<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL606511.8	1	GCAGTAACCTGAGGCCCCTGCAGGCACTCACCCCACCAGAGGAGCCTGGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	146067	GCAGTAACCTGAGGCCCCTGCAGGCACTCACCCCACCAGAGGAGCCTGGA	146116

AL606511.8	51	GGCTGCCTATTTATTTATTTATTTATTTTCATGGCTCTTCAGGGGATTCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	146117	GGCTGCCTATTTATTTATTTATTTATTTTCATGGCTCTTCAGGGGATTCA	146166

AL606511.8	101	GCTAAGAACTGACAATGGTGACAAGTGTCACTAATCCACATTGCTGACTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	146167	GCTAAGAACTGACAATGGTGACAAGTGTCACTAATCCACATTGCTGACTG	146216

AL606511.8	151	AGCACAGGGCCTGAAGCCGGGTCTTAAGAACAAGAGCGAAAAGCTAGCTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	146217	AGCACAGGGCCTGAAGCCGGGTCTTAAGAACAAGAGCGAAAAGCTAGCTG	146266

AL606511.8	201	GAGCTCACTCTTTTCTGCTGAGCCACACCATCTGAAAGTCACCGTGAAGT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	146267	GAGCTCACTCTTTTCTGCTGAGCCACACCATCTGAAAGTCACCGTGAAGT	146316

AL606511.8	251	GGTTTTCTAATATCTATTTTCCCTTGCACAGTCTGGCATGTAAGTCTCCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	146317	GGTTTTCTAATATCTATTTTCCCTTGCACAGTCTGGCATGTAAGTCTCCT	146366

AL606511.8	301	TCCTGAATACAGGGTTCCAGTGGTTCACATCTGCCACGCCCCTGCTAGGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	146367	TCCTGAATACAGGGTTCCAGTGGTTCACATCTGCCACGCCCCTGCTAGGA	146416

AL606511.8	351	AGCACGCGGTATCAACACTTTAAAGAGAAAAGGGTGATGTGCCAGAATTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	146417	AGCACGCGGTATCAACACTTTAAAGAGAAAAGGGTGATGTGCCAGAATTC	146466

AL606511.8	401	CTTGTTTTTTTCAGGGGCCTGGGAACAGAACCCAGGGCCTCTAGCACGCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	146467	CTTGTTTTTTTCAGGGGCCTGGGAACAGAACCCAGGGCCTCTAGCACGCT	146516

AL606511.8	451	AGCTAAGTGCACTGCTCCACTTTCACCCTGAGCCTTAGGATTCTTAAAGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	146517	AGCTAAGTGCACTGCTCCACTTTCACCCTGAGCCTTAGGATTCTTAAAGA	146566

AL606511.8	501	AAATATTTGAAAGCATCTGCTTGCTCCTCCCATGCAAAGTCAGGGGAAAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	146567	AAATATTTGAAAGCATCTGCTTGCTCCTCCCATGCAAAGTCAGGGGAAAA	146616

AL606511.8	551	TAAACAAGGCTGTAGCAGAAGAGCCTACAAAAATACAAACTTATTTGAAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	146617	TAAACAAGGCTGTAGCAGAAGAGCCTACAAAAATACAAACTTATTTGAAA	146666

AL606511.8	601	ATATGCATCACTTAAAAATGATTCATACAGGATTCATTTACAGTAGGATT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	146667	ATATGCATCACTTAAAAATGATTCATACAGGATTCATTTACAGTAGGATT	146716

AL606511.8	651	TCGATGTTTTTGTCTGGTCGGGGGAGAAGGGGGAAGGAACAAGGTCTTTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	146717	TCGATGTTTTTGTCTGGTCGGGGGAGAAGGGGGAAGGAACAAGGTCTTTT	146766

AL606511.8	701	GTTGTTCTGGAAACAGGGTCTCAAGTAGTCCACTATGGCCTTAAAGTCAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	146767	GTTGTTCTGGAAACAGGGTCTCAAGTAGTCCACTATGGCCTTAAAGTCAG	146816

AL606511.8	751	AATCCTTTAGCCTGGCATGTCTCTAAGTGTTTCGATTACACCACACCCTA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	146817	AATCCTTTAGCCTGGCATGTCTCTAAGTGTTTCGATTACACCACACCCTA	146866

AL606511.8	801	CTGACCTTTGCATTTGAGGGGAAACCCCCACCCCAAATCTAACAAAGCAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	146867	CTGACCTTTGCATTTGAGGGGAAACCCCCACCCCAAATCTAACAAAGCAA	146916

AL606511.8	851	GCCTAAGTCATCCCCACCCCCACCCCGTCTTGTAACTATCAAAGGCTTTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	146917	GCCTAAGTCATCCCCACCCCCACCCCGTCTTGTAACTATCAAAGGCTTTC	146966

AL606511.8	901	TTCTCCAAGACCCTAAGATGCTCTATTATCCTCACCATAATAATCAACCA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	146967	TTCTCCAAGACCCTAAGATGCTCTATTATCCTCACCATAATAATCAACCA	147016

AL606511.8	951	TTAAACAAGCATATCAACTCTTTCCCAAAGCTCTTTTAAAAAAGAAAAAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	147017	TTAAACAAGCATATCAACTCTTTCCCAAAGCTCTTTTAAAAAAGAAAAAT	147066

