<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645923.14	1	CACCTAACAATTTTTGAAAATCATTTAATCTTTTTAAGTTGTCCCTGTGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	135783	CACCTAACAATTTTTGAAAATCATTTAATCTTTTTAAGTTGTCCCTGTGG	135832

AL645923.14	51	ATAACTATCTTCTGGGGGAAAACAGCTTGATTTGTAAGTCTAAAACCAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	135833	ATAACTATCTTCTGGGGGAAAACAGCTTGATTTGTAAGTCTAAAACCAAA	135882

AL645923.14	101	ATAATTATAAGGATCCTGAGTTTGTATCTTCTCAGGAACTATTTGTAGTC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	135883	ATAATTATAAGGATCCTGAGTTTGTATCTTCTCAGGAACTATTTGTAGTC	135932

AL645923.14	151	CTTTATCAGCTAAGGCCTTTTGTAAATCTCTATGAAACAAAAGCAAATTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	135933	CTTTATCAGCTAAGGCCTTTTGTAAATCTCTATGAAACAAAAGCAAATTC	135982

AL645923.14	201	TGGGGGTCTTTTCCCACCATCAAGACATCATCTGTGTAATGAATGATGTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	135983	TGGGGGTCTTTTCCCACCATCAAGACATCATCTGTGTAATGAATGATGTA	136032

AL645923.14	251	AATCATAGGCCATTGTTGTCTCACAGGCTGAATGGCTTGTGCCACAAACT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	136033	AATCATAGGCCATTGTTGTCTCACAGGCTGAATGGCTTGTGCCACAAACT	136082

AL645923.14	301	TTTGACATAAGGTAGGACTATTAGCCATGCCCTGTGGGAGAACTGTCCAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	136083	TTTGACATAAGGTAGGACTATTAGCCATGCCCTGTGGGAGAACTGTCCAT	136132

AL645923.14	351	GATATCTCTTCATAGGTTCTTTAAAATTTATAGAAGGACTACTAAAAGCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	136133	GATATCTCTTCATAGGTTCTTTAAAATTTATAGAAGGACTACTAAAAGCA	136182

AL645923.14	401	AATCTTTCACAATCCTCCGGATATAAAGGAATAGTAAAGAAACAATCCTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	136183	AATCTTTCACAATCCTCCGGATATAAAGGAATAGTAAAGAAACAATCCTT	136232

AL645923.14	451	CAGATCTACCACAATTTTATAATATCCTTTAGGGAAGGCCACCAGAGACA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	136233	CAGATCTACCACAATTTTATAATATCCTTTAGGGAAGGCCACCAGAGACA	136282

AL645923.14	501	GAAGCCCAGGTTGTAAAGTTCCCATAGATTTCATGGTCTCATTAACATTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	136283	GAAGCCCAGGTTGTAAAGTTCCCATAGATTTCATGGTCTCATTAACATTT	136332

AL645923.14	551	CTTAGATCTTGCAGCAATCTCCATTTACCAGATTTTTTCTTGATAACAAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	136333	CTTAGATCTTGCAGCAATCTCCATTTACCAGATTTTTTCTTGATAACAAA	136382

AL645923.14	601	AACTGGAGTATTCCAATGAGACTGAGATTCTACTAAATGTCCTGCCTCTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	136383	AACTGGAGTATTCCAATGAGACTGAGATTCTACTAAATGTCCTGCCTCTA	136432

AL645923.14	651	ATTGCTCCTGCACTAGCGAAGAGGCAGCTTCTATTTTCTCTTTAGGTAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	136433	ATTGCTCCTGCACTAGCGAAGAGGCAGCTTCTATTTTCTCTTTAGGTAAA	136482

AL645923.14	701	GACAACTGAACAACCCACACCAGAATATCATTAAGCCATTGAATTTTATC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	136483	GACAACTGAACAACCCACACCAGAATATCATTAAGCCATTGAATTTTATC	136532

AL645923.14	751	AGCATGGGATGCAGGCAAGATAGTGGCCATTACTGAAAATACCCCAAACC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	136533	AGCATGGGATGCAGGCAAGATAGTGGCCATTACTGAAAATACCCCAAACC	136582

AL645923.14	801	TCTTGTGTTAGAGTGAGGTTTAGGACTTTCAAAAGTCTTAATACATCATC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	136583	TCTTGTGTTAGAGTGAGGTTTAGGACTTTCAAAAGTCTTAATACATCATC	136632

AL645923.14	851	CTTTCTTTCCTAGCCCATGTCCAGGCAAAAATTCTTGTCTGAGCATCTGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	136633	CTTTCTTTCCTAGCCCATGTCCAGGCAAAAATTCTTGTCTGAGCATCTGC	136682

AL645923.14	901	TTGGTCACTGCCTCATCAGGACTGCATATTATAACGCCCATCTGAGACAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	136683	TTGGTCACTGCCTCATCAGGACTGCATATTATAACGCCCATCTGAGACAA	136732

AL645923.14	951	GAGATCTCTTCTCCATAGAATAACGGGCTGAATTTGTCCTGATTTGCCTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	136733	GAGATCTCTTCTCCATAGAATAACGGGCTGAATTTGTCCTGATTTGCCTT	136782

