<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL606783.13	1	GAATTCTCAACTGAGAAAATTCAAATGGCTGAGAAGCACCTCCAGAAATG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	182505	GAATTCTCAACTGAGAAAATTCAAATGGCTGAGAAGCACCTCCAGAAATG	182554

AL606783.13	51	TTCAACATCCTTAGACATCAGGAAATGCAAATTGAAATGGCCCTGAGATT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	182555	TTCAACATCCTTAGACATCAGGAAATGCAAATTGAAATGGCCCTGAGATT	182604

AL606783.13	101	CCACCTCATAACAGACAGAATGGCTAAGATCAAAACACAGGTGACAGCAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	182605	CCACCTCATAACAGACAGAATGGCTAAGATCAAAACACAGGTGACAGCAA	182654

AL606783.13	151	ATGCTGGAGAGGATGTGGAGAAAGGAACACTCCTCCATTGCTGGTGGGAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	182655	ATGCTGGAGAGGATGTGGAGAAAGGAACACTCCTCCATTGCTGGTGGGAT	182704

AL606783.13	201	TGCAAGCTGGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCAGTTCCTCAGAAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	182705	TGCAAGCTGGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCAGTTCCTCAGAAA	182754

AL606783.13	251	ACTGAAAATAGTCCTACCTGAATACCCAACTATACTACTCCTTTGCATAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	182755	ACTGAAAATAGTCCTACCTGAATACCCAACTATACTACTCCTTTGCATAT	182804

AL606783.13	301	GGCCAGAAGATGTTCCAACATGTAATAAGGACACATGCTCCACTATGTTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	182805	GGCCAGAAGATGTTCCAACATGTAATAAGGACACATGCTCCACTATGTTC	182854

AL606783.13	351	ATAGCGGCCTTATATATAATACCCAGAGGCTGGAAACAACTCAGATGTCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	182855	ATAGCGGCCTTATATATAATACCCAGAGGCTGGAAACAACTCAGATGTCC	182904

AL606783.13	401	CTTAACAGATGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATTTACACAATGGAGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	182905	CTTAACAGATGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATTTACACAATGGAGT	182954

AL606783.13	451	GCTACTCAGCTATTAAAAGCAATGACTTCATGAAACTCTTAGGCAAATGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	182955	GCTACTCAGCTATTAAAAGCAATGACTTCATGAAACTCTTAGGCAAATGG	183004

AL606783.13	501	ATGGAACTTGGAAATATCACCCTGAGTGAGGTAACTGAGTCACAAAAGAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	183005	ATGGAACTTGGAAATATCACCCTGAGTGAGGTAACTGAGTCACAAAAGAA	183054

AL606783.13	551	CACATACACAGTATATACTCACTGATAAGTGAATATTAGTAGTCCCATAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	183055	CACATACACAGTATATACTCACTGATAAGTGAATATTAGTAGTCCCATAT	183104

AL606783.13	601	ACAGTCAAAAAACCTGGATACCATTGTGGATGCTGAGAAGTGCTTGCTGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	183105	ACAGTCAAAAAACCTGGATACCATTGTGGATGCTGAGAAGTGCTTGCTGA	183154

AL606783.13	651	CAGAAATCTGACATGGCTGTCTCCTGACAAATATAGAAGTGGATGCCTAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	183155	CAGAAATCTGACATGGCTGTCTCCTGACAAATATAGAAGTGGATGCCTAC	183204

AL606783.13	701	AGCGAACCATTTGACTGAGTGTAGAGTCCCCAGTAGAGGAGTTGGAGAAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	183205	AGCGAACCATTTGACTGAGTGTAGAGTCCCCAGTAGAGGAGTTGGAGAAG	183254

AL606783.13	751	GGACTGGAGGAGCTGAGGGGGTTTGCAGCCCCATGGAGAGAGCAACAGTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	183255	GGACTGGAGGAGCTGAGGGGGTTTGCAGCCCCATGGAGAGAGCAACAGTG	183304

AL606783.13	801	TCAACCAGCCAGACCCCTTGCAGTTTCTGGGGACTGTACCACCAACCAGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	183305	TCAACCAGCCAGACCCCTTGCAGTTTCTGGGGACTGTACCACCAACCAGA	183354

AL606783.13	851	GTGTAAACATGGAGAGACCCATGGCTCTGGACATATATTTCCCAGACGAG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	183355	GTGTAAACATGGAGAGACCCATGGCTCTGGACATATATTTCCCAGACGAG	183404

AL606783.13	901	GGCCTTGTTGGACATCAGTGGGAGGAGAGGTCCTTGAGACTGAGGGTGTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	183405	GGCCTTGTTGGACATCAGTGGGAGGAGAGGTCCTTGAGACTGAGGGTGTT	183454

AL606783.13	951	GGATGCCCCAGAGTAGGGGAATGCCAGGGCAGGAAGATTGGAGTGGGTAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	183455	GGATGCCCCAGAGTAGGGGAATGCCAGGGCAGGAAGATTGGAGTGGGTAG	183504

AL606783.13	1001	CTGAGTGAGTGAGCACCCCCATAGAGGCAGGAGGAGGGGTGATGGGATAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	183505	CTGAGTGAGTGAGCACCCCCATAGAGGCAGGAGGAGGGGTGATGGGATAT	183554

