<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645744.16	1	GAATTCACCCAGAGTCTAGGAAATAATTCAGCTCACTTACATCTGTTAGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	75654	GAATTCACCCAGAGTCTAGGAAATAATTCAGCTCACTTACATCTGTTAGC	75703

AL645744.16	51	TACATCTGTTACTTGTGTTACGTCACTTTCCATATAAACGAGGAGAACAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	75704	TACATCTGTTACTTGTGTTACGTCACTTTCCATATAAACGAGGAGAACAC	75753

AL645744.16	101	CCCCTCCCCACTCTCTCTCTTTCTTCTTTCCCCTTCCACTTGCCCTGCCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	75754	CCCCTCCCCACTCTCTCTCTTTCTTCTTTCCCCTTCCACTTGCCCTGCCA	75803

AL645744.16	151	CTCCTTTTCTTCTCTCCCTTACAATAAACCTCTCTCACGTGGAACCGCCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	75804	CTCCTTTTCTTCTCTCCCTTACAATAAACCTCTCTCACGTGGAACCGCCT	75853

AL645744.16	201	TGGCCTGGTGTTCTGTTCGGGTATATCCACTATATATTATTATTAATACA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	75854	TGGCCTGGTGTTCTGTTCGGGTATATCCACTATATATTATTATTAATACA	75903

AL645744.16	251	TCAGGTATTAGGACTTCTTTGAAGGTCTGATAGAATTCTGCACTAAACCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	75904	TCAGGTATTAGGACTTCTTTGAAGGTCTGATAGAATTCTGCACTAAACCC	75953

AL645744.16	301	ATCTGGTCCTGGGCTTTTTTGAGATAGGAGACTTTTGATGACTGCTTCTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	75954	ATCTGGTCCTGGGCTTTTTTGAGATAGGAGACTTTTGATGACTGCTTCTA	76003

AL645744.16	351	TTTCTTTAGGGGTTATGGGACTATTTAGATGGTTTATCTGATCCTGATTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	76004	TTTCTTTAGGGGTTATGGGACTATTTAGATGGTTTATCTGATCCTGATTT	76053

AL645744.16	401	AACTTTGGTATTTGGTGTCTGTCTAGAAAATTGTCCATTTCAACCAGATT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	76054	AACTTTGGTATTTGGTGTCTGTCTAGAAAATTGTCCATTTCAACCAGATT	76103

AL645744.16	451	TTCTAGTTTTATTGAGTATAGGCTTTCGTAGTAGGATCTGATTTTTTTTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	76104	TTCTAGTTTTATTGAGTATAGGCTTTCGTAGTAGGATCTGATTTTTTTTT	76153

AL645744.16	501	CAGTTTCTGTTGTTATATCTCCCTTTTCATTTCTGATTTTGTTAATTTGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	76154	CAGTTTCTGTTGTTATATCTCCCTTTTCATTTCTGATTTTGTTAATTTGG	76203

AL645744.16	551	ATGCTGTCACTGTGCCCTCTGGTTAGTCTGGCTAAGGGTTTATCTATCTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	76204	ATGCTGTCACTGTGCCCTCTGGTTAGTCTGGCTAAGGGTTTATCTATCTT	76253

AL645744.16	601	GTTGATTTTCTCAAAGAACCACCTTCTGGTTTTGTTGATTCTTTGTACAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	76254	GTTGATTTTCTCAAAGAACCACCTTCTGGTTTTGTTGATTCTTTGTACAG	76303

AL645744.16	651	TTCTTTTTGTTTCTACTTGGTTGATTTCAGCCCTGAGTTTGATTATTTTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	76304	TTCTTTTTGTTTCTACTTGGTTGATTTCAGCCCTGAGTTTGATTATTTTA	76353

AL645744.16	701	TGCCTCTTGGGTATATTTGCTTCTTTTTGTTCTAAAGCTTGCAGGTGTGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	76354	TGCCTCTTGGGTATATTTGCTTCTTTTTGTTCTAAAGCTTGCAGGTGTGC	76403

AL645744.16	751	TGCTAAGCTGCTAGTGTGTGCTCTCTCCAGTTTCTTTTTGGAGGTACTCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	76404	TGCTAAGCTGCTAGTGTGTGCTCTCTCCAGTTTCTTTTTGGAGGTACTCA	76453

AL645744.16	801	GGGCTGAGTTTCCTCTTAGCACTGCTTTCACTGTGTCCCATAAGTTTGGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	76454	GGGCTGAGTTTCCTCTTAGCACTGCTTTCACTGTGTCCCATAAGTTTGGG	76503

AL645744.16	851	TATGTTGTACCTTCATTTTCATTAAATTCTAAAAAGTCTTTAATTTCTTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	76504	TATGTTGTACCTTCATTTTCATTAAATTCTAAAAAGTCTTTAATTTCTTT	76553

AL645744.16	901	CTTTATTTCTTACTTGACCAAGTTATCATTGAGTAGAGCATTGTTCAGCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	76554	CTTTATTTCTTACTTGACCAAGTTATCATTGAGTAGAGCATTGTTCAGCT	76603

AL645744.16	951	TCCATGTGTATGTGGGCTTTCTGTTGTTATTGAAGACCAGCCTTAGTCCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	76604	TCCATGTGTATGTGGGCTTTCTGTTGTTATTGAAGACCAGCCTTAGTCCA	76653

