTGGATGCCACTGTGGGGCTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	36051	AAGCCTTCAGTCTGTTACAGAAGAGCAAGCTGGATGCCACTGTGGGGCTC	36100

AL662801.7	1101	TGAGTCCTGAATTCTCACTGGGCTGGTTAAAGATTCCACATACAAAGTTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	36101	TGAGTCCTGAATTCTCACTGGGCTGGTTAAAGATTCCACATACAAAGTTT	36150

AL662801.7	1151	TTGAGGCTATCCTAGTTGATCCATTCCATAACACTATCAGAAGGAAACCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	36151	TTGAGGCTATCCTAGTTGATCCATTCCATAACACTATCAGAAGGAAACCT	36200

AL662801.7	1201	GACACCCAGTGGTCCACAACAAGCATAGGGAGATGCGTAGGCTATCTGCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	36201	GACACCCAGTGGTCCACAACAAGCATAGGGAGATGCGTAGGCTATCTGCA	36250

AL662801.7	1251	GGCCAAGAGAGCCACGGCCTTGGAAAGGGCTGTAAGTTCTACCACACTAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	36251	GGCCAAGAGAGCCACGGCCTTGGAAAGGGCTGTAAGTTCTACCACACTAT	36300

AL662801.7	1301	TGGTGGTTCTCGCCATGCAGCTTGGAGAAGGTGCAATACTCTCCAGCTCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	36301	TGGTGGTTCTCGCCATGCAGCTTGGAGAAGGTGCAATACTCTCCAGCTCC	36350

AL662801.7	1351	ACAGCTACCGCTAATGTTTGTAAAATTCATACCTAATAAACACTAGATCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	36351	ACAGCTACCGCTAATGTTTGTAAAATTCATACCTAATAAACACTAGATCA	36400

AL662801.7	1401	AAAAAAAAAAATCACAGACCTGTGGTAGGCTGGGCACCAGTGCTCTAAAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	36401	AAAAAAAAAAATCACAGACCTGTGGTAGGCTGGGCACCAGTGCTCTAAAG	36450

AL662801.7	1451	CAAGTTCTGCCTAAACTGGCAGGGACATTTTTCACATCAGGAACAGGAGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	36451	CAAGTTCTGCCTAAACTGGCAGGGACATTTTTCACATCAGGAACAGGAGT	36500

AL662801.7	1501	TGTTCCTGGACTCTGTCTGGGGCCAGGCTGGGAGAGACGTGGGGCAGAGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	36501	TGTTCCTGGACTCTGTCTGGGGCCAGGCTGGGAGAGACGTGGGGCAGAGT	36550

AL662801.7	1551	GGGGCAGGGGCAGGGGCAGGGCTGGGGGCTGGGGCCTGGGCAGGGCCAGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	36551	GGGGCAGGGGCAGGGGCAGGGCTGGGGGCTGGGGCCTGGGCAGGGCCAGG	36600

AL662801.7	1601	CACTCAAGTGAGGCCAAGTCCTGGAGCGAACCAGTTCCTGGTGGCCGTTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	36601	CACTCAAGTGAGGCCAAGTCCTGGAGCGAACCAGTTCCTGGTGGCCGTTG	36650

AL662801.7	1651	GACAGCTCACACAGCTCCCTGCCAGGTCACCCGCCATGGTCCTCCCTCTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	36651	GACAGCTCACACAGCTCCCTGCCAGGTCACCCGCCATGGTCCTCCCTCTG	36700

AL662801.7	1701	CCCTGGCTCTCTCGGTACCATTTCCTTCGCCTCCTTCTGCCCTCCTGGTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	36701	CCCTGGCTCTCTCGGTACCATTTCCTTCGCCTCCTTCTGCCCTCCTGGTC	36750

AL662801.7	1751	CTTGGCACCCCAGGGCTCCCATGGGTGCTGCTCCCAAAACCCCAAAGCAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	36751	CTTGGCACCCCAGGGCTCCCATGGGTGCTGCTCCCAAAACCCCAAAGCAA	36800

AL662801.7	1801	GCATGGAAGAGCAGACCAGCTCCAGAGGAAATGGGAAGATGACGTCCCCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	36801	GCATGGAAGAGCAGACCAGCTCCAGAGGAAATGGGAAGATGACGTCCCCT	36850

AL662801.7	1851	CCCAGGGTAAGTGGCACCACAGGTAGGAACAGAGGGTGTGAGAATTTACA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	36851	CCCAGGGTAAGTGGCACCACAGGTAGGAACAGAGGGTGTGAGAATTTACA	36900

AL662801.7	1901	CTGGGGTGTGGGAAAAAAAAACCCTCAATCCCACCCTGCACCACCCCACA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	36901	CTGGGGTGTGGGAAAAAAAAACCCTCAATCCCACCCTGCACCACCCCACA	36950

AL662801.7	1951	CCATGCCTACCCCTGCAGCTCTTTTCTTAGTTCAGCTACCAACTCCTCTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663061.8	36951	CCATGCCTACCCCTGCAGCTCTTTTCTTAGTTCAGCTACCAACTCCTCTC	37000

Overview

Query
AL662801.7 - 132330 bps
Hit
AL663061.8 - 37000 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link