AL645923.14	1001	CCTCATCTCTCCAGGTTAGCAATTTGGAACTTCGTTTTGGGTTATTGGCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	136783	CCTCATCTCTCCAGGTTAGCAATTTGGAACTTCGTTTTGGGTTATTGGCA	136832

AL645923.14	1051	TAACCAATTCCTTGAAGGTGAGTAAGCGTATCAGACAAAGGCCAAGCTGA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	136833	TAACCAATTCCTTGAAGGTGAGTAAGCGTATCAGACAAAGGCCAAGCTGA	136882

AL645923.14	1101	AGGCCAATCTTGTCCTCTAATAATTGTTACATCAGCTCCAGTATCTATTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	136883	AGGCCAATCTTGTCCTCTAATAATTGTTACATCAGCTCCAGTATCTATTA	136932

AL645923.14	1151	ATCCTTCAAAGCTTTTTCCTTCAAATGTCAATTTAAGGTTAGGACTCTGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	136933	ATCCTTCAAAGCTTTTTCCTTCAAATGTCAATTTAAGGTTAGGACTCTGA	136982

AL645923.14	1201	TTAGTTGCCACACACCCTCTAGGTCCCTTGTATGCGTAGAACGGGGTCTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	136983	TTAGTTGCCACACACCCTCTAGGTCCCTTGTATGCGTAGAACGGGGTCTC	137032

AL645923.14	1251	TGGTTGCAGATGGGCAAGGAGTTGACAAATAATAGACAGATCAACACTTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	137033	TGGTTGCAGATGGGCAAGGAGTTGACAAATAATAGACAGATCAACACTTG	137082

AL645923.14	1301	AGATTGTGTAGAATCTGAATGTATGGTCACAAAGTGAACACCTGTCTTAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	137083	AGATTGTGTAGAATCTGAATGTATGGTCACAAAGTGAACACCTGTCTTAT	137132

AL645923.14	1351	ATAATACAGAAAATAAAAGGGGATAGGGTGTCACAGCAGGCAAAGTACAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	137133	ATAATACAGAAAATAAAAGGGGATAGGGTGTCACAGCAGGCAAAGTACAT	137182

AL645923.14	1401	TGAAGTTACCTGACACAAAACAAAGGAATGACTTCAAAGGGACTTACAGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	137183	TGAAGTTACCTGACACAAAACAAAGGAATGACTTCAAAGGGACTTACAGG	137232

AL645923.14	1451	AACCAGGTAAATGTTTACAGTAAAGATAAAGCAGTCCTGCCTAGGGTTAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	137233	AACCAGGTAAATGTTTACAGTAAAGATAAAGCAGTCCTGCCTAGGGTTAG	137282

AL645923.14	1501	CTTAATGACAGGTAAGGATTTCACACCCTAGTCACAATTTGTGCTACTCC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	137283	CTTAATGACAGGTAAGGATTTCACACCCTAGTCACAATTTGTGCTACTCC	137332

AL645923.14	1551	TTTGAGCCTTGTGAAAGCTAGCACCAGGGGGTTCTGCTCTAGCAGACCTC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	137333	TTTGAGCCTTGTGAAAGCTAGCACCAGGGGGTTCTGCTCTAGCAGACCTC	137382

AL645923.14	1601	ATGAATAATGCAATACCACAACCTCCCCTATTTCCTGGGCCCTGATAAAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	137383	ATGAATAATGCAATACCACAACCTCCCCTATTTCCTGGGCCCTGATAAAT	137432

AL645923.14	1651	TCTTGTATAAGTGTAACTTGGCTGTCCTTTTAAGTATCTGTGGAGAATCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	137433	TCTTGTATAAGTGTAACTTGGCTGTCCTTTTAAGTATCTGTGGAGAATCT	137482

AL645923.14	1701	CCATTTGTCAGAAGAATTCACCAACTCTCTTCTAATATGCAATGTAGCCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	137483	CCATTTGTCAGAAGAATTCACCAACTCTCTTCTAATATGCAATGTAGCCT	137532

AL645923.14	1751	GCTATACGTGGCTGTAGTGAAGATTTCTGTCTCAGTGGGATTCCCTAACT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	137533	GCTATACGTGGCTGTAGTGAAGATTTCTGTCTCAGTGGGATTCCCTAACT	137582

AL645923.14	1801	TTTAAGTGGTAAACCCACCTATTAGTTAGGCCATGTGAATTACCTAGTTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	137583	TTTAAGTGGTAAACCCACCTATTAGTTAGGCCATGTGAATTACCTAGTTT	137632

AL645923.14	1851	GGGTGAGAATGGCTACTGTCCTAAGTAATCACTCTGCAGACTAGCCCTGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	137633	GGGTGAGAATGGCTACTGTCCTAAGTAATCACTCTGCAGACTAGCCCTGA	137682

AL645923.14	1901	GCTATTCCGGGTCTGTTCTTTGTAATGCCTAATTAGTTTCACTGTCTCTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	137683	GCTATTCCGGGTCTGTTCTTTGTAATGCCTAATTAGTTTCACTGTCTCTA	137732

AL645923.14	1951	CTAGAAGTAAATTTGAATGTTACTGAATAGATAACCTTCTTACTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645686.10	137733	CTAGAAGTAAATTTGAATGTTACTGAATAGATAACCTTCTTACTGAATTC	137782

Overview

Query
AL645923.14 - 157361 bps
Hit
AL645686.10 - 137782 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link