<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 10188 bps / non-identical: 400 bps

Full alignment

C  AC113211.5	10188	GAATTCCATGATTTTTTGAAGCTCTTAGAGCTGAATTAAATCGCCAGGGG	10139
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	1	GAATTCCATGATTTTTTGAAGCTCTTAGAGCTGAATTAAATCGCCAGGGG	50

C  AC113211.5	10138	CTCTATGAGCTGTAGCTCTAAGGCCCTGAAGCACAGGTTTCTGCAAAGTC	10089
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	51	CTCTATGAGCTGTAGCTCTAAGGCCCTGAAGCACAGGTTTCTGCAAAGTC	100

C  AC113211.5	10088	TCTGGTGAATGGCACCCTGAGCAGCTCCTCTCTGGGGTCCTCCTGCAAGG	10039
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	101	TCTGGTGAATGGCACCCTGAGCAGCTCCTCTCTGGGGTCCTCCTGCAAGG	150

C  AC113211.5	10038	CAGTCATGTTTGTCTTTGAACACACAGGCGCAGTAGGGTCTATATAACCT	9989
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	151	CAGTCATGTTTGTCTTTGAACACACAGGCGCAGTAGGGTCTATATAACCT	200

C  AC113211.5	9988	GACATATGCAGCCTAAAAATCACCAGAGTTTGCTAAGCCATGTGATAAGA	9939
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	201	GACATATGCAGCCTAAAAATCACCAGAGTTTGCTAAGCCATGTGATAAGA	250

C  AC113211.5	9938	ACCACAGGGCTTACGGGAAAAACAGGATTAAAAACACAACACTTGAGGCC	9889
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	251	ACCACAGGGCTTACGGGAAAAACAGGATTAAAAACACAACACTTGAGGCC	300

C  AC113211.5	9888	GGGCGCAGTGGCTCATGCCTTCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCG	9839
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	301	GGGCGCAGTGGCTCATGCCTTCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCG	350

C  AC113211.5	9838	GGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACGGTG	9789
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	351	GGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACGGTG	400

C  AC113211.5	9788	AAACTCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTTAGCTGAGCGTGGTGGTGG	9739
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	401	AAACTCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTTAGCTGAGCGTGGTGGTGG	450

C  AC113211.5	9738	GCGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGA	9689
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	451	GCGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGA	500

C  AC113211.5	9688	GCCCGGGAGGCGAAGGTTGCCGTGAGCCGAGATTACGCCACTGTACTCCA	9639
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	501	GCCCGGGAGGCGAAGGTTGCCGTGAGCCGAGATTACGCCACTGTACTCCA	550

C  AC113211.5	9638	GACTAGGTGACAGAATGAGACTCTGTCTCTGAAATAAACTTTTTTAAAAA	9589
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	551	GACTAGGTGACAGAATGAGACTCTGTCTCTGAAATAAACTTTTTTAAAAA	600

C  AC113211.5	9588	GCACAACACTTGAAAACTTCCTCAGCGACACATTTTGTTTGTTTTGAGAT	9539
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	601	GCACAACACTTGAAAACTTCCTCAGCGACACATTTTGTTTGTTTTGAGAT	650

C  AC113211.5	9538	GGAGTCTTGTTCTGGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGC	9489
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	651	GGAGTCTTGTTCTGGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGC	700

C  AC113211.5	9488	TCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTTAGCTT	9439
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	701	TCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTTAGCTT	750

C  AC113211.5	9438	CCTGAGTAGTGGGGATTACACCACTATGCCTAGCTAATGCGCGTACCACC	9389
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
  AC091199.6	751	CCTGAGTAGTGGGGATTACACCACTATGCCTAGCTAATGCGTGTACCACC	800

C  AC113211.5	9388	ATACCCAGCTAATTTTTGTATGTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTT	9339
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	801	ATACCCAGCTAATTTTTGTATGTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTT	850

C  AC113211.5	9338	GGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTCGGC	9289
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
  AC091199.6	851	GGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTCAGC	900

C  AC113211.5	9288	CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCAACAC	9239
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	901	CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCAACAC	950

C  AC113211.5	9238	ATTTTTAAA-GATAAGAATCCAATAAAAAGATTACCAGAGTTTTATACCC	9190
			||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
  AC091199.6	951	ATTTTTAAAAGATAAGAATCCAATAAAAAGATTACCACAGTTTTATACCC	1000

C  AC113211.5	9189	GTTAAATAGTTAAGAAATATATCAATGCTATACAATAGTAAATATGGCAA	9140
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	1001	GTTAAATAGTTAAGAAATATATCAATGCTATACAATAGTAAATATGGCAA	1050

C  AC113211.5	9139	GTTTGCCTAGGGAAGTGGGCATCAGAAGTGCTGCGGGTTGTGAGTTACTG	9090
			||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
  AC091199.6	1051	GTTTGCCTAGGGAAGTGGGCATCAGAAGTGCTGTGGGTTGTGAGTTACTG	1100

C  AC113211.5	9089	TGAAGCAGTGGAGAAAGGGTTATCTGACATGGGAAGGAAAAGATGTGACT	9040
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	1101	TGAAGCAGTGGAGAAAGGGTTATCTGACATGGGAAGGAAAAGATGTGACT	1150

C  AC113211.5	9039	CCATATTGCATGGATGTGTCTTACCAGTGCACACAGTGGACCGAGGCAGC	8990
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
  AC091199.6	1151	CCATATTGCATGGATGTGTCTTACCAGTGCACACAGTGGACCGAGGCGGC	1200

C  AC113211.5	8989	TGGTGGATGTTTGAGGTGCGCATATGTACACACAGGAGCATTGTTAGTAT	8940
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	1201	TGGTGGATGTTTGAGGTGCGCATATGTACACACAGGAGCATTGTTAGTAT	1250

C  AC113211.5	8939	TCTCCTATGTGGTTCCATTCAGCTGGATGCAGGCTTCTGAATTCACTAAG	8890
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	1251	TCTCCTATGTGGTTCCATTCAGCTGGATGCAGGCTTCTGAATTCACTAAG	1300

C  AC113211.5	8889	TGTTTTCCAAATGTGAAATTGACATTACACTCAAATTATCCCCAATATGT	8840
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	1301	TGTTTTCCAAATGTGAAATTGACATTACACTCAAATTATCCCCAATATGT	1350

C  AC113211.5	8839	CTATATAATTGGAACAGATTTACACTTTCACTACAATAAATACACAACTG	8790
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	1351	CTATATAATTGGAACAGATTTACACTTTCACTACAATAAATACACAACTG	1400

C  AC113211.5	8789	ACTGTATTTTCTACTTCTGCTAGACGTGATGCTCCTTGTCTGGGGCATGG	8740
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	1401	ACTGTATTTTCTACTTCTGCTAGACGTGATGCTCCTTGTCTGGGGCATGG	1450

C  AC113211.5	8739	GTGCTCAAAGCTGCTGGGGTTTCATTCCTTCAGTCAATAAATATGCACAG	8690
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	1451	GTGCTCAAAGCTGCTGGGGTTTCATTCCTTCAGTCAATAAATATGCACAG	1500

C  AC113211.5	8689	TACCAGGCAGTCTGCTAGGCTATAAGGATGCAACAAGTAAAGACTCATCT	8640
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	1501	TACCAGGCAGTCTGCTAGGCTATAAGGATGCAACAAGTAAAGACTCATCT	1550

