<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL845555.1	1	AATGAGCTCAGGATAAAAGTAAATTCAGAGCTTCCTGATATTTATTAGAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	113105	AATGAGCTCAGGATAAAAGTAAATTCAGAGCTTCCTGATATTTATTAGAC	113154

AL845555.1	51	AGTTTTCACTGATGTGAAAGCCTCTCAGTGCTTTTATGATGTATTTTATC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	113155	AGTTTTCACTGATGTGAAAGCCTCTCAGTGCTTTTATGATGTATTTTATC	113204

AL845555.1	101	TTTTGATAACCCATTTTTTGTTAGCATGAGAGTAGGCGTAGATACCTAAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	113205	TTTTGATAACCCATTTTTTGTTAGCATGAGAGTAGGCGTAGATACCTAAT	113254

AL845555.1	151	ATGCCACATTAGTGGTTCACACCTTATCCTTAAAGCTCCTTATCACAAAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	113255	ATGCCACATTAGTGGTTCACACCTTATCCTTAAAGCTCCTTATCACAAAC	113304

AL845555.1	201	CTTCCCATCTTGTTCCTTTGAAGTCATTGAATACCTGAGCAAACTATTAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	113305	CTTCCCATCTTGTTCCTTTGAAGTCATTGAATACCTGAGCAAACTATTAG	113354

AL845555.1	251	TCACTACCCATGCATTGATGAGGATCTAACAATAAGATATTTCTTTAGGC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	113355	TCACTACCCATGCATTGATGAGGATCTAACAATAAGATATTTCTTTAGGC	113404

AL845555.1	301	AAAATGAACTTCCAGATGGTCTGATTGAAAATCTTCCTGCTGGAGGTACT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	113405	AAAATGAACTTCCAGATGGTCTGATTGAAAATCTTCCTGCTGGAGGTACT	113454

AL845555.1	351	TTCCTTTCCACTCTTCTTTATGACAATTCCTGAAAAGGGCTGTAATGCTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	113455	TTCCTTTCCACTCTTCTTTATGACAATTCCTGAAAAGGGCTGTAATGCTG	113504

AL845555.1	401	CAAAGTACACTTTTGGGTATTCAAAGCATATTCAAATTTCTTCTTCTATA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	113505	CAAAGTACACTTTTGGGTATTCAAAGCATATTCAAATTTCTTCTTCTATA	113554

AL845555.1	451	GTCAACAGTCCTTAGGGAACTCCTCAAGACCCCAAGGATGAGACAAGGGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	113555	GTCAACAGTCCTTAGGGAACTCCTCAAGACCCCAAGGATGAGACAAGGGA	113604

AL845555.1	501	GAGTGGATTTACCGGTGGTAATAAGAATACTAGGAATATAGTACATATTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	113605	GAGTGGATTTACCGGTGGTAATAAGAATACTAGGAATATAGTACATATTA	113654

AL845555.1	551	TGAGGCAACTTAGCTGGCCTTGCTAAGGACCAGCTCAGGTCTGATACTGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	113655	TGAGGCAACTTAGCTGGCCTTGCTAAGGACCAGCTCAGGTCTGATACTGT	113704

AL845555.1	601	ATGTATATACAGTATATATATCCACTTCCTCCTGAATGCTCACTGAGTGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	113705	ATGTATATACAGTATATATATCCACTTCCTCCTGAATGCTCACTGAGTGC	113754

AL845555.1	651	TGGTGACCATAAGTGAATAAATAAAATCCAGGTCATGGTGGACATCTCAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	113755	TGGTGACCATAAGTGAATAAATAAAATCCAGGTCATGGTGGACATCTCAA	113804

AL845555.1	701	GTCACTTGGTCATTTGCTGTATCATGATCATGGCATTCAGAATCTACCAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	113805	GTCACTTGGTCATTTGCTGTATCATGATCATGGCATTCAGAATCTACCAG	113854

AL845555.1	751	GGCTCAGTAGCAAGCCAGGAACTGTTATTTAGTAGAAGAATAAAGAATAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	113855	GGCTCAGTAGCAAGCCAGGAACTGTTATTTAGTAGAAGAATAAAGAATAA	113904

AL845555.1	801	AGCTTTTCTTCGAAGCCCTGGAACTTGAGCAGTGAGCTCCTATGCCTGTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	113905	AGCTTTTCTTCGAAGCCCTGGAACTTGAGCAGTGAGCTCCTATGCCTGTT	113954

AL845555.1	851	TCACACACACACACACACACACACACACACGCACACACACACACACACGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	113955	TCACACACACACACACACACACACACACACGCACACACACACACACACGC	114004

AL845555.1	901	GCACACACACACACACACACACACACACACATATCCAAGGAAGCATTTAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	114005	GCACACACACACACACACACACACACACACATATCCAAGGAAGCATTTAG	114054

AL845555.1	951	GCCAAATGGCAGATATGTTTGATGCCTGCCTGGATCAGAATGACATTTCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	114055	GCCAAATGGCAGATATGTTTGATGCCTGCCTGGATCAGAATGACATTTCC	114104

AL845555.1	1001	ATTTCTTATGGAATGTTTTGAACTTGTACTAACTTACCGGATTTTGGTGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	114105	ATTTCTTATGGAATGTTTTGAACTTGTACTAACTTACCGGATTTTGGTGC	114154

