<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL645749.6	1	TCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTTCCCCCCTCTTCCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	207176	TCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTTCCCCCCTCTTCCT	207225

AL645749.6	51	CCCTCTCTCGCTCCCCCTATCCCTCTCCCCCTCTCTCCCTCCTTCCTTCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	207226	CCCTCTCTCGCTCCCCCTATCCCTCTCCCCCTCTCTCCCTCCTTCCTTCC	207275

AL645749.6	101	TTCTTCCTTTTATTGCAGAACATTTTTGTTTGAGAACATTTTGGATTTTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	207276	TTCTTCCTTTTATTGCAGAACATTTTTGTTTGAGAACATTTTGGATTTTG	207325

AL645749.6	151	ACTTTTTGGCTAAGCCTATTCGATTCTTGCTGTTTTCCTTTCTTCTTTCC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	207326	ACTTTTTGGCTAAGCCTATTCGATTCTTGCTGTTTTCCTTTCTTCTTTCC	207375

AL645749.6	201	AGTGATGCTGAGTAGCAGGCTCAGGTCTTTGTGCACAGTAGGCAAATGCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	207376	AGTGATGCTGAGTAGCAGGCTCAGGTCTTTGTGCACAGTAGGCAAATGCC	207425

AL645749.6	251	CAACCACTGCCTTTCAGCTGGACCATCGTCCTCCATAGCTAGGATGAAAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	207426	CAACCACTGCCTTTCAGCTGGACCATCGTCCTCCATAGCTAGGATGAAAG	207475

AL645749.6	301	AGAACCTAATATCGTGTGATGCTTTATAGAACTCTTTGTGCCCACTCTCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	207476	AGAACCTAATATCGTGTGATGCTTTATAGAACTCTTTGTGCCCACTCTCT	207525

AL645749.6	351	GGATATACTCCTTACTTCACAACTCCCTGAGTTGACCTAGAATTCATGAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	207526	GGATATACTCCTTACTTCACAACTCCCTGAGTTGACCTAGAATTCATGAG	207575

AL645749.6	401	TTATTTTAATGTGAGTCTCAGTACAATTTAATGTCAGAATATTCATCTTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	207576	TTATTTTAATGTGAGTCTCAGTACAATTTAATGTCAGAATATTCATCTTC	207625

AL645749.6	451	CCTGGTTTATGACATATGTTGGAAGTTAAAGCTTTTGGATTTATGTCTCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	207626	CCTGGTTTATGACATATGTTGGAAGTTAAAGCTTTTGGATTTATGTCTCT	207675

AL645749.6	501	ATCTGTTGGATTGAAAATGGTAAGCGTATTCATCTCTACAGTTGTCACTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	207676	ATCTGTTGGATTGAAAATGGTAAGCGTATTCATCTCTACAGTTGTCACTG	207725

AL645749.6	551	GTGCCCTCCCTACCCCCAATCCATGTGTCAGGCTAAGGGTTGAGATGCTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	207726	GTGCCCTCCCTACCCCCAATCCATGTGTCAGGCTAAGGGTTGAGATGCTC	207775

AL645749.6	601	AAGATTCCAGTGAGTTTGGGAAGCAGACATTCATGTGCATAATTTTAATT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	207776	AAGATTCCAGTGAGTTTGGGAAGCAGACATTCATGTGCATAATTTTAATT	207825

AL645749.6	651	TGTTAGTGTTCTACATTAGCAGAATTCAAGCAGCTAAGCAGTGACTTATG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	207826	TGTTAGTGTTCTACATTAGCAGAATTCAAGCAGCTAAGCAGTGACTTATG	207875

AL645749.6	701	CTGGGCTTGGGGGACAGGTGTGATGTGATACGGAGGATGCTATAGAGAAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	207876	CTGGGCTTGGGGGACAGGTGTGATGTGATACGGAGGATGCTATAGAGAAG	207925

AL645749.6	751	CAAGACCAATACAAAATGCATACACATCCAGACATGATGGTGTATGCCTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	207926	CAAGACCAATACAAAATGCATACACATCCAGACATGATGGTGTATGCCTT	207975

AL645749.6	801	TAATCCCGGCGCTTGGGAGGCAGAGCCAGAGGCAAGTCAATCTCTGTGAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	207976	TAATCCCGGCGCTTGGGAGGCAGAGCCAGAGGCAAGTCAATCTCTGTGAG	208025

AL645749.6	851	TTCCAGGCCAATCTGGTTTACATAGAATGAGTTCCATGCCAGTTACAGTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	208026	TTCCAGGCCAATCTGGTTTACATAGAATGAGTTCCATGCCAGTTACAGTT	208075

AL645749.6	901	ACAGAGTTATAGGGTGAGATCCTGTGTAAACACACACACACACACACACA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	208076	ACAGAGTTATAGGGTGAGATCCTGTGTAAACACACACACACACACACACA	208125

AL645749.6	951	CACACACACACACACACACACACACGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	208126	CACACACACACACACACACACACACGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	208175

AL645749.6	1001	AGACAGAGACAGAGACAGAGACAGAGACAGAGAGGAGGGGTATGGCAGAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	208176	AGACAGAGACAGAGACAGAGACAGAGACAGAGAGGAGGGGTATGGCAGAA	208225

