<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL670886.6	1	GAATTCCGATCAGGCTCAGGAGATACCATTTGGATTTCCTTGCCGTAGGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	133785	GAATTCCGATCAGGCTCAGGAGATACCATTTGGATTTCCTTGCCGTAGGG	133834

AL670886.6	51	AGAGCAGCAGTTCTTCTCAGCTGCCTGTCCTAGCGTCATTTACCTATACC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	133835	AGAGCAGCAGTTCTTCTCAGCTGCCTGTCCTAGCGTCATTTACCTATACC	133884

AL670886.6	101	GAGAGAGCCCCTCCTCGCCCCTCAATGCTAACCCTTCAACTAAGACCTCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	133885	GAGAGAGCCCCTCCTCGCCCCTCAATGCTAACCCTTCAACTAAGACCTCC	133934

AL670886.6	151	AAGTAATCCTTTCCCTCCCTTGCCATGGTTCATTTCCTTCTCCCCATACT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	133935	AAGTAATCCTTTCCCTCCCTTGCCATGGTTCATTTCCTTCTCCCCATACT	133984

AL670886.6	201	TCACTTAGGATTCCCCACCCACTAAAGATTCCCTCCATCTCTCACTTGGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	133985	TCACTTAGGATTCCCCACCCACTAAAGATTCCCTCCATCTCTCACTTGGG	134034

AL670886.6	251	TGCATTTGTTTCCGGGGCAGGTGTTGGGCCCGCTGGGGCTGGGCCAGGAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	134035	TGCATTTGTTTCCGGGGCAGGTGTTGGGCCCGCTGGGGCTGGGCCAGGAG	134084

AL670886.6	301	TGAGCTCCGGGTTCTGGGCTGGGGCACGCTCCTCCACTTCTTCTGCCTCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	134085	TGAGCTCCGGGTTCTGGGCTGGGGCACGCTCCTCCACTTCTTCTGCCTCC	134134

AL670886.6	351	ATGGGCTCCCGGGGAGGTGCTTCACTTTCAACTGGTTCTGATGTTTGAGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	134135	ATGGGCTCCCGGGGAGGTGCTTCACTTTCAACTGGTTCTGATGTTTGAGA	134184

AL670886.6	401	GCTCAAGGCTACTGGCTCCGGGGTCACAGCCGGTGGCTGCGGGGGCGGCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	134185	GCTCAAGGCTACTGGCTCCGGGGTCACAGCCGGTGGCTGCGGGGGCGGCT	134234

AL670886.6	451	GACTGTGCTGCGGTTGGGGCCCTCCTCGACACTGAAGGTAGGGGAGAGTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	134235	GACTGTGCTGCGGTTGGGGCCCTCCTCGACACTGAAGGTAGGGGAGAGTC	134284

AL670886.6	501	AGGATACCAAAGGCAGGGTAAGACTGCTGCAGAGGATTACTCTACAGGAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	134285	AGGATACCAAAGGCAGGGTAAGACTGCTGCAGAGGATTACTCTACAGGAG	134334

AL670886.6	551	ACTGAACAGAGAAAGTATCCTAACTAGACTCCCTGAAGGCATGGCTCTGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	134335	ACTGAACAGAGAAAGTATCCTAACTAGACTCCCTGAAGGCATGGCTCTGC	134384

AL670886.6	601	AATTTTATCTCCGACTCGCTAGCAACTAGCATAAGACTGACACAAATTAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	134385	AATTTTATCTCCGACTCGCTAGCAACTAGCATAAGACTGACACAAATTAG	134434

AL670886.6	651	ATGCATAATAAGCATCTGTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	134435	ATGCATAATAAGCATCTGTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTC	134484

AL670886.6	701	TCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCAGCTCACTGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	134485	TCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCAGCTCACTGT	134534

AL670886.6	751	AACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGAAATTCTCTTGCCTCAGCCTTCTAAGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	134535	AACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGAAATTCTCTTGCCTCAGCCTTCTAAGT	134584

AL670886.6	801	AGCCAGGCCTACAGGCGCGTGCCACCACACCCAACTAATTTTTGTACTTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	134585	AGCCAGGCCTACAGGCGCGTGCCACCACACCCAACTAATTTTTGTACTTG	134634

AL670886.6	851	TAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGATTGGAACTCCTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	134635	TAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGATTGGAACTCCTG	134684

AL670886.6	901	ACCACACGTTATCCCCCTGCCATGGCGACCCAAAGTGCTGGGATTACAGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	134685	ACCACACGTTATCCCCCTGCCATGGCGACCCAAAGTGCTGGGATTACAGG	134734

AL670886.6	951	CAGGAGCCACCACACCCGGCCACAGCATCTGTAATATTTGTAAATAAATT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	134735	CAGGAGCCACCACACCCGGCCACAGCATCTGTAATATTTGTAAATAAATT	134784

AL670886.6	1001	TCTAACAAAGAGTAGAGATTGTGGTTTCCTTTCCTCCACAAGTTGGTTTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	134785	TCTAACAAAGAGTAGAGATTGTGGTTTCCTTTCCTCCACAAGTTGGTTTC	134834

