<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645646.8	1	AAAGGTATGACTCTACAAGCCACAGAAGGTCAACAATTGCTGGCAAGCCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	191459	AAAGGTATGACTCTACAAGCCACAGAAGGTCAACAATTGCTGGCAAGCCA	191508

AL645646.8	51	CTTGTCGCTGGAAAGAGGCATGGAAAGGCAAAGGCCCTCCCTCACGAGTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	191509	CTTGTCGCTGGAAAGAGGCATGGAAAGGCAAAGGCCCTCCCTCACGAGTT	191558

AL645646.8	101	TCAAAAAGAAAGTGGCCTTGACATCTTCCTAGATGTTCTAGTTTTTGCAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	191559	TCAAAAAGAAAGTGGCCTTGACATCTTCCTAGATGTTCTAGTTTTTGCAA	191608

AL645646.8	151	AGGTAGGACAATAAATCTGTGTGTCCTAAGCCACCTAGTTCTCAATGCTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	191609	AGGTAGGACAATAAATCTGTGTGTCCTAAGCCACCTAGTTCTCAATGCTT	191658

AL645646.8	201	GGCTACAGTATTAGGAAATTACGGTGCCATCAGTATTAGAACCAGTGACC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	191659	GGCTACAGTATTAGGAAATTACGGTGCCATCAGTATTAGAACCAGTGACC	191708

AL645646.8	251	CGAGAGCGCACACAGCAGTTCCCCAATCCATACATGTACTTTTCAGTGAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	191709	CGAGAGCGCACACAGCAGTTCCCCAATCCATACATGTACTTTTCAGTGAA	191758

AL645646.8	301	GAAGCTATACAGAGGTATGCAGACAACTCCCATTTGCTTTCTATCTTGAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	191759	GAAGCTATACAGAGGTATGCAGACAACTCCCATTTGCTTTCTATCTTGAA	191808

AL645646.8	351	CTTCACTCTGATCCACACTGATGAGTGATGAGTCTTGGGTCATGCTGGAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	191809	CTTCACTCTGATCCACACTGATGAGTGATGAGTCTTGGGTCATGCTGGAG	191858

AL645646.8	401	CAGACATGCATTTTCCAGGTGGGTGTCAGAACTTACCAGGTCCCTAGGGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	191859	CAGACATGCATTTTCCAGGTGGGTGTCAGAACTTACCAGGTCCCTAGGGG	191908

AL645646.8	451	AATCTCTGGGTTAAGACAGGGCTAAGCTAAAATTCCAAGGTCTCAACTAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	191909	AATCTCTGGGTTAAGACAGGGCTAAGCTAAAATTCCAAGGTCTCAACTAA	191958

AL645646.8	501	ACCAGACGAAGCCTCTGACCAAAGCATAAACTACCATTTATTAGGAAAAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	191959	ACCAGACGAAGCCTCTGACCAAAGCATAAACTACCATTTATTAGGAAAAT	192008

AL645646.8	551	CTGAAATGCCTTTCTTCAAGGGACACTAGGGCATAGTGTCAGATCTGGCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	192009	CTGAAATGCCTTTCTTCAAGGGACACTAGGGCATAGTGTCAGATCTGGCT	192058

AL645646.8	601	TATTCCCTCCTGCCCCTAATTACTGGGACTTCATCTCTCTTGCAGGATCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	192059	TATTCCCTCCTGCCCCTAATTACTGGGACTTCATCTCTCTTGCAGGATCA	192108

AL645646.8	651	GTCATGTCCCAGGTTCTAGGGCAACCGAGTCCTTAAAAGATGCTGTGAAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	192109	GTCATGTCCCAGGTTCTAGGGCAACCGAGTCCTTAAAAGATGCTGTGAAG	192158

AL645646.8	701	AAGCTCTGCTTGAAAAGCTGGAGCAGTGGCTGACAAAGGCTCTGGAGCCA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	192159	AAGCTCTGCTTGAAAAGCTGGAGCAGTGGCTGACAAAGGCTCTGGAGCCA	192208

AL645646.8	751	AATGGGCGTGTCATTCTCAAAATCTTGGTTTCCTCCCATGAGAAATGATC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	192209	AATGGGCGTGTCATTCTCAAAATCTTGGTTTCCTCCCATGAGAAATGATC	192258

AL645646.8	801	GTGAGCATAAATCCATCCTTCTTATGGGCTTGTTGGTGGATTTGTCGTCG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	192259	GTGAGCATAAATCCATCCTTCTTATGGGCTTGTTGGTGGATTTGTCGTCG	192308

AL645646.8	851	TAATCTAGCCAAAGCTGGAGCTTGTATCTAAAGTCATGGCTGGTTTCCCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	192309	TAATCTAGCCAAAGCTGGAGCTTGTATCTAAAGTCATGGCTGGTTTCCCA	192358

AL645646.8	901	TGTCTCATGGGCCCGATCTTTCTTTCACTGTGGTTGTAGATCTGGTCCCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	192359	TGTCTCATGGGCCCGATCTTTCTTTCACTGTGGTTGTAGATCTGGTCCCC	192408

AL645646.8	951	ATCTGTTCTCCAGCACTGGAAGCTGGCTTTTTAACTTAAAGCCCAAACCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	192409	ATCTGTTCTCCAGCACTGGAAGCTGGCTTTTTAACTTAAAGCCCAAACCC	192458

