<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662799.16	1	TTGATGGTAGTTCTACCAGGCCTAATTGCCACACACCAGCAAAGGCAGGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	76636	TTGATGGTAGTTCTACCAGGCCTAATTGCCACACACCAGCAAAGGCAGGC	76685

AL662799.16	51	TATGCTATAGTATCTTCCACATCTATCATTGAGGCTACTGCTCTGCCCCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	76686	TATGCTATAGTATCTTCCACATCTATCATTGAGGCTACTGCTCTGCCCCT	76735

AL662799.16	101	CTCCACTACCTCTCAGCAAGCTGAACTCATTGCCTTAACTCGAGCCCTCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	76736	CTCCACTACCTCTCAGCAAGCTGAACTCATTGCCTTAACTCGAGCCCTCA	76785

AL662799.16	151	CTTTTGCAAAGGGACTACATGTCAATATTTATACAACTCTAAATATGCCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	76786	CTTTTGCAAAGGGACTACATGTCAATATTTATACAACTCTAAATATGCCT	76835

AL662799.16	201	TCCATATCCTGCACCACCATATTGTTATATGGGCAAAAAGAGGTTTCCTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	76836	TCCATATCCTGCACCACCATATTGTTATATGGGCAAAAAGAGGTTTCCTC	76885

AL662799.16	251	ACTACGCAAGGGTCCTCTGTCATTAATGCCTCTTTAATAAAAACTCTTCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	76886	ACTACGCAAGGGTCCTCTGTCATTAATGCCTCTTTAATAAAAACTCTTCT	76935

AL662799.16	301	CAAGGCCGCTTTACTTCCAAAGGAAGCTGGAGTCATTTACTCCAAGGGCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	76936	CAAGGCCGCTTTACTTCCAAAGGAAGCTGGAGTCATTTACTCCAAGGGCC	76985

AL662799.16	351	ATCAAAAGGCGTCAGATCCCATCGCTCAGGGCAATGCTTTTGCTGATAAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	76986	ATCAAAAGGCGTCAGATCCCATCGCTCAGGGCAATGCTTTTGCTGATAAG	77035

AL662799.16	401	GTAGCTAAAGAAGCAGCTAGCATTCCAAATTCTGTCCCTCACGGCCAATT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	77036	GTAGCTAAAGAAGCAGCTAGCATTCCAAATTCTGTCCCTCACGGCCAATT	77085

AL662799.16	451	TTTCTCATTCTCATGGGTCACTCCCACCTACTCTCCTGCTGAAACTTCTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	77086	TTTCTCATTCTCATGGGTCACTCCCACCTACTCTCCTGCTGAAACTTCTA	77135

AL662799.16	501	CCTATCAGTCTCTTCCCACACAAGGCAAATGGTTCTTGGACCAAGGAAAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	77136	CCTATCAGTCTCTTCCCACACAAGGCAAATGGTTCTTGGACCAAGGAAAA	77185

AL662799.16	551	TATCTCCTAACAGCCTCACAGGCCCATTCTATTCTGCTGTCATTTCATAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	77186	TATCTCCTAACAGCCTCACAGGCCCATTCTATTCTGCTGTCATTTCATAA	77235

AL662799.16	601	CCTCTTCCATGTAAGTTACAAGCTGCTAGCCCACCTCTTAGAACCTCTCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	77236	CCTCTTCCATGTAAGTTACAAGCTGCTAGCCCACCTCTTAGAACCTCTCA	77285

AL662799.16	651	TTTCCTTTCCATCGTGGAAATCTATCCTCAAGGAAATCACTTCTTAGTGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	77286	TTTCCTTTCCATCGTGGAAATCTATCCTCAAGGAAATCACTTCTTAGTGT	77335

AL662799.16	701	TCCATCTGCTATTCTACTACTCCTCAGGGAGTGTTCAGGCTCCCTCCCCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	77336	TCCATCTGCTATTCTACTACTCCTCAGGGAGTGTTCAGGCTCCCTCCCCT	77385

AL662799.16	751	CCCTACACATCAAGCTCAGGGATTTGCCCCTGCCCAGGACTGGCAAATTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	77386	CCCTACACATCAAGCTCAGGGATTTGCCCCTGCCCAGGACTGGCAAATTG	77435

AL662799.16	801	ACTTTACTCACATGCCCCAAGTCAGGAAACTAAAATACCTCTTGGTCTGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	77436	ACTTTACTCACATGCCCCAAGTCAGGAAACTAAAATACCTCTTGGTCTGG	77485

AL662799.16	851	GTAGACACTTTCACTGGATGGGTAGAGGCCTTTCCAACAGGGTCTGAGAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	77486	GTAGACACTTTCACTGGATGGGTAGAGGCCTTTCCAACAGGGTCTGAGAA	77535

AL662799.16	901	GGCCACTGCGGTCATTTCTTCCCTTCTGTCAGACATAATTCCTCGCTTTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	77536	GGCCACTGCGGTCATTTCTTCCCTTCTGTCAGACATAATTCCTCGCTTTG	77585

AL662799.16	951	GCCTTCCCACCTCTATACAGTCCAATAACAGACTGGCCTTTATTAGTCAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	77586	GCCTTCCCACCTCTATACAGTCCAATAACAGACTGGCCTTTATTAGTCAA	77635

