<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662852.9	1	GAGTCCCTCTTTTTCTATAGTTTGGAATAGTTTCAGAAGGAATGATACCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	131758	GAGTCCCTCTTTTTCTATAGTTTGGAATAGTTTCAGAAGGAATGATACCA	131807

AL662852.9	51	GGTCATCTTAGTACCTCTGGTAGAATTTGGCTGTGAATCTGTGTGGTCCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	131808	GGTCATCTTAGTACCTCTGGTAGAATTTGGCTGTGAATCTGTGTGGTCCT	131857

AL662852.9	101	GGAATTTTTTTGGTTGGTAAGCTGCTAATTATTGCCTCAATTTCAGAGCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	131858	GGAATTTTTTTGGTTGGTAAGCTGCTAATTATTGCCTCAATTTCAGAGCC	131907

AL662852.9	151	TGTTATTGGTCTATTCAGAGATTCAACTTCTTCCTGGTTTAGTCTTGGGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	131908	TGTTATTGGTCTATTCAGAGATTCAACTTCTTCCTGGTTTAGTCTTGGGA	131957

AL662852.9	201	GGGTGTATGTGTCCAGAAGTTTATCAATTTCTTCTAGATTTTCTGGTTTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	131958	GGGTGTATGTGTCCAGAAGTTTATCAATTTCTTCTAGATTTTCTGGTTTA	132007

AL662852.9	251	TTTGCGTAGTGGTGTTTATAATATTCTCTGATGGTAGTTTGTATTTCTGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	132008	TTTGCGTAGTGGTGTTTATAATATTCTCTGATGGTAGTTTGTATTTCTGT	132057

AL662852.9	301	GAGATCAGTGGTGATATCTCTTTATCGTTTTTTGTTGTGTCTGATTCTTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	132058	GAGATCAGTGGTGATATCTCTTTATCGTTTTTTGTTGTGTCTGATTCTTC	132107

AL662852.9	351	TCTCTTTTCTCCCTTTTCATAAAGCATTTCATGGATTCATTGACTTTTTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	132108	TCTCTTTTCTCCCTTTTCATAAAGCATTTCATGGATTCATTGACTTTTTG	132157

AL662852.9	401	AAGGGTTTTTTGTGTCTGTATCTCCTTCAATTTTGCTCTGATTTTAGTTA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	132158	AAGGGTTTTTTGTGTCTGTATCTCCTTCAATTTTGCTCTGATTTTAGTTA	132207

AL662852.9	451	TTTCTTGTCTTCTGCTAGCTTTTGAATTTGTTTGCTCTTGCTTCTCTAGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	132208	TTTCTTGTCTTCTGCTAGCTTTTGAATTTGTTTGCTCTTGCTTCTCTAGT	132257

AL662852.9	501	TCTTCTAATTGTGATGTTAAGGTGTCAGTTTTAGATCTTTTCCTCTTTCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	132258	TCTTCTAATTGTGATGTTAAGGTGTCAGTTTTAGATCTTTTCCTCTTTCT	132307

AL662852.9	551	GATGTTGGCATTCAGTGCTATAAATTTTCCTCTAAACACTGCTCTAGCTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	132308	GATGTTGGCATTCAGTGCTATAAATTTTCCTCTAAACACTGCTCTAGCTG	132357

AL662852.9	601	TGTCCCAGAGATTCTAGTACATTGTGTCTTTGTTCTCATTGGTTTCAAAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	132358	TGTCCCAGAGATTCTAGTACATTGTGTCTTTGTTCTCATTGGTTTCAAAG	132407

AL662852.9	651	AACTTCTTTATTTCTGCCTTAATTTTGTTATTTACCCAGTAGTCATTCAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	132408	AACTTCTTTATTTCTGCCTTAATTTTGTTATTTACCCAGTAGTCATTCAG	132457

AL662852.9	701	GAGCAGGTTGTTCAGTTTCCATGTAGTTGTGTAGTTTTGAGTGAGTTTCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	132458	GAGCAGGTTGTTCAGTTTCCATGTAGTTGTGTAGTTTTGAGTGAGTTTCT	132507

AL662852.9	751	TAATCTTGAGTTCTAATTTGATTGCACTGTGGTCTGAGAGACTGTTTTTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	132508	TAATCTTGAGTTCTAATTTGATTGCACTGTGGTCTGAGAGACTGTTTTTT	132557

AL662852.9	801	ATGATTTCTCTTTTGCATTTGCTGAGGAGTGTCTTACTCCCAATTATGTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	132558	ATGATTTCTCTTTTGCATTTGCTGAGGAGTGTCTTACTCCCAATTATGTG	132607

AL662852.9	851	GCCAATTTTAGATTAAGTGTAATGTGGTTCTGAGAAGAATGCATATTCTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	132608	GCCAATTTTAGATTAAGTGTAATGTGGTTCTGAGAAGAATGCATATTCTG	132657

AL662852.9	901	CTGATTAGGGGTGAAGAGTTCTGTAGATGTCTATTAGGTCTGCTTGGTCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	132658	CTGATTAGGGGTGAAGAGTTCTGTAGATGTCTATTAGGTCTGCTTGGTCC	132707

AL662852.9	951	AGAGCTGAGTTCAAGTTCTGAATATCCTTATTAATTTTCTGTCTCACTGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	132708	AGAGCTGAGTTCAAGTTCTGAATATCCTTATTAATTTTCTGTCTCACTGA	132757

