<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL732440.2	1	TATGAATGGGAGTTCACTCATGATTTGGTTCTTTGTTTGTCTGTTATTGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	145558	TATGAATGGGAGTTCACTCATGATTTGGTTCTTTGTTTGTCTGTTATTGG	145607

AL732440.2	51	TGTATAAGAATGCTTGTGCTTTTTGCACATTGATTTTGTATTCTGAGACT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	145608	TGTATAAGAATGCTTGTGCTTTTTGCACATTGATTTTGTATTCTGAGACT	145657

AL732440.2	101	GCTGAAATTGCTTGTCAGCTTAAGGAGATTTTGGGCTGAGATGATGGGGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	145658	GCTGAAATTGCTTGTCAGCTTAAGGAGATTTTGGGCTGAGATGATGGGGT	145707

AL732440.2	151	TTTTTAAATATACAATCTCTTGCCAGTCAGAATGGTGATCATTAAAAAGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	145708	TTTTTAAATATACAATCTCTTGCCAGTCAGAATGGTGATCATTAAAAAGT	145757

AL732440.2	201	CAGGAAACAACAGATGCTGGAGAGGATGTGGAGAAGTAGGAACGCTGTAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	145758	CAGGAAACAACAGATGCTGGAGAGGATGTGGAGAAGTAGGAACGCTGTAC	145807

AL732440.2	251	ACTGTTGGTGGGGGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	145808	ACTGTTGGTGGGGGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGG	145857

AL732440.2	301	CGATTCTTCAAGGATATAGTACCAGAAATATCATTTGACCCAGCAATTCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	145858	CGATTCTTCAAGGATATAGTACCAGAAATATCATTTGACCCAGCAATTCC	145907

AL732440.2	351	ATTTTTGGTTATATACCCAAAGGATTATAAATCATTCTACTATAAAGATA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	145908	ATTTTTGGTTATATACCCAAAGGATTATAAATCATTCTACTATAAAGATA	145957

AL732440.2	401	CATGCATATGTATGTTTATTGCAGCACTGTTCACAATAGAAAAGACTTGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	145958	CATGCATATGTATGTTTATTGCAGCACTGTTCACAATAGAAAAGACTTGG	146007

AL732440.2	451	AACCAACGCAAATGCCCATCAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	146008	AACCAACGCAAATGCCCATCAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCA	146057

AL732440.2	501	CATATACACCATGGAATATTATGCAGCCATAAAGGAGAATGAGTTCATGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	146058	CATATACACCATGGAATATTATGCAGCCATAAAGGAGAATGAGTTCATGT	146107

AL732440.2	551	CCTTTGCAGGGAAATGAATGAAGCTGGAAACGATCATTCTCAGCAAACTA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	146108	CCTTTGCAGGGAAATGAATGAAGCTGGAAACGATCATTCTCAGCAAACTA	146157

AL732440.2	601	ACACAGGAACAGAAAACCAAACACCACATGTTCTCACTCGTAAGTGGGAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	146158	ACACAGGAACAGAAAACCAAACACCACATGTTCTCACTCGTAAGTGGGAG	146207

AL732440.2	651	TTGAACAATGAGAACACATGGACACAGGGAGGAGAACATCAAGAAAAAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	146208	TTGAACAATGAGAACACATGGACACAGGGAGGAGAACATCAAGAAAAAAA	146257

AL732440.2	701	CACAGAATATTATAACACTGCAACTGTGGTGTGTAAACTACTCTTATTCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	146258	CACAGAATATTATAACACTGCAACTGTGGTGTGTAAACTACTCTTATTCT	146307

AL732440.2	751	AAGTAGTAAGACTACGTGATGAACCAATAAAAAATAATAACTACAACAAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	146308	AAGTAGTAAGACTACGTGATGAACCAATAAAAAATAATAACTACAACAAC	146357

AL732440.2	801	TTTTCAAGACATAGTACAATAAGATATAAATAGAAACAACAAAAAGTTAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	146358	TTTTCAAGACATAGTACAATAAGATATAAATAGAAACAACAAAAAGTTAA	146407

AL732440.2	851	AAAGTGGGGAGATGAAGTTAAGGCAAGTTTTTATTAATTTTCTTTTGATT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	146408	AAAGTGGGGAGATGAAGTTAAGGCAAGTTTTTATTAATTTTCTTTTGATT	146457

AL732440.2	901	TTGTTTGCATGGTATACAGTTTCATTCATTTTACTTTTAATGTAAGTATG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	146458	TTGTTTGCATGGTATACAGTTTCATTCATTTTACTTTTAATGTAAGTATG	146507

AL732440.2	951	ACTTTATATTTAAAATGGGTTTCTTGTAGATGGATTATAGTTCAATTGTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	146508	ACTTTATATTTAAAATGGGTTTCTTGTAGATGGATTATAGTTCAATTGTG	146557

AL732440.2	1001	CCATTTTTACTGTCTGATCTTCTTTATCACTTAATTGGTGTGTCTAGGCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	146558	CCATTTTTACTGTCTGATCTTCTTTATCACTTAATTGGTGTGTCTAGGCC	146607