AL662799.16	1001	ATCACCCAAGCAGTTTCTCAGGCTCTTGGTATTCAGTGGAACCTTCATAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	77636	ATCACCCAAGCAGTTTCTCAGGCTCTTGGTATTCAGTGGAACCTTCATAC	77685

AL662799.16	1051	CCCTTACCATCCTCAATCTTCAGAAAAAGTAAAACAGACTAATAGTCTTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	77686	CCCTTACCATCCTCAATCTTCAGAAAAAGTAAAACAGACTAATAGTCTTT	77735

AL662799.16	1101	TAAAGACACACCTCACCAAGCTCAGCCTCCAACTTAAAAAGACTGGACAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	77736	TAAAGACACACCTCACCAAGCTCAGCCTCCAACTTAAAAAGACTGGACAG	77785

AL662799.16	1151	TACTTTTACCACTTGCCCTTCTCAGAATTCGGGCCTGTCCTCGGAATGCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	77786	TACTTTTACCACTTGCCCTTCTCAGAATTCGGGCCTGTCCTCGGAATGCT	77835

AL662799.16	1201	GCAGGATACAGCCCATTTGAGCTCCTGTATGGATGCTCCTTTTTATTAGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	77836	GCAGGATACAGCCCATTTGAGCTCCTGTATGGATGCTCCTTTTTATTAGG	77885

AL662799.16	1251	CCCCAGTCTTATTCCAGACACCAGCCCAACTCGGACTGCACCCCAAAAAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	77886	CCCCAGTCTTATTCCAGACACCAGCCCAACTCGGACTGCACCCCAAAAAC	77935

AL662799.16	1301	TTGTCATCCCTTCTATCTTCTGTCTAGTCATACTCCTATTCACCATTCTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	77936	TTGTCATCCCTTCTATCTTCTGTCTAGTCATACTCCTATTCACCATTCTC	77985

AL662799.16	1351	AACTACTCATAAATGCCCTGCTCTTGTTTACACTGCCGGTTTACACTGTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	77986	AACTACTCATAAATGCCCTGCTCTTGTTTACACTGCCGGTTTACACTGTT	78035

AL662799.16	1401	TCTCCAAGCCGTCACAGCTGGTATCTCCTGGTGCTATCCCCAGACCGCCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	78036	TCTCCAAGCCGTCACAGCTGGTATCTCCTGGTGCTATCCCCAGACCGCCA	78085

AL662799.16	1451	CTCTTAACTCCCTCTTAAAGTAAATAAATAATATTTGCTGGCAGGGCACA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	78086	CTCTTAACTCCCTCTTAAAGTAAATAAATAATATTTGCTGGCAGGGCACA	78135

AL662799.16	1501	CTCCAATACTTTCACCCTGATGAAGTCCTATTCTTTACTTTTATACTCAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	78136	CTCCAATACTTTCACCCTGATGAAGTCCTATTCTTTACTTTTATACTCAC	78185

AL662799.16	1551	TCCTATTCTTGTTCCCATTTTTATGCCACCCTCTACCTCTCCCCAGCTAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	78186	TCCTATTCTTGTTCCCATTTTTATGCCACCCTCTACCTCTCCCCAGCTAG	78235

AL662799.16	1601	CTCCACCACACTATCAATCTCATTCACTCTCTCCTAGCCGTTTCTAATCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	78236	CTCCACCACACTATCAATCTCATTCACTCTCTCCTAGCCGTTTCTAATCC	78285

AL662799.16	1651	CTCATCAAACCATTGCTGAATTTGCATTTCCCTTTCTTCCTGCGCCTACA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	78286	CTCATCAAACCATTGCTGAATTTGCATTTCCCTTTCTTCCTGCGCCTACA	78335

AL662799.16	1701	CAGCTGTCCCCGCCTTACATACAGACTGGGCAACCTCTCCTATCTCCCTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	78336	CAGCTGTCCCCGCCTTACATACAGACTGGGCAACCTCTCCTATCTCCCTA	78385

AL662799.16	1751	CACCTCCAAACTTCCTTTAACAGCCCTCACCTTTACCTTCCTAAAGAACT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	78386	CACCTCCAAACTTCCTTTAACAGCCCTCACCTTTACCTTCCTAAAGAACT	78435

AL662799.16	1801	TCTTTACTTTCTAGACAGGTCCAGCAAGACTTCCCCAGACATTTCACTTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	78436	TCTTTACTTTCTAGACAGGTCCAGCAAGACTTCCCCAGACATTTCACTTC	78485

AL662799.16	1851	AGCAAGCTGCCGCCCTCCTCCACACTTACTTAAAAAACCTTTCTCCTTAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	78486	AGCAAGCTGCCGCCCTCCTCCACACTTACTTAAAAAACCTTTCTCCTTAT	78535

AL662799.16	1901	ATCAACTCTACTCCCCCCATATTTGGACCCCTCACAACACAAACTACTAT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	78536	ATCAACTCTACTCCCCCCATATTTGGACCCCTCACAACACAAACTACTAT	78585

AL662799.16	1951	TCCTGTGGCCGTTCCTTTATGTATCTCTCGGCAAAGACCCACTGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662820.6	78586	TCCTGTGGCCGTTCCTTTATGTATCTCTCGGCAAAGACCCACTGGAATTC	78635

Overview

Query
AL662799.16 - 136021 bps
Hit
AL662820.6 - 78635 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link