<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 945 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AF109719.2	1	CATATACCCGTGCTTCCCCGGTGTTTGGCTTTTGGATATTCTATCAGTGT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109905.1	134601	CATATACCCGTGCTTCCCCGGTGTTTGGCTTTTGGATATTCTATCAGTGT	134650

AF109719.2	51	TGCTTCCTGGATTTCTGCAACAATCCGGACAACAGAAAGAATAGCATGCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109905.1	134651	TGCTTCCTGGATTTCTGCAACAATCCGGACAACAGAAAGAATAGCATGCA	134700

AF109719.2	101	CTAGAACAGCAGGAACCCGCCACGTCCTGCCAGCTAACCTCCAGACTGGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109905.1	134701	CTAGAACAGCAGGAACCCGCCACGTCCTGCCAGCTAACCTCCAGACTGGA	134750

AF109719.2	151	TTTCCATCTGAGTCCATCAGGACAACTCCAAAGCCCTCACTCACTACAGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109905.1	134751	TTTCCATCTGAGTCCATCAGGACAACTCCAAAGCCCTCACTCACTACAGC	134800

AF109719.2	201	CTACATCGTTGACCCCACGTTGGCCTCCCCTCTCCATCCATACCCACAAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109905.1	134801	CTACATCGTTGACCCCACGTTGGCCTCCCCTCTCCATCCATACCCACAAT	134850

AF109719.2	251	GCTCTCCTACCTCTATTTTGTTCAGCCCCCTCTTTGGTCCAAAGTTCCCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109905.1	134851	GCTCTCCTACCTCTATTTTGTTCAGCCCCCTCTTTGGTCCAAAGTTCCCC	134900

AF109719.2	301	CCAAATAAAATAGTATGCAAAGTGTTTGTCGTCTCCTCTGATGGAGGTGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109905.1	134901	CCAAATAAAATAGTATGCAAAGTGTTTGTCGTCTCCTCTGATGGAGGTGA	134950

AF109719.2	351	AGCTAGCCTGTCATAGGGCTCCTCTACTGCCCAGCCCTAGACATATAAAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109905.1	134951	AGCTAGCCTGTCATAGGGCTCCTCTACTGCCCAGCCCTAGACATATAAAA	135000

AF109719.2	401	TTGAAGAGGGACTGGATGCCCTTCTATGGTGAAGGTTGGGTTGGTTAGAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109905.1	135001	TTGAAGAGGGACTGGATGCCCTTCTATGGTGAAGGTTGGGTTGGTTAGAT	135050

AF109719.2	451	TAATAGGTATCCTGAGAGGTACTGTCAGACCAGAGCTGCGTGGGGGAGAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109905.1	135051	TAATAGGTATCCTGAGAGGTACTGTCAGACCAGAGCTGCGTGGGGGAGAA	135100

AF109719.2	501	CTGAGAGGGCTCGGGGGCTATATTGGCAAGATACAGAATATGAGCAATAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109905.1	135101	CTGAGAGGGCTCGGGGGCTATATTGGCAAGATACAGAATATGAGCAATAA	135150

AF109719.2	551	GGATATATAAGCAATATAAGCAATCCCAGGGAGGAGGGATGCTCGAGGAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109905.1	135151	GGATATATAAGCAATATAAGCAATCCCAGGGAGGAGGGATGCTCGAGGAG	135200

AF109719.2	601	GACACTGGGGAGGGGACAGTAGGCTCAAGAAAACCAAGGAACTCTCTGAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109905.1	135201	GACACTGGGGAGGGGACAGTAGGCTCAAGAAAACCAAGGAACTCTCTGAC	135250

AF109719.2	651	TTCCAAGTTTAGTGTCCCTTCCTAAACCTGGCTCCCAGTTTGACCAATTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109905.1	135251	TTCCAAGTTTAGTGTCCCTTCCTAAACCTGGCTCCCAGTTTGACCAATTA	135300

AF109719.2	701	AATCTGACCAGGGTCCATCTGGGGAGGGAGTGTGGATTTTACTGTAGACC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109905.1	135301	AATCTGACCAGGGTCCATCTGGGGAGGGAGTGTGGATTTTACTGTAGACC	135350

AF109719.2	751	CCTTACTGGCCTCCAACTCCAGATTGTCCCTCCTCAATTTCCCGAGTGTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109905.1	135351	CCTTACTGGCCTCCAACTCCAGATTGTCCCTCCTCAATTTCCCGAGTGTT	135400

AF109719.2	801	AACATTACAGCCTGTACCACACAAGCTGCTGTGAGCAGCGTCTACCTGAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109905.1	135401	AACATTACAGCCTGTACCACACAAGCTGCTGTGAGCAGCGTCTACCTGAG	135450

AF109719.2	851	TTAGGAGTGCTCAGGAAGGGCATGAGGGCACACTGGGTGCTGGCCAAGGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109905.1	135451	TTAGGAGTGCTCAGGAAGGGCATGAGGGCACACTGGGTGCTGGCCAAGGC	135500

AF109719.2	901	GTCTGCTGACTGAATAGCTTCCTCTGGTGTGTTTGTGACAAGCTT	945
			|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AF109905.1	135501	GTCTGCTGACTGAATAGCTTCCTCTGGTGTGTTTGTGACAAGCTT	135545

Overview

Query
AF109719.2 - 120990 bps
Hit
AF109905.1 - 135545 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 945 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link