<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL662920.14	1	TACTAACTGGAAAAAAATATTTTGTTTGGGACTTATAGATCTATACATTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	226934	TACTAACTGGAAAAAAATATTTTGTTTGGGACTTATAGATCTATACATTA	226983

AL662920.14	51	AATTATTCTATTAAATGTAACATTTCTATACACTTAAAAATCTTTAACAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	226984	AATTATTCTATTAAATGTAACATTTCTATACACTTAAAAATCTTTAACAT	227033

AL662920.14	101	GCAAGTGCCTAAAATAAAGTGTCTATGCTGCCAAGTGTGGCAGGAGCTGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	227034	GCAAGTGCCTAAAATAAAGTGTCTATGCTGCCAAGTGTGGCAGGAGCTGC	227083

AL662920.14	151	CTATAATCCCAACCCTCAGAAGGTGGATGCAGGGAGGTAGTGTCAAGCCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	227084	CTATAATCCCAACCCTCAGAAGGTGGATGCAGGGAGGTAGTGTCAAGCCA	227133

AL662920.14	201	GCCTGGACTACATAGAAAGACACTGTTTCAATAAACTCAGTGACAGGTAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	227134	GCCTGGACTACATAGAAAGACACTGTTTCAATAAACTCAGTGACAGGTAT	227183

AL662920.14	251	ATAACACTCAATGAAAGAGCAATTGCATAACATATAAAGACTGGTTATGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	227184	ATAACACTCAATGAAAGAGCAATTGCATAACATATAAAGACTGGTTATGA	227233

AL662920.14	301	CACCCCCAATCACCAAAGAAGTGGTTATATAAAATATGTAGGATTTGCCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	227234	CACCCCCAATCACCAAAGAAGTGGTTATATAAAATATGTAGGATTTGCCT	227283

AL662920.14	351	GTATAATTTTGATGTTATAGACAATAGTTTAGGCTTAGTCTTCTAGAGTA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	227284	GTATAATTTTGATGTTATAGACAATAGTTTAGGCTTAGTCTTCTAGAGTA	227333

AL662920.14	401	CTTAGGGTTTTTTATTAATTAATTAATTAATTAATTCACTTTACATCCCA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	227334	CTTAGGGTTTTTTATTAATTAATTAATTAATTAATTCACTTTACATCCCA	227383

AL662920.14	451	ATTGCAGCTCCCCATCTCTCCTCTCTTCCTAGTCCCTCCATTACAAATTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	227384	ATTGCAGCTCCCCATCTCTCCTCTCTTCCTAGTCCCTCCATTACAAATTC	227433

AL662920.14	501	CTCCTGCCATTATTTCCTCCCCTTCTGCTCAGAGAAAGGGAAGCTCTGCT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	227434	CTCCTGCCATTATTTCCTCCCCTTCTGCTCAGAGAAAGGGAAGCTCTGCT	227483

AL662920.14	551	TTGGTACCACCTCACCCTGGGACTTCCAGTCACAGTAGACCTAAATACAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	227484	TTGGTACCACCTCACCCTGGGACTTCCAGTCACAGTAGACCTAAATACAT	227533

AL662920.14	601	CCTCTTCCACTGAGGCCCAACCAGGTAGTTCAGTTAGGGGAAGGGAATTC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	227534	CCTCTTCCACTGAGGCCCAACCAGGTAGTTCAGTTAGGGGAAGGGAATTC	227583

AL662920.14	651	CATGGCAAGGAAACAAGTCAGAGACAGCCTCCTCTACAATTGTTAGGGGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	227584	CATGGCAAGGAAACAAGTCAGAGACAGCCTCCTCTACAATTGTTAGGGGA	227633

AL662920.14	701	CCCATATGAAGACTAAGCTACACATCTGCTACAAATGCGTAGGAAGTTGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	227634	CCCATATGAAGACTAAGCTACACATCTGCTACAAATGCGTAGGAAGTTGA	227683

AL662920.14	751	GTACCTGCTTTTATTTTTTAACTAGTGCTTAAAAACACAGGGAGCTGGGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	227684	GTACCTGCTTTTATTTTTTAACTAGTGCTTAAAAACACAGGGAGCTGGGG	227733

AL662920.14	801	GGGGGGGGGGATCTGTAACCCTATAGGTGGAACAACAATATGAACTAACC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	227734	GGGGGGGGGGATCTGTAACCCTATAGGTGGAACAACAATATGAACTAACC	227783

AL662920.14	851	AGTACCCCCACACACACCCCCAGCTCGTGTCTCTAGCTGCATATGTATCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	227784	AGTACCCCCACACACACCCCCAGCTCGTGTCTCTAGCTGCATATGTATCA	227833

AL662920.14	901	GAAGATGGCCTGGGCAGCCATCAGTGGAAAGAGAGGCCCATTGGACATGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	227834	GAAGATGGCCTGGGCAGCCATCAGTGGAAAGAGAGGCCCATTGGACATGC	227883

AL662920.14	951	AAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAAGAGCAGGGCCAAGAGGTGGGAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	227884	AAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAAGAGCAGGGCCAAGAGGTGGGAG	227933

