<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645663.11	1	TCTGTAAAGATAGGTTAGCCTACAAGCTGTTTGGGTTAATCAAATATGGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	198126	TCTGTAAAGATAGGTTAGCCTACAAGCTGTTTGGGTTAATCAAATATGGT	198175

AL645663.11	51	GAAAGTGTTGATCTCTGAACCTCAGAACAAAGATCTAAGAAGTATTTGTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	198176	GAAAGTGTTGATCTCTGAACCTCAGAACAAAGATCTAAGAAGTATTTGTG	198225

AL645663.11	101	GCTTTTCATTTTACATTCTGGGAGCACAACTTCTATGTAAGATGTAGGGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	198226	GCTTTTCATTTTACATTCTGGGAGCACAACTTCTATGTAAGATGTAGGGC	198275

AL645663.11	151	AACCCAGCTGAGAAATCATGAGCTGTGGCTATATGAAAATAACACATGAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	198276	AACCCAGCTGAGAAATCATGAGCTGTGGCTATATGAAAATAACACATGAA	198325

AL645663.11	201	AAGCTGAATCCCAGCAACTGATCACTCTAGGAAAACGGACAAGGCCAACT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	198326	AAGCTGAATCCCAGCAACTGATCACTCTAGGAAAACGGACAAGGCCAACT	198375

AL645663.11	251	AAGAGACACCATAGGGATTCTCTGCATGTCTACGGTCTTAGTTACTTTCG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	198376	AAGAGACACCATAGGGATTCTCTGCATGTCTACGGTCTTAGTTACTTTCG	198425

AL645663.11	301	GATTTCATGGAGTCAGTTGCAGGAAGGTGGTCGATTACATGCTAAACACA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	198426	GATTTCATGGAGTCAGTTGCAGGAAGGTGGTCGATTACATGCTAAACACA	198475

AL645663.11	351	ACACCCAAGCAACTCACTTGCAGAGATGGAGATGATGCCTGCAATGAACA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	198476	ACACCCAAGCAACTCACTTGCAGAGATGGAGATGATGCCTGCAATGAACA	198525

AL645663.11	401	TTCACCCCACGTTCTAGTGACTTTGATACAGGAATGTCCTCTGCAGGCTA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	198526	TTCACCCCACGTTCTAGTGACTTTGATACAGGAATGTCCTCTGCAGGCTA	198575

AL645663.11	451	CTGAAAGAGAAATGTAAACACCATCCCAACCATGAAACCATGAGCTACTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	198576	CTGAAAGAGAAATGTAAACACCATCCCAACCATGAAACCATGAGCTACTT	198625

AL645663.11	501	ATTCTGCCTGAAATATGCTAGGGCCATGGTGTCATAGACCTTGTGGCAGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	198626	ATTCTGCCTGAAATATGCTAGGGCCATGGTGTCATAGACCTTGTGGCAGT	198675

AL645663.11	551	AATCAGCTGATATCTGCTTTAACTTAAGGCTTGTTCCATGAGATGGGACC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	198676	AATCAGCTGATATCTGCTTTAACTTAAGGCTTGTTCCATGAGATGGGACC	198725

AL645663.11	601	CATACCTGATTTCTTTGGAAGGACCAGACACTAGATAGCTAGATATCTTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	198726	CATACCTGATTTCTTTGGAAGGACCAGACACTAGATAGCTAGATATCTTT	198775

AL645663.11	651	ACCTAGGGTAAAGCCAATTACTACTGGTCTAAAAGCACCAACAAAAAGTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	198776	ACCTAGGGTAAAGCCAATTACTACTGGTCTAAAAGCACCAACAAAAAGTA	198825

AL645663.11	701	ACAATAAAATCACTCCTAATGCTATTTTGCTATACTCATAAATCATAATC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	198826	ACAATAAAATCACTCCTAATGCTATTTTGCTATACTCATAAATCATAATC	198875

AL645663.11	751	TTATTCAGCTATCAACAGAGAAGTTTTCTTCTGCAGCAGATGGGAACAAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	198876	TTATTCAGCTATCAACAGAGAAGTTTTCTTCTGCAGCAGATGGGAACAAA	198925

AL645663.11	801	TATAGACTCTCACAAGCAGACATATGCATAAGGAGACATTGGAACACACA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	198926	TATAGACTCTCACAAGCAGACATATGCATAAGGAGACATTGGAACACACA	198975

AL645663.11	851	GAGCAAAATGTGGTATCTCTATCTAATCCCTCTCCTAGTAGCTCTGGGAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	198976	GAGCAAAATGTGGTATCTCTATCTAATCCCTCTCCTAGTAGCTCTGGGAA	199025

AL645663.11	901	TCCTATGAAAGAGGAGAGAGATGGAGTAGGGGAAACAGAGAACAACAGGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	199026	TCCTATGAAAGAGGAGAGAGATGGAGTAGGGGAAACAGAGAACAACAGGA	199075

AL645663.11	951	GAACAAGGCCCTCTAACACAAACAAGCAAAGCTCATATGAACTCACAGAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	199076	GAACAAGGCCCTCTAACACAAACAAGCAAAGCTCATATGAACTCACAGAG	199125

