<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL606525.7	1	GAATTCAAGATCAGGAAAAGCAACATCATAAAATAAAAATAAATGACAGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	19883	GAATTCAAGATCAGGAAAAGCAACATCATAAAATAAAAATAAATGACAGT	19932

AL606525.7	51	GCGGGGTGAGGTGAATCAATCAAAATATATTTAATAAACACCTTTTCTAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	19933	GCGGGGTGAGGTGAATCAATCAAAATATATTTAATAAACACCTTTTCTAG	19982

AL606525.7	101	GGTTGTTGTTATGGTTAGATTCTCAAAATTAAAAATTATACATATCATTA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	19983	GGTTGTTGTTATGGTTAGATTCTCAAAATTAAAAATTATACATATCATTA	20032

AL606525.7	151	CTGTGAGCATGTATAGGCTTATGTTCAGCGGCACCTGTAGGGACCTTGGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	20033	CTGTGAGCATGTATAGGCTTATGTTCAGCGGCACCTGTAGGGACCTTGGA	20082

AL606525.7	201	GGCCAACTATGTGAAGTCTGTTCTCTCCTACCACCTTTCTGTGGGTTCTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	20083	GGCCAACTATGTGAAGTCTGTTCTCTCCTACCACCTTTCTGTGGGTTCTG	20132

AL606525.7	251	TCATCAGGCTTGTGACATCAGTGTCTTATGTACTAAGCAGTCCTGACAGC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	20133	TCATCAGGCTTGTGACATCAGTGTCTTATGTACTAAGCAGTCCTGACAGC	20182

AL606525.7	301	CCCTAATGTTAAAAGTTTTAAATTAATTTTTAAATCAGGGTTAAAAAAAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	20183	CCCTAATGTTAAAAGTTTTAAATTAATTTTTAAATCAGGGTTAAAAAAAT	20232

AL606525.7	351	CATGTATTTCATTATGACATTTTCGTACATGTTTATCAATATACTGTACT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	20233	CATGTATTTCATTATGACATTTTCGTACATGTTTATCAATATACTGTACT	20282

AL606525.7	401	CATATTTAGCCAAAATTACCTCTCTTGTTCTCTTCCTACCTCTTGTTCAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	20283	CATATTTAGCCAAAATTACCTCTCTTGTTCTCTTCCTACCTCTTGTTCAT	20332

AL606525.7	451	TCTGTTTCCCAAATATCCCCTCCTGTATTATGCTACACACACACACACAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	20333	TCTGTTTCCCAAATATCCCCTCCTGTATTATGCTACACACACACACACAC	20382

AL606525.7	501	ACACACACACACACACACACACACACACACCAGAGTCTACATATAAGTAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	20383	ACACACACACACACACACACACACACACACCAGAGTCTACATATAAGTAA	20432

AL606525.7	551	AAGCACACAATATTTGTGTTTTAGTTTGGCTTACTTTACTTGGTATAATG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	20433	AAGCACACAATATTTGTGTTTTAGTTTGGCTTACTTTACTTGGTATAATG	20482

AL606525.7	601	ATTTCCAATTTGGGGTGGTGTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTTTTGTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	20483	ATTTCCAATTTGGGGTGGTGTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTTTTGTT	20532

AL606525.7	651	TTTTGTTTTTTGTTTTGGAAATGACATAATTTCTCTCTCTGGTATGACTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	20533	TTTTGTTTTTTGTTTTGGAAATGACATAATTTCTCTCTCTGGTATGACTA	20582

AL606525.7	701	AACAGGACCCTGTTGTGGCTGTGTCCCACTTTTCTTTATGTAATCACCTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	20583	AACAGGACCCTGTTGTGGCTGTGTCCCACTTTTCTTTATGTAATCACCTG	20632

AL606525.7	751	CTGATGAACACTTAAGCTGATTCCATACCTACTGTGAGCGATGCAGCTGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	20633	CTGATGAACACTTAAGCTGATTCCATACCTACTGTGAGCGATGCAGCTGT	20682

AL606525.7	801	AATCATGGAGGCTCAGGCATCTGTCTGGTGCGCTGACTTAACTTCCTTAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	20683	AATCATGGAGGCTCAGGCATCTGTCTGGTGCGCTGACTTAACTTCCTTAG	20732

AL606525.7	851	GTAGAGGCCCATGGATCACAAAACTCGACCAGATAGTCGCTCTATTTTTA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	20733	GTAGAGGCCCATGGATCACAAAACTCGACCAGATAGTCGCTCTATTTTTA	20782

AL606525.7	901	GCTTTTCGGAGGAACCTCGTATTGAGTCTACAGTGGTTGGGCTAGTTTTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	20783	GCTTTTCGGAGGAACCTCGTATTGAGTCTACAGTGGTTGGGCTAGTTTTA	20832

AL606525.7	951	CCATCCCACCAGCAATGTCCGAGGGAGGGCCCTGAGGGAGGACCCCTCCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	20833	CCATCCCACCAGCAATGTCCGAGGGAGGGCCCTGAGGGAGGACCCCTCCC	20882

AL606525.7	1001	ACACTTCATCACCAGTGTTTGTCCTTGTCTTTCTGGTGACAGCCATTCTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	20883	ACACTTCATCACCAGTGTTTGTCCTTGTCTTTCTGGTGACAGCCATTCTG	20932

