<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL606757.11	1	TTCCTATATAAACACACATGAGAATTTGCACCAAATCTCAACAGCCAGGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	205367	TTCCTATATAAACACACATGAGAATTTGCACCAAATCTCAACAGCCAGGC	205416

AL606757.11	51	AAAACTCTAGAACTCAAAACTCTTGAAGCTTATACTTAAAGTACTTTTTA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	205417	AAAACTCTAGAACTCAAAACTCTTGAAGCTTATACTTAAAGTACTTTTTA	205466

AL606757.11	101	AAGTGATAGGTAAACAAGATGGAGGCACTTGAATTTAAAAAACAACAACA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	205467	AAGTGATAGGTAAACAAGATGGAGGCACTTGAATTTAAAAAACAACAACA	205516

AL606757.11	151	ACAAAAAAACCCCAACAACAACAAAAAAATGCACATCATTTTTTCCCCCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	205517	ACAAAAAAACCCCAACAACAACAAAAAAATGCACATCATTTTTTCCCCCT	205566

AL606757.11	201	CAGAGAGCTGCACCAATCACCCTTGAGAGGCTGCCAAGACTTTTAATCAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	205567	CAGAGAGCTGCACCAATCACCCTTGAGAGGCTGCCAAGACTTTTAATCAT	205616

AL606757.11	251	TTTTCCTCTGCATTCCAAAATCAGCTGTGAAAGTCTGTCTCACACTAGTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	205617	TTTTCCTCTGCATTCCAAAATCAGCTGTGAAAGTCTGTCTCACACTAGTG	205666

AL606757.11	301	ATGTAACTCCAACTTTGAAAATTAGAAAAGTTTTCAATGTATAGAATCAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	205667	ATGTAACTCCAACTTTGAAAATTAGAAAAGTTTTCAATGTATAGAATCAC	205716

AL606757.11	351	CTCCAAGGGTTTTCCCTAGTGTAAAACCCTGTTCGATATTTAGGAAGTAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	205717	CTCCAAGGGTTTTCCCTAGTGTAAAACCCTGTTCGATATTTAGGAAGTAA	205766

AL606757.11	401	TACTGGGGGCTGGGGGTGGAAGGCACCAGCCTGCCTCATGCTTAAATAAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	205767	TACTGGGGGCTGGGGGTGGAAGGCACCAGCCTGCCTCATGCTTAAATAAC	205816

AL606757.11	451	TATACTTTAATCCAGCCTCTATAGCAAGCCTTTGCACTAAGACTAGCAAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	205817	TATACTTTAATCCAGCCTCTATAGCAAGCCTTTGCACTAAGACTAGCAAT	205866

AL606757.11	501	GCCCTGAAACAGGGTCCCCGTCCAAGAAAGATCAATAGAAGAAAGTGCTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	205867	GCCCTGAAACAGGGTCCCCGTCCAAGAAAGATCAATAGAAGAAAGTGCTC	205916

AL606757.11	551	ACAACGCTGGTTTTGAGTGGTGCCATTTCCCAAGACTGAAGCTATCTATA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	205917	ACAACGCTGGTTTTGAGTGGTGCCATTTCCCAAGACTGAAGCTATCTATA	205966

AL606757.11	601	CTGGGTAAAAAATTCTAGCCCTCCATGAAGGGCTAGTGTCAGAGGTCAGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	205967	CTGGGTAAAAAATTCTAGCCCTCCATGAAGGGCTAGTGTCAGAGGTCAGC	206016

AL606757.11	651	TGGAAGGAGAGCAGACTGTGGGCTTTAGCAAGTCGACTATTAGTGCATTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	206017	TGGAAGGAGAGCAGACTGTGGGCTTTAGCAAGTCGACTATTAGTGCATTA	206066

AL606757.11	701	CCACAAAGCAAAGACAGACACACACACACACACACACACACACACAGAAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	206067	CCACAAAGCAAAGACAGACACACACACACACACACACACACACACAGAAA	206116

AL606757.11	751	AAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	206117	AAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA	206166

AL606757.11	801	GAGAGAGAGATCACTATGACACAAATTCCAAATTAAGTCAGACAGGAGAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	206167	GAGAGAGAGATCACTATGACACAAATTCCAAATTAAGTCAGACAGGAGAG	206216

AL606757.11	851	AAAAGGCACTGGAAAGCCAAAACAATCCATCAAGAACGGAGAATCTTCTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	206217	AAAAGGCACTGGAAAGCCAAAACAATCCATCAAGAACGGAGAATCTTCTC	206266

AL606757.11	901	TACTCAACGCCGCTCACCTGCCAGGCCTAGGTGCAGGCCATGCCTCAAGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	206267	TACTCAACGCCGCTCACCTGCCAGGCCTAGGTGCAGGCCATGCCTCAAGC	206316

AL606757.11	951	CACAGGCAGTCCCAGGAATCTGACTTAGAGGCATGAGGAGTCACATTGAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	206317	CACAGGCAGTCCCAGGAATCTGACTTAGAGGCATGAGGAGTCACATTGAA	206366

AL606757.11	1001	ATGACTGACCGAGGAGCAGCACCTTTCTACCACGGTAAGGCTGAAGGGTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	206367	ATGACTGACCGAGGAGCAGCACCTTTCTACCACGGTAAGGCTGAAGGGTG	206416

