<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645753.11	1	AAGCTTTTCAGGTTTGCGTGGTTCCATTTATTCATTGTTGGTCTCGTTGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	127776	AAGCTTTTCAGGTTTGCGTGGTTCCATTTATTCATTGTTGGTCTCGTTGA	127825

AL645753.11	51	CTGTGCTATCCTTGTCTTGTTCAGGAAGTCTTTTCCTATGCCAGTGAGTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	127826	CTGTGCTATCCTTGTCTTGTTCAGGAAGTCTTTTCCTATGCCAGTGAGTT	127875

AL645753.11	101	CATTCTAACCTCACTTTCTCTTCTATTAGATTCAGGGTATATGGCCTTAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	127876	CATTCTAACCTCACTTTCTCTTCTATTAGATTCAGGGTATATGGCCTTAT	127925

AL645753.11	151	GTTGAGATCCTTAATTTACTTGGAGTTGAGTTTTGTGCAGGGTGATTGAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	127926	GTTGAGATCCTTAATTTACTTGGAGTTGAGTTTTGTGCAGGGTGATTGAC	127975

AL645753.11	201	ATGAATCTATTTGCATTCTTCTACATGCAGACATCCAGTTAGTAATAGTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	127976	ATGAATCTATTTGCATTCTTCTACATGCAGACATCCAGTTAGTAATAGTT	128025

AL645753.11	251	GCTAGAGGAATAGATGCTAAAGGAAGAAATCGAAGAAGACAGATCTATGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	128026	GCTAGAGGAATAGATGCTAAAGGAAGAAATCGAAGAAGACAGATCTATGG	128075

AL645753.11	301	GTAAATTTTAATTGTTATAATTTATATAACAGAAGTAACACTTAATATTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	128076	GTAAATTTTAATTGTTATAATTTATATAACAGAAGTAACACTTAATATTT	128125

AL645753.11	351	GAGTATAATTAGCAAAGATTTCTTTTTTTTAATTTATTTTTTTTATTAGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	128126	GAGTATAATTAGCAAAGATTTCTTTTTTTTAATTTATTTTTTTTATTAGG	128175

AL645753.11	401	TATTTTCCTCGTTTACATTTTCAATGCTATCCCAAAAGTCCCCCATACCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	128176	TATTTTCCTCGTTTACATTTTCAATGCTATCCCAAAAGTCCCCCATACCC	128225

AL645753.11	451	ACCCCCCCAATCCCCTACCCACCCACTCCCCCTTTTTGGCCCTGGGGTTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	128226	ACCCCCCCAATCCCCTACCCACCCACTCCCCCTTTTTGGCCCTGGGGTTC	128275

AL645753.11	501	CCCTGTACTGGGGCATATAAAGTTTGCAAGTCCAATGGGCCTCTCTTTGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	128276	CCCTGTACTGGGGCATATAAAGTTTGCAAGTCCAATGGGCCTCTCTTTGC	128325

AL645753.11	551	AGTGATGGCCGACTAGGCCATCTTTTGATACATATGCAGCTAAAGACAAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	128326	AGTGATGGCCGACTAGGCCATCTTTTGATACATATGCAGCTAAAGACAAG	128375

AL645753.11	601	AGCTCTCGGGTACTGGTTAGTTCATATTGTTGTTCCACCTATAGGGTTGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	128376	AGCTCTCGGGTACTGGTTAGTTCATATTGTTGTTCCACCTATAGGGTTGC	128425

AL645753.11	651	AGTTCCCTTTAGCTCCTTGGGTAATTTCTCTAGCTCCTCCATTGGGGGCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	128426	AGTTCCCTTTAGCTCCTTGGGTAATTTCTCTAGCTCCTCCATTGGGGGCC	128475

AL645753.11	701	GTGTGACCCATCCAATAGCTGACTGTGATCATCCACTTCTGTGTTTGCTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	128476	GTGTGACCCATCCAATAGCTGACTGTGATCATCCACTTCTGTGTTTGCTA	128525

AL645753.11	751	GGCCCCGGCATAGTCTCACAAGAGACAGCTATATCTGGGTTCTTATAAGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	128526	GGCCCCGGCATAGTCTCACAAGAGACAGCTATATCTGGGTTCTTATAAGC	128575

AL645753.11	801	TATACCTTACAAATAAAAACTGATTTATCTCAGAGTAATCCAAATTATTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	128576	TATACCTTACAAATAAAAACTGATTTATCTCAGAGTAATCCAAATTATTT	128625

AL645753.11	851	TCATCAAATTAAGTTTTAAGTGGGTGTGGACCATATTTTGGAATGAGGCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	128626	TCATCAAATTAAGTTTTAAGTGGGTGTGGACCATATTTTGGAATGAGGCA	128675

AL645753.11	901	TGAATACAGGTCTGCTTCCTTTTGGCCTAACTTTCCCACTGATGTTGATT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	128676	TGAATACAGGTCTGCTTCCTTTTGGCCTAACTTTCCCACTGATGTTGATT	128725

AL645753.11	951	AGCTGCATAGTAGGCTAGCACTTCCAGGTTAGTGCCTGAAGTATGGGCAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	128726	AGCTGCATAGTAGGCTAGCACTTCCAGGTTAGTGCCTGAAGTATGGGCAG	128775

