<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL732408.4	1	TCCGTGTGACGTGTCAGCTCCTGATTAGCTGCTGTACGACCCGGAATGGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	209777	TCCGTGTGACGTGTCAGCTCCTGATTAGCTGCTGTACGACCCGGAATGGG	209826

AL732408.4	51	CAGTGACTTGGCACAAATTTACTCTTGCACCTGCACACATTACTTGTTTA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	209827	CAGTGACTTGGCACAAATTTACTCTTGCACCTGCACACATTACTTGTTTA	209876

AL732408.4	101	CCAGTTAGGCACAGCGGAGGCTCATGATGGCGATTGCTCACGGCTCTCCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	209877	CCAGTTAGGCACAGCGGAGGCTCATGATGGCGATTGCTCACGGCTCTCCA	209926

AL732408.4	151	CATCTAACCATGAATTGTAGAGGATAAGACAGATGGCAGAATTGTTATGT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	209927	CATCTAACCATGAATTGTAGAGGATAAGACAGATGGCAGAATTGTTATGT	209976

AL732408.4	201	GGATAGAAAAACCTAGCATGGGGATGTATATTGATAAAAATATTGTAACC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	209977	GGATAGAAAAACCTAGCATGGGGATGTATATTGATAAAAATATTGTAACC	210026

AL732408.4	251	TGAAATGCTCTCTGGAAGGTGTTTTAGGTAAACACTAATGTGCCCTATGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	210027	TGAAATGCTCTCTGGAAGGTGTTTTAGGTAAACACTAATGTGCCCTATGA	210076

AL732408.4	301	AAAAGTCAATTGCCACTGAGAGATAATTTAACTTTGTGAGCAGTAAATCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	210077	AAAAGTCAATTGCCACTGAGAGATAATTTAACTTTGTGAGCAGTAAATCC	210126

AL732408.4	351	TTAATATTATCATATTACTGGGTGTTGAGACCATGTCATAATTGGACTAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	210127	TTAATATTATCATATTACTGGGTGTTGAGACCATGTCATAATTGGACTAT	210176

AL732408.4	401	GAGAACTTTAAAGAGTATGGCTTAAGAACTTATTATAGAAACCTGTGAAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	210177	GAGAACTTTAAAGAGTATGGCTTAAGAACTTATTATAGAAACCTGTGAAT	210226

AL732408.4	451	AGTCCATTTAATAAACTATCACTTTTAGTTCAAAATATCCCACAAACTTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	210227	AGTCCATTTAATAAACTATCACTTTTAGTTCAAAATATCCCACAAACTTA	210276

AL732408.4	501	AGCATACTGGAGTCACATGCAAATTTTGTTATTTTACTAGATGGTGGATG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	210277	AGCATACTGGAGTCACATGCAAATTTTGTTATTTTACTAGATGGTGGATG	210326

AL732408.4	551	CCTGTCATTCTTAAGTTATTTCAACATGTCCATTTTATCAGTAGCTTTGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	210327	CCTGTCATTCTTAAGTTATTTCAACATGTCCATTTTATCAGTAGCTTTGT	210376

AL732408.4	601	TGTACTTTTAATTATGATTTTATGCTTTGATCAGCATTACTTTATTATGA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	210377	TGTACTTTTAATTATGATTTTATGCTTTGATCAGCATTACTTTATTATGA	210426

AL732408.4	651	CTCAAAGGTACAAATTGCCTAATATTTCAACCAAACATCTCTCATTTGTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	210427	CTCAAAGGTACAAATTGCCTAATATTTCAACCAAACATCTCTCATTTGTG	210476

AL732408.4	701	ATAGAATGCTTTAAAGTTATCATAACTTTAAGGATGACAAATAAAAGATA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	210477	ATAGAATGCTTTAAAGTTATCATAACTTTAAGGATGACAAATAAAAGATA	210526

AL732408.4	751	GTGACAAATTTTCTTTTCACACTTTAATCTAGTATGTCTCTTTTGGTTTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	210527	GTGACAAATTTTCTTTTCACACTTTAATCTAGTATGTCTCTTTTGGTTTC	210576

AL732408.4	801	TTTGTAGAGACCATATACATACATGTATGACTTCAAATGGATAAAATTAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	210577	TTTGTAGAGACCATATACATACATGTATGACTTCAAATGGATAAAATTAT	210626

AL732408.4	851	AAACAGTCATCAAAAGAGTGAACAATTGGGTTCATTTTCAAACCTTGAGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	210627	AAACAGTCATCAAAAGAGTGAACAATTGGGTTCATTTTCAAACCTTGAGG	210676

AL732408.4	901	ATGATCAGGTGTTGCCTCCAACAAACACACATTTCAGGTATTTGGGATTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	210677	ATGATCAGGTGTTGCCTCCAACAAACACACATTTCAGGTATTTGGGATTG	210726

AL732408.4	951	AGGTCAACCTTGTATGTGTCAATCCCTAAGCAGAAGGACAATTCAAATAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	210727	AGGTCAACCTTGTATGTGTCAATCCCTAAGCAGAAGGACAATTCAAATAA	210776

AL732408.4	1001	ACCAAAGAGTGTCAAGTTTCTTCATCAGCTGCCTGCAAGGATTCCAGAGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	210777	ACCAAAGAGTGTCAAGTTTCTTCATCAGCTGCCTGCAAGGATTCCAGAGC	210826

