<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL606744.30	1	GAATTCTCACCTGAGGAATACCGAATGGCAGAGAAGCACCTGAAAAAATG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	125114	GAATTCTCACCTGAGGAATACCGAATGGCAGAGAAGCACCTGAAAAAATG	125163

AL606744.30	51	TTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	125164	TTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGAT	125213

AL606744.30	101	TCCACCTCACACCAGTGAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	125214	TCCACCTCACACCAGTGAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGC	125263

AL606744.30	151	AGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	125264	AGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTG	125313

AL606744.30	201	GGATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	125314	GGATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCA	125363

AL606744.30	251	GAAAATTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	125364	GAAAATTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGC	125413

AL606744.30	301	ATATATCCAGAAGAAGCCCCAACTGGTAAGAAGGACACATGCTCCACTAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	125414	ATATATCCAGAAGAAGCCCCAACTGGTAAGAAGGACACATGCTCCACTAT	125463

AL606744.30	351	GTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAACTGGAAAGAACCCAGAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	125464	GTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAACTGGAAAGAACCCAGAT	125513

AL606744.30	401	GCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACACAATG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	125514	GCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACACAATG	125563

AL606744.30	451	GAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	125564	GAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAA	125613

AL606744.30	501	ATGGATGGACCTGGAGATCATCATCCAAAGACCACTTTGTAATATATTTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	125614	ATGGATGGACCTGGAGATCATCATCCAAAGACCACTTTGTAATATATTTT	125663

AL606744.30	551	CTAATATAATTAGCTGTTAAATCCTGTCCTTAATTACTATTCATATTCAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	125664	CTAATATAATTAGCTGTTAAATCCTGTCCTTAATTACTATTCATATTCAA	125713

AL606744.30	601	TACATTAGTACACATTGTTTTTTCACAGGAATACTATTAAATGTCACTTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	125714	TACATTAGTACACATTGTTTTTTCACAGGAATACTATTAAATGTCACTTA	125763

AL606744.30	651	CACTTTTAAGGTAAAAGACACTCTGCCATCCCTCACTTTCCACAAGTCTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	125764	CACTTTTAAGGTAAAAGACACTCTGCCATCCCTCACTTTCCACAAGTCTT	125813

AL606744.30	701	GCTGTACACTGCAGGATTTTATTATCAAATTCCCATTGTCTATGTAGGAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	125814	GCTGTACACTGCAGGATTTTATTATCAAATTCCCATTGTCTATGTAGGAA	125863

AL606744.30	751	AAGAAAAGCCCCTCACCATGTGTAGACCCTCCAACCAGTCAGACAGTACA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	125864	AAGAAAAGCCCCTCACCATGTGTAGACCCTCCAACCAGTCAGACAGTACA	125913

AL606744.30	801	CTAGCACAAGCAGGTGAGGATGGTATTTAGCGGTTTATGAGGAAAACCTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	125914	CTAGCACAAGCAGGTGAGGATGGTATTTAGCGGTTTATGAGGAAAACCTG	125963

AL606744.30	851	CACTTGGGCTCAGGAAATGGCATGTTTTTATCTTTTTATTTCACAGAATA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	125964	CACTTGGGCTCAGGAAATGGCATGTTTTTATCTTTTTATTTCACAGAATA	126013

AL606744.30	901	TATCTGTGAATTATTAGCAGTATGAAATTCTAAGTATAGCAGAAGAGAAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	126014	TATCTGTGAATTATTAGCAGTATGAAATTCTAAGTATAGCAGAAGAGAAT	126063

AL606744.30	951	ATAGAGAATACATCTGGTTTTCTTAGGCAGATACTCTTAAATCCAAAACT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	126064	ATAGAGAATACATCTGGTTTTCTTAGGCAGATACTCTTAAATCCAAAACT	126113

AL606744.30	1001	AAGGAGTCATAAAGGAAAAGTTTCAGCTTCCTATGACACAAACTAAATTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	126114	AAGGAGTCATAAAGGAAAAGTTTCAGCTTCCTATGACACAAACTAAATTT	126163

AL606744.30	1051	AAGAGAAAAAAAATGAAAAAAGAGATTGAATAGGAGAAGGTAATTGCAGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	126164	AAGAGAAAAAAAATGAAAAAAGAGATTGAATAGGAGAAGGTAATTGCAGG	126213

AL606744.30	1101	ATACATAACAGGAAAAGAGGATAATGTCCTAAGCAAAGACCTCTGACCAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	126214	ATACATAACAGGAAAAGAGGATAATGTCCTAAGCAAAGACCTCTGACCAA	126263

