<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662860.3	1	GAATTCTCACTACGCCAGGGTTTTGAGGCACCCCTGTTCCCAGGTTCCTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	110579	GAATTCTCACTACGCCAGGGTTTTGAGGCACCCCTGTTCCCAGGTTCCTT	110628

AL662860.3	51	CCTAGAACCCTGGTCGCCTTGGGATGACTGGGGGATTCTAGTTGACTACC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	110629	CCTAGAACCCTGGTCGCCTTGGGATGACTGGGGGATTCTAGTTGACTACC	110678

AL662860.3	101	CAAGGAAATCTGAAGCTTGGGAAGTTTGCAATGTTAAGTCTCGGTCCAGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	110679	CAAGGAAATCTGAAGCTTGGGAAGTTTGCAATGTTAAGTCTCGGTCCAGA	110728

AL662860.3	151	GTCGGACCTGGCTCCGCGCCTGTCTGGCAGCAGCAGCAGCAATCCCTATC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	110729	GTCGGACCTGGCTCCGCGCCTGTCTGGCAGCAGCAGCAGCAATCCCTATC	110778

AL662860.3	201	CGGGTCCAGAGCCCTGCCCAGTGGATACTGTGTGGTGTTTCCACAAAGTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	110779	CGGGTCCAGAGCCCTGCCCAGTGGATACTGTGTGGTGTTTCCACAAAGTT	110828

AL662860.3	251	GCATCTTTGAGCACCTCACAGAGAATCTGGAGCCTCTCAACCAGGACAAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	110829	GCATCTTTGAGCACCTCACAGAGAATCTGGAGCCTCTCAACCAGGACAAC	110878

AL662860.3	301	GTGAGAAAAAAATCTGAAGAAAAAGGCCCAGGTGCTTGGGGTAAGAACAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	110879	GTGAGAAAAAAATCTGAAGAAAAAGGCCCAGGTGCTTGGGGTAAGAACAG	110928

AL662860.3	351	CCAAGCAAAGGGCAGAGGCTGAGTGGGTGCCAGGAGGACACTTTGTCACT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	110929	CCAAGCAAAGGGCAGAGGCTGAGTGGGTGCCAGGAGGACACTTTGTCACT	110978

AL662860.3	401	TTGGAGACAGAGCCTTTGGCTTAAGGAGTTCCAGGCTGCTCTGGAGGCGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	110979	TTGGAGACAGAGCCTTTGGCTTAAGGAGTTCCAGGCTGCTCTGGAGGCGT	111028

AL662860.3	451	CGGGGGAGGCCTCTGGGACCACCTAGTCATTTTCCGCAAGAAAGTAAGAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	111029	CGGGGGAGGCCTCTGGGACCACCTAGTCATTTTCCGCAAGAAAGTAAGAG	111078

AL662860.3	501	ATTTCCCAGTTTTGTGCTCATGGGGAGCATTCACCTGAGATATAAAACTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	111079	ATTTCCCAGTTTTGTGCTCATGGGGAGCATTCACCTGAGATATAAAACTT	111128

AL662860.3	551	TGGCTGCTTAACTCATTTTAAGGGAATAATAACATATTTGCATACACTTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	111129	TGGCTGCTTAACTCATTTTAAGGGAATAATAACATATTTGCATACACTTT	111178

AL662860.3	601	ATTTGGAGGCAAAAGAAAAAAAATAGTCTGTTGAATAAATTATTCTAGAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	111179	ATTTGGAGGCAAAAGAAAAAAAATAGTCTGTTGAATAAATTATTCTAGAT	111228

AL662860.3	651	TTTACTTCCCAGGGATTTTTTTTTCTTTCTAAAAATTATAGACAATTCAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	111229	TTTACTTCCCAGGGATTTTTTTTTCTTTCTAAAAATTATAGACAATTCAT	111278

AL662860.3	701	CTCCTATTCTCCCTTCTTGAGAAATTAACCATTTGAAAACAGATATGTGC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	111279	CTCCTATTCTCCCTTCTTGAGAAATTAACCATTTGAAAACAGATATGTGC	111328

AL662860.3	751	CCTTAGTCTGCCTTCCAATATCTCTCATACGATCCATGATTTTTAAAGAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	111329	CCTTAGTCTGCCTTCCAATATCTCTCATACGATCCATGATTTTTAAAGAA	111378

AL662860.3	801	ATACAACTCCATTGCATGACCAAAGGGAGGAGGGGGAAATGGAAAGAAGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	111379	ATACAACTCCATTGCATGACCAAAGGGAGGAGGGGGAAATGGAAAGAAGG	111428

AL662860.3	851	AGCTGGGCAACACAAGCACCAGGGGGAAGGGCCTGGGGCCCAGGGCCAGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	111429	AGCTGGGCAACACAAGCACCAGGGGGAAGGGCCTGGGGCCCAGGGCCAGC	111478

AL662860.3	901	ACCTCCCTACTTGTGGGAGCCTCAGCTGTTCCTTCAATCCCCAGGCCACA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	111479	ACCTCCCTACTTGTGGGAGCCTCAGCTGTTCCTTCAATCCCCAGGCCACA	111528

AL662860.3	951	CCTAACCTTGGGTTGAAAAGTGCTTTCTGGGCTGACTCCGCTGTTAGAAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	111529	CCTAACCTTGGGTTGAAAAGTGCTTTCTGGGCTGACTCCGCTGTTAGAAC	111578

