<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645664.8	1	GAATTCCAAGCAATCCATCCATGTCATACTCTGACAAAGCAAGTGAGAAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	82605	GAATTCCAAGCAATCCATCCATGTCATACTCTGACAAAGCAAGTGAGAAG	82654

AL645664.8	51	CCATGAGTAGAGAAGATTTAGTTCTGAGTGGAAAGTAAGAAATCAAGCCT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	82655	CCATGAGTAGAGAAGATTTAGTTCTGAGTGGAAAGTAAGAAATCAAGCCT	82704

AL645664.8	101	TCACACTGACCACAGTGCTGCTCCACATAACCAGGCTGTTTGACCTAGGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	82705	TCACACTGACCACAGTGCTGCTCCACATAACCAGGCTGTTTGACCTAGGG	82754

AL645664.8	151	CCATGTAAAGGGAGGGACTTAATATCCTTGAACTTGAGTCACCTAGTTTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	82755	CCATGTAAAGGGAGGGACTTAATATCCTTGAACTTGAGTCACCTAGTTTT	82804

AL645664.8	201	CAAACTGAAGGAGTTAGACTAGGATATTCCAGTTGTCAGAATGTAGTCAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	82805	CAAACTGAAGGAGTTAGACTAGGATATTCCAGTTGTCAGAATGTAGTCAC	82854

AL645664.8	251	CGGAATAGGGTAACGACAAAAGAAGTATGTCGAATAAATAAACTATTGGC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	82855	CGGAATAGGGTAACGACAAAAGAAGTATGTCGAATAAATAAACTATTGGC	82904

AL645664.8	301	ATTAATTGAAGCTAATGAGTATTTTCAGGTCATATGTAACACACAGCCTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	82905	ATTAATTGAAGCTAATGAGTATTTTCAGGTCATATGTAACACACAGCCTT	82954

AL645664.8	351	TTAAACAAAAACAAAACAATGAAAGTATTAAAAGCTCACAGAAGAGATAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	82955	TTAAACAAAAACAAAACAATGAAAGTATTAAAAGCTCACAGAAGAGATAA	83004

AL645664.8	401	GTAAATACCTTTGTATTTTTATTTTTAAAAAGCTAATCTATAATAGAAAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	83005	GTAAATACCTTTGTATTTTTATTTTTAAAAAGCTAATCTATAATAGAAAT	83054

AL645664.8	451	TTTATAAATTATTTATGGTTTATTTTTATACTTGCTCTTTAATATGAAAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	83055	TTTATAAATTATTTATGGTTTATTTTTATACTTGCTCTTTAATATGAAAT	83104

AL645664.8	501	TCCAGTGACAAAGAAAGTAATCTAATTAAGGTTGTTTAAGCTTTTGTTGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	83105	TCCAGTGACAAAGAAAGTAATCTAATTAAGGTTGTTTAAGCTTTTGTTGT	83154

AL645664.8	551	AGTCAGCAATGAACAAAGACCAAACAGAAAAATCTGTATATAATTTAAGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	83155	AGTCAGCAATGAACAAAGACCAAACAGAAAAATCTGTATATAATTTAAGC	83204

AL645664.8	601	TTTAGTTTAAAACATTTTAACTCCTTAAGACAATTTCAGAAAAGACAGGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	83205	TTTAGTTTAAAACATTTTAACTCCTTAAGACAATTTCAGAAAAGACAGGG	83254

AL645664.8	651	GAGGGAAGTGTCTAATTTTTATTCAAGTTGTACTTAAAGCAATTCTTACA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	83255	GAGGGAAGTGTCTAATTTTTATTCAAGTTGTACTTAAAGCAATTCTTACA	83304

AL645664.8	701	CAAATGTTTAAAAATTTCCACAACACTTGTAATGAAACTTAAAGTGTACA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	83305	CAAATGTTTAAAAATTTCCACAACACTTGTAATGAAACTTAAAGTGTACA	83354

AL645664.8	751	GAAGCAAATATCTTAAGAATGCCTTAGTTAGAGCCAAGATTACTTAAAGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	83355	GAAGCAAATATCTTAAGAATGCCTTAGTTAGAGCCAAGATTACTTAAAGT	83404

AL645664.8	801	ATAATATTGATAATAAGCTTGTAAAAACTTAAGGGCAAGTTTGCCACCTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	83405	ATAATATTGATAATAAGCTTGTAAAAACTTAAGGGCAAGTTTGCCACCTA	83454

AL645664.8	851	ACTCCATGAAATGTTACAAAGTTAGAAACAGAATTTTTATAAAAAATAAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	83455	ACTCCATGAAATGTTACAAAGTTAGAAACAGAATTTTTATAAAAAATAAT	83504

AL645664.8	901	TTATCTATGGAGTTATAATATTGGGAACTTTTATTTGGAAAAACAAAGCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	83505	TTATCTATGGAGTTATAATATTGGGAACTTTTATTTGGAAAAACAAAGCT	83554

AL645664.8	951	TAAAAAGAAAGATAGTAAGAAAGAAACTAAGTATTATTAATCTGATGTAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	83555	TAAAAAGAAAGATAGTAAGAAAGAAACTAAGTATTATTAATCTGATGTAT	83604

