<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL772153.2	1	AATGGAAGCCCTGGGTGCTGTGCCTCCACCTTTCCTCTTCTAGGTGCTCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	135936	AATGGAAGCCCTGGGTGCTGTGCCTCCACCTTTCCTCTTCTAGGTGCTCC	135985

AL772153.2	51	TGAGAGACCTGCCCACAGCAGCTCCCACAGGTACTCTAAACCACCTCTTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	135986	TGAGAGACCTGCCCACAGCAGCTCCCACAGGTACTCTAAACCACCTCTTC	136035

AL772153.2	101	TTCACATCTGTCCCCACTCTCCACATGGTACCCAGCCCCAGCCCCAGTGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	136036	TTCACATCTGTCCCCACTCTCCACATGGTACCCAGCCCCAGCCCCAGTGC	136085

AL772153.2	151	CCTCCGTCCCAGTTACTAATCCCTACCCCCCTTTCCTGTTTATTCTCTGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	136086	CCTCCGTCCCAGTTACTAATCCCTACCCCCCTTTCCTGTTTATTCTCTGG	136135

AL772153.2	201	CCTCCCAAGTCCAGCCTCGGACTCCATCTCTCGGAAGCAAGACAACAGGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	136136	CCTCCCAAGTCCAGCCTCGGACTCCATCTCTCGGAAGCAAGACAACAGGG	136185

AL772153.2	251	GTCAGAAGAGGGGCGGAGGTGGCTCCCGGGAGGTGAATGGCTGAGACTTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	136186	GTCAGAAGAGGGGCGGAGGTGGCTCCCGGGAGGTGAATGGCTGAGACTTC	136235

AL772153.2	301	GAAGAGATTTCCTCCCGGAAAGGCCGAGCATTGAGCCATCCGGGGGGTGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	136236	GAAGAGATTTCCTCCCGGAAAGGCCGAGCATTGAGCCATCCGGGGGGTGG	136285

AL772153.2	351	GGACAGCTGGACTAAGAAAGGGCTTAGTAGGCCTGACCTTTCATGTCCCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	136286	GGACAGCTGGACTAAGAAAGGGCTTAGTAGGCCTGACCTTTCATGTCCCC	136335

AL772153.2	401	ATCTCCTGCTTCCCTCTCATCTCCTCCCCAAGCAGGTGGTCAGTGTGTTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	136336	ATCTCCTGCTTCCCTCTCATCTCCTCCCCAAGCAGGTGGTCAGTGTGTTC	136385

AL772153.2	451	CCTCTTCCCCTCTTCCCTATGGCTGCAAGAGTCCTCCAGTGCCAGTGCTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	136386	CCTCTTCCCCTCTTCCCTATGGCTGCAAGAGTCCTCCAGTGCCAGTGCTG	136435

AL772153.2	501	ACGAGGTTCTTCCTGGAGGTGGGCACCCTCTCACCCATCCCCCAGCAGTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	136436	ACGAGGTTCTTCCTGGAGGTGGGCACCCTCTCACCCATCCCCCAGCAGTC	136485

AL772153.2	551	ACCACCCCTGGCACCAGGCCCGAAGCAGCTCCATGGGCAGAGCCGTCTTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	136486	ACCACCCCTGGCACCAGGCCCGAAGCAGCTCCATGGGCAGAGCCGTCTTT	136535

AL772153.2	601	CCCTGGAGGCCGTCTCTATTTGGGCAGTGAGAATCTCCTCCATCCAGCAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	136536	CCCTGGAGGCCGTCTCTATTTGGGCAGTGAGAATCTCCTCCATCCAGCAT	136585

AL772153.2	651	CCCTCACACGGCCTGGGGCTTGGCCCTCTTCCCCCACCCCACTGATCATC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	136586	CCCTCACACGGCCTGGGGCTTGGCCCTCTTCCCCCACCCCACTGATCATC	136635

AL772153.2	701	CTCCTAAGGGAGCTGGGTCCCCTCACCTCACCCACGCCATGCCTCACCTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	136636	CTCCTAAGGGAGCTGGGTCCCCTCACCTCACCCACGCCATGCCTCACCTC	136685

AL772153.2	751	TGGGTCTGACCACTGAGACACATAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	136686	TGGGTCTGACCACTGAGACACATAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGC	136735

AL772153.2	801	AGCAGTGAAGGGGGCTGCATTCCACAGCCCCTTCTCCAAGCCCCGGTCCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	136736	AGCAGTGAAGGGGGCTGCATTCCACAGCCCCTTCTCCAAGCCCCGGTCCC	136785

AL772153.2	851	TGTCCCTCTTCAGGCAGGGACCCTCAGAGCTCTCACTGGGGCAGGAGCCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	136786	TGTCCCTCTTCAGGCAGGGACCCTCAGAGCTCTCACTGGGGCAGGAGCCA	136835

AL772153.2	901	CCTCCTCTGCTCCCACTGCCCCTCTTCTTCCTCCTCGGCCTGCTGCAAGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	136836	CCTCCTCTGCTCCCACTGCCCCTCTTCTTCCTCCTCGGCCTGCTGCAAGC	136885

AL772153.2	951	CTCACGTCTGAGCTGTTTCCTGAGTCACACAATGTCCTGGACACCCTAGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	136886	CTCACGTCTGAGCTGTTTCCTGAGTCACACAATGTCCTGGACACCCTAGT	136935

