<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2005 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AC073864.29	136258	GAATTCAAGAACAGAGGGGGAAGTGCAGAGAGGGACAAGGACTTATCCAG	136307
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	1	GAATTCAAGAACAGAGGGGGAAGTGCAGAGAGGGACAAGGACTTATCCAG	50

AC073864.29	136308	GGCCATCCATAGGGTTAACAGCAGAGCTGGGACCAGATGCCAGGACTTCT	136357
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	51	GGCCATCCATAGGGTTAACAGCAGAGCTGGGACCAGATGCCAGGACTTCT	100

AC073864.29	136358	GGATAAGCAGAATAATTTAAATTTAAAGGAGAACAATGATAATAACTGAG	136407
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	101	GGATAAGCAGAATAATTTAAATTTAAAGGAGAACAATGATAATAACTGAG	150

AC073864.29	136408	TTCTACTAAATTCTTACTCTGCCCCAGCTCTGTACTGAACACTTTACCGG	136457
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	151	TTCTACTAAATTCTTACTCTGCCCCAGCTCTGTACTGAACACTTTACCGG	200

AC073864.29	136458	CATCGTGTTGCTGAATACCCTCATCCTGACCCCAAAAGTTCATATTGTTA	136507
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	201	CATCGTGTTGCTGAATACCCTCATCCTGACCCCAAAAGTTCATATTGTTA	250

AC073864.29	136508	TTATCAAGACCATTTTACAGAGGGGAAAACTGAGGCACTGATGCATTCAA	136557
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	251	TTATCAAGACCATTTTACAGAGGGGAAAACTGAGGCACTGATGCATTCAA	300

AC073864.29	136558	TGACTTACCCTAGCGTACCCAGCTGGGAAGTTGTAGAGTCAGGATTCAAA	136607
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	301	TGACTTACCCTAGCGTACCCAGCTGGGAAGTTGTAGAGTCAGGATTCAAA	350

AC073864.29	136608	CCCAGGAAGTCAACACCAGTTACAGGAGACAACCACTGTGCCACACAGCC	136657
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	351	CCCAGGAAGTCAACACCAGTTACAGGAGACAACCACTGTGCCACACAGCC	400

AC073864.29	136658	TCCTATGAGCAGCCCCTCACCCTGGCCCCTGGCAGTATTGATGTTGGAAA	136707
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	401	TCCTATGAGCAGCCCCTCACCCTGGCCCCTGGCAGTATTGATGTTGGAAA	450

AC073864.29	136708	GTAGGAGTTTGGGACCCTTGCAAAGTGCTGCAGTGAGGAGCATGCACACG	136757
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	451	GTAGGAGTTTGGGACCCTTGCAAAGTGCTGCAGTGAGGAGCATGCACACG	500

AC073864.29	136758	CACACATACACTCACACACCTTTCACTTATTATGGGTCTCTGTCTGAGGA	136807
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	501	CACACATACACTCACACACCTTTCACTTATTATGGGTCTCTGTCTGAGGA	550

AC073864.29	136808	TCCCTCAGAAGAGGGCAATTCTTACCTTAATGATTTGCTAATGGTAGTGG	136857
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	551	TCCCTCAGAAGAGGGCAATTCTTACCTTAATGATTTGCTAATGGTAGTGG	600

AC073864.29	136858	TTCAGCTACTGTGGTAAGCTAGAGCTATTGCAGACAGGGGCCCTTCCCAG	136907
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	601	TTCAGCTACTGTGGTAAGCTAGAGCTATTGCAGACAGGGGCCCTTCCCAG	650

AC073864.29	136908	AGCCTTTCATCCCTACTGTAGTGGAGTCATTAGTGCTCTTTATAATTCAC	136957
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	651	AGCCTTTCATCCCTACTGTAGTGGAGTCATTAGTGCTCTTTATAATTCAC	700

AC073864.29	136958	AGGGTTCTGAGGGACGGAGGCAAGTGACAAGAGACAGAAATAAAAGGAGA	137007
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	701	AGGGTTCTGAGGGACGGAGGCAAGTGACAAGAGACAGAAATAAAAGGAGA	750

AC073864.29	137008	GATGGTATCCATTTAAAACTCTTTATTGAGACTCTGTTAGGTGTTGGAGA	137057
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	751	GATGGTATCCATTTAAAACTCTTTATTGAGACTCTGTTAGGTGTTGGAGA	800

AC073864.29	137058	ACCAGACATCAATATAACACAGAGACAGAAAACAGACAGGCAACCAGGGA	137107
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	801	ACCAGACATCAATATAACACAGAGACAGAAAACAGACAGGCAACCAGGGA	850

AC073864.29	137108	GCCAACTGTAGTGTGATCTATGCGGGGCTGGAGGTGAGCCCAGGGGACTC	137157
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	851	GCCAACTGTAGTGTGATCTATGCGGGGCTGGAGGTGAGCCCAGGGGACTC	900

AC073864.29	137158	TGGAAATACCAGAGGGGCCATTTCACCCAGTCTTTGGAGGTAGGAGAGGC	137207
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	901	TGGAAATACCAGAGGGGCCATTTCACCCAGTCTTTGGAGGTAGGAGAGGC	950

AC073864.29	137208	TTCCTGGAGGAAGTGATATCTCAACTGAAATCTGAAGGATAAGTAGGATT	137257
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	951	TTCCTGGAGGAAGTGATATCTCAACTGAAATCTGAAGGATAAGTAGGATT	1000