AL606511.8	1001	TTACACCATACTGTTTCAAGGTCTCAGGGAAAAATGATATTAGAACAGTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	147067	TTACACCATACTGTTTCAAGGTCTCAGGGAAAAATGATATTAGAACAGTA	147116

AL606511.8	1051	TTTAGAGAGGGAATTGCTTTTTCAGTTTTTCCCCCCCTTGAATACTTCAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	147117	TTTAGAGAGGGAATTGCTTTTTCAGTTTTTCCCCCCCTTGAATACTTCAT	147166

AL606511.8	1101	CCAAGTATGTAGTGTAAGTTGATCACAGCCAACCCCTAGCAAATGGCTTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	147167	CCAAGTATGTAGTGTAAGTTGATCACAGCCAACCCCTAGCAAATGGCTTT	147216

AL606511.8	1151	TTTACTGTGCAAAAATGCTTGCGGTACTGGCCCTTAAGTCTTCTTTCTGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	147217	TTTACTGTGCAAAAATGCTTGCGGTACTGGCCCTTAAGTCTTCTTTCTGT	147266

AL606511.8	1201	TGTGATCCCAGGATGCAAGCACCTTGCCTCCGATCCTCAGAAAGGATTGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	147267	TGTGATCCCAGGATGCAAGCACCTTGCCTCCGATCCTCAGAAAGGATTGT	147316

AL606511.8	1251	TTCCAAGTGCTGCATGTTAACCCTTTCTCTCCAGGGCGGAAAGACTAGGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	147317	TTCCAAGTGCTGCATGTTAACCCTTTCTCTCCAGGGCGGAAAGACTAGGA	147366

AL606511.8	1301	AACATGGAAAGCACACATTTGTGAAGATGAGCCTTGGGAAGGGAAGATAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	147367	AACATGGAAAGCACACATTTGTGAAGATGAGCCTTGGGAAGGGAAGATAC	147416

AL606511.8	1351	TTCTATTTGCCCATGGAGACCGTTGATCTCTAAAATAAACACCGACTACT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	147417	TTCTATTTGCCCATGGAGACCGTTGATCTCTAAAATAAACACCGACTACT	147466

AL606511.8	1401	GTCCAGCTGCATGCAGGCTTCACTAATGCTGTGTCTGGTGCCTATAAAAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	147467	GTCCAGCTGCATGCAGGCTTCACTAATGCTGTGTCTGGTGCCTATAAAAA	147516

AL606511.8	1451	TCTACACTCTCCTACTTGGCCTGTCATTCCAGTGGTGAGCAGGTAGGCTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	147517	TCTACACTCTCCTACTTGGCCTGTCATTCCAGTGGTGAGCAGGTAGGCTA	147566

AL606511.8	1501	TATTTTACTCACAGTGACGCCCATGTTGGGCGGGGCATAAGATGAACAGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	147567	TATTTTACTCACAGTGACGCCCATGTTGGGCGGGGCATAAGATGAACAGC	147616

AL606511.8	1551	TTAGGGCCATAGTAACTTTGGTAGTTCTGGAAACAGAGTTTCAATCAAGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	147617	TTAGGGCCATAGTAACTTTGGTAGTTCTGGAAACAGAGTTTCAATCAAGT	147666

AL606511.8	1601	AGTCCACTCAGGCCTTAAACTCAGGATCCTTGAGCCTGGCCTGCCTCTCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	147667	AGTCCACTCAGGCCTTAAACTCAGGATCCTTGAGCCTGGCCTGCCTCTCA	147716

AL606511.8	1651	AGTACTTGGATTACACCACACCCTACTGACCTTTGCATTTAAGGGGACTC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	147717	AGTACTTGGATTACACCACACCCTACTGACCTTTGCATTTAAGGGGACTC	147766

AL606511.8	1701	CTCCACCCCACCCCAACAAAGCAAGCCTAAGTTGATTTTGGTTTTCCCAT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	147767	CTCCACCCCACCCCAACAAAGCAAGCCTAAGTTGATTTTGGTTTTCCCAT	147816

AL606511.8	1751	CTTGTAACTATGGAAGGCTTTTCTCCTAGAAGACCTAATAATTTAACAGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	147817	CTTGTAACTATGGAAGGCTTTTCTCCTAGAAGACCTAATAATTTAACAGG	147866

AL606511.8	1801	CTCATTTGTTCTTCTTGGTCTGTGCAAAACAAATCTTGGTGTGTAAAGGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	147867	CTCATTTGTTCTTCTTGGTCTGTGCAAAACAAATCTTGGTGTGTAAAGGG	147916

AL606511.8	1851	GATGGTGGCTTAGAGACACAAAAGCAAAAAATACATTTAAAAAAGTTCAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	147917	GATGGTGGCTTAGAGACACAAAAGCAAAAAATACATTTAAAAAAGTTCAG	147966

AL606511.8	1901	CCTGCCGGCTGGATTGAGAGCAGAGAAGCCTGCCCCTCCCCCCTCTTTGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	147967	CCTGCCGGCTGGATTGAGAGCAGAGAAGCCTGCCCCTCCCCCCTCTTTGC	148016

AL606511.8	1951	AATTTCCAGACAAAGGGTGCCTGCTGATGTACAGTAGACGCAGAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL606528.7	148017	AATTTCCAGACAAAGGGTGCCTGCTGATGTACAGTAGACGCAGAGAATTC	148066

Overview

Query
AL606511.8 - 154685 bps
Hit
AL606528.7 - 148066 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link