AL772153.2	1001	AATGGGGGGCGGAGGAAGAGTGGAGGAACACTAGGGGGGATGAAGGAGGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	136936	AATGGGGGGCGGAGGAAGAGTGGAGGAACACTAGGGGGGATGAAGGAGGG	136985

AL772153.2	1051	GCCTTCTGTCCCTGACAACCCCTGGGGAAGTAGGGGGAAGTAGGACGGTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	136986	GCCTTCTGTCCCTGACAACCCCTGGGGAAGTAGGGGGAAGTAGGACGGTG	137035

AL772153.2	1101	TGCCTGGAGGGCAGGTGATAGGAGGGGAGAAGGAATCTCGGAACCCCCTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	137036	TGCCTGGAGGGCAGGTGATAGGAGGGGAGAAGGAATCTCGGAACCCCCTG	137085

AL772153.2	1151	GGCAGTCCCAGCCCTGCTGTTTGTTGATCTGGTCTCTCCTTTCTAGGGAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	137086	GGCAGTCCCAGCCCTGCTGTTTGTTGATCTGGTCTCTCCTTTCTAGGGAT	137135

AL772153.2	1201	GAGAATTGCAAGGTGGCTGCCCTGTGCCCCAGGAGGGGCAGGACCTGGAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	137136	GAGAATTGCAAGGTGGCTGCCCTGTGCCCCAGGAGGGGCAGGACCTGGAA	137185

AL772153.2	1251	ACAGGTATTGGGTGGTTACAGAGTTCTGTATTCCTCCTCCCAGGAGAGGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	137186	ACAGGTATTGGGTGGTTACAGAGTTCTGTATTCCTCCTCCCAGGAGAGGA	137235

AL772153.2	1301	TGCTTAATTTGCCAGGTTATTACAGATGCTTCTCAGAGAACCTGCAACTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	137236	TGCTTAATTTGCCAGGTTATTACAGATGCTTCTCAGAGAACCTGCAACTT	137285

AL772153.2	1351	GTCATAATTTGAAACCACTCACCTTGGCTAAAGGAACCCAGGGGCTTCTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	137286	GTCATAATTTGAAACCACTCACCTTGGCTAAAGGAACCCAGGGGCTTCTG	137335

AL772153.2	1401	GGCCTTATCTTGGCTCTTGCCAGGACTTATTTTTCTCCTTCTGGCAAATG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	137336	GGCCTTATCTTGGCTCTTGCCAGGACTTATTTTTCTCCTTCTGGCAAATG	137385

AL772153.2	1451	GGCAAGATGCTGGCCGGTTTTGGGGAAATCTTGGTCTTCCTGTTGTAGGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	137386	GGCAAGATGCTGGCCGGTTTTGGGGAAATCTTGGTCTTCCTGTTGTAGGG	137435

AL772153.2	1501	GAATGTTAAGACTGTCATTATCAGTGATAAATGAACATAGTCTACCCTAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	137436	GAATGTTAAGACTGTCATTATCAGTGATAAATGAACATAGTCTACCCTAA	137485

AL772153.2	1551	ATTTTGCAGTCTGAATTGTCTGTAACAAACACTGAATTTGGGTAGTTTTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	137486	ATTTTGCAGTCTGAATTGTCTGTAACAAACACTGAATTTGGGTAGTTTTC	137535

AL772153.2	1601	ACTTCCTCCATCTCTGCCTCCCTCCGCTGTCAAGGTCCTTGGGATGCAGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	137536	ACTTCCTCCATCTCTGCCTCCCTCCGCTGTCAAGGTCCTTGGGATGCAGG	137585

AL772153.2	1651	GAATGCCAGTCAGAATGCAAAATTGGAGTCAATAAAATCACAAAAGAGAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	137586	GAATGCCAGTCAGAATGCAAAATTGGAGTCAATAAAATCACAAAAGAGAA	137635

AL772153.2	1701	TTCTTTGCCTCAGAATGCTCATCCTACCTTCTTGAGTCAACCCAGGACAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	137636	TTCTTTGCCTCAGAATGCTCATCCTACCTTCTTGAGTCAACCCAGGACAA	137685

AL772153.2	1751	CTTTGGGGTCAACCACACACTGAGTTCCTTTAGTAGCACAGGGAACTGAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	137686	CTTTGGGGTCAACCACACACTGAGTTCCTTTAGTAGCACAGGGAACTGAG	137735

AL772153.2	1801	AGTCCAGGGTGGCAGAAGGTGTCAGTGGCAGCTGTGCTCTCCCTGGTGTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	137736	AGTCCAGGGTGGCAGAAGGTGTCAGTGGCAGCTGTGCTCTCCCTGGTGTT	137785

AL772153.2	1851	GAGGCACTCATGGCTGCTGCTGGTGCACCTGAGAGCCTTCCCCTACCGGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	137786	GAGGCACTCATGGCTGCTGCTGGTGCACCTGAGAGCCTTCCCCTACCGGG	137835

AL772153.2	1901	GAATATACTTCACCAGCACCACTTTCTTCCTTTTTTTAGCTTTTTATTTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	137836	GAATATACTTCACCAGCACCACTTTCTTCCTTTTTTTAGCTTTTTATTTT	137885

AL772153.2	1951	AAAATACTTTTAATCTCATGGGAAAGGGGCAAAAATACTAAAAAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662884.11	137886	AAAATACTTTTAATCTCATGGGAAAGGGGCAAAAATACTAAAAAGAATTC	137935

Overview

Query
AL772153.2 - 18228 bps
Hit
AL662884.11 - 137935 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link