AL645749.6	1051	AGAGAGAGCAGGGAGAGAGACACAGAGAGATGATAGACAGAGACACAGAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	208226	AGAGAGAGCAGGGAGAGAGACACAGAGAGATGATAGACAGAGACACAGAG	208275

AL645749.6	1101	AGAGACAGGCACAGAAAGACAGGAGTCACAGAGAGACAGACAGAAAGACA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	208276	AGAGACAGGCACAGAAAGACAGGAGTCACAGAGAGACAGACAGAAAGACA	208325

AL645749.6	1151	GAAAATGACACAGAGAGACAGACAGACGTACACATGTAAAATGGGGGCTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	208326	GAAAATGACACAGAGAGACAGACAGACGTACACATGTAAAATGGGGGCTT	208375

AL645749.6	1201	TATTGGATTGGCTTATATGATAGAAGTTGAGTACTACAACAGTAGCTGTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	208376	TATTGGATTGGCTTATATGATAGAAGTTGAGTACTACAACAGTAGCTGTC	208425

AL645749.6	1251	TGCTAGAAAGTCAGAACACTGTAGTTCCTTAGTCCAGGGATTTATTTTTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	208426	TGCTAGAAAGTCAGAACACTGTAGTTCCTTAGTCCAGGGATTTATTTTTC	208475

AL645749.6	1301	TTCTTTTTTTAAAATTAGGTATTTTCTTCATTTACATTTCCAATGCTATC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	208476	TTCTTTTTTTAAAATTAGGTATTTTCTTCATTTACATTTCCAATGCTATC	208525

AL645749.6	1351	CCAAAAGTCCCCCATTCCCCCACCCCCACCGCCCTACCCACCCACTCCCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	208526	CCAAAAGTCCCCCATTCCCCCACCCCCACCGCCCTACCCACCCACTCCCA	208575

AL645749.6	1401	CTTCTTGACCCTAGTCCAGGGATTTTTGACATCTCAGAAGGCATTATCTG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	208576	CTTCTTGACCCTAGTCCAGGGATTTTTGACATCTCAGAAGGCATTATCTG	208625

AL645749.6	1451	GCACTAAAGCTTGGAGCTCCTTGGGTACTGAGCCCACATTGGAAAACTGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	208626	GCACTAAAGCTTGGAGCTCCTTGGGTACTGAGCCCACATTGGAAAACTGA	208675

AL645749.6	1501	AAAAAAAAAAAAAAAAACTAGAGTCTGATGATATCTGCCCATGCTCAGAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	208676	AAAAAAAAAAAAAAAAACTAGAGTCTGATGATATCTGCCCATGCTCAGAG	208725

AL645749.6	1551	GTAAGCAGCTAGTGCTGGAGAGATGGCTCAGCAGTTAAGAGCACTGGCTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	208726	GTAAGCAGCTAGTGCTGGAGAGATGGCTCAGCAGTTAAGAGCACTGGCTG	208775

AL645749.6	1601	CTTTTCCAGAGGACCCAGGTTCAATTCCCAGCACTCACACGGTGGCTCAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	208776	CTTTTCCAGAGGACCCAGGTTCAATTCCCAGCACTCACACGGTGGCTCAC	208825

AL645749.6	1651	AGCTGCCTGTAATGCTAGTTCCAGGGAGTTGGATGCTCTTTGGCCTGTGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	208826	AGCTGCCTGTAATGCTAGTTCCAGGGAGTTGGATGCTCTTTGGCCTGTGT	208875

AL645749.6	1701	GGGCACTGTACATACTTGCTGCACAGATGGAGTCTGGGTAAGAAAGGATG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	208876	GGGCACTGTACATACTTGCTGCACAGATGGAGTCTGGGTAAGAAAGGATG	208925

AL645749.6	1751	CAGGGCCCAGAGGAGTGGGAGGGAAGGGGAGATGGGATAGATGAGGATGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	208926	CAGGGCCCAGAGGAGTGGGAGGGAAGGGGAGATGGGATAGATGAGGATGT	208975

AL645749.6	1801	GGCTGGACCACTCAAAACTTTGTGAACAGTCATTTGCAGAGGGTGAAAGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	208976	GGCTGGACCACTCAAAACTTTGTGAACAGTCATTTGCAGAGGGTGAAAGA	209025

AL645749.6	1851	GGACAAAGAGAGCGTTTGTTGAGCACCTTGCTGTTCTGTACATTAATCTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	209026	GGACAAAGAGAGCGTTTGTTGAGCACCTTGCTGTTCTGTACATTAATCTG	209075

AL645749.6	1901	GTCCCTTGTGTTTTGGGTTTCAGGTATTCCTTTTTTGTAGCCATGGGCTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	209076	GTCCCTTGTGTTTTGGGTTTCAGGTATTCCTTTTTTGTAGCCATGGGCTA	209125

AL645749.6	1951	CCTTACGATATGCCACATCAGCCGCATTTACATCTTCCACTATGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450321.15	209126	CCTTACGATATGCCACATCAGCCGCATTTACATCTTCCACTATGGAATTC	209175

Overview

Query
AL645749.6 - 54152 bps
Hit
AL450321.15 - 209175 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link