<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL590614.8	1	GAATTCAGCCTACCTTGTCTCTCAGTCGGTCGTCTTCTGAGAGAGTTCTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	1995	GAATTCAGCCTACCTTGTCTCTCAGTCGGTCGTCTTCTGAGAGAGTTCTT	2044

AL590614.8	51	AGCACCCACGTGAACCCTCAGCTGGAAAGCTTGAAGAATATGCCTGCCCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	2045	AGCACCCACGTGAACCCTCAGCTGGAAAGCTTGAAGAATATGCCTGCCCC	2094

AL590614.8	101	ACTCGGGTGCTCACAGTTAGAGCACATCCAAGGCATCTCTTCAGACTCAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	2095	ACTCGGGTGCTCACAGTTAGAGCACATCCAAGGCATCTCTTCAGACTCAA	2144

AL590614.8	151	ATCCCTCAATTGCTTCCACCCAGGCGTCTCCAAGCTCTCCCACAACACCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	2145	ATCCCTCAATTGCTTCCACCCAGGCGTCTCCAAGCTCTCCCACAACACCA	2194

AL590614.8	201	GTCACTGATTCCACCTGGCTATCTTCAATCCCTCGGGCTCACAGGTCTGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	2195	GTCACTGATTCCACCTGGCTATCTTCAATCCCTCGGGCTCACAGGTCTGC	2244

AL590614.8	251	TGTGCCCCCACACTCATCTGTCATTAACCCCACAGCACCCACCACACAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	2245	TGTGCCCCCACACTCATCTGTCATTAACCCCACAGCACCCACCACACAAA	2294

AL590614.8	301	GCACTTTGGTTGGGGTGGTGAGTAACCCAATTCTCCATCTTCCTGCATCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	2295	GCACTTTGGTTGGGGTGGTGAGTAACCCAATTCTCCATCTTCCTGCATCT	2344

AL590614.8	351	GTACTTCCCGTGGAGACGTCTTCTCACTTAGCATTAAGACCTATTTGGGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	2345	GTACTTCCCGTGGAGACGTCTTCTCACTTAGCATTAAGACCTATTTGGGG	2394

AL590614.8	401	GCCTGTTCACAGTACTGAGGTTAGAACTGCCTCATACTCCAGAATTTCTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	2395	GCCTGTTCACAGTACTGAGGTTAGAACTGCCTCATACTCCAGAATTTCTG	2444

AL590614.8	451	TCATGGCTGAGGCCTCTTCAAGCTCTTCTCCCTCTACAACTCCAGGTATC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	2445	TCATGGCTGAGGCCTCTTCAAGCTCTTCTCCCTCTACAACTCCAGGTATC	2494

AL590614.8	501	TTAAGGCCCACCTTCAAGCCTATCTTTGGCAGTATAGAACCGCTTCAAAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	2495	TTAAGGCCCACCTTCAAGCCTATCTTTGGCAGTATAGAACCGCTTCAAAC	2544

AL590614.8	551	TATGTCTGAGACAGCTCCTGTGCACACCAGGCAGCCCTCTTCTTCACTGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	2545	TATGTCTGAGACAGCTCCTGTGCACACCAGGCAGCCCTCTTCTTCACTGA	2594

AL590614.8	601	GTTCTGATTCTACCCATCTTTTCCACAGCCTAGCCACCACAGCCCCCTGT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	2595	GTTCTGATTCTACCCATCTTTTCCACAGCCTAGCCACCACAGCCCCCTGT	2644

AL590614.8	651	GTGGTTACGTCTGTCATTCCAGCCAGCAAATCCAAAGACCCTGGTGTGGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	2645	GTGGTTACGTCTGTCATTCCAGCCAGCAAATCCAAAGACCCTGGTGTGGA	2694

AL590614.8	701	TTTGAACATAGTGACCAGCACCACAGGCAACTCTTGCTCTGTCCCTTCTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	2695	TTTGAACATAGTGACCAGCACCACAGGCAACTCTTGCTCTGTCCCTTCTT	2744

AL590614.8	751	GCAGCACTTTCCTGCTTGGAGCTTCCCAGAACTTTCCCTCGGCCACTGAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	2745	GCAGCACTTTCCTGCTTGGAGCTTCCCAGAACTTTCCCTCGGCCACTGAT	2794

AL590614.8	801	TTAATTTTCCCTTCCCAACACCCCACAATTCCCACTGTACACACGGTCAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	2795	TTAATTTTCCCTTCCCAACACCCCACAATTCCCACTGTACACACGGTCAC	2844

AL590614.8	851	TATCTTTAGCCAGGTTCTTACTAGTGCCATCAAGATATCCCCTCTTAGAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	2845	TATCTTTAGCCAGGTTCTTACTAGTGCCATCAAGATATCCCCTCTTAGAA	2894

AL590614.8	901	GCACTGATACACTGAAGGGGGTGAGCAACCCTCTGGCAACTTTGGGCTTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	2895	GCACTGATACACTGAAGGGGGTGAGCAACCCTCTGGCAACTTTGGGCTTA	2944

AL590614.8	951	TCGTCCACAAACCAGCCTCCAGTGACCTCAAGCAACTCCAATGTGACTTC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	2945	TCGTCCACAAACCAGCCTCCAGTGACCTCAAGCAACTCCAATGTGACTTC	2994