AL732408.4	1051	AGACCACCCAGAATAGTCCTCATTTTTAATTCCAGGATGAACCTAATAAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	210827	AGACCACCCAGAATAGTCCTCATTTTTAATTCCAGGATGAACCTAATAAC	210876

AL732408.4	1101	CAAAATTATACTCAACTGTCTATAATTTATACTGTATGTGCTTGTTTTTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	210877	CAAAATTATACTCAACTGTCTATAATTTATACTGTATGTGCTTGTTTTTC	210926

AL732408.4	1151	ATGTTTTTCTTTTAAATATTGAATTGCATTTAGAGAAACTTTAATAATGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	210927	ATGTTTTTCTTTTAAATATTGAATTGCATTTAGAGAAACTTTAATAATGT	210976

AL732408.4	1201	GAAACTTCAGCTGTAGACACTGGATTTCATTAGTCTAGCACTTGGTATTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	210977	GAAACTTCAGCTGTAGACACTGGATTTCATTAGTCTAGCACTTGGTATTC	211026

AL732408.4	1251	TGACCTCATTGGATATCTAAAAGCTAGAATCAAATTCCAACTCCATATTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	211027	TGACCTCATTGGATATCTAAAAGCTAGAATCAAATTCCAACTCCATATTT	211076

AL732408.4	1301	TCTTATATTGAATTGATAACAGACATATCATATCCTTTAAAACAAGCATG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	211077	TCTTATATTGAATTGATAACAGACATATCATATCCTTTAAAACAAGCATG	211126

AL732408.4	1351	ATGAAGTAACAGAAAAATATTGTCTCAACATAAACTTGTCAACTGGATAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	211127	ATGAAGTAACAGAAAAATATTGTCTCAACATAAACTTGTCAACTGGATAG	211176

AL732408.4	1401	TTTCGAGTCACTGTGATACAAGCTAGAGTCATCAGAGAGGAAAAAGCCTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	211177	TTTCGAGTCACTGTGATACAAGCTAGAGTCATCAGAGAGGAAAAAGCCTC	211226

AL732408.4	1451	AATCGAGGAAATCCAGCCAAAGTTTTCTTAAGTAGCAATTAATGAGAGAG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	211227	AATCGAGGAAATCCAGCCAAAGTTTTCTTAAGTAGCAATTAATGAGAGAG	211276

AL732408.4	1501	GTCCCAGCCCATTGTGGGTGGTGCCATCCCAGGCTGGTGATCCTGGGTTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	211277	GTCCCAGCCCATTGTGGGTGGTGCCATCCCAGGCTGGTGATCCTGGGTTC	211326

AL732408.4	1551	TAGAAGAAAACAGGCTGAGCAAATCAGAGGAAGCAATACAGTAAGGAGCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	211327	TAGAAGAAAACAGGCTGAGCAAATCAGAGGAAGCAATACAGTAAGGAGCA	211376

AL732408.4	1601	CTCCTCCATGGCTTCTACATCAGCTCCTGCATCTAGAATCCTGCCCTGTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	211377	CTCCTCCATGGCTTCTACATCAGCTCCTGCATCTAGAATCCTGCCCTGTT	211426

AL732408.4	1651	TGAGTTTTTCTGCTGAAATCCTTCAGTAATTAATAGCAAGATGGAAATGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	211427	TGAGTTTTTCTGCTGAAATCCTTCAGTAATTAATAGCAAGATGGAAATGT	211476

AL732408.4	1701	AAGCCAAATAAACCCATCTCCTCAACTTGCTTTTTGGTCATAGTTATTAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	211477	AAGCCAAATAAACCCATCTCCTCAACTTGCTTTTTGGTCATAGTTATTAA	211526

AL732408.4	1751	TAAAAGCATAAGAAACCCCAACTAAGACAAGTTCTGCTTTAGTAATACCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	211527	TAAAAGCATAAGAAACCCCAACTAAGACAAGTTCTGCTTTAGTAATACCA	211576

AL732408.4	1801	ATGGATGCTGACAGTTTAGAGGTGATTGTCCAGCACCTAGGAATAGTACT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	211577	ATGGATGCTGACAGTTTAGAGGTGATTGTCCAGCACCTAGGAATAGTACT	211626

AL732408.4	1851	GTCAAAACTACTATGAAGTTAAACATTTATGTCAATTTTTTCTGTTTGTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	211627	GTCAAAACTACTATGAAGTTAAACATTTATGTCAATTTTTTCTGTTTGTT	211676

AL732408.4	1901	TGTTTGTTTGCTTGCTTGCTTGCATGCTTGTTTTTTGTTCTTATTTTCTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	211677	TGTTTGTTTGCTTGCTTGCTTGCATGCTTGTTTTTTGTTCTTATTTTCTT	211726

AL732408.4	1951	GATAATTCAATCAACTTAATACAAGCTAGGATTACCCTGAAAAAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL590522.7	211727	GATAATTCAATCAACTTAATACAAGCTAGGATTACCCTGAAAAAGAATTC	211776

Overview

Query
AL732408.4 - 29333 bps
Hit
AL590522.7 - 211776 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link