AL606783.13	1051	GGGGCTTCGGAAGGGGATACCTGGAAAGGGAAAAACATTTGAAATGTAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	183555	GGGGCTTCGGAAGGGGATACCTGGAAAGGGAAAAACATTTGAAATGTAAA	183604

AL606783.13	1101	TAAAGAAAATATCCAATTAAACAAAAAGGTTTGTGCCACAATTGGACTTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	183605	TAAAGAAAATATCCAATTAAACAAAAAGGTTTGTGCCACAATTGGACTTG	183654

AL606783.13	1151	TGATTAAATCTTGCTTGACTTCATATTGAATTATCTTTGGCTAAACAGGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	183655	TGATTAAATCTTGCTTGACTTCATATTGAATTATCTTTGGCTAAACAGGT	183704

AL606783.13	1201	TTACCCTGATGCTTCAAACCATTTACTAATATATTGGTATCTAGAACAAT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	183705	TTACCCTGATGCTTCAAACCATTTACTAATATATTGGTATCTAGAACAAT	183754

AL606783.13	1251	AAAACTGATTAGTACTATAGAAAATTATAATTAGTCCCAGCATGAATTCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	183755	AAAACTGATTAGTACTATAGAAAATTATAATTAGTCCCAGCATGAATTCT	183804

AL606783.13	1301	CCATATCATGTAGAATGAAAATTATATATCTTCTAAATAAACTCTTACAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	183805	CCATATCATGTAGAATGAAAATTATATATCTTCTAAATAAACTCTTACAT	183854

AL606783.13	1351	TTTATTTATGGTGTGCATCAGTAATGAAAATAAGTGTATAGAATGAGGCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	183855	TTTATTTATGGTGTGCATCAGTAATGAAAATAAGTGTATAGAATGAGGCA	183904

AL606783.13	1401	ATATCTAATCAAGCTGGCCTAAGACTTTTTCAAAACTCTCATAGGTTTTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	183905	ATATCTAATCAAGCTGGCCTAAGACTTTTTCAAAACTCTCATAGGTTTTA	183954

AL606783.13	1451	GTGTTGTCTATTTTAACTACCTACTTTCAAGTTTACAACAGATATAATTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	183955	GTGTTGTCTATTTTAACTACCTACTTTCAAGTTTACAACAGATATAATTA	184004

AL606783.13	1501	CAATTTCTTTAGCTGCTTTTCCAAGCATGTAAGACAGTAAATGTTTGCAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	184005	CAATTTCTTTAGCTGCTTTTCCAAGCATGTAAGACAGTAAATGTTTGCAT	184054

AL606783.13	1551	TATAAGTGAATTCCAAATTCCACACAGTGTACCTGAAAATTTGGAGGCCC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	184055	TATAAGTGAATTCCAAATTCCACACAGTGTACCTGAAAATTTGGAGGCCC	184104

AL606783.13	1601	TGCTGTTGCTGCCTCAAAAGATATTTATGCTGGTTTTGTTTGTGAGGTAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	184105	TGCTGTTGCTGCCTCAAAAGATATTTATGCTGGTTTTGTTTGTGAGGTAT	184154

AL606783.13	1651	TAAGGAATTCAACACAAAAGAAAATTAAAGGATCAGGTTCTAATAAAGCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	184155	TAAGGAATTCAACACAAAAGAAAATTAAAGGATCAGGTTCTAATAAAGCA	184204

AL606783.13	1701	TGCAAATACCTTAATGCTTGTTCTACTTCTTTCATAGAGCAAGCAAATTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	184205	TGCAAATACCTTAATGCTTGTTCTACTTCTTTCATAGAGCAAGCAAATTT	184254

AL606783.13	1751	GGGTGCAGCAAGGGAGATAGGAGACACATTCTTTCATACCTCTTCTTAAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	184255	GGGTGCAGCAAGGGAGATAGGAGACACATTCTTTCATACCTCTTCTTAAT	184304

AL606783.13	1801	AAAATAAAGTAGTTAGTATTCCTTATCAACGTGAAGTGATAAAAAAAAAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	184305	AAAATAAAGTAGTTAGTATTCCTTATCAACGTGAAGTGATAAAAAAAAAT	184354

AL606783.13	1851	GGGACCAGTCTTCTTAATCTTGCCACAGAAATTGGCAGCACAGTACCCAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	184355	GGGACCAGTCTTCTTAATCTTGCCACAGAAATTGGCAGCACAGTACCCAG	184404

AL606783.13	1901	TGCACTGAATTTTCAGGCATGAAATTTACAGGATATATTAAACTTGCCTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	184405	TGCACTGAATTTTCAGGCATGAAATTTACAGGATATATTAAACTTGCCTC	184454

AL606783.13	1951	AAAGTTGAGAATGAGCAATGTATTGCAGAGTCAGAATCTCTGAAAGGAGA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL627326.16	184455	AAAGTTGAGAATGAGCAATGTATTGCAGAGTCAGAATCTCTGAAAGGAGA	184504

Overview

Query
AL606783.13 - 127451 bps
Hit
AL627326.16 - 184504 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link