AL645664.8	1001	CTTCATCTATTTATAGTTCTCATTTTTAAAAAACTTCAATGAGTTGGAGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	83605	CTTCATCTATTTATAGTTCTCATTTTTAAAAAACTTCAATGAGTTGGAGT	83654

AL645664.8	1051	GTGCCTTGTGGGTAGAGAGCTTGGTGCAAGACCCTACATTTGATCCTCAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	83655	GTGCCTTGTGGGTAGAGAGCTTGGTGCAAGACCCTACATTTGATCCTCAG	83704

AL645664.8	1101	TAACATAAGCCGACCAACCAGCCCCAACTAATGGAATTGAAATTTTAATT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	83705	TAACATAAGCCGACCAACCAGCCCCAACTAATGGAATTGAAATTTTAATT	83754

AL645664.8	1151	CTTAGCATCTTTGGGAGGGGGTGATTTTTTTATTTAGTTTTTCTAGATGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	83755	CTTAGCATCTTTGGGAGGGGGTGATTTTTTTATTTAGTTTTTCTAGATGA	83804

AL645664.8	1201	TGAATACATACTCTACTAAGAATCATAAAACTACCTTAACATTTCTAATT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	83805	TGAATACATACTCTACTAAGAATCATAAAACTACCTTAACATTTCTAATT	83854

AL645664.8	1251	TTTGTTGTTTGTTCCCTAAGAGCATCACCTATAATCAACTAATACACTTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	83855	TTTGTTGTTTGTTCCCTAAGAGCATCACCTATAATCAACTAATACACTTT	83904

AL645664.8	1301	ACATTATAAACTCTCAATGAACATACCCGCTAAGGCTGCCTTATGATCCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	83905	ACATTATAAACTCTCAATGAACATACCCGCTAAGGCTGCCTTATGATCCT	83954

AL645664.8	1351	ATAAATCAAAAATCTACTCATAAGTAACTACATCTTCACACTAACTTTTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	83955	ATAAATCAAAAATCTACTCATAAGTAACTACATCTTCACACTAACTTTTT	84004

AL645664.8	1401	TTTCCATAAAAATCATTAATAATTCATTAAACAGGAACTTCTGGAAAACT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	84005	TTTCCATAAAAATCATTAATAATTCATTAAACAGGAACTTCTGGAAAACT	84054

AL645664.8	1451	GTACTGGAATAAAACTTATCAACAATATTTGATATGTAGGCTTTGTTCCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	84055	GTACTGGAATAAAACTTATCAACAATATTTGATATGTAGGCTTTGTTCCT	84104

AL645664.8	1501	ACAACCACAACCTCCTTAATCAGATCATAGAAATAGTTGATTTATTTGCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	84105	ACAACCACAACCTCCTTAATCAGATCATAGAAATAGTTGATTTATTTGCT	84154

AL645664.8	1551	TCCGGTTTTCCCTTTTGATCAAAGTTGGGACACAATACATTCTCTCTGCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	84155	TCCGGTTTTCCCTTTTGATCAAAGTTGGGACACAATACATTCTCTCTGCA	84204

AL645664.8	1601	ATAGGCTCCAATTTTTAAGAAAGACATAGTGAGATATTAAAGTTAAATAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	84205	ATAGGCTCCAATTTTTAAGAAAGACATAGTGAGATATTAAAGTTAAATAC	84254

AL645664.8	1651	AGAAACAAATTAACACTGGAATTTAAGTTTACTCATGTGACTAAATAAAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	84255	AGAAACAAATTAACACTGGAATTTAAGTTTACTCATGTGACTAAATAAAT	84304

AL645664.8	1701	TTATAGAGAATGCACATCTGCTTATTTTCTTAAAGAAAAACCAGCATTTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	84305	TTATAGAGAATGCACATCTGCTTATTTTCTTAAAGAAAAACCAGCATTTA	84354

AL645664.8	1751	GCGTTCAAATTGATAGTTTGTAGATAATAATTTTTTTCTAGAAGGATATT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	84355	GCGTTCAAATTGATAGTTTGTAGATAATAATTTTTTTCTAGAAGGATATT	84404

AL645664.8	1801	TCAATGATAAATGTACTACCATAGCTGATAGAACATTCTCCTTTAATTTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	84405	TCAATGATAAATGTACTACCATAGCTGATAGAACATTCTCCTTTAATTTG	84454

AL645664.8	1851	TGCTTTCTGAAAAAAAAATGAAGCATAATGCTTTTTCTATCCTATTGTGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	84455	TGCTTTCTGAAAAAAAAATGAAGCATAATGCTTTTTCTATCCTATTGTGT	84504

AL645664.8	1901	CCAAGGTATAGGCCTACTTTAAAAAATGAAATTAAGAATTTCTAGAGAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	84505	CCAAGGTATAGGCCTACTTTAAAAAATGAAATTAAGAATTTCTAGAGAAA	84554

AL645664.8	1951	ACTACTTTATACAAAAGTTTATAAAGTTATCAGATTCTTTCTCCAAAAAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645763.6	84555	ACTACTTTATACAAAAGTTTATAAAGTTATCAGATTCTTTCTCCAAAAAA	84604

Overview

Query
AL645664.8 - 193914 bps
Hit
AL645763.6 - 84604 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link