C  AC113211.5	8639	CTTTCTTTAAGAGGCAGAGAAAAGTAAACATATCATCAGCGTGCATGCAG	8590
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	1551	CTTTCTTTAAGAGGCAGAGAAAAGTAAACATATCATCAGCGTGCATGCAG	1600

C  AC113211.5	8589	GGTGACTGACTCCTGCCGTAAGTCTCTGTCTAGTGCATGTAAAATACAAA	8540
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	1601	GGTGACTGACTCCTGCCGTAAGTCTCTGTCTAGTGCATGTAAAATACAAA	1650

C  AC113211.5	8539	GGAAGGAGCAGCCATCTCCCAGGATGAATCAAGAAGAGCTTCACAGGGGG	8490
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	1651	GGAAGGAGCAGCCATCTCCCAGGATGAATCAAGAAGAGCTTCACAGGGGG	1700

C  AC113211.5	8489	GCGACATGTGACACGAGATGCTTTCCAGGCAGAGGAAACAGCAAAGGTGC	8440
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	1701	GCGACATGTGACACGAGATGCTTTCCAGGCAGAGGAAACAGCAAAGGTGC	1750

C  AC113211.5	8439	AGAGGCAGGAGATGGTCAGGCCATTTGAGAAGTGCATTAAGATTGTGGTG	8390
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	1751	AGAGGCAGGAGATGGTCAGGCCATTTGAGAAGTGCATTAAGATTGTGGTG	1800

C  AC113211.5	8389	AGAGATAATGCAAATAAAACAGACGAATCACAAAGGCCCAGTTCTGCCAG	8340
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	1801	AGAGATAATGCAAATAAAACAGACGAATCACAAAGGCCCAGTTCTGCCAG	1850

C  AC113211.5	8339	TCTCAGGTGTTGGGGCTTTTCTGGAAAGCAGTGAGGAGCCATCAGATGTT	8290
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	1851	TCTCAGGTGTTGGGGCTTTTCTGGAAAGCAGTGAGGAGCCATCAGATGTT	1900

C  AC113211.5	8289	TCCAAGCAGAGCAGAGGCATGGTGTGACTTTGTTTTAGAAAGATATCCCA	8240
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	1901	TCCAAGCAGAGCAGAGGCATGGTGTGACTTTGTTTTAGAAAGATATCCCA	1950

C  AC113211.5	8239	GGCTGCAGCAGTGTGAAAGGACCCTAGAGACGGTGCTGGCACAGGAAGGC	8190
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	1951	GGCTGCAGCAGTGTGAAAGGACCCTAGAGACGGTGCTGGCACAGGAAGGC	2000

C  AC113211.5	8189	AGAGCAAGGATGCTGGCTTCTTGGAACCATGCACCTGTGCCATGCCTTTG	8140
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	2001	AGAGCAAGGATGCTGGCTTCTTGGAACCATGCACCTGTGCCATGCCTTTG	2050

C  AC113211.5	8139	GCACTTCTGACCAGTCATATTGGATAGAAACCGAATGATCTGCGTCTGTA	8090
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	2051	GCACTTCTGACCAGTCATATTGGATAGAAACCGAATGATCTGCGTCTGTA	2100

C  AC113211.5	8089	TCCAGGAATAGCCCAACACCCATGATGCTGATGCCTAGGAATAGAGGAAA	8040
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	2101	TCCAGGAATAGCCCAACACCCATGATGCTGATGCCTAGGAATAGAGGAAA	2150

C  AC113211.5	8039	GTAGATGATCTACTCACCAGGGCCTCAGGGATGTCTCAACTCCACCTTGG	7990
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	2151	GTAGATGATCTACTCACCAGGGCCTCAGGGATGTCTCAACTCCACCTTGG	2200

C  AC113211.5	7989	ATGGCTTTTGCTGCTGGACACAATTGCTGTGGTTCATAGAGCCAACAATG	7940
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	2201	ATGGCTTTTGCTGCTGGACACAATTGCTGTGGTTCATAGAGCCAACAATG	2250

C  AC113211.5	7939	GGGATGGGGCCAGTGAGTGGCTTGAGCTAGGAAGTAAGTAGAAGGTGAAT	7890
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	2251	GGGATGGGGCCAGTGAGTGGCTTGAGCTAGGAAGTAAGTAGAAGGTGAAT	2300

C  AC113211.5	7889	GGCTACCATCTGCCACTGTCATTTCTCCTATGGGTCCTCTGTGGCTATTA	7840
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	2301	GGCTACCATCTGCCACTGTCATTTCTCCTATGGGTCCTCTGTGGCTATTA	2350

C  AC113211.5	7839	ACCTGGCATCTTTGGTTAATCAATATTAAACCAGAGCCCTTGTCATATGT	7790
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	2351	ACCTGGCATCTTTGGTTAATCAATATTAAACCAGAGCCCTTGTCATATGT	2400

C  AC113211.5	7789	TCACTTTAAGAACTTGCATTGGTGAAGGAAGAAGGGAAGATGCTATTCCA	7740
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	2401	TCACTTTAAGAACTTGCATTGGTGAAGGAAGAAGGGAAGATGCTATTCCA	2450

C  AC113211.5	7739	TTTCTTAATGCTTCCTAACACAGTGCCTGGCACATGGTAGGTGCTCAATA	7690
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	2451	TTTCTTAATGCTTCCTAACACAGTGCCTGGCACATGGTAGGTGCTCAATA	2500

C  AC113211.5	7689	AAGTGGCACGACCTCAGCCTTCCTAAAAATGTCTTTTAAACAAGGACAGT	7640
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	2501	AAGTGGCACGACCTCAGCCTTCCTAAAAATGTCTTTTAAACAAGGACAGT	2550

C  AC113211.5	7639	GCCAAAGTAGGAGGAATTGACGTGTTTTCAGCAACTGTTATGTGCCCAGC	7590
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	2551	GCCAAAGTAGGAGGAATTGACGTGTTTTCAGCAACTGTTATGTGCCCAGC	2600

C  AC113211.5	7589	ATGATCTGGGTATTTGGACATCCATTAACTCATTCCGTTCTCTTCCCAAT	7540
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	2601	ATGATCTGGGTATTTGGACATCCATTAACTCATTCCGTTCTCTTCCCAAT	2650

C  AC113211.5	7539	GACCTGACAGATGGATATTGTTAACAGTAAGGAACTGAAGCTCAGGGAGG	7490
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	2651	GACCTGACAGATGGATATTGTTAACAGTAAGGAACTGAAGCTCAGGGAGG	2700

C  AC113211.5	7489	TTAAGTAACTTCCCAAGATCACACAGGTCTTACAGGGTAGAGCCAAGATT	7440
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	2701	TTAAGTAACTTCCCAAGATCACACAGGTCTTACAGGGTAGAGCCAAGATT	2750

C  AC113211.5	7439	TAAACCCAGGTCACCTGGCTCCAGAGCCTACACACTTTGCACTTATTTTT	7390
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	2751	TAAACCCAGGTCACCTGGCTCCAGAGCCTACACACTTTGCACTTATTTTT	2800

C  AC113211.5	7389	GTTCTCACTTCAAGTGCTCTTCTGAGTTTTTGAAATATAGGAGGACTGGC	7340
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	2801	GTTCTCACTTCAAGTGCTCTTCTGAGTTTTTGAAATATAGGAGGACTGGC	2850