AL662920.14	1001	TGGGTGGGTGGGGGAGTGGATGTGGGAGGGTGTGGGGGACTTTTGGGATA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	227934	TGGGTGGGTGGGGGAGTGGATGTGGGAGGGTGTGGGGGACTTTTGGGATA	227983

AL662920.14	1051	GCATTGGAAATGTAAATGAAATAAATACCTAATAATAATTAAAAAATTAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	227984	GCATTGGAAATGTAAATGAAATAAATACCTAATAATAATTAAAAAATTAA	228033

AL662920.14	1101	AACAAAACCCACGAGTGTTCTATTTGATAACAATTAGTATTAAGGAAGTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	228034	AACAAAACCCACGAGTGTTCTATTTGATAACAATTAGTATTAAGGAAGTA	228083

AL662920.14	1151	TTAGCAATTTCCTTTTATTTTAGGTTGAGCAGTTAGAAGTTTAAGGAGAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	228084	TTAGCAATTTCCTTTTATTTTAGGTTGAGCAGTTAGAAGTTTAAGGAGAA	228133

AL662920.14	1201	TTATAGTTTAATGTAATAGCTTTTCTTCTTAAGTTAATAATATCCATCAG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	228134	TTATAGTTTAATGTAATAGCTTTTCTTCTTAAGTTAATAATATCCATCAG	228183

AL662920.14	1251	GCAGTGGTGGCACATGCCTTTAATGCCTTGGGAGGCAGAGGCAGGTGATT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	228184	GCAGTGGTGGCACATGCCTTTAATGCCTTGGGAGGCAGAGGCAGGTGATT	228233

AL662920.14	1301	TCCAAGTTCGAGTCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGAGAGCCAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	228234	TCCAAGTTCGAGTCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGAGAGCCAG	228283

AL662920.14	1351	AACTCTATAGAGGAACACTGTCTTGGAAAAACAAAGAAAAGAATTAGTAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	228284	AACTCTATAGAGGAACACTGTCTTGGAAAAACAAAGAAAAGAATTAGTAA	228333

AL662920.14	1401	CACTACAAACAAAATGGCTTCATTTCCATTTCTGCCACTTCCTCCTTCTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	228334	CACTACAAACAAAATGGCTTCATTTCCATTTCTGCCACTTCCTCCTTCTT	228383

AL662920.14	1451	GCCTGTAATCATCTTCTGGGTTCTGCCATGTGGGCTCTCAAGTTATTTCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	228384	GCCTGTAATCATCTTCTGGGTTCTGCCATGTGGGCTCTCAAGTTATTTCT	228433

AL662920.14	1501	GACTTTTGCTTCTGGTTCTTTACCCAGTTATTCCCTGGACCTATTACCAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	228434	GACTTTTGCTTCTGGTTCTTTACCCAGTTATTCCCTGGACCTATTACCAG	228483

AL662920.14	1551	ACTTCTTTTCTTCCCTGACCTTTTGCTGCCTCCTGAAAGAGTCAACTGTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	228484	ACTTCTTTTCTTCCCTGACCTTTTGCTGCCTCCTGAAAGAGTCAACTGTA	228533

AL662920.14	1601	AGCCAGAGTCCTCATACAATCTTTTAGTCCTTGCTCATGGCCCCCATTAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	228534	AGCCAGAGTCCTCATACAATCTTTTAGTCCTTGCTCATGGCCCCCATTAA	228583

AL662920.14	1651	GTGATTCTCCCAAATGCCCACAGGTACCCTGAACTCAGTTGTGGTGTTTA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	228584	GTGATTCTCCCAAATGCCCACAGGTACCCTGAACTCAGTTGTGGTGTTTA	228633

AL662920.14	1701	GTATAGCATAGTACAGTACAGTGCAGTATATAGTAGAGTAGTCAACTGCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	228634	GTATAGCATAGTACAGTACAGTGCAGTATATAGTAGAGTAGTCAACTGCT	228683

AL662920.14	1751	TGTTGACCAGCGTGAAGGATCCAGGCAATCAATAGCCTGAGGTATCTACT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	228684	TGTTGACCAGCGTGAAGGATCCAGGCAATCAATAGCCTGAGGTATCTACT	228733

AL662920.14	1801	TTTCCCTTACTAGTAGAAGACAGTTGGTACCAAGGTCCATGAATTATTAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	228734	TTTCCCTTACTAGTAGAAGACAGTTGGTACCAAGGTCCATGAATTATTAT	228783

AL662920.14	1851	AAATTTTTAAGGTAAATAAAAATTTTATTTCTCCATCTTCACTGAACTTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	228784	AAATTTTTAAGGTAAATAAAAATTTTATTTCTCCATCTTCACTGAACTTC	228833

AL662920.14	1901	TTATTTTAGATTTTCTCTACTTTTCCCAAATTAAAGCAGTGTTCTTCTGA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	228834	TTATTTTAGATTTTCTCTACTTTTCCCAAATTAAAGCAGTGTTCTTCTGA	228883

AL662920.14	1951	GTCTTTCTTGATTTGTTTCTCCCACCAATAATAATGCTACTGTTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC101661.7	228884	GTCTTTCTTGATTTGTTTCTCCCACCAATAATAATGCTACTGTTGAATTC	228933

Overview

Query
AL662920.14 - 146582 bps
Hit
AC101661.7 - 228933 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link