AL645744.16	1001	TGGTGATCTGATAGGATGCATGGGATTATTTCAATCTTCTTTTATCTGTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	76654	TGGTGATCTGATAGGATGCATGGGATTATTTCAATCTTCTTTTATCTGTT	76703

AL645744.16	1051	GAGGCCTGATTTGTGACCAATTATATGGTCAGTTTTGGAGAAGGTACCAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	76704	GAGGCCTGATTTGTGACCAATTATATGGTCAGTTTTGGAGAAGGTACCAT	76753

AL645744.16	1101	GAGGTGCTGAGAAGAAGGTATATTCTTTTGTTTTAGGATGAAATGTTCTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	76754	GAGGTGCTGAGAAGAAGGTATATTCTTTTGTTTTAGGATGAAATGTTCTA	76803

AL645744.16	1151	TAGATATCTGTTAAATCCATTTGGTCCATAACTTCTGTTAGTTTCACTGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	76804	TAGATATCTGTTAAATCCATTTGGTCCATAACTTCTGTTAGTTTCACTGT	76853

AL645744.16	1201	GTCTCTGTTTAGTTTCTATTTCCATGATCTGTCCATTGATGAGAGCAGTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	76854	GTCTCTGTTTAGTTTCTATTTCCATGATCTGTCCATTGATGAGAGCAGTG	76903

AL645744.16	1251	TGTTGAAGTCTCCCACTATTATTGTGTGAGGTGCAATGTGTGCTTTGAGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	76904	TGTTGAAGTCTCCCACTATTATTGTGTGAGGTGCAATGTGTGCTTTGAGC	76953

AL645744.16	1301	TTTAGTAAAGTTTCCTTTATGAATGTGGATGCCCTTGCATTTGGAGCATA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	76954	TTTAGTAAAGTTTCCTTTATGAATGTGGATGCCCTTGCATTTGGAGCATA	77003

AL645744.16	1351	GATGTTCAGAATTGAGAGTTCTTGGTAGATTTTTCCTTTGGCCAGTATGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	77004	GATGTTCAGAATTGAGAGTTCTTGGTAGATTTTTCCTTTGGCCAGTATGA	77053

AL645744.16	1401	AGTGTCCTTCCTTATCCCTTTTGATAACCTTTGGTTGAAAGTTGATTTTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	77054	AGTGTCCTTCCTTATCCCTTTTGATAACCTTTGGTTGAAAGTTGATTTTA	77103

AL645744.16	1451	TTCAATATTAGAATGGCTACTCCGGCTTGTTTCTTGGAACCATTTGCTTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	77104	TTCAATATTAGAATGGCTACTCCGGCTTGTTTCTTGGAACCATTTGCTTG	77153

AL645744.16	1501	GAAAATTGTTTTCCAGTCCTTTACTCTGAGTTAGTGTCTGTCTTTGACAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	77154	GAAAATTGTTTTCCAGTCCTTTACTCTGAGTTAGTGTCTGTCTTTGACAC	77203

AL645744.16	1551	TGAGGTGCATTTTCTGTAAGCAGTAAAATGCTGGGTCTTGTTTACATATC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	77204	TGAGGTGCATTTTCTGTAAGCAGTAAAATGCTGGGTCTTGTTTACATATC	77253

AL645744.16	1601	CAGTCTGTTAGTCTATGCCTTTTTATTGGGGAATTGAGTCCATTGATGTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	77254	CAGTCTGTTAGTCTATGCCTTTTTATTGGGGAATTGAGTCCATTGATGTT	77303

AL645744.16	1651	AAGAGATATTAAGGAATAGTGATTGTTGCTTCCTGTTATTTTTGATGTTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	77304	AAGAGATATTAAGGAATAGTGATTGTTGCTTCCTGTTATTTTTGATGTTA	77353

AL645744.16	1701	ATTTTTTTATGTTTGTGTGGCTTCTTTTGGGTTTGTTGGAAGGAGATTAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	77354	ATTTTTTTATGTTTGTGTGGCTTCTTTTGGGTTTGTTGGAAGGAGATTAC	77403

AL645744.16	1751	TTTCTTGCTTTTTCTAGGGTATAGTTTCGCTCCTTGTGTTGCTATTTTCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	77404	TTTCTTGCTTTTTCTAGGGTATAGTTTCGCTCCTTGTGTTGCTATTTTCC	77453

AL645744.16	1801	ATCTATTATCCTTTGAAGGGCTAGATTTGTGTAAATTGGATTTATCATAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	77454	ATCTATTATCCTTTGAAGGGCTAGATTTGTGTAAATTGGATTTATCATAG	77503

AL645744.16	1851	AATATCTTAGTTTCTCCATCTATGATAATTGAGAGTTTTGCTGGGTATAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	77504	AATATCTTAGTTTCTCCATCTATGATAATTGAGAGTTTTGCTGGGTATAG	77553

AL645744.16	1901	TAGCTTGGGCTGGCATTTTTTGTTCTCTTAGGGTCTGTATAACATCTGTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	77554	TAGCTTGGGCTGGCATTTTTTGTTCTCTTAGGGTCTGTATAACATCTGTC	77603

AL645744.16	1951	CAGGATCTTCTGGTTTTCATAGTCTCTGGTGAGAAGTCTGGTGTATTTCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL663047.15	77604	CAGGATCTTCTGGTTTTCATAGTCTCTGGTGAGAAGTCTGGTGTATTTCT	77653

Overview

Query
AL645744.16 - 108015 bps
Hit
AL663047.15 - 77653 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link