C  AC113211.5	7339	CTCTCCTTCCTCTAACAAGAGCACCTATTTTTGGTGTACACCTTGTGATG	7290
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	2851	CTCTCCTTCCTCTAACAAGAGCACCTATTTTTGGTGTACACCTTGTGATG	2900

C  AC113211.5	7289	CGCCCCCACCCCGCCCCCTCATAAGATGGCTGGCTGATTACAGCCACCCT	7240
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	2901	CGCCCCCACCCCGCCCCCTCATAAGATGGCTGGCTGATTACAGCCACCCT	2950

C  AC113211.5	7239	CTCAGGGGCCAGTGATTGCCACATGCTTGGTGAGAGGAGCATCGTGGGAA	7190
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	2951	CTCAGGGGCCAGTGATTGCCACATGCTTGGTGAGAGGAGCATCGTGGGAA	3000

C  AC113211.5	7189	CACCTGCAGGTGGATCTGGGGCTGATGAGCAGCCTTGTGCCTGGCTCCCA	7140
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	3001	CACCTGCAGGTGGATCTGGGGCTGATGAGCAGCCTTGTGCCTGGCTCCCA	3050

C  AC113211.5	7139	TCACACTGCTGTGACAATGGCCCCCTCCCCACAGTGGGCCGTCCTCTGGC	7090
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	3051	TCACACTGCTGTGACAATGGCCCCCTCCCCACAGTGGGCCGTCCTCTGGC	3100

C  AC113211.5	7089	TTATAGATGAGGAAGCTGGTGCTCACCCAAGAAATTGATAGCAGAGCTGA	7040
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	3101	TTATAGATGAGGAAGCTGGTGCTCACCCAAGAAATTGATAGCAGAGCTGA	3150

C  AC113211.5	7039	GATTAAAACAGGGATCCCCCAGTTTCCAGCCGAGCCTCTATCACTTAACC	6990
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	3151	GATTAAAACAGGGATCCCCCAGTTTCCAGCCGAGCCTCTATCACTTAACC	3200

C  AC113211.5	6989	AGGGGCTTTTAAAGGAACGTTCAAAGGTCTAGGCTCATCTGTCTTTTGAC	6940
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	3201	AGGGGCTTTTAAAGGAACGTTCAAAGGTCTAGGCTCATCTGTCTTTTGAC	3250

C  AC113211.5	6939	AGAGCAGCTCCACCGTTATATTTCTTATATAATAAAGTTTTGTTGGGGAG	6890
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	3251	AGAGCAGCTCCACCGTTATATTTCTTATATAATAAAGTTTTGTTGGGGAG	3300

C  AC113211.5	6889	AAAACAAAGTATAAAAACCACAGCAGCCTTGGAATATGCTGCCTGGATTC	6840
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	3301	AAAACAAAGTATAAAAACCACAGCAGCCTTGGAATATGCTGCCTGGATTC	3350

C  AC113211.5	6839	TAACAAATGGCTCTTGAGTCTCTCCTGACATGCTCCCTTGTAAAGAAGCC	6790
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	3351	TAACAAATGGCTCTTGAGTCTCTCCTGACATGCTCCCTTGTAAAGAAGCC	3400

C  AC113211.5	6789	TTTTGTTTCCTGCGGAAATCCTTGGTTAATTATTTTTAAATAAATAATTG	6740
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	3401	TTTTGTTTCCTGCGGAAATCCTTGGTTAATTATTTTTAAATAAATAATTG	3450

C  AC113211.5	6739	CGTAGCCTTTGGTAGGGGAGAAGCCTCCTTGTTACCCATATTTGATCATC	6690
			|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
  AC091199.6	3451	CGTAGCCTTTGGTAGGGGAGAAGCCTCCTTGTGACCCATATTTGATCATC	3500

C  AC113211.5	6689	AGAGGGCTGGCCCTTTTCCATCAGCCAAATTAAATAGGCTAAATCCAGAG	6640
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	3501	AGAGGGCTGGCCCTTTTCCATCAGCCAAATTAAATAGGCTAAATCCAGAG	3550

C  AC113211.5	6639	ACTGTTTGACTTGAGACTGAATCGATGATGGGGACAGGCTGGGAGGTGAA	6590
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	3551	ACTGTTTGACTTGAGACTGAATCGATGATGGGGACAGGCTGGGAGGTGAA	3600

C  AC113211.5	6589	AACACAACTGACTCCCAGCGTTATCAACACTCTCTCAGGAGCAGAGCCTC	6540
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	3601	AACACAACTGACTCCCAGCGTTATCAACACTCTCTCAGGAGCAGAGCCTC	3650

C  AC113211.5	6539	TCGGGGAGGTAAATAGCTGGTTAGGGAGTCAGAGAAAGCAGGAGAAAAAC	6490
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	3651	TCGGGGAGGTAAATAGCTGGTTAGGGAGTCAGAGAAAGCAGGAGAAAAAC	3700

C  AC113211.5	6489	AGGGTGAAGTCCAGTTCCTCCAAAAGAACAGAGCAAGAGGGCAGCGGCTA	6440
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	3701	AGGGTGAAGTCCAGTTCCTCCAAAAGAACAGAGCAAGAGGGCAGCGGCTA	3750

C  AC113211.5	6439	GACCTCTCTCCCAGGTTGCTTCCAGGGCAAAGCATCAGTGGTTCTGCCAG	6390
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	3751	GACCTCTCTCCCAGGTTGCTTCCAGGGCAAAGCATCAGTGGTTCTGCCAG	3800

C  AC113211.5	6389	GGTAGGATTCTTTGGAAACTGTTCTCTACGGAAAGATAATTCCATTCAGT	6340
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	3801	GGTAGGATTCTTTGGAAACTGTTCTCTACGGAAAGATAATTCCATTCAGT	3850

C  AC113211.5	6339	GTTTAGAATCTGTCCTAAGCCATCTAGAATTCTAGGATCTTAGGGCAAAT	6290
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	3851	GTTTAGAATCTGTCCTAAGCCATCTAGAATTCTAGGATCTTAGGGCAAAT	3900

C  AC113211.5	6289	ATCTTGGGGTCCATTCCTGTACCAGCTTCCTCCCCACAGCATCCCCACCC	6240
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	3901	ATCTTGGGGTCCATTCCTGTACCAGCTTCCTCCCCACAGCATCCCCACCC	3950

C  AC113211.5	6239	ATAGTTGCCATTTATATGGCATTTTGCAAGAAACTGTATAGATGTTACCT	6190
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	3951	ATAGTTGCCATTTATATGGCATTTTGCAAGAAACTGTATAGATGTTACCT	4000

C  AC113211.5	6189	CTAATCCAAAAAGAGTCCTGTTGAGGAGGCATTCTCTCCATTTTTCTAGA	6140
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	4001	CTAATCCAAAAAGAGTCCTGTTGAGGAGGCATTCTCTCCATTTTTCTAGA	4050

C  AC113211.5	6139	GGAAACAAAGGCACAGAGAGGGAAAGTAATTTTCCCATGATCACAGATCT	6090
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	4051	GGAAACAAAGGCACAGAGAGGGAAAGTAATTTTCCCATGATCACAGATCT	4100

