<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL731562.10	1	AATTTTGACTGTAGTGGGATTCTTCACCAAAAATTCCCAGGCATTTGAAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	189716	AATTTTGACTGTAGTGGGATTCTTCACCAAAAATTCCCAGGCATTTGAAT	189765

AL731562.10	51	CTGTATTGTATTCACATGAGATGAATGACAGCTTTGGAATTGTATTGGAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	189766	CTGTATTGTATTCACATGAGATGAATGACAGCTTTGGAATTGTATTGGAG	189815

AL731562.10	101	ACAAAAATTAAGAGATTCTTGTTTTTGTTTTTATTTCTAGTGTATGCAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	189816	ACAAAAATTAAGAGATTCTTGTTTTTGTTTTTATTTCTAGTGTATGCAAA	189865

AL731562.10	151	TACAACTGGGAGTGTCACATCTAGAAACCATATTGTTTAGAATGTTAGTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	189866	TACAACTGGGAGTGTCACATCTAGAAACCATATTGTTTAGAATGTTAGTT	189915

AL731562.10	201	TTGGATGAAGAAACTCAAGATGCAGTACGATCTGCTACCAAACAGTGAAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	189916	TTGGATGAAGAAACTCAAGATGCAGTACGATCTGCTACCAAACAGTGAAA	189965

AL731562.10	251	AAGAAAAAAGAAGATAGCCAAGCTCTTGTTCACTGATCTCAACATTCATT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	189966	AAGAAAAAAGAAGATAGCCAAGCTCTTGTTCACTGATCTCAACATTCATT	190015

AL731562.10	301	TTTGTATTTGGCTTAAGGAGTAATATGGAGGAATATATTTTATGTAGACA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	190016	TTTGTATTTGGCTTAAGGAGTAATATGGAGGAATATATTTTATGTAGACA	190065

AL731562.10	351	TATATACACATATAAATATATACATATATATCCTATATATGCATATTATT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	190066	TATATACACATATAAATATATACATATATATCCTATATATGCATATTATT	190115

AL731562.10	401	AATATATTAATATATAGGTTATGGAAAAACATAACTTCTCTATAGCCTTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	190116	AATATATTAATATATAGGTTATGGAAAAACATAACTTCTCTATAGCCTTT	190165

AL731562.10	451	CTCCTCACTATGAAGGCAGAAACAGCAAATATAGTTTCCACTGAAGACTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	190166	CTCCTCACTATGAAGGCAGAAACAGCAAATATAGTTTCCACTGAAGACTT	190215

AL731562.10	501	ACCAGCCTTCCTGCTTCCATTTGTGCAAAGTACTTATATCACTGTCTAAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	190216	ACCAGCCTTCCTGCTTCCATTTGTGCAAAGTACTTATATCACTGTCTAAT	190265

AL731562.10	551	AATAACTTTTTGTTTTCTTTCTCACAAGGAGAGAGGAAGAATTAATGTTA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	190266	AATAACTTTTTGTTTTCTTTCTCACAAGGAGAGAGGAAGAATTAATGTTA	190315

AL731562.10	601	TGAATTTTGTAAGCCCTTCCAAATCCCTAGAGGTATGCAACATAAATATC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	190316	TGAATTTTGTAAGCCCTTCCAAATCCCTAGAGGTATGCAACATAAATATC	190365

AL731562.10	651	TTATGACCACATGCATAATTCCTTCAACTTACTTGTTGCTCCTGGGTGGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	190366	TTATGACCACATGCATAATTCCTTCAACTTACTTGTTGCTCCTGGGTGGG	190415

AL731562.10	701	AAAGGAAGATGTGTTCACTCATCCAGCAAACTCAGTAATATTACTTTTAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	190416	AAAGGAAGATGTGTTCACTCATCCAGCAAACTCAGTAATATTACTTTTAA	190465

AL731562.10	751	TAAATGAATCTCTTAATATTTGGTTTTCCAAAAAGACAGTTAAAACAAAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	190466	TAAATGAATCTCTTAATATTTGGTTTTCCAAAAAGACAGTTAAAACAAAG	190515

AL731562.10	801	AACTACTTTACATAATGTATTAGTGTTCTACTGCTGTGATGAGACATCAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	190516	AACTACTTTACATAATGTATTAGTGTTCTACTGCTGTGATGAGACATCAA	190565

AL731562.10	851	GACACCACAAGTATGGCAACCCGTGTAAAACAAAGCATTTAACTGGGGCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	190566	GACACCACAAGTATGGCAACCCGTGTAAAACAAAGCATTTAACTGGGGCT	190615

AL731562.10	901	TGCTTACAGTTGCAGAGGCTTAGAACATTATTATCACAGGATGAGTATGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	190616	TGCTTACAGTTGCAGAGGCTTAGAACATTATTATCACAGGATGAGTATGG	190665

AL731562.10	951	CAGCACACAGAACAGTGTGGGAAAGGAAGCTGAGAGTTCTGCATATAGAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	190666	CAGCACACAGAACAGTGTGGGAAAGGAAGCTGAGAGTTCTGCATATAGAT	190715

