<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR589946.2	1	TACGGTGATGTTCATCTATGGTAGATAAAACACAGGTCTGCATGGTAAAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	193589	TACGGTGATGTTCATCTATGGTAGATAAAACACAGGTCTGCATGGTAAAG	193638

CR589946.2	51	TACCTCAATCCTTAATGCCTCCCCAGTAGCGACAATGACAGCAAGAGAAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	193639	TACCTCAATCCTTAATGCCTCCCCAGTAGCGACAATGACAGCAAGAGAAG	193688

CR589946.2	101	GAAAATGTTACTGTAACTATATGACACATTTTGGTACTGGAAGCTCACTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	193689	GAAAATGTTACTGTAACTATATGACACATTTTGGTACTGGAAGCTCACTT	193738

CR589946.2	151	TATCTTCCTTCCTATTTCTAACACCCTGTTCTTCCTTCTTCTACAGATCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	193739	TATCTTCCTTCCTATTTCTAACACCCTGTTCTTCCTTCTTCTACAGATCA	193788

CR589946.2	201	ATTTGACTTTACTACCCTCCATTACATACATCCACTTTTTTTATTTATTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	193789	ATTTGACTTTACTACCCTCCATTACATACATCCACTTTTTTTATTTATTC	193838

CR589946.2	251	CATGTACACTCTGCCCTCCTCATTCTTTCTTTCTCTTTTATTCATTTCCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	193839	CATGTACACTCTGCCCTCCTCATTCTTTCTTTCTCTTTTATTCATTTCCT	193888

CR589946.2	301	CTTCCCTCTCTCCTGACTTGCCTCAGGTCTTAAGAGTATGTTAAAATGGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	193889	CTTCCCTCTCTCCTGACTTGCCTCAGGTCTTAAGAGTATGTTAAAATGGA	193938

CR589946.2	351	ACTCATAACTCAGCTCCTTTAGTGGTACTTCCAATAGAATCAACTGCTGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	193939	ACTCATAACTCAGCTCCTTTAGTGGTACTTCCAATAGAATCAACTGCTGA	193988

CR589946.2	401	CCCTTGGTTAGAGACACCACTTATCACCATTTCATTTCTCTTTTACTTAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	193989	CCCTTGGTTAGAGACACCACTTATCACCATTTCATTTCTCTTTTACTTAT	194038

CR589946.2	451	GATACAGTTAATAGGACATTTTCTTTAGCTATTAAACTCTATTAGTGCTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	194039	GATACAGTTAATAGGACATTTTCTTTAGCTATTAAACTCTATTAGTGCTC	194088

CR589946.2	501	ATATTTTAAAAGAAACATTCCATCAATGCCTTTTTTTTTTTTTTGAGATG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	194089	ATATTTTAAAAGAAACATTCCATCAATGCCTTTTTTTTTTTTTTGAGATG	194138

CR589946.2	551	GAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCCGCTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	194139	GAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCCGCTC	194188

CR589946.2	601	ACTGCAAGCTCCACCTCCCAGGTTCACACCATCCTCCTGCCTCAGCCTCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	194189	ACTGCAAGCTCCACCTCCCAGGTTCACACCATCCTCCTGCCTCAGCCTCC	194238

CR589946.2	651	CGAGTTGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	194239	CGAGTTGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTTG	194288

CR589946.2	701	TGTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGAAGGTCTTGAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	194289	TGTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGAAGGTCTTGAT	194338

CR589946.2	751	CTCCTGACCTCATTACCCGCCCACCTCAGGCTCCCAAAGTGCTGGAATTA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	194339	CTCCTGACCTCATTACCCGCCCACCTCAGGCTCCCAAAGTGCTGGAATTA	194388

CR589946.2	801	CAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTCCATCAAATGACTTTTTAAATAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	194389	CAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTCCATCAAATGACTTTTTAAATAAA	194438

CR589946.2	851	ATACGGTTCTCACCTTTTCCTTTTCCATTGACTATTCTGTTTCCTTTTTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	194439	ATACGGTTCTCACCTTTTCCTTTTCCATTGACTATTCTGTTTCCTTTTTC	194488

CR589946.2	901	ATGAGAAGGTCCACGTAAAGGCTCTGACACTTTCTCGGGGACACACTGCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	194489	ATGAGAAGGTCCACGTAAAGGCTCTGACACTTTCTCGGGGACACACTGCT	194538

CR589946.2	951	AAGGTAATATCAAGAATTAGTTTCCATTTAAAATTATAATGAGTTGCATC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	194539	AAGGTAATATCAAGAATTAGTTTCCATTTAAAATTATAATGAGTTGCATC	194588

CR589946.2	1001	AAGAGTTTCTTATCAATCTCTTTTTATGAAACTGGGTCTCACTCTGTCAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	194589	AAGAGTTTCTTATCAATCTCTTTTTATGAAACTGGGTCTCACTCTGTCAA	194638

