<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL672167.6	1	TTTTTCCTTCATTTCAACCTTGGTGAATCTGACAATTACATGTTTTTGGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	145668	TTTTTCCTTCATTTCAACCTTGGTGAATCTGACAATTACATGTTTTTGGG	145717

AL672167.6	51	TTGCTCTTCTTGAGGAGTATCTTTGTGGTGTTCTCTCTATCTCCTGAATT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	145718	TTGCTCTTCTTGAGGAGTATCTTTGTGGTGTTCTCTCTATCTCCTGAATT	145767

AL672167.6	101	TGAATGTTGGCCTGTCTTGCTAGGCTGGGGAAGGTCTCCTGGATAATATC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	145768	TGAATGTTGGCCTGTCTTGCTAGGCTGGGGAAGGTCTCCTGGATAATATC	145817

AL672167.6	151	CTGAAGAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTTCTAGTCACTTTCAGGTA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	145818	CTGAAGAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTTCTAGTCACTTTCAGGTA	145867

AL672167.6	201	TACCAATCAAATGTAGGTTTGGTCTTTTCACATAGTCCCATATTTCTTGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	145868	TACCAATCAAATGTAGGTTTGGTCTTTTCACATAGTCCCATATTTCTTGG	145917

AL672167.6	251	ATGCTTTGTTCATTCCTTTTCATTCTCTTTTCTCTAATCTTGGCTTCATG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	145918	ATGCTTTGTTCATTCCTTTTCATTCTCTTTTCTCTAATCTTGGCTTCATG	145967

AL672167.6	301	CTTTATTTCATTAATTTGATCTTCCATCTCTTGTATACTTTCTTCCACTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	145968	CTTTATTTCATTAATTTGATCTTCCATCTCTTGTATACTTTCTTCCACTT	146017

AL672167.6	351	GATTGATTCAGCTATTGATACTTGTGTATTCTTTACGAAGTTCTCGTGGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	146018	GATTGATTCAGCTATTGATACTTGTGTATTCTTTACGAAGTTCTCGTGGT	146067

AL672167.6	401	GTGTTTTTCAGCTCCATCAGGTTATTTATATTCTTCTCTAAATTGGTATT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	146068	GTGTTTTTCAGCTCCATCAGGTTATTTATATTCTTCTCTAAATTGGTATT	146117

AL672167.6	451	CTAGTTAGCAATTCCTCTAAACATTTTTCAAGGTTTTTAGCTTCCTTGCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	146118	CTAGTTAGCAATTCCTCTAAACATTTTTCAAGGTTTTTAGCTTCCTTGCA	146167

AL672167.6	501	TTGGGTTAGAACATGCTCTTTTAGCTCAGAGGAGTTTGTTATTACCCACC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	146168	TTGGGTTAGAACATGCTCTTTTAGCTCAGAGGAGTTTGTTATTACCCACC	146217

AL672167.6	551	TTCTGAAGCCTACTTCTGTCAATTTGTCAAATTCATTCTCGATCCAGTTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	146218	TTCTGAAGCCTACTTCTGTCAATTTGTCAAATTCATTCTCGATCCAGTTT	146267

AL672167.6	601	TGTTCCCTTGCTGGTGAGGATTTGTGATCTTTGGAGTAGAAGAGGTGCTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	146268	TGTTCCCTTGCTGGTGAGGATTTGTGATCTTTGGAGTAGAAGAGGTGCTC	146317

AL672167.6	651	TGATTTTTGGTATTTTCAGCCTTTTTGTGCTGTTTTTTTTTTCTCATCTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	146318	TGATTTTTGGTATTTTCAGCCTTTTTGTGCTGTTTTTTTTTTCTCATCTT	146367

AL672167.6	701	CATGGATTTATATACCTTTGGCTTTTGATGTTGGTGACCTTCAGATGGGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	146368	CATGGATTTATATACCTTTGGCTTTTGATGTTGGTGACCTTCAGATGGGA	146417

AL672167.6	751	TCCTGAGTAGACATTTTTCTCTTGATGTTGATACTATTCCTTTCTGTTTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	146418	TCCTGAGTAGACATTTTTCTCTTGATGTTGATACTATTCCTTTCTGTTTG	146467

AL672167.6	801	TTAGTATTTCTTCTAACCATCAGGCCTCTCTGCTGCAGGTCTCCTGGAGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	146468	TTAGTATTTCTTCTAACCATCAGGCCTCTCTGCTGCAGGTCTCCTGGAGT	146517

AL672167.6	851	TTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTCACCTGGGTATCACCAGCAGAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	146518	TTGCTGGAGGTCCACTCCAGACCCTGTTCACCTGGGTATCACCAGCAGAG	146567

AL672167.6	901	GTTGCCGGACAGCACAGATTGCTGCCTGTTCCTTCCTCTGGAAGCTTTGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	146568	GTTGCCGGACAGCACAGATTGCTGCCTGTTCCTTCCTCTGGAAGCTTTGT	146617

AL672167.6	951	TTAGGAGGGGCACCTGCTGGATGCCAGCTGGAGCTCTCCTGTATGAGGTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	146618	TTAGGAGGGGCACCTGCTGGATGCCAGCTGGAGCTCTCCTGTATGAGGTG	146667