C  AC113211.5	6089	ATTAAGAGCAGCATCAGAATTTGAACCTGAGTTGGTTTCGCTGCAGAGTC	6040
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	4101	ATTAAGAGCAGCATCAGAATTTGAACCTGAGTTGGTTTCGCTGCAGAGTC	4150

C  AC113211.5	6039	CATAGTCTTCCCACTGCCCCTCCTTGATAGAAAATTCTTCCTGTTATTTA	5990
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	4151	CATAGTCTTCCCACTGCCCCTCCTTGATAGAAAATTCTTCCTGTTATTTA	4200

C  AC113211.5	5989	TTTGAAATCTGCCTCCCTGTTTTCCATTGAACCTAGCTCTGCCTTCAGAG	5940
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	4201	TTTGAAATCTGCCTCCCTGTTTTCCATTGAACCTAGCTCTGCCTTCAGAG	4250

C  AC113211.5	5939	CTCATAAGGTTCAAATCTCTTTCTTCTTTCATGTAACAACACTTTGAACT	5890
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	4251	CTCATAAGGTTCAAATCTCTTTCTTCTTTCATGTAACAACACTTTGAACT	4300

C  AC113211.5	5889	GTTGGAAGCATCCTACTGGGAACTGGGTGGCAGACGTGAAGAAAGAAGGC	5840
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	4301	GTTGGAAGCATCCTACTGGGAACTGGGTGGCAGACGTGAAGAAAGAAGGC	4350

C  AC113211.5	5839	CTCATTTAATCCAATGGGATGGCATCGATGGCAAACAGGAGACGTGGGGG	5790
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	4351	CTCATTTAATCCAATGGGATGGCATCGATGGCAAACAGGAGACGTGGGGG	4400

C  AC113211.5	5789	CTGCAGATAGGTGCACAGGAGGACAGGGGCCTGGGCACCGGCTGTTGACT	5740
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	4401	CTGCAGATAGGTGCACAGGAGGACAGGGGCCTGGGCACCGGCTGTTGACT	4450

C  AC113211.5	5739	TGGGGAGCTGAACGCTGTTCCTCCTTTTAACTTCATGATTTCTGTCCTTC	5690
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	4451	TGGGGAGCTGAACGCTGTTCCTCCTTTTAACTTCATGATTTCTGTCCTTC	4500

C  AC113211.5	5689	CCAAAAAATGTAGTGCCTTAAACCAATACACCAATGCCAGCGCCATCCCA	5640
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	4501	CCAAAAAATGTAGTGCCTTAAACCAATACACCAATGCCAGCGCCATCCCA	4550

C  AC113211.5	5639	CTGTCACCACCACCCCCACTAGCAGCTCCTTGATTCAAAGAATGGGGAAA	5590
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	4551	CTGTCACCACCACCCCCACTAGCAGCTCCTTGATTCAAAGAATGGGGAAA	4600

C  AC113211.5	5589	ATGGCCAATAGAAAAGCTCATAGAGCAAGCGTCAAGCCACTACATACTCA	5540
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	4601	ATGGCCAATAGAAAAGCTCATAGAGCAAGCGTCAAGCCACTACATACTCA	4650

C  AC113211.5	5539	GACAAGTTGCTCTTGAAGGTTAGAACCCAGCTTTAGCATTTGTTTTGTTC	5490
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	4651	GACAAGTTGCTCTTGAAGGTTAGAACCCAGCTTTAGCATTTGTTTTGTTC	4700

C  AC113211.5	5489	TTTTCCCCAGCCCTCTTAAGCTCTAGGTCATATCGGCCTTGGGTAAAGTC	5440
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	4701	TTTTCCCCAGCCCTCTTAAGCTCTAGGTCATATCGGCCTTGGGTAAAGTC	4750

C  AC113211.5	5439	CTTAGGAAGATCCAAGGAAAACTGGCTTGGGGCTCATCTAGTCTCATCTT	5390
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	4751	CTTAGGAAGATCCAAGGAAAACTGGCTTGGGGCTCATCTAGTCTCATCTT	4800

C  AC113211.5	5389	GGTAAGCTTCATCTTGGTGAATTAGAGGCAGATTATGACACTGATTATGG	5340
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	4801	GGTAAGCTTCATCTTGGTGAATTAGAGGCAGATTATGACACTGATTATGG	4850

C  AC113211.5	5339	CAGTGCCTGGCCCCTGGGGGAACTTTGTGGTCTCCTCTGGAAGGTGGGGC	5290
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	4851	CAGTGCCTGGCCCCTGGGGGAACTTTGTGGTCTCCTCTGGAAGGTGGGGC	4900

C  AC113211.5	5289	TCTAGCTAGGGCAGGGGGTGGGTGGATGAAAGAGCAACAACAGAATCAGT	5240
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	4901	TCTAGCTAGGGCAGGGGGTGGGTGGATGAAAGAGCAACAACAGAATCAGT	4950

C  AC113211.5	5239	GTACAGGGATGGTTCATCTTGGGAAACTGGGCAAAGGAAGACGTGCAGCT	5190
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	4951	GTACAGGGATGGTTCATCTTGGGAAACTGGGCAAAGGAAGACGTGCAGCT	5000

C  AC113211.5	5189	AAAGAGTTGGTCCACCTATCCAGATAATTCCATGCCTAGAGCATTTGGTC	5140
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	5001	AAAGAGTTGGTCCACCTATCCAGATAATTCCATGCCTAGAGCATTTGGTC	5050

C  AC113211.5	5139	TCTGCAGGACAGGGTCCTCCAAACCTTTTTGTCAAATCCAAAGCAAAAAA	5090
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	5051	TCTGCAGGACAGGGTCCTCCAAACCTTTTTGTCAAATCCAAAGCAAAAAA	5100

C  AC113211.5	5089	CAAGAACACTGTCTTTCTAAGCACTGAGCTTAGGGGTGAGATGCCCCATG	5040
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	5101	CAAGAACACTGTCTTTCTAAGCACTGAGCTTAGGGGTGAGATGCCCCATG	5150

C  AC113211.5	5039	TACCCCCAACCTTGTCCTTGACTGTTTCATGGGCACATCAAGCAGGATTT	4990
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	5151	TACCCCCAACCTTGTCCTTGACTGTTTCATGGGCACATCAAGCAGGATTT	5200

C  AC113211.5	4989	CCATCTGCAAACTGGACCCAGGCGTTCTTTTAGCTTCCTTCAGTTGCCTG	4940
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	5201	CCATCTGCAAACTGGACCCAGGCGTTCTTTTAGCTTCCTTCAGTTGCCTG	5250

C  AC113211.5	4939	ATCTCTGTCCAGAACTTTTCTTTCCTGAGAGCAGACCTCCATTTTGGTTC	4890
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	5251	ATCTCTGTCCAGAACTTTTCTTTCCTGAGAGCAGACCTCCATTTTGGTTC	5300

C  AC113211.5	4889	CCGAGCAAGAGGGAGGGTCAGAGCAGCGAGGTTGTAAACATGTTTGGTTC	4840
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	5301	CCGAGCAAGAGGGAGGGTCAGAGCAGCGAGGTTGTAAACATGTTTGGTTC	5350

C  AC113211.5	4839	TACCCTTCCCCTGCAGAGCAAACTCCAGTGGTTTACTAAACATCCACATC	4790
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	5351	TACCCTTCCCCTGCAGAGCAAACTCCAGTGGTTTACTAAACATCCACATC	5400

