<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL627230.15	1	GAATTCAACACCAGCCTGGCCAAGATGGCTAATCCCCAACTCTACTAAAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	93129	GAATTCAACACCAGCCTGGCCAAGATGGCTAATCCCCAACTCTACTAAAA	93178

AL627230.15	51	AATACAAAAATTATCCAGGCACGGTGGCAGGCACCTGTGATCCTAGCTAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	93179	AATACAAAAATTATCCAGGCACGGTGGCAGGCACCTGTGATCCTAGCTAC	93228

AL627230.15	101	TTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	93229	TTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTCAACCCAGGAGGCAGAGGTTGC	93278

AL627230.15	151	AGTGAGCTGAGATCTCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	93279	AGTGAGCTGAGATCTCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGA	93328

AL627230.15	201	ATCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATGGGGAAACTCCATCTCTACTAAAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	93329	ATCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATGGGGAAACTCCATCTCTACTAAAA	93378

AL627230.15	251	ATACAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	93379	ATACAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTT	93428

AL627230.15	301	GGGAGGCTGAGGCAAGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTTTGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	93429	GGGAGGCTGAGGCAAGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTTTGG	93478

AL627230.15	351	GGAGGTGGAGGTTGAGGTGAGCCAAGATCGTGGCATTGCACTGCAGCCTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	93479	GGAGGTGGAGGTTGAGGTGAGCCAAGATCGTGGCATTGCACTGCAGCCTG	93528

AL627230.15	401	GGCAACAAGAGTAAAACTCTCTCTAACAAACAAACAAACAAACAAACAAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	93529	GGCAACAAGAGTAAAACTCTCTCTAACAAACAAACAAACAAACAAACAAA	93578

AL627230.15	451	ACAAAACAAAGAAAAATACACACAACTTATTTCCTGGTTTGTGATAATCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	93579	ACAAAACAAAGAAAAATACACACAACTTATTTCCTGGTTTGTGATAATCT	93628

AL627230.15	501	GTGAAATATATTTTGAAATGAATTGGAATTCAATACAGTACTATTCACAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	93629	GTGAAATATATTTTGAAATGAATTGGAATTCAATACAGTACTATTCACAC	93678

AL627230.15	551	CCCAAATACTCCTAATATTTCCTTTCCCAGATGATGACCTGGTACTCTTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	93679	CCCAAATACTCCTAATATTTCCTTTCCCAGATGATGACCTGGTACTCTTC	93728

AL627230.15	601	CTAGGGCTTGACTTCTCCCTACAGGTCCCCAGTACAAGTATTTGTGATTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	93729	CTAGGGCTTGACTTCTCCCTACAGGTCCCCAGTACAAGTATTTGTGATTC	93778

AL627230.15	651	TGAGTCAATTCATTGTCTACATGTGTGACAATGCAATGCTCTTGTTGTAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	93779	TGAGTCAATTCATTGTCTACATGTGTGACAATGCAATGCTCTTGTTGTAG	93828

AL627230.15	701	AGTACCAAGATGAGGCAGGTCCAAACTGCACATTTGTAGAGAACATAGTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	93829	AGTACCAAGATGAGGCAGGTCCAAACTGCACATTTGTAGAGAACATAGTA	93878

AL627230.15	751	TATGTGCAATTGAACATGTATGTGGTTGTGATACTGAAAACAATACGAAC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	93879	TATGTGCAATTGAACATGTATGTGGTTGTGATACTGAAAACAATACGAAC	93928

AL627230.15	801	TTATGCCAGGTGCAATGGCTGATGCCTGTAATCTTAGCAATTTGGGAGGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	93929	TTATGCCAGGTGCAATGGCTGATGCCTGTAATCTTAGCAATTTGGGAGGC	93978

AL627230.15	851	CGAGGCATGGAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGAGCAGCCTGGCCAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	93979	CGAGGCATGGAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGAGCAGCCTGGCCAA	94028

AL627230.15	901	CCTGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAGTACAAAAAATTAGCTGGGCGTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	94029	CCTGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAGTACAAAAAATTAGCTGGGCGTG	94078

AL627230.15	951	GTGGCAGGCACCTGTAATTCCACCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGAAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	94079	GTGGCAGGCACCTGTAATTCCACCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGAAT	94128

AL627230.15	1001	CGCTTGAACCCAGGAGATGGAGGTTGCAATGAGCCAAGATCACACCACTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	94129	CGCTTGAACCCAGGAGATGGAGGTTGCAATGAGCCAAGATCACACCACTG	94178

