<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662870.16	1	TGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAAGGCAGGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	169628	TGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAAGGCAGGA	169677

AL662870.16	51	GGATCACCTGAGATCAGGAGTTCGAGACAAGCCTGCCCAACATGGTGAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	169678	GGATCACCTGAGATCAGGAGTTCGAGACAAGCCTGCCCAACATGGTGAAA	169727

AL662870.16	101	CCCCGTCTCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCATGGTAGCACGTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	169728	CCCCGTCTCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCATGGTAGCACGTG	169777

AL662870.16	151	CCTGTAATCCCAGATACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	169778	CCTGTAATCCCAGATACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACC	169827

AL662870.16	201	CAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGTTGAGATCCTGCCACTGCACTCTAGCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	169828	CAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGTTGAGATCCTGCCACTGCACTCTAGCC	169877

AL662870.16	251	TGGGTGACAGAGGGAGACTCCATCTCCAAAGGAAAAAAAAAAAGAGAAAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	169878	TGGGTGACAGAGGGAGACTCCATCTCCAAAGGAAAAAAAAAAAGAGAAAG	169927

AL662870.16	301	TAAAATTTGTACTTCAATTCAGAGATTATAAACAATGTATACTTGACTTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	169928	TAAAATTTGTACTTCAATTCAGAGATTATAAACAATGTATACTTGACTTT	169977

AL662870.16	351	GTGGCAGTGATCACTATTGTACAATAGTTACTTAAACTCAGGAGGCAGAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	169978	GTGGCAGTGATCACTATTGTACAATAGTTACTTAAACTCAGGAGGCAGAG	170027

AL662870.16	401	GCTGCAGTGAGCCAAGATAGCTCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	170028	GCTGCAGTGAGCCAAGATAGCTCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAG	170077

AL662870.16	451	CGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTACTCACTCATTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	170078	CGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTACTCACTCATTT	170127

AL662870.16	501	GTTCTGCAGAATCTATTTATTGCTGTGTTCACAGAAAAGGAAGCATCAAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	170128	GTTCTGCAGAATCTATTTATTGCTGTGTTCACAGAAAAGGAAGCATCAAG	170177

AL662870.16	551	ACGGCAAAGCTCTTTGATGAAAAGCCAGGCGTACTCACACACACAACTGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	170178	ACGGCAAAGCTCTTTGATGAAAAGCCAGGCGTACTCACACACACAACTGA	170227

AL662870.16	601	GAAAGTTCTGGAAGTAGGAGAAAACGTCTTTAAGGCATATAGGCTAAACT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	170228	GAAAGTTCTGGAAGTAGGAGAAAACGTCTTTAAGGCATATAGGCTAAACT	170277

AL662870.16	651	TATATAAATATTGTTAGTGTTTGCCAAAACAGGGATAATCTAGTAAAATC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	170278	TATATAAATATTGTTAGTGTTTGCCAAAACAGGGATAATCTAGTAAAATC	170327

AL662870.16	701	AGAGATACAAAGCCAGAACAGAGAATTGGTAAGTAAAAAATTGTTAAGAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	170328	AGAGATACAAAGCCAGAACAGAGAATTGGTAAGTAAAAAATTGTTAAGAA	170377

AL662870.16	751	TGTATATTGGCTGGGCGCGATGGCTCATGCCTGTAATACTAGCACTTTGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	170378	TGTATATTGGCTGGGCGCGATGGCTCATGCCTGTAATACTAGCACTTTGG	170427

AL662870.16	801	GGAGGCTGAGGGGGGCAGATTGCTTGAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	170428	GGAGGCTGAGGGGGGCAGATTGCTTGAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT	170477

AL662870.16	851	GGGCAACCCTTTCACTACTGAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	170478	GGGCAACCCTTTCACTACTGAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCA	170527

AL662870.16	901	AAAACAAAACTGGGCGTGCTGGTGCGCACGTGTGGTCCCAATTACCCTGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	170528	AAAACAAAACTGGGCGTGCTGGTGCGCACGTGTGGTCCCAATTACCCTGG	170577

AL662870.16	951	AGGCTAATGTGGAAGGATCGCTTGAGCCCAGAGTGTGGGGGTGGGGGTTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	170578	AGGCTAATGTGGAAGGATCGCTTGAGCCCAGAGTGTGGGGGTGGGGGTTG	170627

AL662870.16	1001	GGAGGCAAGGTTGCAGTGAGCCTGGATTGCACCACTGCACTTCAGCCTGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	170628	GGAGGCAAGGTTGCAGTGAGCCTGGATTGCACCACTGCACTTCAGCCTGG	170677

AL662870.16	1051	GTAACAGAGCGAGACCTTGTCTCAAAAAAAAAAAAAGTATCAAAAGGCCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	170678	GTAACAGAGCGAGACCTTGTCTCAAAAAAAAAAAAAGTATCAAAAGGCCT	170727

