<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL391421.27	1	GAATTCTTGGTCCATCCTGTGGCACAGGGGACAATGCTGGGCAGGGCCAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	46538	GAATTCTTGGTCCATCCTGTGGCACAGGGGACAATGCTGGGCAGGGCCAT	46587

AL391421.27	51	CGAGACCCTGCTGCCCTGCCCTTCCTGCCCTTCCTGGTGAGAAAAGCAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	46588	CGAGACCCTGCTGCCCTGCCCTTCCTGCCCTTCCTGGTGAGAAAAGCAAA	46637

AL391421.27	101	GGTGGGCCAGACACTGGGCTCCCCCCACACTCCTTGGCAGGTCTCAAGGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	46638	GGTGGGCCAGACACTGGGCTCCCCCCACACTCCTTGGCAGGTCTCAAGGC	46687

AL391421.27	151	TACATCTCCTCCCACGCCCCTGGGAACCCTCGGTACATGCTGCGGGGGTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	46688	TACATCTCCTCCCACGCCCCTGGGAACCCTCGGTACATGCTGCGGGGGTG	46737

AL391421.27	201	ACACAAACACCAGCACCAGGGCAAGCTCTCAGAGCAGGCGATTTTTTCTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	46738	ACACAAACACCAGCACCAGGGCAAGCTCTCAGAGCAGGCGATTTTTTCTA	46787

AL391421.27	251	CTACAGCATATTCAGCTCGGTGTCAAAAGGAACTGCTAGGACAGCCTTCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	46788	CTACAGCATATTCAGCTCGGTGTCAAAAGGAACTGCTAGGACAGCCTTCA	46837

AL391421.27	301	ATTGGTGACATGACGAGTTACGCTTCCTGCCATAGAAGGGAAATGATGCA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	46838	ATTGGTGACATGACGAGTTACGCTTCCTGCCATAGAAGGGAAATGATGCA	46887

AL391421.27	351	GGGATGCAGGCTGCCTCGAAAACATGCTCAGTGACAGGAGCCAGATGAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	46888	GGGATGCAGGCTGCCTCGAAAACATGCTCAGTGACAGGAGCCAGATGAAA	46937

AL391421.27	401	GGCCACACTATGCAATCCCAACCACACAGAAGTCCAGACAGGGAGACCCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	46938	GGCCACACTATGCAATCCCAACCACACAGAAGTCCAGACAGGGAGACCCA	46987

AL391421.27	451	TGGGTATCAAAAGTAAAGTAGTGGCTGCCTAGGGCTGAGGGCTGGGTGGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	46988	TGGGTATCAAAAGTAAAGTAGTGGCTGCCTAGGGCTGAGGGCTGGGTGGG	47037

AL391421.27	501	AGGACAGTGGGATAAGGGGCTGACAGCTAATGGGTCTGGGGTTTGTTTGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	47038	AGGACAGTGGGATAAGGGGCTGACAGCTAATGGGTCTGGGGTTTGTTTGA	47087

AL391421.27	551	GGTGATGGAAATGCTCTAAAATTAACTGTAGTGGCGGCTGCACACACCTA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	47088	GGTGATGGAAATGCTCTAAAATTAACTGTAGTGGCGGCTGCACACACCTA	47137

AL391421.27	601	TCAATATGTTGAAAACCACTGAATGGTACACTTTGAGGGAGCGGCAAGGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	47138	TCAATATGTTGAAAACCACTGAATGGTACACTTTGAGGGAGCGGCAAGGC	47187

AL391421.27	651	ACGAGTATCTCCATAAATCCATTTTTCTAAAACACGTTATGCCTTCTGAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	47188	ACGAGTATCTCCATAAATCCATTTTTCTAAAACACGTTATGCCTTCTGAC	47237

AL391421.27	701	CCATCACTGTGCTCTATACAGCACTGACTCACACTAGGAGCAGCTTTTTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	47238	CCATCACTGTGCTCTATACAGCACTGACTCACACTAGGAGCAGCTTTTTA	47287

AL391421.27	751	GACCAGCACTTTTGGCAAAATGTAGAGAGCAGAAGCTAAGATAAGAAGCA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	47288	GACCAGCACTTTTGGCAAAATGTAGAGAGCAGAAGCTAAGATAAGAAGCA	47337

AL391421.27	801	GAATCCCTCCTCCAGCAGCCCTGGCCCCAGCCCCCTCCCATGGGACAGCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	47338	GAATCCCTCCTCCAGCAGCCCTGGCCCCAGCCCCCTCCCATGGGACAGCT	47387

AL391421.27	851	CCATGGCTGGTGGCCCTCGGCGACCCCTGCCCCACCCCACCCCAGGCCCG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	47388	CCATGGCTGGTGGCCCTCGGCGACCCCTGCCCCACCCCACCCCAGGCCCG	47437

AL391421.27	901	GAGAACACTTACACATATTTGCTGGGAATCTGCCCGCGCTGGATCTTCTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	47438	GAGAACACTTACACATATTTGCTGGGAATCTGCCCGCGCTGGATCTTCTG	47487

AL391421.27	951	GGCATTCTCGTCCAGCTGCCAAGCCATCCAGGACCCGAACGTGCCCTGGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	47488	GGCATTCTCGTCCAGCTGCCAAGCCATCCAGGACCCGAACGTGCCCTGGG	47537