AL731562.10	1001	TGGCAGGTAGCAGGGAAAGAAAGAGACATTGATCCTGGCTTAAACATTGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	190716	TGGCAGGTAGCAGGGAAAGAAAGAGACATTGATCCTGGCTTAAACATTGA	190765

AL731562.10	1051	AAGCCTCAAAGGCCTCCCTCGATTACACTCTTCCTCTAAAAAGGTTGTGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	190766	AAGCCTCAAAGGCCTCCCTCGATTACACTCTTCCTCTAAAAAGGTTGTGT	190815

AL731562.10	1101	GTCCTAATCTTTTCAAATTATCATACTCTATGAGCTTACCACACATGATA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	190816	GTCCTAATCTTTTCAAATTATCATACTCTATGAGCTTACCACACATGATA	190865

AL731562.10	1151	ACTGTATTTATTACTGTATAAGTCCATACATCGTAGTAGACTTCAGTCTC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	190866	ACTGTATTTATTACTGTATAAGTCCATACATCGTAGTAGACTTCAGTCTC	190915

AL731562.10	1201	ACATAGAACCTTCAATCACTGTAACTCAATGCTGTATATCATTGTTACCA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	190916	ACATAGAACCTTCAATCACTGTAACTCAATGCTGTATATCATTGTTACCA	190965

AL731562.10	1251	TTTGTTCAAGGATGGTGGCTATCTACCATTGTGGCTTCTCCCATTTCTTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	190966	TTTGTTCAAGGATGGTGGCTATCTACCATTGTGGCTTCTCCCATTTCTTT	191015

AL731562.10	1301	TGAGATTGCACAAAAGATCTATATACATAAAAAGAAAAAGACATTTAATT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	191016	TGAGATTGCACAAAAGATCTATATACATAAAAAGAAAAAGACATTTAATT	191065

AL731562.10	1351	TTTTTGTACTTATTTATTGATCATGTGTGTGTGAGAGAAAGGTGAAAGCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	191066	TTTTTGTACTTATTTATTGATCATGTGTGTGTGAGAGAAAGGTGAAAGCT	191115

AL731562.10	1401	TATGCCACTGTGTATATGCAAAGGTCAGAGGACAACTTGCAAGAGTCAGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	191116	TATGCCACTGTGTATATGCAAAGGTCAGAGGACAACTTGCAAGAGTCAGT	191165

AL731562.10	1451	TCTCTCCTTACATGATTTGGGTCACAAATCATACTCAAGGTATCAGTCTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	191166	TCTCTCCTTACATGATTTGGGTCACAAATCATACTCAAGGTATCAGTCTT	191215

AL731562.10	1501	GGCAGTAAATGCATTTTCTGGTTCTGAAAATACAATCTTTTAAAGAAATA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	191216	GGCAGTAAATGCATTTTCTGGTTCTGAAAATACAATCTTTTAAAGAAATA	191265

AL731562.10	1551	TCTTGAGAAAAGGTCTCCTGTAGGCCAAGAGACCCTCAGTTTCACTGAGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	191266	TCTTGAGAAAAGGTCTCCTGTAGGCCAAGAGACCCTCAGTTTCACTGAGT	191315

AL731562.10	1601	AGCTGATGATATCCTCGACCATCTGATCCTCCTGTTTCTACCTGTCTATC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	191316	AGCTGATGATATCCTCGACCATCTGATCCTCCTGTTTCTACCTGTCTATC	191365

AL731562.10	1651	ACCTGGATTACAGATGTGAGCCACATGATCCAAAACACAATAGTGTCATT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	191366	ACCTGGATTACAGATGTGAGCCACATGATCCAAAACACAATAGTGTCATT	191415

AL731562.10	1701	AAACCCAGTGCTCGATGCATGATGATCAAGCATGCTACCAACTGCGTGTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	191416	AAACCCAGTGCTCGATGCATGATGATCAAGCATGCTACCAACTGCGTGTC	191465

AL731562.10	1751	TTAATTTCTTCTCTTGTTGCTATGATAAAATACCCTCATTACAAAACCAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	191466	TTAATTTCTTCTCTTGTTGCTATGATAAAATACCCTCATTACAAAACCAA	191515

AL731562.10	1801	TTTAAGGGAGAAAGACTCTACTGTAGTCAATAGTTCATGCCAAAATAAAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	191516	TTTAAGGGAGAAAGACTCTACTGTAGTCAATAGTTCATGCCAAAATAAAT	191565

AL731562.10	1851	GAAGGTGGGAAGTCAAGGCACTGTACAGCTGGGTCATAAAATGCACACAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	191566	GAAGGTGGGAAGTCAAGGCACTGTACAGCTGGGTCATAAAATGCACACAG	191615

AL731562.10	1901	TCCAAGGTACAGAGACACAAAGTTATGTGCTATGCTTACTTTCTTCATCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	191616	TCCAAGGTACAGAGACACAAAGTTATGTGCTATGCTTACTTTCTTCATCT	191665

AL731562.10	1951	TATATTCCCCAGTGAGTGAACAATCCCTGCCATGAGTAAGATAAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL611951.11	191666	TATATTCCCCAGTGAGTGAACAATCCCTGCCATGAGTAAGATAAGAATTC	191715

Overview

Query
AL731562.10 - 81954 bps
Hit
AL611951.11 - 191715 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link