AL606757.11	1051	AGCCTGAAGCTCCAAGCCAAACCCCGAGAGTGTGCATCTGCGCGCTCAAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	206417	AGCCTGAAGCTCCAAGCCAAACCCCGAGAGTGTGCATCTGCGCGCTCAAG	206466

AL606757.11	1101	GGTAAAGATGCTGTTTTCAGCCCAGCTGCCCTTGACTGAGAAACAGAACA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	206467	GGTAAAGATGCTGTTTTCAGCCCAGCTGCCCTTGACTGAGAAACAGAACA	206516

AL606757.11	1151	GAGAACCAACTCGGAAAGCAGGTCAGAGTTCTGAAAAAAAGAGCAAAAGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	206517	GAGAACCAACTCGGAAAGCAGGTCAGAGTTCTGAAAAAAAGAGCAAAAGA	206566

AL606757.11	1201	AAAAGACTGCTTCCATTTAGGTTACAGCCTGCGCTTGCCCTTCAGTGCCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	206567	AAAAGACTGCTTCCATTTAGGTTACAGCCTGCGCTTGCCCTTCAGTGCCC	206616

AL606757.11	1251	TCTGCCAAGGCCGGGTTTCACGTTACCCAAGACACACACACACACACACT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	206617	TCTGCCAAGGCCGGGTTTCACGTTACCCAAGACACACACACACACACACT	206666

AL606757.11	1301	ACTAGATTCAGTACAAGGATGTCTGGGGCATATGTGAGCAGCACAAAAGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	206667	ACTAGATTCAGTACAAGGATGTCTGGGGCATATGTGAGCAGCACAAAAGG	206716

AL606757.11	1351	CAGGCTTCAGATAAAGCTTCCTGACATCTGAAGTGCAAGGTTACCTGGCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	206717	CAGGCTTCAGATAAAGCTTCCTGACATCTGAAGTGCAAGGTTACCTGGCC	206766

AL606757.11	1401	TGTTCTGGTCTGGCAGTAGGCTCACACAGAGCAGGTAGGCACAACTCTAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	206767	TGTTCTGGTCTGGCAGTAGGCTCACACAGAGCAGGTAGGCACAACTCTAG	206816

AL606757.11	1451	TGCAGACATCCACAAACCAGGGCTTGAATCTTAAAAATGGAGCTTTGGTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	206817	TGCAGACATCCACAAACCAGGGCTTGAATCTTAAAAATGGAGCTTTGGTC	206866

AL606757.11	1501	AACGCCACTTTTCACTATAATGGTTCTAGAACACACATCAGCTCTCTAAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	206867	AACGCCACTTTTCACTATAATGGTTCTAGAACACACATCAGCTCTCTAAC	206916

AL606757.11	1551	CACAAAACAGCGGGGCAGACTAAAAGGGACCGATCAAGGTGGGGCCGTCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	206917	CACAAAACAGCGGGGCAGACTAAAAGGGACCGATCAAGGTGGGGCCGTCA	206966

AL606757.11	1601	TCCAGTGGTGGTTTACAACTCCTGTGTCTCCTCTCTCCATCCTCAGAAGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	206967	TCCAGTGGTGGTTTACAACTCCTGTGTCTCCTCTCTCCATCCTCAGAAGA	207016

AL606757.11	1651	CAATTATGGCCAGACTGGAAAAATGTATGTATATAAAGCAGTAAGAACTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	207017	CAATTATGGCCAGACTGGAAAAATGTATGTATATAAAGCAGTAAGAACTC	207066

AL606757.11	1701	CAAGATGATGCCAGAAATTTTCCAGTGTCTTACTTGTCCCCAAGCCTTGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	207067	CAAGATGATGCCAGAAATTTTCCAGTGTCTTACTTGTCCCCAAGCCTTGT	207116

AL606757.11	1751	CACAGCTGAAGCAGTCCTGCTTTCCGCTTCTATTAGCAAGTGCTTACATT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	207117	CACAGCTGAAGCAGTCCTGCTTTCCGCTTCTATTAGCAAGTGCTTACATT	207166

AL606757.11	1801	CAGGGAGGCTCCAACACACTTCAAAAGCTTTGATTGGGCAAACCTAGTTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	207167	CAGGGAGGCTCCAACACACTTCAAAAGCTTTGATTGGGCAAACCTAGTTC	207216

AL606757.11	1851	TGTGCAAACACATTCTCTTTTGATTACAACTGTAGCCTCTTAAGGTCATG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	207217	TGTGCAAACACATTCTCTTTTGATTACAACTGTAGCCTCTTAAGGTCATG	207266

AL606757.11	1901	GATGACCAGCAGTTTTCAAAGTTGGGTTCGTTTTTCATTACCTTCCTTTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	207267	GATGACCAGCAGTTTTCAAAGTTGGGTTCGTTTTTCATTACCTTCCTTTT	207316

AL606757.11	1951	AACCCTGAAACAGCTCAGGTCTCCTCACAAAACCCAAAGCCAATGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606750.13	207317	AACCCTGAAACAGCTCAGGTCTCCTCACAAAACCCAAAGCCAATGAATTC	207366

Overview

Query
AL606757.11 - 127113 bps
Hit
AL606750.13 - 207366 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link