AC073864.29	137258	GAGCTAGGTAAAGAGCAGGGGTGGTGGGGGGCGTATTCCAGGCATAGAGA	137307
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	1001	GAGCTAGGTAAAGAGCAGGGGTGGTGGGGGGCGTATTCCAGGCATAGAGA	1050

AC073864.29	137308	AGAGCTTGTGCAGAGGCCCAATGGGGGAAGACAGTGGCCCATTCCAATAA	137357
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	1051	AGAGCTTGTGCAGAGGCCCAATGGGGGAAGACAGTGGCCCATTCCAATAA	1100

AC073864.29	137358	CTGTCAGTCACTCTGTTCAGCTGGGTCACTCTATTCGGTTTGAGGATGGT	137407
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	1101	CTGTCAGTCACTCTGTTCAGCTGGGTCACTCTATTCGGTTTGAGGATGGT	1150

AC073864.29	137408	CATGAGATGGGAGAGGGGAGAGGCAAGGCTGGAGAGGTGGGCAGGGGCCA	137457
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	1151	CATGAGATGGGAGAGGGGAGAGGCAAGGCTGGAGAGGTGGGCAGGGGCCA	1200

AC073864.29	137458	TGTCAGACAGCGGTCTGCAGCTCATTCTATCATGAGGGCCATGGATGACC	137507
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	1201	TGTCAGACAGCGGTCTGCAGCTCATTCTATCATGAGGGCCATGGATGACC	1250

AC073864.29	137508	ACTGGTGGGCTTGAAGTAAGGAGGTGACAGGATTATATTTGTGTTAGAAA	137557
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	1251	ACTGGTGGGCTTGAAGTAAGGAGGTGACAGGATTATATTTGTGTTAGAAA	1300

AC073864.29	137558	ATTATTCCAGCTGTTGGATGGAGAATTGGACAGGTGGGGTGAAGCTAGTG	137607
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	1301	ATTATTCCAGCTGTTGGATGGAGAATTGGACAGGTGGGGTGAAGCTAGTG	1350

AC073864.29	137608	TGGACATGCACTGTATTCTTGATTCTCCGATTTCCTTCAGTATTTACCTC	137657
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	1351	TGGACATGCACTGTATTCTTGATTCTCCGATTTCCTTCAGTATTTACCTC	1400

AC073864.29	137658	AGTGGATTGATGGGTGCAAAAAAGGAATGAAGAAAGAAAAACAGGGAGGG	137707
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	1401	AGTGGATTGATGGGTGCAAAAAAGGAATGAAGAAAGAAAAACAGGGAGGG	1450

AC073864.29	137708	AGGGAGGGAGGAAAATGGATGGATGGGATAGATTGATGGATGGATGAAAC	137757
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	1451	AGGGAGGGAGGAAAATGGATGGATGGGATAGATTGATGGATGGATGAAAC	1500

AC073864.29	137758	CCAAGGGAGGCCAGGTACACTGGTTCACGCCTGTAATGCCAACACTTTGG	137807
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	1501	CCAAGGGAGGCCAGGTACACTGGTTCACGCCTGTAATGCCAACACTTTGG	1550

AC073864.29	137808	GAGGCCAAGGCAGGCAGATTACTTGAAGTCAGGACTTCGAGACCAGCCTG	137857
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	1551	GAGGCCAAGGCAGGCAGATTACTTGAAGTCAGGACTTCGAGACCAGCCTG	1600

AC073864.29	137858	GCCAACATAGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCA	137907
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	1601	GCCAACATAGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCA	1650

AC073864.29	137908	GGTGTGGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG	137957
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	1651	GGTGTGGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG	1700

AC073864.29	137958	GAGAATCACTTGAACCCAGGAGATGGAGGCTGCAGTGAGCCGAGATTGCA	138007
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	1701	GAGAATCACTTGAACCCAGGAGATGGAGGCTGCAGTGAGCCGAGATTGCA	1750

AC073864.29	138008	CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGGGAGACTCCATCTCAATTTAAA	138057
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	1751	CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGGGAGACTCCATCTCAATTTAAA	1800

AC073864.29	138058	AAAAAAAAAAAAAGAAGTAGAAACCCATGGAGATAAAATAGAATCAATGA	138107
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	1801	AAAAAAAAAAAAAGAAGTAGAAACCCATGGAGATAAAATAGAATCAATGA	1850

AC073864.29	138108	ACACAAGTCCAAGGAGAAAATATCTCAACTTGGAATATGAAAAACTTTCA	138157
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	1851	ACACAAGTCCAAGGAGAAAATATCTCAACTTGGAATATGAAAAACTTTCA	1900

AC073864.29	138158	TAATAATCTAAATAGTCCAAAGGTGGCAAGAACTGCCTTGAGAGACAGTG	138207
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	1901	TAATAATCTAAATAGTCCAAAGGTGGCAAGAACTGCCTTGAGAGACAGTG	1950

AC073864.29	138208	AGTTCCCTATATGTGGGAGTATGGAGGCACAGACTGAGATGAGGCATAAG	138257
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AC068799.14	1951	AGTTCCCTATATGTGGGAGTATGGAGGCACAGACTGAGATGAGGCATAAG	2000

AC073864.29	138258	CATCA	138262
			|||||
AC068799.14	2001	CATCA	2005

Overview

Query
AC073864.29 - 138262 bps
Hit
AC068799.14 - 170249 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2005 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link