AL391421.27	1001	GTAAGGTGTCATCCACGTAGAGGATGTCGTCCTTCTTAAAGCTCAACTCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	47538	GTAAGGTGTCATCCACGTAGAGGATGTCGTCCTTCTTAAAGCTCAACTCT	47587

AL391421.27	1051	TGCTCCACATCTGCCAGCCGGTCGTACAGGGCCCTGGACCACAGCACAGA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	47588	TGCTCCACATCTGCCAGCCGGTCGTACAGGGCCCTGGACCACAGCACAGA	47637

AL391421.27	1101	AGGAACACGATCAGGCGGCTCTGGCCACCAAGGACGAACCAGGTGCCTTC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	47638	AGGAACACGATCAGGCGGCTCTGGCCACCAAGGACGAACCAGGTGCCTTC	47687

AL391421.27	1151	TGTGGCCAGGCCCCTAAGGCTGCCATTCTGCTTTGGGCTGTCTCCAAACT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	47688	TGTGGCCAGGCCCCTAAGGCTGCCATTCTGCTTTGGGCTGTCTCCAAACT	47737

AL391421.27	1201	TGATCAGGAATCGCCGAGGGTGGTGATTCTCAAAGTGGGGAGCCCTGTGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	47738	TGATCAGGAATCGCCGAGGGTGGTGATTCTCAAAGTGGGGAGCCCTGTGT	47787

AL391421.27	1251	TTTACATAAAGGGGCAAAGACTGCCTTTGCTCCCCTAACACTGAGGGCGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	47788	TTTACATAAAGGGGCAAAGACTGCCTTTGCTCCCCTAACACTGAGGGCGC	47837

AL391421.27	1301	ATCCCCATCAAAGAACTCACCAAGATCTGAGGCCATAACTTCCCTTTCCA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	47838	ATCCCCATCAAAGAACTCACCAAGATCTGAGGCCATAACTTCCCTTTCCA	47887

AL391421.27	1351	GGTGGCCTTTCCCAGTTGCCTCCCTCCTCGAAGCCCAGGCCCGGCCCCTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	47888	GGTGGCCTTTCCCAGTTGCCTCCCTCCTCGAAGCCCAGGCCCGGCCCCTG	47937

AL391421.27	1401	GTTCCTACAGACTGGAATCTCTCTAGGATGGAAATATGTCATCTTCTACC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	47938	GTTCCTACAGACTGGAATCTCTCTAGGATGGAAATATGTCATCTTCTACC	47987

AL391421.27	1451	CTAGAGACAGGGAGTTGTACCGCATCAGTGTTCTCATGCTTTCTGTGATC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	47988	CTAGAGACAGGGAGTTGTACCGCATCAGTGTTCTCATGCTTTCTGTGATC	48037

AL391421.27	1501	TTGGATCTTAGGAAATGTGAAGAAAGCTCTGAGCTCCTCCTAGAAAGCCT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	48038	TTGGATCTTAGGAAATGTGAAGAAAGCTCTGAGCTCCTCCTAGAAAGCCT	48087

AL391421.27	1551	GCTGCCATCCCTAAATGCCCACAGCATTTCATACAGTAGTAAGGGCACTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	48088	GCTGCCATCCCTAAATGCCCACAGCATTTCATACAGTAGTAAGGGCACTG	48137

AL391421.27	1601	AAGATGCCTGGAAGTCCACACACACTGCAGAGGGATCTGCAAACCTGGCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	48138	AAGATGCCTGGAAGTCCACACACACTGCAGAGGGATCTGCAAACCTGGCT	48187

AL391421.27	1651	TGGGGGACACCAGAAAAAGAGGAGCACAGCACACAGGAAAACGGGGCTTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	48188	TGGGGGACACCAGAAAAAGAGGAGCACAGCACACAGGAAAACGGGGCTTG	48237

AL391421.27	1701	ACTGCCTCCAAATTCTCTAGGTCTTAAGCCCTAAAGAGGGGGCCCAGCTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	48238	ACTGCCTCCAAATTCTCTAGGTCTTAAGCCCTAAAGAGGGGGCCCAGCTG	48287

AL391421.27	1751	GTTCTTTAAGCCCTAAAGGGTTGTTCTAAGTCACAATCATCTCAACATAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	48288	GTTCTTTAAGCCCTAAAGGGTTGTTCTAAGTCACAATCATCTCAACATAA	48337

AL391421.27	1801	ATAAGCGTGCAGATTGAGTGTCAAGGAATGATGATCATGGCCCCAGCCTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	48338	ATAAGCGTGCAGATTGAGTGTCAAGGAATGATGATCATGGCCCCAGCCTT	48387

AL391421.27	1851	GGGGGGCAAGAAACAGAGAGCCATTCACCAGGAAAAGAGTCTCCAGTGAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	48388	GGGGGGCAAGAAACAGAGAGCCATTCACCAGGAAAAGAGTCTCCAGTGAA	48437

AL391421.27	1901	AGCCTCTCCTCTGGTTCCAAATCTCCCACCGATTCCCCAGCCACTGGTAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	48438	AGCCTCTCCTCTGGTTCCAAATCTCCCACCGATTCCCCAGCCACTGGTAC	48487

AL391421.27	1951	CTGATGTAGAAGCTGTCACCAGGCAGGCCCTTGGCCTTCGTGAACTCCTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL450306.14	48488	CTGATGTAGAAGCTGTCACCAGGCAGGCCCTTGGCCTTCGTGAACTCCTC	48537

Overview

Query
AL391421.27 - 168239 bps
Hit
AL450306.14 - 48537 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link