CR589946.2	1051	CCCAGGGCTAGAATGCAGGGGCCTGATTATGGCTCACTGTGGTCTCAAAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	194639	CCCAGGGCTAGAATGCAGGGGCCTGATTATGGCTCACTGTGGTCTCAAAC	194688

CR589946.2	1101	TCCTGACCTCAAGCAATCTTCCCACCTCAACTTCCTGAATAGCTGGAACT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	194689	TCCTGACCTCAAGCAATCTTCCCACCTCAACTTCCTGAATAGCTGGAACT	194738

CR589946.2	1151	ACAGGTGCATACCATCATGTCATGCTAATGTTTTTATTGTTATCTTTGTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	194739	ACAGGTGCATACCATCATGTCATGCTAATGTTTTTATTGTTATCTTTGTA	194788

CR589946.2	1201	GAGACAAGGCCTCATTATACCTCCCAGGCTGGTCTCAAGCTCCTGGGCTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	194789	GAGACAAGGCCTCATTATACCTCCCAGGCTGGTCTCAAGCTCCTGGGCTC	194838

CR589946.2	1251	AAGCAAATCTTCCACTTCTGCCTCCCAAAATGTTGAGATAAGCAGTTTGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	194839	AAGCAAATCTTCCACTTCTGCCTCCCAAAATGTTGAGATAAGCAGTTTGC	194888

CR589946.2	1301	ACCACCACACCCAGCCCTAATCAATTTCTTTAAATCAATCTCAATGTTGC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	194889	ACCACCACACCCAGCCCTAATCAATTTCTTTAAATCAATCTCAATGTTGC	194938

CR589946.2	1351	CCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCTCAGCCCTTTGCAAGGCCAAGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	194939	CCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCTCAGCCCTTTGCAAGGCCAAGG	194988

CR589946.2	1401	TGGGTGGATTGCTTGAGTTCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGGCAACATAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	194989	TGGGTGGATTGCTTGAGTTCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGGCAACATAA	195038

CR589946.2	1451	TGAGAACACATCTCTACACAAAAAATACCAAAAGGAGTCAGGCATGATGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	195039	TGAGAACACATCTCTACACAAAAAATACCAAAAGGAGTCAGGCATGATGG	195088

CR589946.2	1501	TGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTGCTTGGGAAGCTGATGTGGGAGGATCACT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	195089	TGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTGCTTGGGAAGCTGATGTGGGAGGATCACT	195138

CR589946.2	1551	TGAGCCTGAGAGGTGGATACAGCAGTGAGCCAAGATCATGCAACTACACT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	195139	TGAGCCTGAGAGGTGGATACAGCAGTGAGCCAAGATCATGCAACTACACT	195188

CR589946.2	1601	GCAGCATGGACAACAGAGCAAGACCCTGCCTCCCCAAAAATTTCAATTTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	195189	GCAGCATGGACAACAGAGCAAGACCCTGCCTCCCCAAAAATTTCAATTTA	195238

CR589946.2	1651	AAATGTGAGAACAAAGAGAGATACAAACAAAAAACAAACCTAATTAGTCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	195239	AAATGTGAGAACAAAGAGAGATACAAACAAAAAACAAACCTAATTAGTCA	195288

CR589946.2	1701	ATGAAATATGAGCTTAAGCCAAGAAAGAAAATGAAAAACATGAAGTACAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	195289	ATGAAATATGAGCTTAAGCCAAGAAAGAAAATGAAAAACATGAAGTACAA	195338

CR589946.2	1751	TAAAGTACATGGGGAAATAGATCTATAACAGAGCCTTCGGTCTTTCATAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	195339	TAAAGTACATGGGGAAATAGATCTATAACAGAGCCTTCGGTCTTTCATAA	195388

CR589946.2	1801	CTCTGATAATACTAATTAATATTTATGCTGCAATTACTTTTTTGTAAGTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	195389	CTCTGATAATACTAATTAATATTTATGCTGCAATTACTTTTTTGTAAGTA	195438

CR589946.2	1851	CTTCTGTGATAGTGTTTCTTACTATAAGACATTCAATTAGCTAAATATGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	195439	CTTCTGTGATAGTGTTTCTTACTATAAGACATTCAATTAGCTAAATATGG	195488

CR589946.2	1901	TCATCTGCCATTACCTGAAAGAACATTATTATAACAGAGAGAGAAAACTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	195489	TCATCTGCCATTACCTGAAAGAACATTATTATAACAGAGAGAGAAAACTG	195538

CR589946.2	1951	GAACTTTCCATCAACTTTCCACCCAGAAAAAGAATTGATCACCAGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL583842.40	195539	GAACTTTCCATCAACTTTCCACCCAGAAAAAGAATTGATCACCAGAATTC	195588

Overview

Query
CR589946.2 - 16121 bps
Hit
AL583842.40 - 195588 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link