<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL929000.6	62209	GAATTCTCAAACACGAAAATGAAAGCCTGACAAATAAGATGCTAATGCCA	62258
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	1	GAATTCTCAAACACGAAAATGAAAGCCTGACAAATAAGATGCTAATGCCA	50

AL929000.6	62259	TTTTCACTTAAAAAATAGAACAAGCGAAAGAGAGAAATAAAAGCACTAGC	62308
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	51	TTTTCACTTAAAAAATAGAACAAGCGAAAGAGAGAAATAAAAGCACTAGC	100

AL929000.6	62309	CCAGTAAGAACATCCTCTATTTGCCTTACTCATAAGCCATTTCAGGGCCA	62358
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	101	CCAGTAAGAACATCCTCTATTTGCCTTACTCATAAGCCATTTCAGGGCCA	150

AL929000.6	62359	TATCTGCAAAACTAGGAAGAAACTGCTAAGTGCTAAAACATTTTAACCAA	62408
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	151	TATCTGCAAAACTAGGAAGAAACTGCTAAGTGCTAAAACATTTTAACCAA	200

AL929000.6	62409	TCACTTTAAGAAAGGCAGAGGAAGCAAATCACTCTAGTAGATAAAACAGG	62458
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	201	TCACTTTAAGAAAGGCAGAGGAAGCAAATCACTCTAGTAGATAAAACAGG	250

AL929000.6	62459	AGAGACTGAAGTTGCTATAGTTGTAATCTTTTTAAAAATAATCTATTTGT	62508
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	251	AGAGACTGAAGTTGCTATAGTTGTAATCTTTTTAAAAATAATCTATTTGT	300

AL929000.6	62509	TTTGAAGAAAATCCCAATAGGAAGGTGTCTTCATTTTTAAAGGTATCTCT	62558
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	301	TTTGAAGAAAATCCCAATAGGAAGGTGTCTTCATTTTTAAAGGTATCTCT	350

AL929000.6	62559	CTTCAGATACTATTTAATATTCAATGTGCTAATAATGTCAAAAATTGTTA	62608
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	351	CTTCAGATACTATTTAATATTCAATGTGCTAATAATGTCAAAAATTGTTA	400

AL929000.6	62609	AATGCATATATATCTGTATTTCAAATAGGATAGTTTATCAAGTCAGGTTT	62658
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	401	AATGCATATATATCTGTATTTCAAATAGGATAGTTTATCAAGTCAGGTTT	450

AL929000.6	62659	TCCAAGAAGCTGATACTATGCAATTATAAGTCACTCAAAAGGTTATGAGA	62708
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	451	TCCAAGAAGCTGATACTATGCAATTATAAGTCACTCAAAAGGTTATGAGA	500

AL929000.6	62709	GGAACGTTAGATAAAGATTAAGAAGAAAAAGCAGATCTAAGTGCAGGGAG	62758
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	501	GGAACGTTAGATAAAGATTAAGAAGAAAAAGCAGATCTAAGTGCAGGGAG	550

AL929000.6	62759	TCTTCAGTGATGCAAGCCTGGCTTCTGTCAAAGGAGGGGGAGAAGGAAGA	62808
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	551	TCTTCAGTGATGCAAGCCTGGCTTCTGTCAAAGGAGGGGGAGAAGGAAGA	600

AL929000.6	62809	AGGATGAGAATGAAAGAGTCACAGCCTGAAACACAGTTTAGGAAGTTTTG	62858
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	601	AGGATGAGAATGAAAGAGTCACAGCCTGAAACACAGTTTAGGAAGTTTTG	650

AL929000.6	62859	GCCCGGACAATAGGAGTCTCCAGTCCAAAGTCTTCTGTTGGAAGGTTATC	62908
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	651	GCCCGGACAATAGGAGTCTCCAGTCCAAAGTCTTCTGTTGGAAGGTTATC	700

AL929000.6	62909	ACAAATCTTAAAAATGGCCTTCATCAATACTCCGAGCATGCTCAGTCATT	62958
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	701	ACAAATCTTAAAAATGGCCTTCATCAATACTCCGAGCATGCTCAGTCATT	750

AL929000.6	62959	GGCCAGGAACAGCCAGAGAAAATATGGTCTGAGTGCAAAGATAGTCATAC	63008
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	751	GGCCAGGAACAGCCAGAGAAAATATGGTCTGAGTGCAAAGATAGTCATAC	800

AL929000.6	63009	AACCAGAAAAACAGTAGCTGGGGCTGCCTGTCATCCATGCTCACTGAAGC	63058
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	801	AACCAGAAAAACAGTAGCTGGGGCTGCCTGTCATCCATGCTCACTGAAGC	850

AL929000.6	63059	AAGAGTTGTGAGTGGTGACCACATATATCAAATATTTCTATGAAAAAAAC	63108
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	851	AAGAGTTGTGAGTGGTGACCACATATATCAAATATTTCTATGAAAAAAAC	900

AL929000.6	63109	AAAACAAAACAAAACCCAATCAAGTGAAACTCCAAAATGATAACCTTTAA	63158
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	901	AAAACAAAACAAAACCCAATCAAGTGAAACTCCAAAATGATAACCTTTAA	950

AL929000.6	63159	TGCTTATTAGATGGCACAAGTGTTAGGTTGGGTATTTTACTAAATATTTA	63208
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	951	TGCTTATTAGATGGCACAAGTGTTAGGTTGGGTATTTTACTAAATATTTA	1000