AL672167.6	1001	TCTGTCGATCCCTGCTGGGAGGTGTTTTTCAGTCAGGAGGCATGGGGGTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	146668	TCTGTCGATCCCTGCTGGGAGGTGTTTTTCAGTCAGGAGGCATGGGGGTC	146717

AL672167.6	1051	AGCGACCCACTTGAGGAGGCAGTCTGTTCCTTAGCAGAGCTCGGGCACTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	146718	AGCGACCCACTTGAGGAGGCAGTCTGTTCCTTAGCAGAGCTCGGGCACTG	146767

AL672167.6	1101	TGCTGGGTGATCCACTGCTCTCCTCAGAGCTGGCAGTCACGAATGTTTAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	146768	TGCTGGGTGATCCACTGCTCTCCTCAGAGCTGGCAGTCACGAATGTTTAA	146817

AL672167.6	1151	GTCTCGAATTTGTTAATTCTTAATAAAAATGATACACATTTCTCATGTGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	146818	GTCTCGAATTTGTTAATTCTTAATAAAAATGATACACATTTCTCATGTGC	146867

AL672167.6	1201	TCACATGATCACAGCTGTACTGTTAATATAATATGTAGCTGAATGAGAAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	146868	TCACATGATCACAGCTGTACTGTTAATATAATATGTAGCTGAATGAGAAA	146917

AL672167.6	1251	ATAGTTAATTGAAAAAGTGATTATGATGTGAATAATGCTTTTTAGTAATT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	146918	ATAGTTAATTGAAAAAGTGATTATGATGTGAATAATGCTTTTTAGTAATT	146967

AL672167.6	1301	TCTTTGTCAATTAAATATTTTTCAGTTTTTATTGTTAATTAAGAAATTGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	146968	TCTTTGTCAATTAAATATTTTTCAGTTTTTATTGTTAATTAAGAAATTGA	147017

AL672167.6	1351	TACACAACTATTGTACATGTTTCTGAGGTGCTTGTGATATTTTGATAAAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	147018	TACACAACTATTGTACATGTTTCTGAGGTGCTTGTGATATTTTGATAAAT	147067

AL672167.6	1401	CTCTATGATAACAATAATTTATTGTTTATTTCAAAATAGCTAGAAGAAAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	147068	CTCTATGATAACAATAATTTATTGTTTATTTCAAAATAGCTAGAAGAAAG	147117

AL672167.6	1451	ACTTAGCATGTTCCCGACACAAATAAATGCTATATTTCTTTTTTCCCCCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	147118	ACTTAGCATGTTCCCGACACAAATAAATGCTATATTTCTTTTTTCCCCCA	147167

AL672167.6	1501	CTAAATATTATGTTTAATGTTTTACTGGTTCATGTAAAAATGTATTTATT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	147168	CTAAATATTATGTTTAATGTTTTACTGGTTCATGTAAAAATGTATTTATT	147217

AL672167.6	1551	TTCACTTCTGACTTGAACATGAGTTGCTTTCAAAGTTACGTTATCTCTGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	147218	TTCACTTCTGACTTGAACATGAGTTGCTTTCAAAGTTACGTTATCTCTGT	147267

AL672167.6	1601	TACCATAATTATTATTGGACACATTAATAGTTTAGTTTTATGATTACTCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	147268	TACCATAATTATTATTGGACACATTAATAGTTTAGTTTTATGATTACTCT	147317

AL672167.6	1651	TTTATCATCTGTGTATTCAGAGATCAGTTTACCCTACTTTTGAGATAAGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	147318	TTTATCATCTGTGTATTCAGAGATCAGTTTACCCTACTTTTGAGATAAGA	147367

AL672167.6	1701	ATAAATGGAAAACATGAATCCTACAAACTGGTTATGACAATCAATGGTAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	147368	ATAAATGGAAAACATGAATCCTACAAACTGGTTATGACAATCAATGGTAG	147417

AL672167.6	1751	CAGTACATTTTAAAGAAATATCACTGACCCCAAAAATCCATCAGAGACTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	147418	CAGTACATTTTAAAGAAATATCACTGACCCCAAAAATCCATCAGAGACTA	147467

AL672167.6	1801	TTTCGAGCACCTCTATGCACAAAAACTAGAAAACCTAAAAGAAATGGCTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	147468	TTTCGAGCACCTCTATGCACAAAAACTAGAAAACCTAAAAGAAATGGCTG	147517

AL672167.6	1851	AATTCCTAGAAACACACTACCTTTCAAGATTCAACCAAGAAGAAAGTAAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	147518	AATTCCTAGAAACACACTACCTTTCAAGATTCAACCAAGAAGAAAGTAAA	147567

AL672167.6	1901	ACCCTGAACAGACCAATAATGAGTTCTGAAATTGAATCAGTAATTTAAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	147568	ACCCTGAACAGACCAATAATGAGTTCTGAAATTGAATCAGTAATTTAAAA	147617

AL672167.6	1951	ACTTACAAATCAGAAAAAGCCCTGTACCAGGCAAATTCACAGCTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645937.6	147618	ACTTACAAATCAGAAAAAGCCCTGTACCAGGCAAATTCACAGCTGAATTC	147667

Overview

Query
AL672167.6 - 44704 bps
Hit
AL645937.6 - 147667 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link