AL662870.16	1101	AGGAATTTGTTCTCCAGGTAAATCTGCCCTCCCTCATCTCTAACCTTTAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	170728	AGGAATTTGTTCTCCAGGTAAATCTGCCCTCCCTCATCTCTAACCTTTAT	170777

AL662870.16	1151	GAAATCACCCAAATGGAGACATCACAGCAAGGCCCCGACAAGGAAATGAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	170778	GAAATCACCCAAATGGAGACATCACAGCAAGGCCCCGACAAGGAAATGAG	170827

AL662870.16	1201	GAATGTAGGTGGATAAGGGACTGGAATAGTGCAGCACAACACTAACTACA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	170828	GAATGTAGGTGGATAAGGGACTGGAATAGTGCAGCACAACACTAACTACA	170877

AL662870.16	1251	GGTTTCAGCCCCAATGAGATTGCCCTCACTTCCGCCGCCAGCCACAAGTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	170878	GGTTTCAGCCCCAATGAGATTGCCCTCACTTCCGCCGCCAGCCACAAGTG	170927

AL662870.16	1301	TGGAGGTCCCCAGGCTACTCGCTCCTCTGACCAACTGGCTACTAATCTGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	170928	TGGAGGTCCCCAGGCTACTCGCTCCTCTGACCAACTGGCTACTAATCTGG	170977

AL662870.16	1351	GGGGTACCCACAACCCCCTCGGGTTTGATAATTTGCTAGAACAACTCACC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	170978	GGGGTACCCACAACCCCCTCGGGTTTGATAATTTGCTAGAACAACTCACC	171027

AL662870.16	1401	AAACTCAGGAGAATGTTATACTTACGATTACAGGCTTGTTACAAAGGATA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	171028	AAACTCAGGAGAATGTTATACTTACGATTACAGGCTTGTTACAAAGGATA	171077

AL662870.16	1451	CAAATCAGGAGGACCAGACTAATGAAGACACACGTAGGGCGGGGTCTGGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	171078	CAAATCAGGAGGACCAGACTAATGAAGACACACGTAGGGCGGGGTCTGGG	171127

AL662870.16	1501	CGGGTCTTCCATGCAGAGCTTCTGTGTCTTCTCTCTGTGAATCAGGTTGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	171128	CGGGTCTTCCATGCAGAGCTTCTGTGTCTTCTCTCTGTGAATCAGGTTGT	171177

AL662870.16	1551	GTCACCCTCCTGGCACATGGATGTGTTCACCAACCAGGAAGCTCCACCAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	171178	GTCACCCTCCTGGCACATGGATGTGTTCACCAACCAGGAAGCTCCACCAA	171227

AL662870.16	1601	ATTTTGGCGTCCAGAGTTTTCATTACATAGGCACAATTGGTTGACTCATT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	171228	ATTTTGGCGTCCAGAGTTTTCATTACATAGGCACAATTGGTTGACTCATT	171277

AL662870.16	1651	TGCCACCGAATTGAACGCAATCTCTAGTCCTCCCACCCTCCGTCGAGGTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	171278	TGCCACCGAATTGAACGCAATCTCTAGTCCTCCCACCCTCCGTCGAGGTT	171327

AL662870.16	1701	GGGCTGGCTCTAAGGCCCAATCCTTTTATTATGTGATCTTTCTGATGACC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	171328	GGGCTGGCTCTAAGGCCCAATCCTTTTATTATGTGATCTTTCTGATGACC	171377

AL662870.16	1751	AACCTCCCATCGTGAGTTCTCTCTTAGCATAAGCCCAGGTGTGATCCAAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	171378	AACCTCCCATCGTGAGTTCTCTCTTAGCATAAGCCCAGGTGTGATCCAAG	171427

AL662870.16	1801	GGGCTCATGAATAACAAAGATACTCATATTACTCAGGAGATTCCAAGGAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	171428	GGGCTCATGAATAACAAAGATACTCATATTACTCAGGAGATTCCAAGGAT	171477

AL662870.16	1851	TTAGTTTCCCTCCTAGGAACCAGGGACAAAGGGCAGTCAAATTCTTTATT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	171478	TTAGTTTCCCTCCTAGGAACCAGGGACAAAGGGCAGTCAAATTCTTTATT	171527

AL662870.16	1901	GTTATCACAGAGACACAGTAATATAATATGATACAGCAGAAGAGAGGTGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	171528	GTTATCACAGAGACACAGTAATATAATATGATACAGCAGAAGAGAGGTGA	171577

AL662870.16	1951	GGAATGTTGCCATGCCTTGAGAAGCCTATCACAAGAGCTTTAAGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662797.7	171578	GGAATGTTGCCATGCCTTGAGAAGCCTATCACAAGAGCTTTAAGGAATTC	171627

Overview

Query
AL662870.16 - 61698 bps
Hit
AL662797.7 - 171627 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link