AL732440.2	1051	AATTATACCTATGAAATTATCAACATGGTTGGATTACTTTTGCTAGATAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	146608	AATTATACCTATGAAATTATCAACATGGTTGGATTACTTTTGCTAGATAT	146657

AL732440.2	1101	TTTTTGTTAATTCTATTAAACATTTGTTCATTTTCAAAATTGTTTTTCTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	146658	TTTTTGTTAATTCTATTAAACATTTGTTCATTTTCAAAATTGTTTTTCTG	146707

AL732440.2	1151	CCTTCTTTTGGATTAGTTTTTGCCCTAGGATTTTACATATATGTATAATA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	146708	CCTTCTTTTGGATTAGTTTTTGCCCTAGGATTTTACATATATGTATAATA	146757

AL732440.2	1201	TACTTTCAAATATACCTTAGCTCAGTATGCTCCAAATTTCTCTCTCTCTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	146758	TACTTTCAAATATACCTTAGCTCAGTATGCTCCAAATTTCTCTCTCTCTC	146807

AL732440.2	1251	ATTCATTGTGCAATTGTTATCATATATTATACTTTTTTATATTCCATAAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	146808	ATTCATTGTGCAATTGTTATCATATATTATACTTTTTTATATTCCATAAA	146857

AL732440.2	1301	CACAAAATATATTGCTACTAATTTTGCTGTAGACCCTCTGTTACCTATAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	146858	CACAAAATATATTGCTACTAATTTTGCTGTAGACCCTCTGTTACCTATAA	146907

AL732440.2	1351	GGTAACCTTGCAAAGACAATTCTGTTTGTTATTTAATATCATCCCCACCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	146908	GGTAACCTTGCAAAGACAATTCTGTTTGTTATTTAATATCATCCCCACCA	146957

AL732440.2	1401	ATTCTTTGTCAGTAACAACTCCTATATCAATGAATTAGTTGCTTTAAACA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	146958	ATTCTTTGTCAGTAACAACTCCTATATCAATGAATTAGTTGCTTTAAACA	147007

AL732440.2	1451	ACTCTCTTAAATAAACTACACAATAACAAAAAAATAGTACGGGGAAAATA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	147008	ACTCTCTTAAATAAACTACACAATAACAAAAAAATAGTACGGGGAAAATA	147057

AL732440.2	1501	CTGCTGCCTAATAGTCTTCTGTGGGAAAACACGCAAAATTACTCCCATGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	147058	CTGCTGCCTAATAGTCTTCTGTGGGAAAACACGCAAAATTACTCCCATGT	147107

AL732440.2	1551	GCAGATCTGCTTTCACCATAGCCCCAGGTTGCTCTTCAGCTAAACAGAAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	147108	GCAGATCTGCTTTCACCATAGCCCCAGGTTGCTCTTCAGCTAAACAGAAT	147157

AL732440.2	1601	AGGTTATTTGATAAAGACTTTGTGCAGAGACTATAGTATGTAATCAATAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	147158	AGGTTATTTGATAAAGACTTTGTGCAGAGACTATAGTATGTAATCAATAA	147207

AL732440.2	1651	ATACTTGTTGAGTTGAACTGAAATTCTTAATTCATCTGAATCAGGTTGTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	147208	ATACTTGTTGAGTTGAACTGAAATTCTTAATTCATCTGAATCAGGTTGTA	147257

AL732440.2	1701	GAACTGACTACTGGGAAACAGATAATATTCCTCACGCCTAATAGCAATTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	147258	GAACTGACTACTGGGAAACAGATAATATTCCTCACGCCTAATAGCAATTG	147307

AL732440.2	1751	ATTCTTTTCCTAGGAACTCTCCAATCCTAATGTACATATTGTGAACATTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	147308	ATTCTTTTCCTAGGAACTCTCCAATCCTAATGTACATATTGTGAACATTC	147357

AL732440.2	1801	TTTGAATAGATCTTTTCATTTATTTATTTTTAGAGACGGGGTCTTGCTAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	147358	TTTGAATAGATCTTTTCATTTATTTATTTTTAGAGACGGGGTCTTGCTAC	147407

AL732440.2	1851	TGAGACAGCCAGGTGGGAAGGGGTCCCCAGATAAATTCCAGCCAGCCTGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	147408	TGAGACAGCCAGGTGGGAAGGGGTCCCCAGATAAATTCCAGCCAGCCTGA	147457

AL732440.2	1901	GCACTGGGAGGAGTGCAAACTGGGATGGAGCCACAGAAGTTTGCACCATT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	147458	GCACTGGGAGGAGTGCAAACTGGGATGGAGCCACAGAAGTTTGCACCATT	147507

AL732440.2	1951	TGCGGCAGGGAGGAGACTGACCCCTCTTCTTTGGGTGGAACGTGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL662789.11	147508	TGCGGCAGGGAGGAGACTGACCCCTCTTCTTTGGGTGGAACGTGGAATTC	147557

Overview

Query
AL732440.2 - 3994 bps
Hit
AL662789.11 - 147557 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link