AL929000.6	63209	ATCATTGTATATGCACATATTTATGGGCATGTGAGCTTAATTTCTGTTTT	63258
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	1001	ATCATTGTATATGCACATATTTATGGGCATGTGAGCTTAATTTCTGTTTT	1050

AL929000.6	63259	TAAATTCAGAATGCTTCAATAATAACATTGCATTTTATATAATCCTGATT	63308
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	1051	TAAATTCAGAATGCTTCAATAATAACATTGCATTTTATATAATCCTGATT	1100

AL929000.6	63309	TTCTTTTTTAAAATCAGCTCAAAAGGAGAAGTTAAATATTCAGCTTTAAT	63358
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	1101	TTCTTTTTTAAAATCAGCTCAAAAGGAGAAGTTAAATATTCAGCTTTAAT	1150

AL929000.6	63359	TTCACCAGTAGATTTTTAATGTTTTGTAATCATAATGTTTAATTTGTGCT	63408
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	1151	TTCACCAGTAGATTTTTAATGTTTTGTAATCATAATGTTTAATTTGTGCT	1200

AL929000.6	63409	GTTCTTAGAACTTTAATTATGAAGCTAAATTGTACTAATACCCATTAGGT	63458
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	1201	GTTCTTAGAACTTTAATTATGAAGCTAAATTGTACTAATACCCATTAGGT	1250

AL929000.6	63459	ACTTCTTAATTGAAGGCACATCATATGTCTGATGTGGCAGTACTAATTGG	63508
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	1251	ACTTCTTAATTGAAGGCACATCATATGTCTGATGTGGCAGTACTAATTGG	1300

AL929000.6	63509	TGTAATTAAATTCTAATATGCTTCAGTAGCCTGATTTTTTTAAGTGAATA	63558
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	1301	TGTAATTAAATTCTAATATGCTTCAGTAGCCTGATTTTTTTAAGTGAATA	1350

AL929000.6	63559	AAAAGCTGATAGAAATAAGTCAGCTCTTGAAGCTGCATAGTTGTATAATA	63608
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	1351	AAAAGCTGATAGAAATAAGTCAGCTCTTGAAGCTGCATAGTTGTATAATA	1400

AL929000.6	63609	CATACACGTGTTTGCATTTGTAACATGCACATTTATTCAGAAGAAACAAC	63658
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	1401	CATACACGTGTTTGCATTTGTAACATGCACATTTATTCAGAAGAAACAAC	1450

AL929000.6	63659	TCATTAATTTATTCTAAAACCATTTCACCTGATAACTTAAAATACAGAGT	63708
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	1451	TCATTAATTTATTCTAAAACCATTTCACCTGATAACTTAAAATACAGAGT	1500

AL929000.6	63709	AAAACAAATTGGTCAGGTAAATATACATGTAACTTAAAAAGAAACAGTCA	63758
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	1501	AAAACAAATTGGTCAGGTAAATATACATGTAACTTAAAAAGAAACAGTCA	1550

AL929000.6	63759	TGTACTTTAGGCATAAGGACAATGCTTTTCTCTTTTACAAATTCTAAGTT	63808
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	1551	TGTACTTTAGGCATAAGGACAATGCTTTTCTCTTTTACAAATTCTAAGTT	1600

AL929000.6	63809	AGGTCAAATTCTCTGAAAGTCACTACCTTTCTTTACTGTGATGTGTTTTC	63858
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	1601	AGGTCAAATTCTCTGAAAGTCACTACCTTTCTTTACTGTGATGTGTTTTC	1650

AL929000.6	63859	GGTGAAGTTACAGCCTATTTGCAAATCACATCACTGGTTTGTCCAAGCAG	63908
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	1651	GGTGAAGTTACAGCCTATTTGCAAATCACATCACTGGTTTGTCCAAGCAG	1700

AL929000.6	63909	AGGTAGATGAGAGGTAAGCTCCTGTCCTGCTAAAAGTCTCCTAAAAACAG	63958
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	1701	AGGTAGATGAGAGGTAAGCTCCTGTCCTGCTAAAAGTCTCCTAAAAACAG	1750

AL929000.6	63959	CAAGAAAATATTTTTACATGTTCAAAAATGCTCATTTATTTATATTCCTA	64008
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	1751	CAAGAAAATATTTTTACATGTTCAAAAATGCTCATTTATTTATATTCCTA	1800

AL929000.6	64009	AATTTTCTTTTACTCAGTATAATATAGATAATTTAAAAATAAGTAGAATA	64058
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	1801	AATTTTCTTTTACTCAGTATAATATAGATAATTTAAAAATAAGTAGAATA	1850

AL929000.6	64059	TTTTTATTATATATGTTTTATTTTTATACTTCTAGTTAAATTAATAGTGG	64108
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	1851	TTTTTATTATATATGTTTTATTTTTATACTTCTAGTTAAATTAATAGTGG	1900

AL929000.6	64109	AACATTATATATCTATTAAATGTTTTAAATTACATGGAATTAAAATATCA	64158
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	1901	AACATTATATATCTATTAAATGTTTTAAATTACATGGAATTAAAATATCA	1950

AL929000.6	64159	AAGTTAATTATGTTATTATAATTTTTAAATTTCAGAAACCTTCTTTAAAA	64208
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AL354718.10	1951	AAGTTAATTATGTTATTATAATTTTTAAATTTCAGAAACCTTCTTTAAAA	2000

Overview

Query
AL929000.6 - 64208 bps
Hit
AL354718.10 - 175271 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link