C  AC113211.5	4789	TGCCTGTGTGTGGTGCTGCCTGCCCCACCTCCCAGCAGACACACCTTTCC	4740
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	5401	TGCCTGTGTGTGGTGCTGCCTGCCCCACCTCCCAGCAGACACACCTTTCC	5450

C  AC113211.5	4739	CTGTGCCCTGGAAGGCAGCCAAATGGGACCCCCAGCAAAGGAATGTGAGT	4690
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	5451	CTGTGCCCTGGAAGGCAGCCAAATGGGACCCCCAGCAAAGGAATGTGAGT	5500

C  AC113211.5	4689	TCTACAGCCTAGCTCCTAGACGCAGCTTCATCCCTGTCCTGCTCTGCCTG	4640
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	5501	TCTACAGCCTAGCTCCTAGACGCAGCTTCATCCCTGTCCTGCTCTGCCTG	5550

C  AC113211.5	4639	TGTCCGTGCCCCTGACCTCTTGGGCCTGGCCACAAAGGTGGTACACAGAG	4590
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	5551	TGTCCGTGCCCCTGACCTCTTGGGCCTGGCCACAAAGGTGGTACACAGAG	5600

C  AC113211.5	4589	ACTGATGCCTAAGCTACGGCTCTTTCAAGGGTCACTGGACAAGGGCTTCT	4540
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	5601	ACTGATGCCTAAGCTACGGCTCTTTCAAGGGTCACTGGACAAGGGCTTCT	5650

C  AC113211.5	4539	TCTTCGTCACATGGGTCTACTTATACTTTGCAGCACCACGAGGGATGCCA	4490
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	5651	TCTTCGTCACATGGGTCTACTTATACTTTGCAGCACCACGAGGGATGCCA	5700

C  AC113211.5	4489	GGGAAACATTTCTAAAAGGCATTTTAAAGAATAAAAAATACTCCAGCCAG	4440
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	5701	GGGAAACATTTCTAAAAGGCATTTTAAAGAATAAAAAATACTCCAGCCAG	5750

C  AC113211.5	4439	TAACAGAAGGCTAGTCTCAACCCCCAAATCCTCAAAGAACTGTGCGGAAG	4390
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	5751	TAACAGAAGGCTAGTCTCAACCCCCAAATCCTCAAAGAACTGTGCGGAAG	5800

C  AC113211.5	4389	CAATAACAAACAGAATCCATCCAGTCATTCATTTATTCATCAGAAGTTTA	4340
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	5801	CAATAACAAACAGAATCCATCCAGTCATTCATTTATTCATCAGAAGTTTA	5850

C  AC113211.5	4339	CCGAGTGGCTATTCAGTGCCAAGGCACTGGGGATACATCAGTGAACAAAA	4290
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	5851	CCGAGTGGCTATTCAGTGCCAAGGCACTGGGGATACATCAGTGAACAAAA	5900

C  AC113211.5	4289	CAAACGAGATAAAAATTTCCTGCCCTCGTGGCGCTTACATTCTAGAATTA	4240
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	5901	CAAACGAGATAAAAATTTCCTGCCCTCGTGGCGCTTACATTCTAGAATTA	5950

C  AC113211.5	4239	AATAGAGAACATGCCATATTTACCCTGGAGAAAAGCAGCCGATATTTCTT	4190
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	5951	AATAGAGAACATGCCATATTTACCCTGGAGAAAAGCAGCCGATATTTCTT	6000

C  AC113211.5	4189	GTGGGTGGACAGGGGAGGAGAAAGCAACTTTATTTTCTTATTACCCACCC	4140
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	6001	GTGGGTGGACAGGGGAGGAGAAAGCAACTTTATTTTCTTATTACCCACCC	6050

C  AC113211.5	4139	TTGAAAACAAGAGGTGCCGAGTCATTGTTCCAGGACCCTGGTGGCACTAA	4090
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	6051	TTGAAAACAAGAGGTGCCGAGTCATTGTTCCAGGACCCTGGTGGCACTAA	6100

C  AC113211.5	4089	TGTTCCCTACTGGGTTTGTGTTGTTTTGCAGGAGTGCGCTACAGCCAGCA	4040
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	6101	TGTTCCCTACTGGGTTTGTGTTGTTTTGCAGGAGTGCGCTACAGCCAGCA	6150

C  AC113211.5	4039	GGGAAACAATGAGATCACTTCCTCCTCAACAATCAGTCACCATGGCAACA	3990
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	6151	GGGAAACAATGAGATCACTTCCTCCTCAACAATCAGTCACCATGGCAACA	6200

C  AC113211.5	3989	GCGCCATGGTGACCAGCCAGTCGGTTTTACAGCAAGTCTCCCCAGCCAGC	3940
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	6201	GCGCCATGGTGACCAGCCAGTCGGTTTTACAGCAAGTCTCCCCAGCCAGC	6250

C  AC113211.5	3939	CTGGACCCAGGCCACAATCTCCTCTCACCTGATGGTAAAATGGTGAGTAC	3890
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	6251	CTGGACCCAGGCCACAATCTCCTCTCACCTGATGGTAAAATGGTGAGTAC	6300

C  AC113211.5	3889	ACCTGGGCCATTGTCGCTCTGGAGCTGATAAGATAAGAGGCAAAACAAAC	3840
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	6301	ACCTGGGCCATTGTCGCTCTGGAGCTGATAAGATAAGAGGCAAAACAAAC	6350

C  AC113211.5	3839	ACAACTTCTCACAAGGCCTGCCTCAAACAATGAACCATTGTAGCCCCATA	3790
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	6351	ACAACTTCTCACAAGGCCTGCCTCAAACAATGAACCATTGTAGCCCCATA	6400

C  AC113211.5	3789	GGGGAAAATGAGGGCTGTCCAGAGTCGGAAAGGAGAGGTAGTGCTGGTGA	3740
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	6401	GGGGAAAATGAGGGCTGTCCAGAGTCGGAAAGGAGAGGTAGTGCTGGTGA	6450

C  AC113211.5	3739	CCCAGCCTTTGGCGGGTAGAAGAGGTGTTCGGTTTGAACCCAGCCAATAA	3690
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	6451	CCCAGCCTTTGGCGGGTAGAAGAGGTGTTCGGTTTGAACCCAGCCAATAA	6500

C  AC113211.5	3689	ATCTGACAGAGTTCTGCTCTCTTTTTATTGATTGAATGCCTCATAAAGGA	3640
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	6501	ATCTGACAGAGTTCTGCTCTCTTTTTATTGATTGAATGCCTCATAAAGGA	6550

C  AC113211.5	3639	GCAAGCCCGGTGGGACACTGTTTGTTTTGGGGCTTGCCAATGACATTTGT	3590
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	6551	GCAAGCCCGGTGGGACACTGTTTGTTTTGGGGCTTGCCAATGACATTTGT	6600

C  AC113211.5	3589	GTTGATAAAATGTTCATTCATCCCTCCCCCCAAGGCCTCCAAAGCCAATT	3540
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	6601	GTTGATAAAATGTTCATTCATCCCTCCCCCCAAGGCCTCCAAAGCCAATT	6650

C  AC113211.5	3539	TTTTAACTTAGAGAGCACCTCACTTTGACACAAGCCCCCTCTTCCTCCTT	3490
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	6651	TTTTAACTTAGAGAGCACCTCACTTTGACACAAGCCCCCTCTTCCTCCTT	6700