AL645753.11	1001	TCACTTATATTCCAGGGGCTGTTTCTGGAAAAATATTTGAGAACTGACTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	128776	TCACTTATATTCCAGGGGCTGTTTCTGGAAAAATATTTGAGAACTGACTG	128825

AL645753.11	1051	TCCTAGAGATATTTTTACTCCTTTTATATTCAAATTATATTTTTAAAATG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	128826	TCCTAGAGATATTTTTACTCCTTTTATATTCAAATTATATTTTTAAAATG	128875

AL645753.11	1101	CCTCCTGTAAGTCATCATCAAGTCTTACTAATTTATTAATTATTTCTAAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	128876	CCTCCTGTAAGTCATCATCAAGTCTTACTAATTTATTAATTATTTCTAAT	128925

AL645753.11	1151	AAATGCTATAATCCATCAGATCCTCTTGCATAGCAAACAGTCTTGCTTAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	128926	AAATGCTATAATCCATCAGATCCTCTTGCATAGCAAACAGTCTTGCTTAT	128975

AL645753.11	1201	GGTTAGAGCAGCTTTATGACATCAGTTCTATGAACTCCATGAAACTGTTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	128976	GGTTAGAGCAGCTTTATGACATCAGTTCTATGAACTCCATGAAACTGTTT	129025

AL645753.11	1251	TCTTAGGAGTTTGCAACCTTGCTTTTATTTTTCTGTTAGATGTAAACTGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	129026	TCTTAGGAGTTTGCAACCTTGCTTTTATTTTTCTGTTAGATGTAAACTGT	129075

AL645753.11	1301	ATCTGACTAAACAGGGATTCTTTTCAACAGCAGTAGATTACTTGTGACAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	129076	ATCTGACTAAACAGGGATTCTTTTCAACAGCAGTAGATTACTTGTGACAA	129125

AL645753.11	1351	AGATGTTTTTTGTGGTTATGATTTTATAGTGCTATCCCCTTTCAGTTTTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	129126	AGATGTTTTTTGTGGTTATGATTTTATAGTGCTATCCCCTTTCAGTTTTA	129175

AL645753.11	1401	CCACTGCCGGGATTTAATTATTGAAAGCATAGTTGAGTAGGAATTTCTTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	129176	CCACTGCCGGGATTTAATTATTGAAAGCATAGTTGAGTAGGAATTTCTTA	129225

AL645753.11	1451	TATTACTTTTTCTAGGAAGACATAATGACTCCAGATATAGAGGGCACCAT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	129226	TATTACTTTTTCTAGGAAGACATAATGACTCCAGATATAGAGGGCACCAT	129275

AL645753.11	1501	CAGACTGAAGAAAAGATTGCATAAAACTCTGGCTTGGTGAGCCAGTGGGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	129276	CAGACTGAAGAAAAGATTGCATAAAACTCTGGCTTGGTGAGCCAGTGGGC	129325

AL645753.11	1551	TTACTGGGGTTACTCAATCGAAGCATGAGGAACCTTTAAGGTAGCGTCAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	129326	TTACTGGGGTTACTCAATCGAAGCATGAGGAACCTTTAAGGTAGCGTCAC	129375

AL645753.11	1601	AACTATGAAGTCTCCCCTCAAGCAGTTTCCATAATGAAAAGCTGCATCAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	129376	AACTATGAAGTCTCCCCTCAAGCAGTTTCCATAATGAAAAGCTGCATCAC	129425

AL645753.11	1651	TAAAGTCTCACTACCGCACTGCCCTGCCTTCTGTAGCACCCTCCAGAACC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	129426	TAAAGTCTCACTACCGCACTGCCCTGCCTTCTGTAGCACCCTCCAGAACC	129475

AL645753.11	1701	ACATGCAGCTGGAGCAGGATCTTAGGCGAGGGTCTCGTAACACCCTCCAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	129476	ACATGCAGCTGGAGCAGGATCTTAGGCGAGGGTCTCGTAACACCCTCCAC	129525

AL645753.11	1751	CCTTCATCACCATCACCACAGGCATAGCTATGAGTTGTACCCTGCTTATT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	129526	CCTTCATCACCATCACCACAGGCATAGCTATGAGTTGTACCCTGCTTATT	129575

AL645753.11	1801	TGGTTACTGTGGCTGTAGATCTCTTGTAGGTCATCACAGCCACTCTGTTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	129576	TGGTTACTGTGGCTGTAGATCTCTTGTAGGTCATCACAGCCACTCTGTTT	129625

AL645753.11	1851	CGTGAGTGCATGCCCAAAGAAGTAGCTGCACAGTGTCCTGACACATCATC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	129626	CGTGAGTGCATGCCCAAAGAAGTAGCTGCACAGTGTCCTGACACATCATC	129675

AL645753.11	1901	TAGTCAGAAAGCAGAACGAGAGGAATGCTAGAGCTCTTGGATGTTCATAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	129676	TAGTCAGAAAGCAGAACGAGAGGAATGCTAGAGCTCTTGGATGTTCATAG	129725

AL645753.11	1951	GGTGGCGTCACCCACACCCAGGGTAGTTCTTTTCCACCCAGTTAAACTTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645806.9	129726	GGTGGCGTCACCCACACCCAGGGTAGTTCTTTTCCACCCAGTTAAACTTT	129775

Overview

Query
AL645753.11 - 145594 bps
Hit
AL645806.9 - 129775 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link