AL645663.11	1001	ACTGAAGCACTGGGGCCCACAGGGATACACATCAGGTCCTCTGTATATGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	199126	ACTGAAGCACTGGGGCCCACAGGGATACACATCAGGTCCTCTGTATATGT	199175

AL645663.11	1051	GCTATAACTTTCAGTTTAGTAGTCACAGAAGACTCCTGAATATGTAAAAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	199176	GCTATAACTTTCAGTTTAGTAGTCACAGAAGACTCCTGAATATGTAAAAG	199225

AL645663.11	1101	AGTAGGTTTCTGATTCTTGTGCCTTCTCTTGAGGCTCTTTTATATTTGTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	199226	AGTAGGTTTCTGATTCTTGTGCCTTCTCTTGAGGCTCTTTTATATTTGTG	199275

AL645663.11	1151	TTGACTTGCCTTGTCCAACTTTGATATGATGATTTTTGCTTTACCTTATT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	199276	TTGACTTGCCTTGTCCAACTTTGATATGATGATTTTTGCTTTACCTTATT	199325

AL645663.11	1201	ATATTTTATTTTATTCTGTTTAGTTGTCATATCTTAGAAACCTGTTATTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	199326	ATATTTTATTTTATTCTGTTTAGTTGTCATATCTTAGAAACCTGTTATTT	199375

AL645663.11	1251	TCTAATGAGAGACAGAAAGTGGATCCAGATGAGAGAAGAGGTGAGAAAGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	199376	TCTAATGAGAGACAGAAAGTGGATCCAGATGAGAGAAGAGGTGAGAAAGA	199425

AL645663.11	1301	ACTTCTAGGAAACTGTATTTAGATTATAGTAAATGAGAAAAGAATCTATG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	199426	ACTTCTAGGAAACTGTATTTAGATTATAGTAAATGAGAAAAGAATCTATG	199475

AL645663.11	1351	TTTTAAAAAAAAACTGGAAAAATATAAATGATACATGAACTTATCCAAAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	199476	TTTTAAAAAAAAACTGGAAAAATATAAATGATACATGAACTTATCCAAAT	199525

AL645663.11	1401	ATATTCCAGACCAGAACATAGAATTCTCTTGAGTCCTGTGATCTTCCTGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	199526	ATATTCCAGACCAGAACATAGAATTCTCTTGAGTCCTGTGATCTTCCTGT	199575

AL645663.11	1451	GCTCAAATTCAGCACTCAATTGGCATTTCATTTGTTTGTCTCATTTATTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	199576	GCTCAAATTCAGCACTCAATTGGCATTTCATTTGTTTGTCTCATTTATTA	199625

AL645663.11	1501	ACTTTTAGAGCTTTCAAACAAATAGGTACTTTTTGAAAAATCTGTATTTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	199626	ACTTTTAGAGCTTTCAAACAAATAGGTACTTTTTGAAAAATCTGTATTTT	199675

AL645663.11	1551	GATTATTTTAACCTAAGTACTATTCAAATATAAAGCATTTAATTTCAAAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	199676	GATTATTTTAACCTAAGTACTATTCAAATATAAAGCATTTAATTTCAAAA	199725

AL645663.11	1601	TCATATAGTTTTCTTTTATCCTTGTAGTGAATTCAATTTTTAAAAGTTCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	199726	TCATATAGTTTTCTTTTATCCTTGTAGTGAATTCAATTTTTAAAAGTTCA	199775

AL645663.11	1651	AGATTGTTGGAACATTACTTCCTTGTTTTGTATTTCTTCCAGCATTTACC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	199776	AGATTGTTGGAACATTACTTCCTTGTTTTGTATTTCTTCCAGCATTTACC	199825

AL645663.11	1701	ATAGAACTACTGAGAAAGAAGGATCATAAAAATTAATGAATGGATGGTTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	199826	ATAGAACTACTGAGAAAGAAGGATCATAAAAATTAATGAATGGATGGTTA	199875

AL645663.11	1751	TGTAAGTGAATATATGAATGCATGAATAAGTGATGCAGAACTTAAGAGCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	199876	TGTAAGTGAATATATGAATGCATGAATAAGTGATGCAGAACTTAAGAGCA	199925

AL645663.11	1801	CAGGAAGTTTCTGTGATGCAGTAAACTTTACATAACTTATTCAGGATCAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	199926	CAGGAAGTTTCTGTGATGCAGTAAACTTTACATAACTTATTCAGGATCAT	199975

AL645663.11	1851	CACTAGAAGATAAAACAGAGCCATATTATGAAGACAAGGCAGGAAGAATG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	199976	CACTAGAAGATAAAACAGAGCCATATTATGAAGACAAGGCAGGAAGAATG	200025

AL645663.11	1901	CTTACGTAGTCTGGAATTTTTTTAAGGTGAAGAATCTCTCTTGTTCCTTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	200026	CTTACGTAGTCTGGAATTTTTTTAAGGTGAAGAATCTCTCTTGTTCCTTT	200075

AL645663.11	1951	GAGCAGCTTATAATTTATTGAAAAATAAATCTTGTCTCGGTGTTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL589722.17	200076	GAGCAGCTTATAATTTATTGAAAAATAAATCTTGTCTCGGTGTTGAATTC	200125

Overview

Query
AL645663.11 - 104722 bps
Hit
AL589722.17 - 200125 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link