C  AC113211.5	3489	ACCATCCCCTTGGTACTGACAAGAAGAGTCATTAGCAAGTCAGGATGTAG	3440
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	6701	ACCATCCCCTTGGTACTGACAAGAAGAGTCATTAGCAAGTCAGGATGTAG	6750

C  AC113211.5	3439	TGGATAGGAGGCGATGGGGAGAAGCTTCTTGAACTGGAACAGTGAAAGAC	3390
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	6751	TGGATAGGAGGCGATGGGGAGAAGCTTCTTGAACTGGAACAGTGAAAGAC	6800

C  AC113211.5	3389	ATGGGACACCATGACAGCGAAGATCACAGCACAAATGGTAGATGGGGTGG	3340
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	6801	ATGGGACACCATGACAGCGAAGATCACAGCACAAATGGTAGATGGGGTGG	6850

C  AC113211.5	3339	GGCGATGCTTAGGGAGGGAGAAACACCAACTTTGAAGTTACAATTGCCCA	3290
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	6851	GGCGATGCTTAGGGAGGGAGAAACACCAACTTTGAAGTTACAATTGCCCA	6900

C  AC113211.5	3289	GGTTCAAATCCCAGCTCCAGCTCTTAATAGCTGTGTAGCCTGAGCAGGTT	3240
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	6901	GGTTCAAATCCCAGCTCCAGCTCTTAATAGCTGTGTAGCCTGAGCAGGTT	6950

C  AC113211.5	3239	ACTCGACTACTTATGATCTCTTCCTCATCTATAAAATGGGGGCGGTAACA	3190
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	6951	ACTCGACTACTTATGATCTCTTCCTCATCTATAAAATGGGGGCGGTAACA	7000

C  AC113211.5	3189	ATAGACTTGGTGGGGGCATGAGCGTGATAACATTTGAGAAATACTCTGCA	3140
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	7001	ATAGACTTGGTGGGGGCATGAGCGTGATAACATTTGAGAAATACTCTGCA	7050

C  AC113211.5	3139	GTGTTTGCCATAGAAAATAGTCAATAAATTGCAGTATTGTTGTTGTTGTC	3090
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	7051	GTGTTTGCCATAGAAAATAGTCAATAAATTGCAGTATTGTTGTTGTTGTC	7100

C  AC113211.5	3089	GTGTAAATGTCAATATCATTCTCATTAAATGAAGTTTTCTATATCCGTAA	3040
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	7101	GTGTAAATGTCAATATCATTCTCATTAAATGAAGTTTTCTATATCCGTAA	7150

C  AC113211.5	3039	CCACAGCCCCACACCCAGATGCAAGTTTAGCACACTTGGTGAAGAATGCA	2990
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	7151	CCACAGCCCCACACCCAGATGCAAGTTTAGCACACTTGGTGAAGAATGCA	7200

C  AC113211.5	2989	CAATTTGAATTTGAATTTTCTACATCAAACTAGATTCTAGGCCAGGTGCA	2940
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	7201	CAATTTGAATTTGAATTTTCTACATCAAACTAGATTCTAGGCCAGGTGCA	7250

C  AC113211.5	2939	GTGGCTCATACCTGTAATTCCAGCACTTGGGGAGACTGAGGCAGGTGGAT	2890
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	7251	GTGGCTCATACCTGTAATTCCAGCACTTGGGGAGACTGAGGCAGGTGGAT	7300

C  AC113211.5	2889	CACTTGAGGCCAGAAAGTTTGAGACCAGCCTGGACAACAGGGCGAAACAC	2840
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	7301	CACTTGAGGCCAGAAAGTTTGAGACCAGCCTGGACAACAGGGCGAAACAC	7350

C  AC113211.5	2839	CATCTCTATTAAAAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGAATGGTGGCATGC	2790
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	7351	CATCTCTATTAAAAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGAATGGTGGCATGC	7400

C  AC113211.5	2789	ACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGGAGCTCACTTGAGC	2740
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	7401	ACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGGAGCTCACTTGAGC	7450

C  AC113211.5	2739	CTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTCACACCACTGCACTCCAGCCTGGG	2690
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	7451	CTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTCACACCACTGCACTCCAGCCTGGG	7500

C  AC113211.5	2689	CAACAGAGTGAGACTCGGGTGTCTCAAAAAATAATAATTAATAATAACAA	2640
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	7501	CAACAGAGTGAGACTCGGGTGTCTCAAAAAATAATAATTAATAATAACAA	7550

C  AC113211.5	2639	TAAAATAAATAAAACTAGGTTCTAATTAGGATTAGGTTCTGATCCTGTAG	2590
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	7551	TAAAATAAATAAAACTAGGTTCTAATTAGGATTAGGTTCTGATCCTGTAG	7600

C  AC113211.5	2589	CAACACAAGTGCAGGAGAGAGTGGCTTATGGGAGAACAGGAGCATTACGA	2540
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	7601	CAACACAAGTGCAGGAGAGAGTGGCTTATGGGAGAACAGGAGCATTACGA	7650

C  AC113211.5	2539	CACTGGCAAGGGTAGAGAATGGAAAGCTCTATTCTTTGGGTCATGCTCTG	2490
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	7651	CACTGGCAAGGGTAGAGAATGGAAAGCTCTATTCTTTGGGTCATGCTCTG	7700

C  AC113211.5	2489	TTTTTCAGGGGAGGGAGGAGCCGCAGATTCCCGACTTTCATGCTGAAGGT	2440
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	7701	TTTTTCAGGGGAGGGAGGAGCCGCAGATTCCCGACTTTCATGCTGAAGGT	7750

C  AC113211.5	2439	GGAGCTGCACACATTCCCAGAGTGGGGGCCAGGATGGGTGAGGGCAACAG	2390
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	7751	GGAGCTGCACACATTCCCAGAGTGGGGGCCAGGATGGGTGAGGGCAACAG	7800

C  AC113211.5	2389	GGTGCAGAGGCCATTTTAGATCTTGACGTGTGTGCTGTGTAGGCAACACA	2340
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	7801	GGTGCAGAGGCCATTTTAGATCTTGACGTGTGTGCTGTGTAGGCAACACA	7850

C  AC113211.5	2339	GAAACGGTGAGTCACAGGTGATCGAGTCCCTGGCTCCCTGGAGGAAAAAC	2290
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	7851	GAAACGGTGAGTCACAGGTGATCGAGTCCCTGGCTCCCTGGAGGAAAAAC	7900

C  AC113211.5	2289	AAGTGTGGTTTCTGAGGGGAGCACTGACCCGGCCAATTCTGGTTTCAGAG	2240
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	7901	AAGTGTGGTTTCTGAGGGGAGCACTGACCCGGCCAATTCTGGTTTCAGAG	7950

C  AC113211.5	2239	GACCTGAGCTGCTTGCCCTGGTCGTGGTCTCTGCAAACAAAAATGAAAGG	2190
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	7951	GACCTGAGCTGCTTGCCCTGGTCGTGGTCTCTGCAAACAAAAATGAAAGG	8000

C  AC113211.5	2189	GCATTCCTGGGGGAGGCATTTTGCAGCCCTCTTCTCCTACTCCCACCTAT	2140
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	8001	GCATTCCTGGGGGAGGCATTTTGCAGCCCTCTTCTCCTACTCCCACCTAT	8050