AL606525.7	1051	ACAGGGGCGAGATGGAAAGGAATCTCAAGCAGCCTTAATTCGAGTTATCT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	20933	ACAGGGGCGAGATGGAAAGGAATCTCAAGCAGCCTTAATTCGAGTTATCT	20982

AL606525.7	1101	CCGATGGCTAAGGATATCGAACACTTTTTTTTCCATATATTTACTGGCTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	20983	CCGATGGCTAAGGATATCGAACACTTTTTTTTCCATATATTTACTGGCTG	21032

AL606525.7	1151	TTTATTTTCCTTCTGAAAATCGGCCCTTTAATTGAGGGATTGCTTCACTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	21033	TTTATTTTCCTTCTGAAAATCGGCCCTTTAATTGAGGGATTGCTTCACTG	21082

AL606525.7	1201	TTTAGGTATTTTACATTATTCGGGAGTCTAGATCTTAACTCACCATCAGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	21083	TTTAGGTATTTTACATTATTCGGGAGTCTAGATCTTAACTCACCATCAGA	21132

AL606525.7	1251	TGTACAGCTGTGAAGTGACTCCCTCTCTGCAGGTTCTTTTCGCTTAGCTG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	21133	TGTACAGCTGTGAAGTGACTCCCTCTCTGCAGGTTCTTTTCGCTTAGCTG	21182

AL606525.7	1301	GTTTGTTTCGTTTCTGGATAGAAACGTCTATATTCATGTGACCCTGGTTG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	21183	GTTTGTTTCGTTTCTGGATAGAAACGTCTATATTCATGTGACCCTGGTTG	21232

AL606525.7	1351	TCACTTCTTGCTGTCCTTCCCTGTGCTCTTGGAGTCTTCTTCAGAAAATC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	21233	TCACTTCTTGCTGTCCTTCCCTGTGCTCTTGGAGTCTTCTTCAGAAAATC	21282

AL606525.7	1401	CTTGCTTACATCTGTAACTCTGAGTGCTTTTCCTATGTTTCCTCTAGAAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	21283	CTTGCTTACATCTGTAACTCTGAGTGCTTTTCCTATGTTTCCTCTAGAAG	21332

AL606525.7	1451	TCTCAAACTAAGGTACTGGTTTATTTTGATTTTTTTTTCCCAGAGTGAGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	21333	TCTCAAACTAAGGTACTGGTTTATTTTGATTTTTTTTTCCCAGAGTGAGA	21382

AL606525.7	1501	GAAAAGCGCCTAGCTTCCTTCTTCTGCACGTGGCTAGATTGAGTCAATCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	21383	GAAAAGCGCCTAGCTTCCTTCTTCTGCACGTGGCTAGATTGAGTCAATCT	21432

AL606525.7	1551	TCCCTCTCTGATTTTCATTATTACTTATCTTAATTGGCCTCTTGACACCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	21433	TCCCTCTCTGATTTTCATTATTACTTATCTTAATTGGCCTCTTGACACCT	21482

AL606525.7	1601	TGTAGCCAGGTCTCATCTGTTAGAACTGCCAGCCTCAGGTTTTGACTCCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	21483	TGTAGCCAGGTCTCATCTGTTAGAACTGCCAGCCTCAGGTTTTGACTCCA	21532

AL606525.7	1651	AGTTCTCCGGGATCAATGTGGGAGGAGTCATTGCACAGTGAGGAGGGCTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	21533	AGTTCTCCGGGATCAATGTGGGAGGAGTCATTGCACAGTGAGGAGGGCTG	21582

AL606525.7	1701	CAGGTTTCTTTTCACCAGGACTGGCTGGCTGGTCTGCCTTGTGGCTTAAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	21583	CAGGTTTCTTTTCACCAGGACTGGCTGGCTGGTCTGCCTTGTGGCTTAAG	21632

AL606525.7	1751	TATTTGCTTCCCCGCCATTGCTGGGAACTGCCTGGTGCTTCCTTTCATAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	21633	TATTTGCTTCCCCGCCATTGCTGGGAACTGCCTGGTGCTTCCTTTCATAG	21682

AL606525.7	1801	GGTGGTGCTTCTTTATATTTTCTGACACTTCCCTGATCAGTCTTTGGGTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	21683	GGTGGTGCTTCTTTATATTTTCTGACACTTCCCTGATCAGTCTTTGGGTC	21732

AL606525.7	1851	AGAGTCTATATATGAGCTATAATCCACAGTAGCTGAGTGAGACATGAGTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	21733	AGAGTCTATATATGAGCTATAATCCACAGTAGCTGAGTGAGACATGAGTG	21782

AL606525.7	1901	GCCAAGAACCTCCAACCTCATTATTTTCATGGCGAATTTTTAATACTGTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	21783	GCCAAGAACCTCCAACCTCATTATTTTCATGGCGAATTTTTAATACTGTC	21832

AL606525.7	1951	AAAATCCTCCACTTTGTTTTTTTTTTTCAAAGCAAACAAAAAGAATAAAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606782.10	21833	AAAATCCTCCACTTTGTTTTTTTTTTTCAAAGCAAACAAAAAGAATAAAA	21882

Overview

Query
AL606525.7 - 187348 bps
Hit
AL606782.10 - 21882 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link