AL645646.8	1001	CTTGTCTTGAATACTTACCTAATAGCTTCTCTAGAACAAGGACCCAGATG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	192459	CTTGTCTTGAATACTTACCTAATAGCTTCTCTAGAACAAGGACCCAGATG	192508

AL645646.8	1051	AGGCTTTTGGTGCCTCCTCCCCTATTGTCAGGGAGGAATCTGTGTCTGTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	192509	AGGCTTTTGGTGCCTCCTCCCCTATTGTCAGGGAGGAATCTGTGTCTGTG	192558

AL645646.8	1101	GCCTCACTTTCTTCCCAAAGATATACTTGATGCTATTTAGCTGTCGGTAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	192559	GCCTCACTTTCTTCCCAAAGATATACTTGATGCTATTTAGCTGTCGGTAT	192608

AL645646.8	1151	GTACAAAAGTTTGAACTCTCCACTCTCGGGTCCACCTTTTCAAGGTGTCC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	192609	GTACAAAAGTTTGAACTCTCCACTCTCGGGTCCACCTTTTCAAGGTGTCC	192658

AL645646.8	1201	TTTCTTTCCCCCTCTCTTCCTCTTCCCCCTTCTCTCCTTTCCATGGTATA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	192659	TTTCTTTCCCCCTCTCTTCCTCTTCCCCCTTCTCTCCTTTCCATGGTATA	192708

AL645646.8	1251	TGCACGTCCATGTGTGTGCTCATGCACGTGTGGTACACAAGCTAGAGGCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	192709	TGCACGTCCATGTGTGTGCTCATGCACGTGTGGTACACAAGCTAGAGGCC	192758

AL645646.8	1301	AGTGTCAATCCTCTTCCCCCATCACACTTCGCTTTTTTTTTTTTTAATCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	192759	AGTGTCAATCCTCTTCCCCCATCACACTTCGCTTTTTTTTTTTTTAATCC	192808

AL645646.8	1351	ACAGACTCTTCCACTAAGACTGAAGTTCACTGATTCAGCAAGACGAGCTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	192809	ACAGACTCTTCCACTAAGACTGAAGTTCACTGATTCAGCAAGACGAGCTA	192858

AL645646.8	1401	TCCACAAACTACAAACTCTAAGGTTTCTCTCTATTCAACTCCTCAGTGCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	192859	TCCACAAACTACAAACTCTAAGGTTTCTCTCTATTCAACTCCTCAGTGCT	192908

AL645646.8	1451	AGGATTACAAGTGTGTACCTATAGGTTGGGGGTTTTTACCTGCTTAGTGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	192909	AGGATTACAAGTGTGTACCTATAGGTTGGGGGTTTTTACCTGCTTAGTGA	192958

AL645646.8	1501	GTCTCTAAACTTGGGTCTTCACGTCTGTGTGGCCAACACTTTACCAACTA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	192959	GTCTCTAAACTTGGGTCTTCACGTCTGTGTGGCCAACACTTTACCAACTA	193008

AL645646.8	1551	AGCTGTCTACACAGCCCTTCCTAGCATCACCTTTGACCCTCTGTCTTAAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	193009	AGCTGTCTACACAGCCCTTCCTAGCATCACCTTTGACCCTCTGTCTTAAC	193058

AL645646.8	1601	TTCTCCAGTGATGACAAGCAGTAGGGGCTGTCACCTGCCGCTACATCAGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	193059	TTCTCCAGTGATGACAAGCAGTAGGGGCTGTCACCTGCCGCTACATCAGA	193108

AL645646.8	1651	TGTGCTTTATATTAGCAGATGAGTTGTCACTGAAAAATATGCTAGGACAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	193109	TGTGCTTTATATTAGCAGATGAGTTGTCACTGAAAAATATGCTAGGACAT	193158

AL645646.8	1701	AATGCAAGCAAGGCTCTGGCATCTCGCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	193159	AATGCAAGCAAGGCTCTGGCATCTCGCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTT	193208

AL645646.8	1751	TTTTTTTGTTCTAGATTTCTGCAAGGAGCTTCTAACAGCGTCCTGTCTCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	193209	TTTTTTTGTTCTAGATTTCTGCAAGGAGCTTCTAACAGCGTCCTGTCTCA	193258

AL645646.8	1801	ACGTCACCAAAGTGGGTGTCCTCATTTTGAACACAAAATTGTCACAACAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	193259	ACGTCACCAAAGTGGGTGTCCTCATTTTGAACACAAAATTGTCACAACAC	193308

AL645646.8	1851	TGAAAACATGTGGGGCTGCACAGGTCCTTTAATAATGTCAAACCTATCAC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	193309	TGAAAACATGTGGGGCTGCACAGGTCCTTTAATAATGTCAAACCTATCAC	193358

AL645646.8	1901	TCATGTGGCGTTCCTACTAGATTCCATAATATGGTCTTATTTTATCTTAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	193359	TCATGTGGCGTTCCTACTAGATTCCATAATATGGTCTTATTTTATCTTAA	193408

AL645646.8	1951	ACAGAGCAGGACAGCAACATTGGGAAGCAAATCTGCCTCTTTTTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL645606.22	193409	ACAGAGCAGGACAGCAACATTGGGAAGCAAATCTGCCTCTTTTTGAATTC	193458

Overview

Query
AL645646.8 - 78438 bps
Hit
AL645606.22 - 193458 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link