C  AC113211.5	2139	CCCTTAAGAAAGATTCTTCTCCATGTGAAGAACCACTTGTGTCAGTTACC	2090
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	8051	CCCTTAAGAAAGATTCTTCTCCATGTGAAGAACCACTTGTGTCAGTTACC	8100

C  AC113211.5	2089	TGTGAGAGGCACAGACAAGTCTTTCTGACTTCTCAAGAGTGTCCCAAACA	2040
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	8101	TGTGAGAGGCACAGACAAGTCTTTCTGACTTCTCAAGAGTGTCCCAAACA	8150

C  AC113211.5	2039	AGTTAGGGTTAAGGATTACCCAGGCTTCCATGGAGAAGGGTGCCTTACGG	1990
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	8151	AGTTAGGGTTAAGGATTACCCAGGCTTCCATGGAGAAGGGTGCCTTACGG	8200

C  AC113211.5	1989	AAGAGGTCTTGACTTCTCAGTGTGGAAGAACCTTCCAGGTCTCAGCTCTT	1940
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	8201	AAGAGGTCTTGACTTCTCAGTGTGGAAGAACCTTCCAGGTCTCAGCTCTT	8250

C  AC113211.5	1939	ACTGCTTGAAGGTCCTTGGGGTTTCCTACTGAGCTCTGCCTCTCCTCCTT	1890
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	8251	ACTGCTTGAAGGTCCTTGGGGTTTCCTACTGAGCTCTGCCTCTCCTCCTT	8300

C  AC113211.5	1889	CTAAGAGGCAAGCTGCCTCACCCAGGCCAGGGCCGCTCTAAATGCAGCCT	1840
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	8301	CTAAGAGGCAAGCTGCCTCACCCAGGCCAGGGCCGCTCTAAATGCAGCCT	8350

C  AC113211.5	1839	GTGGACACGCTTTTTGCTTCCTGTTCTGCTCAGCAGTGCTTTAACTGGGC	1790
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	8351	GTGGACACGCTTTTTGCTTCCTGTTCTGCTCAGCAGTGCTTTAACTGGGC	8400

C  AC113211.5	1789	AGTGTGTTACTGGATTGATGATTGACCAAGACTGCACACCTCAACGTTAG	1740
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	8401	AGTGTGTTACTGGATTGATGATTGACCAAGACTGCACACCTCAACGTTAG	8450

C  AC113211.5	1739	CAAACACCTGGAAGCTTGTTTGCAGGGCCTGGCTTTTCTCTTGTCTCCAA	1690
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	8451	CAAACACCTGGAAGCTTGTTTGCAGGGCCTGGCTTTTCTCTTGTCTCCAA	8500

C  AC113211.5	1689	CACCCTAGTGCATGTGCTGTGTCACTATCATCAGAGGTCCAAATTCAAGA	1640
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	8501	CACCCTAGTGCATGTGCTGTGTCACTATCATCAGAGGTCCAAATTCAAGA	8550

C  AC113211.5	1639	GTCTGTTTTCTTGTTAATATAATAACATGTCCATCACGGATCTTGGTCCC	1590
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	8551	GTCTGTTTTCTTGTTAATATAATAACATGTCCATCACGGATCTTGGTCCC	8600

C  AC113211.5	1589	CCAAGGCAAGAGTGGAGTATGGTTAAAAAGGAATGCAGGGAAGGGAACCA	1540
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	8601	CCAAGGCAAGAGTGGAGTATGGTTAAAAAGGAATGCAGGGAAGGGAACCA	8650

C  AC113211.5	1539	GTATGTGCAAGTCTTGGCTCGGTCATTCACCAGCAGTAGTGTGGACAAAT	1490
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	8651	GTATGTGCAAGTCTTGGCTCGGTCATTCACCAGCAGTAGTGTGGACAAAT	8700

C  AC113211.5	1489	TGCTTAACCTCAGTTTCTTCATCTGTAAAATGGGGGATAATGATGCCTAC	1440
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	8701	TGCTTAACCTCAGTTTCTTCATCTGTAAAATGGGGGATAATGATGCCTAC	8750

C  AC113211.5	1439	GTCATAGGGTTGGTGTGAAGATTGCTTGTAGCACTGTTGTTCTTTGGGTC	1390
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	8751	GTCATAGGGTTGGTGTGAAGATTGCTTGTAGCACTGTTGTTCTTTGGGTC	8800

C  AC113211.5	1389	AGCCCTGTTCTAGGAATGACAATCTCTGCATGCTGACTTTCAGTAGGACG	1340
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	8801	AGCCCTGTTCTAGGAATGACAATCTCTGCATGCTGACTTTCAGTAGGACG	8850

C  AC113211.5	1339	TGCCTTGAAATCTTTCCCCAAGGACTGGTTTTGGAAATAAAGCCAATCCA	1290
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	8851	TGCCTTGAAATCTTTCCCCAAGGACTGGTTTTGGAAATAAAGCCAATCCA	8900

C  AC113211.5	1289	TTTGAACTCTCTGTTGTACTGTCTGCCCCTACCCGCCCCCATGCCCAAAT	1240
			|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
  AC091199.6	8901	TTTGAACTCTCTGTTGTACTGTCTGCCCCTACCCACCCCCATGCCCAAAT	8950

C  AC113211.5	1239	GTCACGCATTGACAAAAAACTGGCCAGGTTTAGGGTTGTAGTCTGTGCAT	1190
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	8951	GTCACGCATTGACAAAAAACTGGCCAGGTTTAGGGTTGTAGTCTGTGCAT	9000

C  AC113211.5	1189	GTCGAACCTTTAAAAAAAAAAAAAAGAGAGAGAACAAAGCAAAGCACATA	1140
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	9001	GTCGAACCTTTAAAAAAAAAAAAAAGAGAGAGAACAAAGCAAAGCACATA	9050

C  AC113211.5	1139	CTGGATACTTTCACAGTATCAAGCAGTATGTCCTAATGGTGAAAAGCTCA	1090
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	9051	CTGGATACTTTCACAGTATCAAGCAGTATGTCCTAATGGTGAAAAGCTCA	9100

C  AC113211.5	1089	GGCTGTGGCGGTAGATAGCCTGCTTTCAACCCCAATTCTACCACTTGGGC	1040
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	9101	GGCTGTGGCGGTAGATAGCCTGCTTTCAACCCCAATTCTACCACTTGGGC	9150

C  AC113211.5	1039	ACACTTCTTAACTTCTCTAAATTTCAGTATCCTTCTCTATGAAATAGGGA	990
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	9151	ACACTTCTTAACTTCTCTAAATTTCAGTATCCTTCTCTATGAAATAGGGA	9200

C  AC113211.5	989	TAATAATACCAACCTTATAGATTATAGGTATATAAAGAACCTAGCATAGT	940
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	9201	TAATAATACCAACCTTATAGATTATAGGTATATAAAGAACCTAGCATAGT	9250

C  AC113211.5	939	GAAGAGACCATAAATGACAGCATTAATGTAATTCAGGCTCTCCAAATTAT	890
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	9251	GAAGAGACCATAAATGACAGCATTAATGTAATTCAGGCTCTCCAAATTAT	9300

