<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL591676.10	1	TCTTTAAGAAAGCACGTGCAAAAAAAATGCAAACATATAAATCAGTTTGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	105840	TCTTTAAGAAAGCACGTGCAAAAAAAATGCAAACATATAAATCAGTTTGA	105889

AL591676.10	51	CAACACATAGGCATGCAAATAGCAGAGACTGCAATGCAAATGTGTCAGGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	105890	CAACACATAGGCATGCAAATAGCAGAGACTGCAATGCAAATGTGTCAGGG	105939

AL591676.10	101	GACCCCAAAAACCTGTTTAGAGTTTAACAGTTCATTTTAGATTAGGTGGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	105940	GACCCCAAAAACCTGTTTAGAGTTTAACAGTTCATTTTAGATTAGGTGGC	105989

AL591676.10	151	CCTATCACCAATTAGACTTAATAAGACACAAGGTGTGTATGGTGTGATTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	105990	CCTATCACCAATTAGACTTAATAAGACACAAGGTGTGTATGGTGTGATTT	106039

AL591676.10	201	GTTGCTATTTTCAGACCAGTGCAACCCTAATTTTCATGTTTTGTGCCACG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	106040	GTTGCTATTTTCAGACCAGTGCAACCCTAATTTTCATGTTTTGTGCCACG	106089

AL591676.10	251	CTGTTTAAATAGCAAATCCATTTGGGCCACATTGTGGACTCGCGTGTGCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	106090	CTGTTTAAATAGCAAATCCATTTGGGCCACATTGTGGACTCGCGTGTGCC	106139

AL591676.10	301	GGTCTGAAAAGGAGATGTGTTAATGCGCATTTTAAGTTCATTTACGACAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	106140	GGTCTGAAAAGGAGATGTGTTAATGCGCATTTTAAGTTCATTTACGACAA	106189

AL591676.10	351	TCTGCATTTGTATAATGTTATTATTATCAGCAGTATTATTTATTATATGC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	106190	TCTGCATTTGTATAATGTTATTATTATCAGCAGTATTATTTATTATATGC	106239

AL591676.10	401	ATATTTATGTTTTAATAAATTTATTTGTTTGCTGGAAAATAGAACTGAAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	106240	ATATTTATGTTTTAATAAATTTATTTGTTTGCTGGAAAATAGAACTGAAT	106289

AL591676.10	451	TTAGAAATAGTTTTGAAACAAATATTTGTGCTTAACAAACTAAATTAAAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	106290	TTAGAAATAGTTTTGAAACAAATATTTGTGCTTAACAAACTAAATTAAAT	106339

AL591676.10	501	ATGTAGGCTAATGCAGTGGTCCACAACCACCGGGCTGCGGACCGGTACCG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	106340	ATGTAGGCTAATGCAGTGGTCCACAACCACCGGGCTGCGGACCGGTACCG	106389

AL591676.10	551	GTCCATGGAACAATTGGTACCGGTTCACATAAGAAATCATAAATTATTTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	106390	GTCCATGGAACAATTGGTACCGGTTCACATAAGAAATCATAAATTATTTC	106439

AL591676.10	601	TGTAGAAAATATTCCCCCCGCGACTTGGTTTCTTCCACTCACCCCGCCAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	106440	TGTAGAAAATATTCCCCCCGCGACTTGGTTTCTTCCACTCACCCCGCCAT	106489

AL591676.10	651	CTCACGTTAAATGGACTATGCCAAAATCCACCACGGAGCGGGAAGAACGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	106490	CTCACGTTAAATGGACTATGCCAAAATCCACCACGGAGCGGGAAGAACGA	106539

AL591676.10	701	TCGCTACAATATCTCAGTGGTGGTTGTTGATAGTTTAAAGTTATAAAACA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	106540	TCGCTACAATATCTCAGTGGTGGTTGTTGATAGTTTAAAGTTATAAAACA	106589

AL591676.10	751	GGTATTATAGAGTCCAAGTCAGCAGAGCATTTAAGGACTGCATATATGTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	106590	GGTATTATAGAGTCCAAGTCAGCAGAGCATTTAAGGACTGCATATATGTG	106639

AL591676.10	801	TGCGTGCATCGCTAAGTAAGTACCTGAAATCATTGCAATTTATCTACATG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	106640	TGCGTGCATCGCTAAGTAAGTACCTGAAATCATTGCAATTTATCTACATG	106689

AL591676.10	851	GAGTTTCACATAATCATACTCATTAGGGCTGTAACATGCCAATGCATACA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	106690	GAGTTTCACATAATCATACTCATTAGGGCTGTAACATGCCAATGCATACA	106739

AL591676.10	901	TTTAATTCGGCTGTACGTTTGTATTATTGTTAATATGTTTGTCAGTTGAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	106740	TTTAATTCGGCTGTACGTTTGTATTATTGTTAATATGTTTGTCAGTTGAG	106789

AL591676.10	951	ATGTTTGACACAGATGTTATGTATTTGATGCAAATAAACCTTGTTTGAAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	106790	ATGTTTGACACAGATGTTATGTATTTGATGCAAATAAACCTTGTTTGAAA	106839

AL591676.10	1001	CACAATCAGACCGTGATAGTGCAACTAGCGCATGCGCACTGAGTTGTTCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	106840	CACAATCAGACCGTGATAGTGCAACTAGCGCATGCGCACTGAGTTGTTCA	106889

