<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL928614.3	1	TGAGCCCAAACCTCACGCTTTATACAAAAAAAAAAAAAAAAACCTCAAAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	78663	TGAGCCCAAACCTCACGCTTTATACAAAAAAAAAAAAAAAAACCTCAAAA	78712

AL928614.3	51	TGAATCACAGGCTTTAATGTAAAACACACAGTTAAAATTACAAACATTGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	78713	TGAATCACAGGCTTTAATGTAAAACACACAGTTAAAATTACAAACATTGA	78762

AL928614.3	101	GCCAGGTGTGGTGTCACAGGCCTGTACTCTCACCTACTCAGGAGACTGAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	78763	GCCAGGTGTGGTGTCACAGGCCTGTACTCTCACCTACTCAGGAGACTGAG	78812

AL928614.3	151	TGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCCAGCCTAGGCAAGATTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	78813	TGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCCAGCCTAGGCAAGATTT	78862

AL928614.3	201	TTTTTTAAATAAATAACAAATACATTAAAAAATTAAAATTACAAATCTTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	78863	TTTTTTAAATAAATAACAAATACATTAAAAAATTAAAATTACAAATCTTT	78912

AL928614.3	251	TAACAAAAAGCCATCAGAACTAAGACTAGACAAAGAGTTCTTACACATAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	78913	TAACAAAAAGCCATCAGAACTAAGACTAGACAAAGAGTTCTTACACATAA	78962

AL928614.3	301	CACCAAAAGTATGATCCGTAAAAGAAAAAGTTACTAAACTGGATCTTTTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	78963	CACCAAAAGTATGATCCGTAAAAGAAAAAGTTACTAAACTGGATCTTTTC	79012

AL928614.3	351	AAAATTAAAACTGTTGCTCTGTGAGAGACCTATGAAGAGCATAAAAAGAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	79013	AAAATTAAAACTGTTGCTCTGTGAGAGACCTATGAAGAGCATAAAAAGAC	79062

AL928614.3	401	AAGCTACAGAATGAGAGAAGATATTTGCAAACCACATATTCAATAAAGAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	79063	AAGCTACAGAATGAGAGAAGATATTTGCAAACCACATATTCAATAAAGAC	79112

AL928614.3	451	TTGCATTCACAATATATGAAGAAATGTAAAAACTCAACAGTAAAAATGAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	79113	TTGCATTCACAATATATGAAGAAATGTAAAAACTCAACAGTAAAAATGAA	79162

AL928614.3	501	ATCCAAATAAACAATAGGCAATGAGCAAGACATGAACAGACGTTTCACTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	79163	ATCCAAATAAACAATAGGCAATGAGCAAGACATGAACAGACGTTTCACTG	79212

AL928614.3	551	AAGAGGATAAACACCAGGCTAACAAGCAGATGAAAAGACACTCAACATCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	79213	AAGAGGATAAACACCAGGCTAACAAGCAGATGAAAAGACACTCAACATCA	79262

AL928614.3	601	CTATCCAGTAGGAAAATACAAATGAAAACTGCAGTGATGAGAATGGCTGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	79263	CTATCCAGTAGGAAAATACAAATGAAAACTGCAGTGATGAGAATGGCTGA	79312

AL928614.3	651	AATACAAAATAAAGGTAGCAACAGATGCTGGCAAGGTTACAGAGAAACTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	79313	AATACAAAATAAAGGTAGCAACAGATGCTGGCAAGGTTACAGAGAAACTG	79362

AL928614.3	701	GATCATTCATATTGCTGGTAGGAATGGATTTTAAAATGGTACAGCCACTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	79363	GATCATTCATATTGCTGGTAGGAATGGATTTTAAAATGGTACAGCCACTC	79412

AL928614.3	751	TGGAAATGGATATTGCAGTTTTCTTCAAACTGAACATGCAATTTACCATA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	79413	TGGAAATGGATATTGCAGTTTTCTTCAAACTGAACATGCAATTTACCATA	79462

AL928614.3	801	TGACTAGCAATTGCCCTCCTAGGCATTTATTTCAAACAAGGGAAAACTTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	79463	TGACTAGCAATTGCCCTCCTAGGCATTTATTTCAAACAAGGGAAAACTTT	79512

AL928614.3	851	ATGTTCATGAAAAACCTGTATACAAATACTCTTGCAGCTTTATTCATAAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	79513	ATGTTCATGAAAAACCTGTATACAAATACTCTTGCAGCTTTATTCATAAT	79562

AL928614.3	901	ACTCCTGGAAGTAATTATTCATAATTACTTCCATAAACTGGAAATAATGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	79563	ACTCCTGGAAGTAATTATTCATAATTACTTCCATAAACTGGAAATAATGC	79612

AL928614.3	951	AATTGTCTTTCAGTGGGTGAAGGAGATCTGCTGGTTGAACTCATAACTGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	79613	AATTGTCTTTCAGTGGGTGAAGGAGATCTGCTGGTTGAACTCATAACTGA	79662

AL928614.3	1001	GTCTACACAAGTGCCCTTTCTCAAGACTACTATCCTGCTTCTCTTTGCAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	79663	GTCTACACAAGTGCCCTTTCTCAAGACTACTATCCTGCTTCTCTTTGCAT	79712