C  AC113211.5	889	CATGTAAGGATCACCACTGATACCCTTGGCAGTGCCCTAGCTTCCATCAG	840
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	9301	CATGTAAGGATCACCACTGATACCCTTGGCAGTGCCCTAGCTTCCATCAG	9350

C  AC113211.5	839	TCCAGGAGCCAAATAGAAAGTAATGGTTGTAGCCGGGCACAGTGGCTCAC	790
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	9351	TCCAGGAGCCAAATAGAAAGTAATGGTTGTAGCCGGGCACAGTGGCTCAC	9400

C  AC113211.5	789	ACGTGTAATTCCACTATTTTGGGAGGTGAGGAAAGATAATTGCTTGAGCC	740
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	9401	ACGTGTAATTCCACTATTTTGGGAGGTGAGGAAAGATAATTGCTTGAGCC	9450

C  AC113211.5	739	CAGGAGTTCAAGACCAGCTTGGGTAACACAGCAAGGCCCTGTCCCTACAA	690
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	9451	CAGGAGTTCAAGACCAGCTTGGGTAACACAGCAAGGCCCTGTCCCTACAA	9500

C  AC113211.5	689	AAAATAAAAAAATTAGCTGGGCACGGTGGTGCATGCCTGTTGTCCCAGCT	640
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	9501	AAAATAAAAAAATTAGCTGGGCACGGTGGTGCATGCCTGTTGTCCCAGCT	9550

C  AC113211.5	639	ACTCCAGAGGTTGAGGTGACAAGATCGCTTAATTCCAGGAGTTCGAAGCT	590
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	9551	ACTCCAGAGGTTGAGGTGACAAGATCGCTTAATTCCAGGAGTTCGAAGCT	9600

C  AC113211.5	589	GCAGTGAGCTGTGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTTGGCGATAGAGTAA	540
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	9601	GCAGTGAGCTGTGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTTGGCGATAGAGTAA	9650

C  AC113211.5	539	GACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAAATAATAGTTGCATTTTA	490
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	9651	GACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAAATAATAGTTGCATTTTA	9700

C  AC113211.5	489	GAATGGGAAGTAACTTGATCAAGGTTGCCCAAACTTAGTAAGTGAATAAG	440
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	9701	GAATGGGAAGTAACTTGATCAAGGTTGCCCAAACTTAGTAAGTGAATAAG	9750

C  AC113211.5	439	ATTTAAGCTCCAGCAAAACTGGATTTTAACTCTGGCTTTTTCACTTATGA	390
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	9751	ATTTAAGCTCCAGCAAAACTGGATTTTAACTCTGGCTTTTTCACTTATGA	9800

C  AC113211.5	389	GTCAAGTGACATAGAAATAGTCTCAACTCTTCTGAAGATCAGTTTCTTAA	340
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	9801	GTCAAGTGACATAGAAATAGTCTCAACTCTTCTGAAGATCAGTTTCTTAA	9850

C  AC113211.5	339	TCTGTAATACAGGGACTGATAGTAATAATGCCTGCCCTACTTGTGTCATT	290
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	9851	TCTGTAATACAGGGACTGATAGTAATAATGCCTGCCCTACTTGTGTCATT	9900

C  AC113211.5	289	ATCTATTAAGGACAATCAGTGAAAGCACTTTACAAATCCTAAAGTCACAC	240
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	9901	ATCTATTAAGGACAATCAGTGAAAGCACTTTACAAATCCTAAAGTCACAC	9950

C  AC113211.5	239	ACATTTAAATTATTTTTATCATTGGCCTCCACACTTCTCTTATACCATTA	190
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	9951	ACATTTAAATTATTTTTATCATTGGCCTCCACACTTCTCTTATACCATTA	10000

C  AC113211.5	189	ACCAAATGCTGAAATGTCAGAGAAATTACTGTCACTTGGTTGACTTTCTC	140
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	10001	ACCAAATGCTGAAATGTCAGAGAAATTACTGTCACTTGGTTGACTTTCTC	10050

C  AC113211.5	139	CAAAGGAACTACATTACCCAAGAGATTCAGTCTGAGGGCAGGCTACGGAT	90
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	10051	CAAAGGAACTACATTACCCAAGAGATTCAGTCTGAGGGCAGGCTACGGAT	10100

C  AC113211.5	89	TTTTTTTTTTTT-TTTTTTAATGACTGGTATTTTGAAAAACAAGTCCAGC	41
			|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	10101	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATGACTGGTATTTTGAAAAACAAGTCCAGC	10150

C  AC113211.5	40	AAACAGGCTGCTTCTCTCTTGTTTGATGTGGTCAGAATTC	1
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	10151	AAACAGGCTGCTTCTCTCTTGTTTGATGTGGTCAGAATTC	10190

Compact alignment

skip 750 bps 100% identity alignment

C  AC113211.5	9438	CCTGAGTAGTGGGGATTACACCACTATGCCTAGCTAATGCGCGTACCACC	9389
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
  AC091199.6	751	CCTGAGTAGTGGGGATTACACCACTATGCCTAGCTAATGCGTGTACCACC	800

skip 50 bps 100% identity alignment

C  AC113211.5	9338	GGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTCGGC	9289
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
  AC091199.6	851	GGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTCAGC	900

skip 50 bps 100% identity alignment

C  AC113211.5	9238	ATTTTTAAA-GATAAGAATCCAATAAAAAGATTACCAGAGTTTTATACCC	9190
			||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
  AC091199.6	951	ATTTTTAAAAGATAAGAATCCAATAAAAAGATTACCACAGTTTTATACCC	1000

skip 50 bps 100% identity alignment

C  AC113211.5	9139	GTTTGCCTAGGGAAGTGGGCATCAGAAGTGCTGCGGGTTGTGAGTTACTG	9090
			||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
  AC091199.6	1051	GTTTGCCTAGGGAAGTGGGCATCAGAAGTGCTGTGGGTTGTGAGTTACTG	1100

skip 50 bps 100% identity alignment

C  AC113211.5	9039	CCATATTGCATGGATGTGTCTTACCAGTGCACACAGTGGACCGAGGCAGC	8990
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
  AC091199.6	1151	CCATATTGCATGGATGTGTCTTACCAGTGCACACAGTGGACCGAGGCGGC	1200

skip 2250 bps 100% identity alignment

C  AC113211.5	6739	CGTAGCCTTTGGTAGGGGAGAAGCCTCCTTGTTACCCATATTTGATCATC	6690
			|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
  AC091199.6	3451	CGTAGCCTTTGGTAGGGGAGAAGCCTCCTTGTGACCCATATTTGATCATC	3500

skip 5400 bps 100% identity alignment

C  AC113211.5	1289	TTTGAACTCTCTGTTGTACTGTCTGCCCCTACCCGCCCCCATGCCCAAAT	1240
			|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
  AC091199.6	8901	TTTGAACTCTCTGTTGTACTGTCTGCCCCTACCCACCCCCATGCCCAAAT	8950

skip 1150 bps 100% identity alignment

C  AC113211.5	89	TTTTTTTTTTTT-TTTTTTAATGACTGGTATTTTGAAAAACAAGTCCAGC	41
			|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  AC091199.6	10101	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATGACTGGTATTTTGAAAAACAAGTCCAGC	10150

skip 40 bps 100% identity alignment

Overview

Query
AC113211.5 - 181625 bps
Hit
AC091199.6 - 189572 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 10188 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
199.9313010188110188-11101901
Short-link