AL606744.30	1151	AATAGTGAGGCCAATGAAAGGACACAAAAAATAAACAACAAAAGAAACAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	126264	AATAGTGAGGCCAATGAAAGGACACAAAAAATAAACAACAAAAGAAACAA	126313

AL606744.30	1201	AACTCAGTCATTACCTAAGAAAACATACTCAAGTTCAGTAACCTGAGAAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	126314	AACTCAGTCATTACCTAAGAAAACATACTCAAGTTCAGTAACCTGAGAAA	126363

AL606744.30	1251	AGCCAATTCTACCGAGAAATGCAAGATTCGACTACTAACAGGTTCCCAAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	126364	AGCCAATTCTACCGAGAAATGCAAGATTCGACTACTAACAGGTTCCCAAG	126413

AL606744.30	1301	AATATGTTTAGAGTTTTATACACTTATTTATCTGTGCATATAAATGGGCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	126414	AATATGTTTAGAGTTTTATACACTTATTTATCTGTGCATATAAATGGGCA	126463

AL606744.30	1351	TATGCACCACAGCATGTGTATATGGGGCTATTCCCTCTCTGCAGCAAGTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	126464	TATGCACCACAGCATGTGTATATGGGGCTATTCCCTCTCTGCAGCAAGTG	126513

AL606744.30	1401	GGTCCTAAGAATCAAATTCAGAAGCAAGTACCCTTAGCTGCTGAGTCCTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	126514	GGTCCTAAGAATCAAATTCAGAAGCAAGTACCCTTAGCTGCTGAGTCCTT	126563

AL606744.30	1451	TGGACAGTCCAACAAGTGAGTGACACACAGAGAAATAAAGAGAAAATGTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	126564	TGGACAGTCCAACAAGTGAGTGACACACAGAGAAATAAAGAGAAAATGTT	126613

AL606744.30	1501	ATTCCAGCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGTGCTGGGGATTGAACCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	126614	ATTCCAGCCATCCATCCATCCATCCATCCATGGTGCTGGGGATTGAACCT	126663

AL606744.30	1551	AGGGCCTTGTACATGCTGGGTAAGTACTCTACTACTGGGCTATGTCCTCG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	126664	AGGGCCTTGTACATGCTGGGTAAGTACTCTACTACTGGGCTATGTCCTCG	126713

AL606744.30	1601	TCCCTCCTCAAGTATTTTTAAAAGCTTACTATTATTACTATCCAGTGCTG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	126714	TCCCTCCTCAAGTATTTTTAAAAGCTTACTATTATTACTATCCAGTGCTG	126763

AL606744.30	1651	ATAATATAGTTCATATTTGTTGAGAATGGTAGTAGATAGCAAAATTTAAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	126764	ATAATATAGTTCATATTTGTTGAGAATGGTAGTAGATAGCAAAATTTAAT	126813

AL606744.30	1701	ATATGCACCTAGTTCTGGAATGCACCTGTAACAATACCTGAAAAACCAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	126814	ATATGCACCTAGTTCTGGAATGCACCTGTAACAATACCTGAAAAACCAAA	126863

AL606744.30	1751	ATACTGGTGTAAGAAAAAAATCCACTATAAAACTGTTTTCATTTGTAAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	126864	ATACTGGTGTAAGAAAAAAATCCACTATAAAACTGTTTTCATTTGTAAAA	126913

AL606744.30	1801	AGTTAAACACAGCCTGAAATATCTAGGGAAGTCAATAAATAAATAGAGTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	126914	AGTTAAACACAGCCTGAAATATCTAGGGAAGTCAATAAATAAATAGAGTA	126963

AL606744.30	1851	TAAATATAGTACAGTGCAATACATGCCAATGAAAAGGAATCAAATATGTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	126964	TAAATATAGTACAGTGCAATACATGCCAATGAAAAGGAATCAAATATGTC	127013

AL606744.30	1901	TGTAATCTTACACTGAAGGGTATCTATTTCTACCTAGTTAAGTGTGGAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	127014	TGTAATCTTACACTGAAGGGTATCTATTTCTACCTAGTTAAGTGTGGAAA	127063

AL606744.30	1951	GGGAGCAGGCTCAGAACAATATGTAGAGTTTGACATTGCTTAGAATTATA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606757.11	127064	GGGAGCAGGCTCAGAACAATATGTAGAGTTTGACATTGCTTAGAATTATA	127113

Overview

Query
AL606744.30 - 185867 bps
Hit
AL606757.11 - 127113 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link