AL845555.1	1051	AGAGAAATCCCCTCACAAGATAAGAAATCACATTTTTTCTTTGTTGAAAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	114155	AGAGAAATCCCCTCACAAGATAAGAAATCACATTTTTTCTTTGTTGAAAT	114204

AL845555.1	1101	TATTTATCTTCATTAACGTTTAATAACACCGGTGCAGTTATTTTTCAAAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	114205	TATTTATCTTCATTAACGTTTAATAACACCGGTGCAGTTATTTTTCAAAG	114254

AL845555.1	1151	AGCTTGTACTCCAATCTTGGAGGAATTCCTTGAGTTGAAAAGCCCAGGGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	114255	AGCTTGTACTCCAATCTTGGAGGAATTCCTTGAGTTGAAAAGCCCAGGGC	114304

AL845555.1	1201	CTGAATAATGAGGGAGTCTCATTTCCAACAGCTTCCAATCAGCTGTAGGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	114305	CTGAATAATGAGGGAGTCTCATTTCCAACAGCTTCCAATCAGCTGTAGGA	114354

AL845555.1	1251	TTGAATGAAGACACATGTGATTGCATGATTTTAAGAGAGGGTAGGGGAGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	114355	TTGAATGAAGACACATGTGATTGCATGATTTTAAGAGAGGGTAGGGGAGA	114404

AL845555.1	1301	GGGGCAGTGCTTGTTTCACACTTAACTGAACTACTTCCTTGGCCTCCACT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	114405	GGGGCAGTGCTTGTTTCACACTTAACTGAACTACTTCCTTGGCCTCCACT	114454

AL845555.1	1351	CAAATTTAACTGCAGCATTGGTGACTTGATTTACAGAGTCAGAAATTTCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	114455	CAAATTTAACTGCAGCATTGGTGACTTGATTTACAGAGTCAGAAATTTCC	114504

AL845555.1	1401	TAGGTATGGAATGTGCTGTCTTAAATAGTAATGAGTCCAATCTATGTAGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	114505	TAGGTATGGAATGTGCTGTCTTAAATAGTAATGAGTCCAATCTATGTAGA	114554

AL845555.1	1451	GTGTCCTTCTTTATCATTGGGGGTCATATGAAGTCAGCGATTCTTTTAGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	114555	GTGTCCTTCTTTATCATTGGGGGTCATATGAAGTCAGCGATTCTTTTAGA	114604

AL845555.1	1501	AATTTGGGGTTACAAACAGAAGGCCTCAACTTACTTCAATTTGAAAAACC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	114605	AATTTGGGGTTACAAACAGAAGGCCTCAACTTACTTCAATTTGAAAAACC	114654

AL845555.1	1551	TGAACAAGGAATCTCTGGTGTCTGGATCCTTATTTGTCTCACAAAATTGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	114655	TGAACAAGGAATCTCTGGTGTCTGGATCCTTATTTGTCTCACAAAATTGA	114704

AL845555.1	1601	ATTGTGAGCTGTGACATTTTCTCCCAAAAGTCTCTTTTAGGACAGAACTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	114705	ATTGTGAGCTGTGACATTTTCTCCCAAAAGTCTCTTTTAGGACAGAACTT	114754

AL845555.1	1651	CTGGTAATGGCAACATGAACAGGTAGATCAGCAAGTCTTCCTCTAAATAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	114755	CTGGTAATGGCAACATGAACAGGTAGATCAGCAAGTCTTCCTCTAAATAG	114804

AL845555.1	1701	CAATATGAGAACTGGACAAAATCATAAAAATAAATATTTGAAGTCACTGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	114805	CAATATGAGAACTGGACAAAATCATAAAAATAAATATTTGAAGTCACTGG	114854

AL845555.1	1751	AAAACAAACAAAGGCGAGCAGAAATGTAATAGTGCTTTGATCTTGAGACT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	114855	AAAACAAACAAAGGCGAGCAGAAATGTAATAGTGCTTTGATCTTGAGACT	114904

AL845555.1	1801	ATCTATTGGGTAAAAGCTGCAAGTTGGTGGCCTTTCCTCCTTACCTATGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	114905	ATCTATTGGGTAAAAGCTGCAAGTTGGTGGCCTTTCCTCCTTACCTATGA	114954

AL845555.1	1851	GTTTGCTCCAAACTCCCAGCAGGTAACTGCAGCCCTAATGGATCAATAGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	114955	GTTTGCTCCAAACTCCCAGCAGGTAACTGCAGCCCTAATGGATCAATAGG	115004

AL845555.1	1901	GCAGTTTATAGAGTTAAAAGCCCAAATAAGCTAAAAATGTTTACATTTTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	115005	GCAGTTTATAGAGTTAAAAGCCCAAATAAGCTAAAAATGTTTACATTTTT	115054

AL845555.1	1951	ACATGTTTACATCAGTCAGGCAATTTTGAAAGAGATCTGCTGAAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662795.5	115055	ACATGTTTACATCAGTCAGGCAATTTTGAAAGAGATCTGCTGAAGAATTC	115104

Overview

Query
AL845555.1 - 16279 bps
Hit
AL662795.5 - 115104 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link