AL590614.8	1001	AGCACTCACATCATCTTTGGGGTCAAGCCCAAAGCCACTTTTGCCACCAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	2995	AGCACTCACATCATCTTTGGGGTCAAGCCCAAAGCCACTTTTGCCACCAT	3044

AL590614.8	1051	CCCAAAGAAATACTTCTCAAAGCTCACCTGGGGCCATAGATGGGCTAAAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	3045	CCCAAAGAAATACTTCTCAAAGCTCACCTGGGGCCATAGATGGGCTAAAG	3094

AL590614.8	1101	CAATCTTCTCTCCAGCTAGCTCCTGCCCAAAGCTTCAGTACCTCTTTCCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	3095	CAATCTTCTCTCCAGCTAGCTCCTGCCCAAAGCTTCAGTACCTCTTTCCT	3144

AL590614.8	1151	TTCAGAGAACTCAGGTGTGTCTCCAACCCCATCTGCTCAACTGGTCCTTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	3145	TTCAGAGAACTCAGGTGTGTCTCCAACCCCATCTGCTCAACTGGTCCTTA	3194

AL590614.8	1201	GCAAGACCACACAGCCAGCTTGTGGGCAGTTGACATCGTCAGCTCCCATT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	3195	GCAAGACCACACAGCCAGCTTGTGGGCAGTTGACATCGTCAGCTCCCATT	3244

AL590614.8	1251	ATTCACACTCCTGCCACCAGTCAGACAGGCTTTGGCAGCACTCTGGCTGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	3245	ATTCACACTCCTGCCACCAGTCAGACAGGCTTTGGCAGCACTCTGGCTGG	3294

AL590614.8	1301	GTTTCCATTCGGCAAAGCTAGTTCAACTGCCCTTAGGGTTATCAGGCAGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	3295	GTTTCCATTCGGCAAAGCTAGTTCAACTGCCCTTAGGGTTATCAGGCAGA	3344

AL590614.8	1351	ACCACCAGAGTGTGACCTACAGTTCAGTTTTTGGCAGCACAGCCCCAAGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	3345	ACCACCAGAGTGTGACCTACAGTTCAGTTTTTGGCAGCACAGCCCCAAGA	3394

AL590614.8	1401	CCTTTTGCTTTTGGAGGATTAGTGATGCCTATGGATTGTGGGGAGCCTGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	3395	CCTTTTGCTTTTGGAGGATTAGTGATGCCTATGGATTGTGGGGAGCCTGA	3444

AL590614.8	1451	GGTCATTGTGGCTGCCCCCAAAAGGAGCACTTCTGGCACAAGACAGAGTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	3445	GGTCATTGTGGCTGCCCCCAAAAGGAGCACTTCTGGCACAAGACAGAGTA	3494

AL590614.8	1501	TGACCCCAAGCACCCTAGCTCCCTTTGTGCAATGCTGGAACCAGAGTATG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	3495	TGACCCCAAGCACCCTAGCTCCCTTTGTGCAATGCTGGAACCAGAGTATG	3544

AL590614.8	1551	CAGGGCCCTCCTAACCAGATCACACCTTTGGCTGGCATTCCTGCAAGAAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	3545	CAGGGCCCTCCTAACCAGATCACACCTTTGGCTGGCATTCCTGCAAGAAA	3594

AL590614.8	1601	GATCATGTCTGGGGCCCCCTCCCTGGTCCCCTTTGCTCAGAGTATCCCTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	3595	GATCATGTCTGGGGCCCCCTCCCTGGTCCCCTTTGCTCAGAGTATCCCTG	3644

AL590614.8	1651	TACCTGGAGCAATTAAGGCAGGTAGCAGTCTTGGCTTTGGGATGTCCTCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	3645	TACCTGGAGCAATTAAGGCAGGTAGCAGTCTTGGCTTTGGGATGTCCTCT	3694

AL590614.8	1701	CCCACTGTTCAGGGTTCTGTGGGGAGAAATCCTTTGAGATCATTGGAACC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	3695	CCCACTGTTCAGGGTTCTGTGGGGAGAAATCCTTTGAGATCATTGGAACC	3744

AL590614.8	1751	TTCATTCTGTATTGGTACAAAATCAAAAACACTAAGGAACCGAGAGCCAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	3745	TTCATTCTGTATTGGTACAAAATCAAAAACACTAAGGAACCGAGAGCCAG	3794

AL590614.8	1801	GGCGCTCCCGGAAACATCACACTTACAAGAAATAGCCCACTCTCTCTGTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	3795	GGCGCTCCCGGAAACATCACACTTACAAGAAATAGCCCACTCTCTCTGTC	3844

AL590614.8	1851	ACACTGCAACAGAGTCTTGATCTCTTCCAACTCTCTATAACAAACATACC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	3845	ACACTGCAACAGAGTCTTGATCTCTTCCAACTCTCTATAACAAACATACC	3894

AL590614.8	1901	TAAGACCAAAAAGTGAAAGCTATAGGTGTTCCCTTCATGTGTCATAATCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	3895	TAAGACCAAAAAGTGAAAGCTATAGGTGTTCCCTTCATGTGTCATAATCT	3944

AL590614.8	1951	AAGTCTTCCAAGAAGGTAAACCACCAGTACGTCATCAAGTGCTGGCAAAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606968.9	3945	AAGTCTTCCAAGAAGGTAAACCACCAGTACGTCATCAAGTGCTGGCAAAG	3994

Overview

Query
AL590614.8 - 210845 bps
Hit
AL606968.9 - 3994 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link