AL662860.3	1001	AGGTAGGAGGTTGCTTGGTAAATGTTGCAAGAATGTGAACTCTTGTGGTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	111579	AGGTAGGAGGTTGCTTGGTAAATGTTGCAAGAATGTGAACTCTTGTGGTA	111628

AL662860.3	1051	GAAATATTCTGAGGCTGATTCAGAGGCTGCCTGGGACCCCGTCACAGCTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	111629	GAAATATTCTGAGGCTGATTCAGAGGCTGCCTGGGACCCCGTCACAGCTC	111678

AL662860.3	1101	TGGGGTCTGTCTCCCACAAGGAGCCATGCCCCGAACAGAGGTACCTGTGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	111679	TGGGGTCTGTCTCCCACAAGGAGCCATGCCCCGAACAGAGGTACCTGTGT	111728

AL662860.3	1151	CCACTCATCCTGCAGAGAGTGGGAGCCAGTTCCTGCCCCACCTGCTGTCT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	111729	CCACTCATCCTGCAGAGAGTGGGAGCCAGTTCCTGCCCCACCTGCTGTCT	111778

AL662860.3	1201	CCTAAGTGCTTCTTTGTGCCCAGGAGGGAGAGGGAGCAAAGGGCATGGGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	111779	CCTAAGTGCTTCTTTGTGCCCAGGAGGGAGAGGGAGCAAAGGGCATGGGA	111828

AL662860.3	1251	ACCTCCTGGGCTGTGACCAGTCATCACCTGGGATCCCACTGCCACAGCTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	111829	ACCTCCTGGGCTGTGACCAGTCATCACCTGGGATCCCACTGCCACAGCTC	111878

AL662860.3	1301	AGAGCTAAAGACAGAAACACCCAGCATTTCACTGCACGCTGATCTCAGCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	111879	AGAGCTAAAGACAGAAACACCCAGCATTTCACTGCACGCTGATCTCAGCC	111928

AL662860.3	1351	AGCACTGGGAAGGGCTGGGAGCATGTCCTGCGTGCTTGGTTTCCCATGCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	111929	AGCACTGGGAAGGGCTGGGAGCATGTCCTGCGTGCTTGGTTTCCCATGCC	111978

AL662860.3	1401	CCTGAGACGCTTTTCCTGCTTCCGCACTATCTCCTTGGGTTGCACAGAGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	111979	CCTGAGACGCTTTTCCTGCTTCCGCACTATCTCCTTGGGTTGCACAGAGA	112028

AL662860.3	1451	GTTCCAGCACTCCGCTTCCCTGGGGAAACTGACAATGACTGGCCCTTGAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	112029	GTTCCAGCACTCCGCTTCCCTGGGGAAACTGACAATGACTGGCCCTTGAT	112078

AL662860.3	1501	TGACTCACCCAGTGAGTTGGTTTCCTGGGGCCATGGTAACAAACTACCAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	112079	TGACTCACCCAGTGAGTTGGTTTCCTGGGGCCATGGTAACAAACTACCAC	112128

AL662860.3	1551	AAACCAGATGGCTTTAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACAAAACAAAACA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	112129	AAACCAGATGGCTTTAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACAAAACAAAACA	112178

AL662860.3	1601	GAAACTCATGCTCTCCCAATTCTGGAGGCCAGAGGCCATAGTCTGAAATC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	112179	GAAACTCATGCTCTCCCAATTCTGGAGGCCAGAGGCCATAGTCTGAAATC	112228

AL662860.3	1651	CAGGTCTGGGCAGGGCCAGGCTTTCTCTCCCAGCTCTGGTGTATCCTGGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	112229	CAGGTCTGGGCAGGGCCAGGCTTTCTCTCCCAGCTCTGGTGTATCCTGGC	112278

AL662860.3	1701	AGTCCTTGGCTCTCCTTGGTTGCAGCTGCATCCCTCCCACCTCTGCCTCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	112279	AGTCCTTGGCTCTCCTTGGTTGCAGCTGCATCCCTCCCACCTCTGCCTCC	112328

AL662860.3	1751	GTTTTTGTGTGACATTCTCTCTGCCAGCATCTGCCTGTTTCTCTTGTCTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	112329	GTTTTTGTGTGACATTCTCTCTGCCAGCATCTGCCTGTTTCTCTTGTCTT	112378

AL662860.3	1801	GTACCTACACCAGTCATACTGGATTAAAGGCCCTCCCTGCTCCACTCTGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	112379	GTACCTACACCAGTCATACTGGATTAAAGGCCCTCCCTGCTCCACTCTGA	112428

AL662860.3	1851	TCTCATCTTAACTGACATCCCAATGACATCTACACATACCCTATTTCCAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	112429	TCTCATCTTAACTGACATCCCAATGACATCTACACATACCCTATTTCCAA	112478

AL662860.3	1901	AGAAGATCACATTCCCAGGTATCAGGGGTTAGGACTTGAACATATCTTTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	112479	AGAAGATCACATTCCCAGGTATCAGGGGTTAGGACTTGAACATATCTTTC	112528

AL662860.3	1951	TGAGGTCACACCAGGTGACCCTTCTTCCCTAACAGACCATCCAGATCCTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645927.3	112529	TGAGGTCACACCAGGTGACCCTTCTTCCCTAACAGACCATCCAGATCCTC	112578

Overview

Query
AL662860.3 - 49694 bps
Hit
AL645927.3 - 112578 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link