AL662852.9	1001	TCTGTCTAATATTGACAGTGGGGTGTTAAAGTCTCCCACTATTATTGTGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	132758	TCTGTCTAATATTGACAGTGGGGTGTTAAAGTCTCCCACTATTATTGTGC	132807

AL662852.9	1051	AGGAGTCTGAGTCTCTTTGTAGGTCTCTAAGAACTTGCTTTATGAAACTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	132808	AGGAGTCTGAGTCTCTTTGTAGGTCTCTAAGAACTTGCTTTATGAAACTG	132857

AL662852.9	1101	GGTGCACTTGTATTGGGTGCGTATATATTTAGGATAGTTAGCTCTTCTCG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	132858	GGTGCACTTGTATTGGGTGCGTATATATTTAGGATAGTTAGCTCTTCTCG	132907

AL662852.9	1151	TTGCACTGATCCCTTTACCGTTATGTAATTCCCTTCTTTGTCTTTTTTGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	132908	TTGCACTGATCCCTTTACCGTTATGTAATTCCCTTCTTTGTCTTTTTTGA	132957

AL662852.9	1201	TTTAAAGTCTGTTTTATCAGAGACTAGGATTGCTACTGCTGCTTTTTTTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	132958	TTTAAAGTCTGTTTTATCAGAGACTAGGATTGCTACTGCTGCTTTTTTTT	133007

AL662852.9	1251	TTTTTTGGCTTTCTATTTGCTTGGTAAATATTCCTCCATCCCTTTATTTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	133008	TTTTTTGGCTTTCTATTTGCTTGGTAAATATTCCTCCATCCCTTTATTTT	133057

AL662852.9	1301	GAGCCTGTGTGTGTCTTTGCACATGAGATGGGTCTCCTGAATACAGCACA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	133058	GAGCCTGTGTGTGTCTTTGCACATGAGATGGGTCTCCTGAATACAGCACA	133107

AL662852.9	1351	CTGATGGGTCTTGACTCTTTATCCAATTTATCAGTATGTGTCTTTTAATT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	133108	CTGATGGGTCTTGACTCTTTATCCAATTTATCAGTATGTGTCTTTTAATT	133157

AL662852.9	1401	GGAGCATTTAGCCCATTTATATTTAAGGTTAATATTGTTATGTGTGAATT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	133158	GGAGCATTTAGCCCATTTATATTTAAGGTTAATATTGTTATGTGTGAATT	133207

AL662852.9	1451	TGATCATGTCATTATGATGCTAGCTGGTTATTTTGCCTGTTAGTTGATGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	133208	TGATCATGTCATTATGATGCTAGCTGGTTATTTTGCCTGTTAGTTGATGC	133257

AL662852.9	1501	AGTTTCTTCATAATGTCAATAGTCTTTACAATACTGCAAAAACAGTACTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	133258	AGTTTCTTCATAATGTCAATAGTCTTTACAATACTGCAAAAACAGTACTG	133307

AL662852.9	1551	ATTTTTTTATGTTGATTTATATCCTGAACTAGTTCATTAGTTTTAACAGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	133308	ATTTTTTTATGTTGATTTATATCCTGAACTAGTTCATTAGTTTTAACAGT	133357

AL662852.9	1601	TTTTGGTGTAATATTTGGGGTTTCTATATATAACAATAGGTAATCAGTAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	133358	TTTTGGTGTAATATTTGGGGTTTCTATATATAACAATAGGTAATCAGTAT	133407

AL662852.9	1651	ACAAAGACCATTTCTTTCCTTCCTCCCTCCCTCCCTTTCTCTCTCTCTTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	133408	ACAAAGACCATTTCTTTCCTTCCTCCCTCCCTCCCTTTCTCTCTCTCTTT	133457

AL662852.9	1701	CTTTCTCTCTCTCTTTTGTTCATTCCGATTTGTATGCTTTTAATTTCTTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	133458	CTTTCTCTCTCTCTTTTGTTCATTCCGATTTGTATGCTTTTAATTTCTTT	133507

AL662852.9	1751	CTCTTGCCTAATTGCCATGGCTATAACTTCCAGTACTAGGTTGAATAGAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	133508	CTCTTGCCTAATTGCCATGGCTATAACTTCCAGTACTAGGTTGAATAGAA	133557

AL662852.9	1801	GTGGTGAGAGTGGGCATCTTTGCTTTGTTTCTGATCTGAGAGGGAAAACT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	133558	GTGGTGAGAGTGGGCATCTTTGCTTTGTTTCTGATCTGAGAGGGAAAACT	133607

AL662852.9	1851	TTCAAATTGATGGTCTCAGCTGTGGGGTTGTCATACATGGTCTTTATTGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	133608	TTCAAATTGATGGTCTCAGCTGTGGGGTTGTCATACATGGTCTTTATTGT	133657

AL662852.9	1901	GTTGTCATACATTCCTTATAACCAATTTGTTGAGACATTTCTTATGAAGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	133658	GTTGTCATACATTCCTTATAACCAATTTGTTGAGACATTTCTTATGAAGA	133707

AL662852.9	1951	AATGTTGAATGTTTTTCAAATTCTTTTCCAATCTCAAAGTACCAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662865.4	133708	AATGTTGAATGTTTTTCAAATTCTTTTCCAATCTCAAAGTACCAGAATTC	133757

Overview

Query
AL662852.9 - 142562 bps
Hit
AL662865.4 - 133757 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link