AL627230.15	1051	CATTCCAGCCTGGGTGACAAGAGTAAAACTGCGTCAAGAAAAAAAAAAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	94179	CATTCCAGCCTGGGTGACAAGAGTAAAACTGCGTCAAGAAAAAAAAAAAA	94228

AL627230.15	1101	AAATTGGCCTTGGGCGTTTCTTTACGTTGGCTCCTGTGTTCTATTTATAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	94229	AAATTGGCCTTGGGCGTTTCTTTACGTTGGCTCCTGTGTTCTATTTATAG	94278

AL627230.15	1151	CATGCCTTTATCAGGGGGTTGGGGTGTGGGACTAATTACCAACTTTCTGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	94279	CATGCCTTTATCAGGGGGTTGGGGTGTGGGACTAATTACCAACTTTCTGG	94328

AL627230.15	1201	CACATAAAGTGTTTTGATTCATCTGGTATTTTCCCTGACCCAGACGTGAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	94329	CACATAAAGTGTTTTGATTCATCTGGTATTTTCCCTGACCCAGACGTGAA	94378

AL627230.15	1251	ATAAACCATTTATTTAAAGATCCTTGGCTTCTTTCATTGAAAAGTATTAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	94379	ATAAACCATTTATTTAAAGATCCTTGGCTTCTTTCATTGAAAAGTATTAT	94428

AL627230.15	1301	TTACAAAGCACCAAAATCTTGGGCTGGGTGAGGTGGCTCAGGTCTGTAAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	94429	TTACAAAGCACCAAAATCTTGGGCTGGGTGAGGTGGCTCAGGTCTGTAAT	94478

AL627230.15	1351	CTCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCCCTTGAGGCCAAGAGTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	94479	CTCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCCCTTGAGGCCAAGAGTT	94528

AL627230.15	1401	TGAGACAAGCTTGGGCAATGCAGTGAGACCCCCATCTCTATTTTTAAAAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	94529	TGAGACAAGCTTGGGCAATGCAGTGAGACCCCCATCTCTATTTTTAAAAA	94578

AL627230.15	1451	CCAAACAAAAACAAAATCGCCAAGATCGGGGTGACACGTGTGCTCATTGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	94579	CCAAACAAAAACAAAATCGCCAAGATCGGGGTGACACGTGTGCTCATTGC	94628

AL627230.15	1501	TATGGGTGTGTCATTGCTTCTAGGCCCTCTTAGTGGGCAGAACTAGGAAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	94629	TATGGGTGTGTCATTGCTTCTAGGCCCTCTTAGTGGGCAGAACTAGGAAA	94678

AL627230.15	1551	TATATTGTACGTATACTAACACACATGTCACATGCCTAATTTGTATATTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	94679	TATATTGTACGTATACTAACACACATGTCACATGCCTAATTTGTATATTT	94728

AL627230.15	1601	ATTTAGCCTTACTGGAAGCATTCTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	94729	ATTTAGCCTTACTGGAAGCATTCTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTC	94778

AL627230.15	1651	ACTCTGTCACCTAGGCTGGAGAGCAGTGGCATAATCTCAGCTCAATGCAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	94779	ACTCTGTCACCTAGGCTGGAGAGCAGTGGCATAATCTCAGCTCAATGCAA	94828

AL627230.15	1701	CCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAACCTCCTGAGTAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	94829	CCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAACCTCCTGAGTAG	94878

AL627230.15	1751	TTGGCACTACAGGTGCATGCCACCATGCCTGGTTAATTTTTGTATTTTTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	94879	TTGGCACTACAGGTGCATGCCACCATGCCTGGTTAATTTTTGTATTTTTA	94928

AL627230.15	1801	GTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTTGTCTGGAACTCCTGAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	94929	GTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTTGTCTGGAACTCCTGAC	94978

AL627230.15	1851	CTCAGTGGATCTGCCCCCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	94979	CTCAGTGGATCTGCCCCCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCA	95028

AL627230.15	1901	TGAGCCTCTGTGCCTGGCCAAGCATTTTTAATGGGAGTGATATTGCCCCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	95029	TGAGCCTCTGTGCCTGGCCAAGCATTTTTAATGGGAGTGATATTGCCCCT	95078

AL627230.15	1951	AAGAGGGTGAACATTGGTTATTGAAGGTAAAATGAATTATAGTTGTTGCA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL355151.11	95079	AAGAGGGTGAACATTGGTTATTGAAGGTAAAATGAATTATAGTTGTTGCA	95128

Overview

Query
AL627230.15 - 194246 bps
Hit
AL355151.11 - 95128 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link