AL591676.10	1051	TGATTAACCTGGATGTACGAGCGCAGCAGCTGTGTTCACGTGAAGACACT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	106890	TGATTAACCTGGATGTACGAGCGCAGCAGCTGTGTTCACGTGAAGACACT	106939

AL591676.10	1101	TACCATTGTGTGACGCAGCTGACTCTATGGGAAATGAGAATCTGATTGGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	106940	TACCATTGTGTGACGCAGCTGACTCTATGGGAAATGAGAATCTGATTGGT	106989

AL591676.10	1151	TTAATGCACGTTATACTCAAAACACACCCAAAACTCATTAAGAGAATAAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	106990	TTAATGCACGTTATACTCAAAACACACCCAAAACTCATTAAGAGAATAAG	107039

AL591676.10	1201	CACAACCCTGTTAGACCATGCGCCGGGGCGCAAACCGTATTTTTTCATCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	107040	CACAACCCTGTTAGACCATGCGCCGGGGCGCAAACCGTATTTTTTCATCC	107089

AL591676.10	1251	TTAAAATAGCGAAAGTTAATTCGGACACACCCTTAATGCTTTTGTGCTAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	107090	TTAAAATAGCGAAAGTTAATTCGGACACACCCTTAATGCTTTTGTGCTAT	107139

AL591676.10	1301	GCGCTTTACACTGCGTGCCTAGATTGCTTAAACAGGGCCCTAAAAGATCT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	107140	GCGCTTTACACTGCGTGCCTAGATTGCTTAAACAGGGCCCTAAAAGATCT	107189

AL591676.10	1351	AAAAATATACAAGCAATAAGGAAGCGTTGACCAGGACATTAAAATAACCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	107190	AAAAATATACAAGCAATAAGGAAGCGTTGACCAGGACATTAAAATAACCT	107239

AL591676.10	1401	AAAACTCACCTGTCAGATCTCAGACAACACCACTGTCACTAAACAAAAAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	107240	AAAACTCACCTGTCAGATCTCAGACAACACCACTGTCACTAAACAAAAAG	107289

AL591676.10	1451	CAGTCGGATTTATCACTTTGTTGGGTCCCTCAACATATTTCCCTTGTGGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	107290	CAGTCGGATTTATCACTTTGTTGGGTCCCTCAACATATTTCCCTTGTGGT	107339

AL591676.10	1501	CTGAATTATTTGTAGTGTATTTCTGTATTTCATGTGTTGTGAAAGTTAGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	107340	CTGAATTATTTGTAGTGTATTTCTGTATTTCATGTGTTGTGAAAGTTAGT	107389

AL591676.10	1551	GTGCGCACGTGGTGTCCAATTGAGGAGGATGTTTGAGCTCTCCTGGCCAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	107390	GTGCGCACGTGGTGTCCAATTGAGGAGGATGTTTGAGCTCTCCTGGCCAT	107439

AL591676.10	1601	CATATTAACGTCTTTATCTGCATATTTAGCAGAGTCACTGATTAGAGGAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	107440	CATATTAACGTCTTTATCTGCATATTTAGCAGAGTCACTGATTAGAGGAA	107489

AL591676.10	1651	TGTAGCATGTGACTTGTCTACACAAAGGCTATAGTGTTGCACATCTTCAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	107490	TGTAGCATGTGACTTGTCTACACAAAGGCTATAGTGTTGCACATCTTCAT	107539

AL591676.10	1701	ATATTATACATGGCCGACTTGTAATCTTATGCCAGCCTCATCTACGCACG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	107540	ATATTATACATGGCCGACTTGTAATCTTATGCCAGCCTCATCTACGCACG	107589

AL591676.10	1751	GACATGGTTCATTTCTATGCCTGCTGACTGCTGTCCGCTCACACGGCCTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	107590	GACATGGTTCATTTCTATGCCTGCTGACTGCTGTCCGCTCACACGGCCTG	107639

AL591676.10	1801	AATGACCTCTCATGTTTTTCTACAAGCGAGTCTGAATACGCCTCTTGAGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	107640	AATGACCTCTCATGTTTTTCTACAAGCGAGTCTGAATACGCCTCTTGAGG	107689

AL591676.10	1851	TCTCTGGAGCGACTAACAAGAGTGTTTCAGCAACATTTTCTCGAATAAGT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	107690	TCTCTGGAGCGACTAACAAGAGTGTTTCAGCAACATTTTCTCGAATAAGT	107739

AL591676.10	1901	GATGTCTGAACTACAAAGCGAGTCGGCCAGCAGATCTCTTTGATTTAACA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	107740	GATGTCTGAACTACAAAGCGAGTCGGCCAGCAGATCTCTTTGATTTAACA	107789

AL591676.10	1951	ATACACAATGGACCAAAACAGACTTTATGAATACAGAGCAGGATATGATC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL591669.5	107790	ATACACAATGGACCAAAACAGACTTTATGAATACAGAGCAGGATATGATC	107839

Overview

Query
AL591676.10 - 31713 bps
Hit
AL591669.5 - 107839 bps
Total alignments
7
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100196820001200011058401078391
210035712216922239122880229501
3805113412111344173964740981
489.059314780988244-180779809241
593.1863882269522782-180837809241
694.35471242213122254194888950111
779.667530389519253-1998911001801
Short-link