AL928614.3	1051	ATCTCCCATTTTCTCACAAAGAATATTAAAGACATGTACTCAAGGATCAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	79713	ATCTCCCATTTTCTCACAAAGAATATTAAAGACATGTACTCAAGGATCAA	79762

AL928614.3	1101	AATTTAATGAACATAAATATTTTACTGCTCCATCAAAGGCATTCTTAAAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	79763	AATTTAATGAACATAAATATTTTACTGCTCCATCAAAGGCATTCTTAAAT	79812

AL928614.3	1151	GGGACTGCAGTTTGGAGCCACTGCCTTGGTTCTGCTAAGGTGCTGGGTGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	79813	GGGACTGCAGTTTGGAGCCACTGCCTTGGTTCTGCTAAGGTGCTGGGTGT	79862

AL928614.3	1201	GCTACCGACCTTGGCATTTGCAGCATTAATGGAAAAGTCAACATAATGAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	79863	GCTACCGACCTTGGCATTTGCAGCATTAATGGAAAAGTCAACATAATGAA	79912

AL928614.3	1251	ACAGGCAAATGGCATCTTGGTATTACTGTGAAAACAGGTTTCCCTCCAGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	79913	ACAGGCAAATGGCATCTTGGTATTACTGTGAAAACAGGTTTCCCTCCAGG	79962

AL928614.3	1301	ACTCTCTGAAGGCAGCTCAGGGGGCCATACTTTCAAAATGGCAGAGATCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	79963	ACTCTCTGAAGGCAGCTCAGGGGGCCATACTTTCAAAATGGCAGAGATCA	80012

AL928614.3	1351	ATTATGGTTCCTAGTGAGACCCAACCCCTAGCCTATTCAGATTCAGCACT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	80013	ATTATGGTTCCTAGTGAGACCCAACCCCTAGCCTATTCAGATTCAGCACT	80062

AL928614.3	1401	CTCTCTCGCTCTTTTTTTTCCCTCATTCTTCCAACTTATAATTGTATATA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	80063	CTCTCTCGCTCTTTTTTTTCCCTCATTCTTCCAACTTATAATTGTATATA	80112

AL928614.3	1451	TTTTCAAATGTGCAAAGAAGCTGAAAGAATAGTGCAGTAAAATTCAAGTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	80113	TTTTCAAATGTGCAAAGAAGCTGAAAGAATAGTGCAGTAAAATTCAAGTT	80162

AL928614.3	1501	ATCACTCTGATATATCTGATTAATATCTCTTTATATGCATGAAAGCAGCG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	80163	ATCACTCTGATATATCTGATTAATATCTCTTTATATGCATGAAAGCAGCG	80212

AL928614.3	1551	TGTGGAATGATAGACAATAGAGACCCAGAAGGGTAAGAGTGGTTGGCAGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	80213	TGTGGAATGATAGACAATAGAGACCCAGAAGGGTAAGAGTGGTTGGCAGT	80262

AL928614.3	1601	GGGTGTATCGTAGAGGAGTTTCTTGTTGGGGTCAATGTATCTGTCTCCAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	80263	GGGTGTATCGTAGAGGAGTTTCTTGTTGGGGTCAATGTATCTGTCTCCAG	80312

AL928614.3	1651	TGCTGGATGCACTGAAGGCCCTGACTTTACCACAACTCAATATAGCAATG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	80313	TGCTGGATGCACTGAAGGCCCTGACTTTACCACAACTCAATATAGCAATG	80362

AL928614.3	1701	TAGCAAAACTGCACCTGTGCCCCATAAATATATACGAATTTAAAAATTTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	80363	TAGCAAAACTGCACCTGTGCCCCATAAATATATACGAATTTAAAAATTTA	80412

AL928614.3	1751	AAAATAAAATAACATCTCTCTTTATAGATACAGGTAGACATGTTTGCATA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	80413	AAAATAAAATAACATCTCTCTTTATAGATACAGGTAGACATGTTTGCATA	80462

AL928614.3	1801	GCATGTGTGTGAATGTGTGTGTATGTGTGTGTAGAGAGGCAGCAGGAATG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	80463	GCATGTGTGTGAATGTGTGTGTATGTGTGTGTAGAGAGGCAGCAGGAATG	80512

AL928614.3	1851	AAGAGATTAAGCTTTTGTGACTGAGCCATTCTAAAGTAACAAACATAAAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	80513	AAGAGATTAAGCTTTTGTGACTGAGCCATTCTAAAGTAACAAACATAAAA	80562

AL928614.3	1901	CACGCATGGATAAATGTCTATGTGACAACAAACCTGAATATAAACATGAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	80563	CACGCATGGATAAATGTCTATGTGACAACAAACCTGAATATAAACATGAA	80612

AL928614.3	1951	AGAATATGTCTATAAACATATCTCTGGCTAGATAACCTATGAAAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645929.4	80613	AGAATATGTCTATAAACATATCTCTGGCTAGATAACCTATGAAAGAATTC	80662

Overview

Query
AL928614.3 - 21222 bps
Hit
AL645929.4 - 80662 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link