AL670886.6	1051	CCAGCCTCCACAAGTTAAGAGAGTAGAATCCTTTAATTGAAAAGAGATGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	134835	CCAGCCTCCACAAGTTAAGAGAGTAGAATCCTTTAATTGAAAAGAGATGC	134884

AL670886.6	1101	CATGAGACTAAGTCTGAAACAAACTCCCCAGATACCAGGCACCAAGAGGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	134885	CATGAGACTAAGTCTGAAACAAACTCCCCAGATACCAGGCACCAAGAGGA	134934

AL670886.6	1151	TTGGCAGAAATGAGAGAGCCTCACAAAGATACTTTTTCTGCCCAAAAGAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	134935	TTGGCAGAAATGAGAGAGCCTCACAAAGATACTTTTTCTGCCCAAAAGAA	134984

AL670886.6	1201	TGAATACTGCAGAGAAGACTAGATTATGAAGGCCAAACCCTGTGAATGTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	134985	TGAATACTGCAGAGAAGACTAGATTATGAAGGCCAAACCCTGTGAATGTG	135034

AL670886.6	1251	GCCAGTGAAGCCCTAACTCCCAGGCTGAGAGAAAAGGGAGAGGGAGGGTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	135035	GCCAGTGAAGCCCTAACTCCCAGGCTGAGAGAAAAGGGAGAGGGAGGGTG	135084

AL670886.6	1301	GAGAGAGACCCTAGCCAGCCTTGCCCACTTACCTCCATCCGGGATAGTAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	135085	GAGAGAGACCCTAGCCAGCCTTGCCCACTTACCTCCATCCGGGATAGTAA	135134

AL670886.6	1351	GGTCTGTATATCCCTGATCATGTGCTGAGCCATCACCAGCCGTACCCGGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	135135	GGTCTGTATATCCCTGATCATGTGCTGAGCCATCACCAGCCGTACCCGGG	135184

AL670886.6	1401	GCTCACTCTACAATGAGAGAAGGTTTATCAGGGTAGGTTACAGATGAAGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	135185	GCTCACTCTACAATGAGAGAAGGTTTATCAGGGTAGGTTACAGATGAAGC	135234

AL670886.6	1451	CATGAGTTCTACCACCTACTAAATCAGGTCCCAGCCATCTCTCAGCCAGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	135235	CATGAGTTCTACCACCTACTAAATCAGGTCCCAGCCATCTCTCAGCCAGG	135284

AL670886.6	1501	TCCACCCCACCTCCCAGCCTCCTTCTCCCAGATCCCCTTCCCTGACCCTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	135285	TCCACCCCACCTCCCAGCCTCCTTCTCCCAGATCCCCTTCCCTGACCCTC	135334

AL670886.6	1551	GGAGGCCCCTCAATACCTGAATCGGGGCCTGTTCCATGTTGATGTGAACA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	135335	GGAGGCCCCTCAATACCTGAATCGGGGCCTGTTCCATGTTGATGTGAACA	135384

AL670886.6	1601	TCCACAGCAGAGCCGTCACTCTGGGGAAAGGGTAAGGGAAGTTGTTCTGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	135385	TCCACAGCAGAGCCGTCACTCTGGGGAAAGGGTAAGGGAAGTTGTTCTGG	135434

AL670886.6	1651	GAGAAGCCAACACTAAGGCCTCCACACCTCCAATTCATTCCCTGGAGCCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	135435	GAGAAGCCAACACTAAGGCCTCCACACCTCCAATTCATTCCCTGGAGCCC	135484

AL670886.6	1701	TACCTCCTTTTCTCCTTAAAGACTGAGACCAATAGCACACCACAGGGCCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	135485	TACCTCCTTTTCTCCTTAAAGACTGAGACCAATAGCACACCACAGGGCCC	135534

AL670886.6	1751	CCTGAACCCAATCTAAAGATGGAAGCATCTATCTTATTAATTCCCTGGTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	135535	CCTGAACCCAATCTAAAGATGGAAGCATCTATCTTATTAATTCCCTGGTG	135584

AL670886.6	1801	CTACCACAACCAAAGCTACCCACAAAAGCCCTCCCCTGTGGAACATAAGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	135585	CTACCACAACCAAAGCTACCCACAAAAGCCCTCCCCTGTGGAACATAAGC	135634

AL670886.6	1851	TTACAGGAAGATTGAAGGTTCCAACCATGACATAGCTGTTGGCATTCCGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	135635	TTACAGGAAGATTGAAGGTTCCAACCATGACATAGCTGTTGGCATTCCGG	135684

AL670886.6	1901	TCATGAACAGAGGCCCCAGGCCCCCGAGTACCAGGGGGGGATCCCCCACC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	135685	TCATGAACAGAGGCCCCAGGCCCCCGAGTACCAGGGGGGGATCCCCCACC	135734

AL670886.6	1951	ATGAGTGGCTGAGGCAGACCCCGTCCCAGAAGATGCCCCAGAAGGGAGGT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662847.6	135735	ATGAGTGGCTGAGGCAGACCCCGTCCCAGAAGATGCCCCAGAAGGGAGGT	135784

Overview

Query
AL670886.6 - 90732 bps
Hit
AL662847.6 - 135784 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link